Protein

Genbank accession
ADO19603.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber distal subunit [Shigella phage SP18]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,71
Protein sequence
MATLKSIQFKRSKTPGAKPTAAQLDEGELAINLRDRTIFTKSDQGQIIDLGFAKGGTIDGDVLQNGTFNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTTGNGAWANQHLNKAPIFTDLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSVGTLVSEGSFRVHYIDSTAPDNSKHWVFNRNGNFIVDSGNIEVRTGNISASGNINSANGIVSAPQVITKNIILDSKNFGQYDSQSLVNYVYPGTGETNGVNYLRKVRAKSGGTMWHELCTAQTGQADELSWWTGNTPTSKQYGIRNDGRMAGRNSLALGTFTTDFPSSDYGNFGIMGDKYLVLGDTVTGLKYIKQGVYDLVGGGYSVASITPDSFRSTRKGLFGRSEDQGETWIMPGTNKALLSVQTQADNNAAGDGQTHIGYNSGGKMNHYFRGKGKTNINTQKGMEVNPGILKLVTGSDNLQFYANGTISSIQPIKLDNEIFLTTSNNTAGLKFGAPSGVNETRAIQWNGGTREGQNKNYVIVKAWGNSFNAAGDKSRETVFQVSDGQGYYFYAHRKAPTGDETIGRIEAQFAGALNAKSINAIENFKVNGLSTLVGGVTMSNGLNLTGGANISGPVKIGGVTNALRIWDSRYGAIFRRSETSLHIIPTNENEGENGAISNLRPFSIELGTGTVIMGDKSTGGPLFTVDNVSKFVQTDCRFRVNMDSDGIVVNASSQAASNFIQGRKADVTKWYLGIGDGGNVVRMHNYTYSHGIALNSDTVDITKPLKVGNAQLGTDGNITGGSGNFGNLNTTIENMKADIVTSYPVGAPIPWPSDSVPDGFALMEGQTFDTGAYPKLAIAYPTGTIPDMRGQTIKGTPSGRAVLSAEADGVKSHNHSASASTTALTGTTNGTDLGTKTVSTVDIGRKYTNNAGAHTHTFSGTTSTNGDHNHPASLGNNANVQSGRFAASNSGQSAIAYTNNAGNHSHTFSGTTSAGPEHSHYVDIGSHNHTVAIGSHSHTFSIAAHGHTITVNNTGNTENTVKNIAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1009 AA
molecular weight: 107350,38520 Da
isoelectric point:8,64361
aromaticity:0,08325
hydropathy:-0,41695

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage SP18
[NCBI]
645664 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO19603.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GQ981382.1 [NCBI]
CDS location
range 157165 -> 160194
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAATCGATACAATTTAAAAGAAGTAAAACACCAGGAGCCAAGCCTACTGCAGCTCAGTTAGATGAAGGCGAACTGGCTATTAACTTGCGTGACCGCACTATTTTTACTAAATCCGACCAGGGACAGATTATTGATTTGGGCTTTGCAAAAGGCGGAACTATTGATGGAGATGTTCTTCAAAACGGGACATTTAACCTTAACGGTAACCAATTTGTTTATGCCGGTAAATATATTGAATTTTTACCTAAGACCACCGGTAATGGCGCATGGGCAAACCAGCATCTGAATAAAGCACCTATCTTTACGGATTTGAGTTCAACTACCTCAGTATCAGAATACCACCCTTTGATTAAGCAACGTTATAAAGATGGTACTTTTTCAGTAGGTACATTAGTAAGCGAAGGCTCATTTAGAGTTCATTATATTGATTCTACAGCTCCAGACAATTCTAAACACTGGGTCTTTAACCGTAACGGTAATTTTATTGTAGATTCTGGCAATATTGAGGTCCGCACAGGTAATATTTCTGCGTCAGGCAATATTAACTCCGCTAATGGTATAGTTTCTGCTCCACAAGTTATTACTAAAAATATTATTCTTGATTCGAAAAATTTCGGACAATACGACAGTCAATCTTTAGTTAACTACGTATACCCAGGCACAGGCGAAACGAATGGTGTAAACTATCTTCGTAAAGTTCGCGCCAAATCCGGCGGCACTATGTGGCATGAGCTTTGCACTGCCCAGACAGGTCAAGCTGATGAATTGTCTTGGTGGACAGGTAATACTCCAACATCTAAACAATATGGCATTCGTAATGATGGACGAATGGCAGGCCGTAATAGCCTTGCATTAGGTACATTCACTACAGATTTCCCGTCTAGTGATTATGGCAACTTCGGTATAATGGGCGATAAGTATCTTGTTCTCGGTGACACTGTAACTGGTCTGAAATATATTAAACAAGGTGTTTATGATTTAGTTGGTGGAGGTTATTCAGTTGCTTCCATTACTCCTGATAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGGTTTATTTGGTCGTTCAGAAGACCAAGGCGAAACATGGATTATGCCTGGAACCAACAAGGCGCTTTTATCGGTTCAAACACAAGCTGATAATAACGCTGCTGGCGACGGCCAGACACATATTGGCTATAACTCAGGCGGAAAAATGAACCACTATTTCCGTGGTAAAGGCAAAACTAATATTAATACTCAAAAAGGCATGGAAGTTAATCCGGGTATTTTGAAATTGGTAACTGGCTCTGATAATCTACAATTTTATGCTAACGGAACTATTTCTTCTATTCAACCTATTAAATTGGATAATGAGATATTTTTAACTACCTCTAATAATACTGCAGGCCTTAAATTTGGCGCCCCTAGCGGAGTTAATGAAACAAGAGCTATCCAGTGGAACGGTGGTACTCGTGAAGGACAGAATAAAAACTATGTGATTGTTAAAGCATGGGGTAACTCATTTAATGCCGCCGGTGATAAATCTCGCGAAACGGTTTTCCAAGTATCAGATGGTCAAGGATATTATTTTTATGCCCATCGTAAAGCTCCAACCGGCGACGAAACTATTGGACGCATTGAAGCTCAGTTTGCTGGAGCTCTTAATGCTAAAAGTATTAATGCCATCGAAAATTTTAAAGTTAATGGATTAAGCACTTTAGTCGGCGGAGTTACAATGAGCAATGGACTTAATTTAACTGGCGGTGCTAATATCAGCGGGCCAGTTAAAATCGGCGGCGTCACCAATGCATTAAGAATTTGGGACTCTCGCTATGGCGCCATTTTCCGTCGCTCAGAAACATCATTACATATTATCCCAACTAATGAAAATGAAGGGGAAAACGGTGCAATAAGCAACCTTCGTCCGTTTAGTATTGAGTTAGGCACCGGTACGGTTATAATGGGGGATAAATCTACGGGCGGACCGCTTTTCACGGTCGACAACGTAAGTAAATTCGTCCAGACGGACTGTAGATTCCGTGTTAACATGGATTCTGATGGTATTGTTGTTAACGCCTCATCTCAAGCGGCATCTAACTTTATTCAAGGTCGTAAGGCTGATGTGACTAAATGGTATTTGGGTATTGGCGATGGCGGCAACGTCGTTCGTATGCACAACTACACATATTCTCACGGTATTGCGTTAAACTCTGATACTGTCGATATTACTAAGCCTCTTAAAGTTGGAAATGCCCAACTAGGAACTGACGGTAATATTACAGGTGGTAGTGGTAATTTCGGTAATTTAAATACTACCATCGAGAATATGAAAGCCGATATTGTTACCAGTTACCCAGTCGGTGCCCCAATTCCATGGCCAAGTGATTCAGTTCCTGACGGATTTGCTTTAATGGAAGGCCAGACTTTTGACACAGGTGCTTATCCTAAGCTCGCTATCGCATATCCTACCGGTACTATTCCTGATATGCGTGGACAAACTATCAAGGGTACACCTAGTGGACGGGCCGTGTTAAGCGCAGAAGCAGATGGTGTTAAGTCTCATAACCACTCCGCATCGGCATCAACTACTGCTTTGACAGGCACAACCAATGGTACGGACTTGGGTACAAAAACTGTCAGCACTGTTGATATAGGGCGTAAGTATACTAATAACGCAGGAGCGCATACTCACACGTTCTCAGGAACAACTAGTACGAACGGCGACCATAACCACCCAGCTTCACTTGGTAACAACGCCAACGTTCAATCAGGTCGTTTTGCAGCATCTAACTCAGGTCAGTCTGCTATAGCATATACCAACAACGCTGGTAACCACAGTCACACGTTCTCAGGAACTACGTCTGCAGGCCCAGAGCACAGTCACTACGTTGATATAGGTAGTCATAACCACACCGTAGCAATAGGTTCACATAGCCATACGTTCTCTATTGCGGCTCACGGTCATACCATCACCGTAAATAACACCGGTAATACAGAAAACACAGTTAAAAACATTGCTTTTAACTATATTGTTCGTTTAGCTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.