Protein

Genbank accession
YP_009794601.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,83
Protein sequence
MALKTKIIVQQILNIDDTTTTASKYPKYTVVLGNSISSITAGELTSAVEASAASAAAAKGSEIAAKDSENKAKDSEIMAGIYADSSQTSATQSAASAAESEKQARLSQKSADASATSAEESKGFRDSAELAAQNAENSRRLAEQAKSAAQAAQTAAETAKTGAETAKAGADAAATTAGEHAAAAKQSELNAKTSETNAASSATEAGDKAIDATTEADRAKAEADRATQIVDSKLDKVDISGFIKVYKTKAEADADVGSRVLGEKILVWNQTDSKYGWYKVTGTAEAPVLELAEIEQKLVSINNVRADDAGNVQITLPGGNPSLWLGEVTWFPYDKDSGVGYPGVLPADGREVLRVDYPDTWEAIEAGLIPSVSEAEWQAGAILYFSTGDGSTTFRLPDMMQGQAFRAPTKGEENAGAIKEQIPYITTVNGISPADDTGAIKLPYVAMVNGTIIPDENGNLALGNVVTKNVWNGTDGEVLLRGAFGLGGAGIALNEPDIVSFFKAMRAFGSGYYRNDTGFDGLPAYAAGFYSRVADTNSFICPSYGSASVFVAAINDAGLDSENPIVHTNILYGTVNKPDLNGDTNGVLSVGKGGTGATTVSAAKKALEVGGVFCNDSPADAAFNSLQSPAGIHEFRLTNEGLWGVWKKGEETVAALPIGSGGTGATDKVAARDNFELGYHNTPRFTGVDLSNPESIPYSGILNLNRLKESDQNVITQGRIYHEMQSDLAKITLHINNTLNGANRYIQFVENGDLTGLQNVHAVNYLASGYVTAQGWIKGGEKIYIQQTGGGNREISMAVPTPNNDPGAGSWVNLLQGNWYNGYWQVGGIRGSGPDLDCLRIGVNNSGTDWKEFNFYNSYGGHITAPKGFRGQCTQGYWGLEWDYMGAPFHAESVANNDGGWSPIVSGGSLSAGGYHLRIGLGCISNGNAAWPDAALKLNGDGQFHRSFNFRTNGSVYTWGNDPWGGNYDFAMNPSSDRDIKRDINYDDGLASYENIKQFKPTTFIYKLDKYNRVRRGVIAQDLYKIDPEYVKLVPGSPIIETPEHHCCDEKTENVESKIIDYEDDTLALDINPIAIDTALAVRYLSLKFEESQEELKSVKAELAELKALVATLVNK
Physico‐chemical
properties
protein length:1116 AA
molecular weight: 118823,12290 Da
isoelectric point:4,81713
aromaticity:0,08333
hydropathy:-0,34507

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage SSP1
[NCBI] 		1983588 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009794601.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_047881.1 [NCBI]
CDS location
range 53834 -> 57184
strand +
CDS
ATGGCACTTAAAACTAAAATTATTGTACAGCAGATTCTGAACATAGATGACACTACAACTACTGCTAGTAAGTACCCTAAATATACAGTAGTTTTAGGAAATTCTATTAGCTCTATTACTGCTGGTGAATTAACTTCTGCTGTAGAAGCCTCCGCTGCTTCTGCGGCAGCAGCAAAAGGTTCTGAAATTGCTGCTAAAGATTCTGAGAATAAAGCAAAAGACTCCGAAATTATGGCGGGTATCTATGCAGATTCTTCCCAAACATCAGCTACTCAATCCGCAGCTTCAGCAGCAGAATCTGAGAAACAAGCTAGATTATCTCAGAAGAGTGCAGATGCTTCTGCTACATCAGCGGAAGAGTCTAAAGGATTTAGAGATTCTGCTGAACTAGCTGCTCAGAATGCTGAGAACAGTCGTAGACTTGCTGAACAAGCTAAGTCTGCTGCGCAAGCTGCTCAAACAGCGGCTGAAACTGCTAAGACTGGTGCTGAAACAGCAAAAGCTGGAGCAGATGCTGCTGCTACAACTGCTGGAGAACACGCTGCTGCTGCGAAACAATCAGAATTAAATGCTAAAACTTCTGAGACTAATGCTGCTAGCTCTGCTACAGAAGCGGGGGACAAAGCTATTGATGCTACTACTGAAGCAGATCGTGCTAAAGCTGAAGCAGATCGTGCAACTCAGATTGTTGATAGTAAACTTGATAAGGTAGATATTTCTGGTTTCATCAAAGTTTATAAGACTAAAGCAGAAGCCGATGCGGATGTTGGAAGTCGTGTACTAGGGGAGAAGATCCTAGTATGGAATCAAACTGATTCAAAATATGGGTGGTATAAGGTCACTGGTACTGCCGAAGCTCCTGTTCTAGAATTAGCAGAAATAGAGCAAAAGCTAGTTTCTATTAATAACGTTCGTGCAGATGACGCGGGTAACGTACAGATTACTCTTCCTGGTGGTAACCCCTCTTTATGGCTAGGTGAAGTTACTTGGTTCCCTTATGATAAAGATTCAGGTGTTGGCTATCCCGGTGTTCTGCCTGCCGATGGCCGTGAAGTCCTTCGTGTAGACTACCCAGACACTTGGGAAGCCATCGAAGCTGGTCTAATTCCTTCTGTATCAGAAGCTGAATGGCAGGCTGGTGCAATACTCTACTTCTCCACTGGTGATGGTTCTACAACCTTCCGTTTACCAGATATGATGCAAGGGCAGGCTTTCCGTGCACCAACTAAAGGTGAAGAAAATGCTGGTGCTATCAAAGAACAAATTCCTTATATCACCACTGTGAATGGAATTAGTCCTGCTGACGATACTGGAGCTATTAAGCTCCCTTACGTGGCGATGGTTAATGGAACTATTATACCAGATGAGAATGGAAACCTAGCACTAGGTAACGTTGTTACTAAGAATGTTTGGAATGGTACTGATGGAGAAGTTCTACTTCGTGGTGCTTTTGGTTTAGGTGGTGCTGGTATTGCGTTAAATGAACCTGATATAGTATCATTTTTTAAGGCTATGAGAGCTTTTGGCTCTGGGTATTATCGCAATGATACGGGATTTGATGGCTTGCCTGCATACGCTGCAGGTTTCTACTCCAGGGTAGCAGATACTAACTCGTTTATCTGCCCATCGTATGGTAGTGCTTCAGTATTTGTAGCTGCAATCAATGATGCTGGTTTAGATAGTGAAAACCCTATTGTTCATACTAATATTCTTTATGGTACTGTTAATAAGCCAGATCTAAATGGTGATACTAATGGAGTTCTTAGTGTTGGTAAAGGCGGTACTGGAGCTACCACAGTTAGTGCTGCTAAGAAAGCTTTAGAAGTTGGTGGAGTTTTCTGTAATGATAGCCCAGCTGATGCTGCTTTCAACTCTCTCCAGAGCCCTGCTGGTATTCATGAGTTTAGACTAACTAATGAGGGGTTATGGGGTGTATGGAAGAAGGGGGAAGAAACGGTAGCTGCGTTGCCTATAGGCTCTGGTGGTACAGGAGCTACTGATAAAGTTGCTGCACGTGATAACTTTGAATTGGGGTATCATAATACTCCTAGATTTACTGGGGTAGATCTATCTAATCCCGAAAGCATACCCTATAGTGGTATCCTTAATCTAAACAGGCTAAAGGAATCTGATCAAAATGTTATTACTCAGGGTAGAATCTATCATGAGATGCAATCAGATTTGGCTAAAATTACCCTTCATATTAACAATACTTTAAATGGTGCAAACCGTTATATACAGTTTGTAGAAAATGGTGATTTAACTGGGCTACAGAATGTACATGCAGTTAACTACCTTGCAAGTGGTTATGTTACAGCCCAGGGATGGATCAAAGGCGGGGAAAAAATCTATATACAGCAAACAGGTGGGGGCAACAGGGAAATTAGTATGGCTGTACCTACTCCTAATAATGACCCTGGTGCTGGTTCTTGGGTTAACTTACTACAGGGTAACTGGTATAACGGTTACTGGCAAGTAGGTGGTATCCGTGGTAGTGGACCGGACTTAGACTGCCTCCGTATTGGAGTTAACAACTCTGGTACAGATTGGAAGGAATTCAATTTCTACAACTCCTATGGTGGCCATATAACTGCTCCAAAAGGTTTTCGTGGTCAGTGTACTCAAGGATATTGGGGCTTAGAGTGGGATTACATGGGCGCCCCATTTCATGCAGAGTCTGTAGCAAATAATGATGGTGGTTGGTCTCCTATAGTATCGGGAGGTTCTTTATCCGCTGGTGGATATCATTTAAGAATAGGCCTTGGCTGTATCTCTAATGGTAACGCTGCATGGCCTGACGCTGCTCTTAAGTTAAATGGGGATGGCCAGTTCCACCGTTCATTCAACTTTAGAACAAACGGTAGCGTGTATACTTGGGGTAATGATCCTTGGGGAGGTAACTATGACTTTGCTATGAACCCTTCTTCAGATAGAGATATCAAAAGAGATATTAATTATGATGATGGGTTAGCCTCCTATGAGAATATAAAGCAATTTAAACCTACCACATTTATCTATAAACTAGATAAGTATAATCGTGTACGCCGTGGTGTTATTGCTCAAGATCTTTATAAAATTGACCCTGAGTACGTAAAACTGGTTCCTGGTTCCCCTATCATAGAAACTCCAGAACATCATTGCTGTGACGAAAAAACTGAGAACGTAGAAAGTAAGATCATTGACTATGAGGATGATACTTTAGCTCTGGATATTAACCCGATCGCTATTGATACGGCATTAGCAGTTCGTTACTTGTCTCTAAAGTTCGAAGAGTCCCAGGAAGAACTGAAGTCCGTTAAGGCAGAACTGGCAGAGTTAAAAGCTCTAGTAGCCACTCTGGTAAATAAGTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.