Protein

Genbank accession
AGF88192.1 [GenBank]
Protein name
tail spike protein
RBP type
TF

evidence: Phold

probability: 1,0000

TSP

evidence: DepoScope

probability: 0,9990

TSP

evidence: RBPdetect

probability: 0,9491

Protein sequence
MNELFSQGGKGSTGILTNKQAVARHFGVKQNEVIYFAVGADLGGYKVIYDKENQQAYTLPVGIAPGTTAVSMSSTGNLVHSSGAVDLSDLAVKRREFITLQGDFVSGATLTRKHEVITYSNSRYRWTGTLPKVVAPDSLPDSSEWLNVDANPALSELAKAVGASMIGYKPTGTTTTTGTVKTKLDSFIDFANDYCGGPITGQPDLSDQLQQAIIDAFNSGVGDIKIVGDFYISKMILWYPGVRLLGGRYDTTLIRAATTFPVGDTMFRSYRPPLWNAGCHGLSMENLYLVGRSTKNLHAIDINDASYFNLEGVRLDLFNKGISFNRWIDETRVESGGIITYPNAHTPAIGGQSYFGTVTRCYAGSCVTCVDFNGVVNRCTFTSNTWTSSDLAYNFSNPRGVYETNTFITCNIEGVKIVWEWFFSINSPYHNVWINTSIDNGNPDITCLAKDGGRQTFIGLAIFPYGNTDLVNWYGINPNGYRSTVIGTDNGELLPENQLKTQVREELHTLTGIANKQWAGQQITETIPANGYKSYNITVTGLKGNAAVIASLSQIYHGITVNAASNNTGTVQVIISNYTAADIAINSYLSVTGIAKSFL
Physico‐chemical
properties
protein length:599 AA
molecular weight: 65078,32270 Da
isoelectric point:6,02052
aromaticity:0,10518
hydropathy:-0,12120

Domains

Domains [InterPro]
IPR040775
92–143
IPR040775
AGF88192.1
1 599
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage FSL SP-058
[NCBI] 		1173761 Uroviricota > Caudoviricetes > Schitoviridae > Ithacavirus > Ithacavirus SP058
Host Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin
[NCBI] 		98360 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Salmonella

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGF88192.1_KC139517.1_58820_60619 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KC139517.1 [NCBI]
CDS location
range 58820 -> 60619
strand -
CDS
ATGAACGAACTGTTCTCACAAGGCGGTAAAGGTTCAACTGGAATCTTAACCAATAAACAAGCAGTAGCTAGACACTTTGGTGTTAAGCAAAACGAGGTAATTTACTTTGCTGTTGGTGCTGATTTGGGTGGATATAAAGTAATTTATGATAAGGAAAATCAACAAGCTTATACATTACCTGTCGGTATTGCACCAGGAACAACTGCTGTATCAATGAGTTCAACAGGCAATCTGGTTCATTCATCCGGTGCAGTTGACCTAAGTGACTTGGCTGTTAAGCGCAGAGAGTTTATTACTCTTCAGGGGGATTTCGTTAGTGGTGCAACTCTTACCCGTAAGCATGAAGTTATTACTTACAGTAATAGTCGATATCGCTGGACTGGAACATTACCCAAAGTTGTTGCCCCAGACTCTTTACCTGATAGTTCTGAGTGGCTCAATGTGGATGCTAACCCTGCTTTGTCTGAATTAGCCAAAGCCGTTGGTGCTTCTATGATTGGGTATAAACCAACAGGGACTACCACCACTACGGGTACTGTTAAAACCAAACTGGATAGTTTTATAGATTTTGCCAATGATTACTGCGGTGGGCCAATTACGGGGCAACCGGACCTTTCCGACCAATTGCAACAAGCGATTATTGATGCCTTTAACTCAGGTGTTGGTGATATTAAAATCGTTGGAGATTTCTATATCTCTAAGATGATTTTATGGTATCCCGGTGTGCGTTTGCTTGGTGGGCGTTATGATACTACCTTAATTCGAGCAGCTACTACCTTCCCTGTCGGCGATACTATGTTCCGTTCTTATCGTCCTCCTTTGTGGAATGCAGGCTGCCATGGATTGTCCATGGAGAACTTGTATCTGGTAGGTCGTTCTACTAAGAACCTACATGCAATAGATATTAATGATGCCTCCTATTTTAACCTGGAAGGTGTACGGTTAGACCTGTTTAATAAGGGTATTTCTTTTAACAGATGGATTGATGAAACTCGCGTCGAATCTGGTGGAATTATTACTTATCCTAATGCCCATACACCAGCTATTGGAGGTCAATCCTACTTTGGTACGGTAACCCGTTGCTACGCTGGTAGCTGTGTTACTTGTGTGGATTTTAATGGTGTAGTTAACCGTTGTACCTTTACTAGTAACACTTGGACCTCTAGTGACTTAGCATATAACTTCAGTAATCCTCGTGGTGTATATGAAACAAATACGTTCATCACTTGTAATATCGAAGGTGTAAAAATTGTTTGGGAATGGTTCTTCTCAATCAACTCTCCTTATCACAACGTGTGGATTAACACTAGTATTGATAATGGTAATCCAGATATCACTTGTCTGGCTAAAGATGGTGGTAGACAAACCTTTATTGGTTTAGCCATTTTCCCTTATGGTAATACTGACTTAGTTAATTGGTATGGTATAAATCCAAATGGATATCGTAGTACTGTTATTGGTACTGATAATGGAGAATTGTTACCAGAAAACCAGTTAAAAACTCAGGTACGAGAAGAGTTGCATACTCTTACTGGTATTGCTAATAAACAATGGGCTGGGCAGCAGATAACAGAGACTATTCCTGCTAATGGGTATAAGTCTTACAACATTACTGTTACTGGTTTAAAAGGTAATGCTGCTGTTATTGCGTCATTATCTCAGATTTATCATGGCATTACTGTAAATGCTGCTAGTAATAATACAGGTACTGTTCAGGTTATTATTAGTAATTACACTGCGGCAGATATTGCTATTAATTCATATTTAAGTGTTACTGGTATTGCTAAATCATTCCTTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID: 19

Method: ESMFold

Resolution: 0,7494

Evidence: 0,8064

Literature

No literature entries available.