Protein

Genbank accession
ABA47074.1 [GenBank]
Protein name
structural protein [Synechococcus phage syn9]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,92
Protein sequence
MAQNTNLNVTPYYDDFDKAKNFYRVLYRPGFPIQARELTTMQSILQNQVESVGAHLFKDGAMVIPGQVGYDLNVDAIMLQESFLGANVEDYRTQLDNKIITGLTSGVKAKVLYSIPASMSEKGYITIYVKYIESGGEQNSQNTFTNNEQLVTDTEITFGTTLIEVGSPFAQLLPTDALQTGSVAYVQEGVYFIRGFFVDVPYQYILLDQYGTNPKYRVGLEILESIITPEDDLSLNDNAAGTSNYAAPGAHRFKVSTNLTKKLLTDDADKDFIELLRINGNKIEKLVDRSAYDEIEKTMALRTYEESGNYVVNDFQITMRENLNDGFNNGVYQSGETTAQGNTASSSMYAVEFSPGVAYVRGYRIKNLSPVYLDLDKPRSTNAAQNVIIPFEMGNYSNINNIYGFPNCSGATISNHYQVVELYDTAIATPGDVSGNLIGYARVKSCEFSSNPNGTFGDADDIYKLNLSDVQMITVLQLNSNVTVSQGSVLEGVNSGARAYVIDALSGTNDIPVYQVEGVFQAGEMLTVDGIQLDTITHFHSYVYSDTRSFAARDEITQAVEFTADLILENINLVQGASFTYDATGGSETITGLNSNFAADLRPGDRIYFSDTAFVTVDLVDPTDLAASRVGTIFNYQTQVVNVTPGAVAPVAGTYTALLRYRGKLFGLENADLLSRMPRPYVKSISDESMVVRRTFDAQTVASNSISITLPENEQFSALSPEHFSFTVMASTNGSYPVGSQIPIDDTNTGAFGYTSFTSAERTTLQIDNLTNITSVKVTGTISKNFTTRKTKSPSRMFILKVNKTQSNLDKQNYGLTHSLLYGTRIEDKEISLGLVDAYHIHAVYESLDDSDPVIPSVTLVEPSFFATGSIVIGKTSGARARVVDFNSSTLKLTVVYLSGQLVAGEVVNGFDSSNNAISGIINDSDGSVIVGSKVVTDRYQLADGQTGFLYTTSSLVRQKGVATPIRKLKVVLDYYNHSATGDYFGGQSYLDTDYEDVPFFGDSFLADFLDFRPGCKNLYSGSGTVASPAFVNCSTFDFKSRVFPTSSTPAATLIDIPKLDSDFRCDFDWYLPRIDKLFLLPNGEFQVIKGKSEENPSPPDNIAEGMQLALLRHRPYGFSPEDDVIIIKSDNRRYTMRDIGSIEKRLDQVEYYTAINMLEADTINFQITDAQGKNRFKNGFLVDDFTDHAKSAVGLQDYSVSLDYIEGTCRPSHYTTNVPMVINESLSTNYRKTGPIITLPYQEELLVDQPYASRVENVNPFNVFAYIGRIDLTPQSDDWVDTNRLPTRVTNMEGDFRATQEELNVDQNGFAPIQWNAWQTNWSSTSGPVAGSTWREHTFANFRPGRGRRVMQNTTTTTTTSLSRTGIRTRVVPRIDRQSLGDSLLSSTTIPWIRSRNVDVNIVRMKPRTSFFAFFDGQKIDDYLVPKVIELIKDPTTDSRTNSTPFVIGETVVGLTSGCRFRVAAPNDYFKWNPYDDTELPTSYSSTTAFLNIDTLSLAEQAAGDFYGNMQVGEILQGASGATAVVQNRRIVTDRLGQYRGSFAIPDPGLETNPRWNTGTRVIRFTTNENDSRLPGAVASAAQAEYAATGTLNTVQENVLAIRNAEIVRDTVSQDRTVSSTRTESRQVGWWDPLAQSFLVDEEGGVFITSVSVYFNAKDDNIPISMQIRTMENGYPTTTILPFSDVTINPADVQISETGSVATTFVFQAPVYIPQSIEHCFVLFSDSNSYQVWISRMGELDITGDRTISEQPYAGVLFKSQNATTWTADQYEDMKFQINRAVFDNTSTSVLTLNNAPLDRGNKGKINLGNDAIQTFQPQLQLVLNSTIPYTIGARIKQEITLAQATIVGVEDTVSGTVLTVNDISGNWSAGSNTGGVILNRVVSSKTLATMTVNTPSGDFSVGEIITGNSATTPTAEVITWDSGTNTLTLRYISTEFTPSTETITGGDSNVTATVNTITYSGDATSGGTAVDDAFVNTTPTYTATNRKVRVNHYNHAMNDIDNNVEITGVESEVSPTYLTSSLSDTDTTIQVNDASAFHTIINGSNVSASNLGYIMIENEIMSYSSITNNGRTITINERGIDGTTAVSHADETPVMCYNLDGIPLIEINKTHEAISSPTLDTYDIATSSLGRLGIKSGGPNIVATQNIQYEIITPQIQRLLLPKTNITGRINTITGTSINDGTNLSQNSFSNTGEFFDILLNDSNYFNAPQLICSQINESSELSGAKSIRMDLSLFSDSTSVSPVIDTDRMSITLTSNRINNPSNPNTALLPRGDGHDAAYITKVATLTNPSSSIKLIFAGYRPPNTFIKPLYRVVPTGATETIDQIGYEFFPTNDATIPATTENELYQDYEYEITGLDFTAFQIKLVFVSPNQAFVPIIKDFRAIALAV
Physico‐chemical
properties
protein length:2391 AA
molecular weight: 262397,09320 Da
isoelectric point:4,66395
aromaticity:0,09368
hydropathy:-0,23450

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage syn9
[NCBI] 		382359 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ABA47074.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
DQ149023.2 [NCBI]
CDS location
range 85976 -> 93151
strand +
CDS
ATGGCACAGAACACCAACCTAAACGTCACACCTTACTACGACGATTTCGATAAGGCGAAAAACTTTTATCGAGTGTTGTATCGTCCTGGATTCCCTATTCAGGCAAGAGAGCTCACAACAATGCAGAGTATTCTGCAAAATCAGGTAGAGAGTGTTGGAGCTCACTTGTTTAAAGATGGTGCCATGGTCATTCCTGGTCAAGTAGGATATGACTTGAATGTTGATGCGATTATGCTTCAGGAAAGTTTCCTGGGTGCAAACGTTGAAGACTATCGCACCCAGTTAGATAACAAAATTATCACTGGTCTTACATCTGGCGTTAAAGCAAAGGTGCTGTATAGCATCCCCGCCTCGATGTCGGAAAAAGGGTATATTACGATTTACGTTAAGTATATTGAATCTGGTGGTGAGCAAAACAGTCAGAATACATTTACCAACAACGAGCAGTTAGTAACAGACACAGAAATTACTTTCGGCACTACTCTTATTGAAGTTGGATCTCCGTTTGCTCAGTTGCTTCCTACTGATGCACTTCAAACTGGATCTGTTGCATATGTCCAAGAGGGTGTATACTTCATCAGAGGTTTCTTTGTTGACGTACCTTATCAGTATATTCTCCTTGATCAGTATGGAACTAACCCCAAATACAGAGTCGGTCTCGAAATCCTTGAATCGATCATCACCCCAGAAGATGACTTATCACTTAATGATAACGCTGCAGGCACATCTAACTATGCTGCTCCTGGTGCTCACAGATTCAAAGTAAGTACAAACTTAACTAAGAAGTTACTTACAGATGATGCCGATAAAGACTTTATCGAATTGTTGAGAATCAATGGTAATAAAATTGAGAAACTGGTCGATCGTAGTGCATACGATGAAATCGAAAAGACCATGGCTCTCAGAACTTATGAAGAGTCTGGAAACTATGTTGTAAATGATTTCCAGATCACAATGAGAGAAAATCTCAATGATGGATTCAACAACGGCGTATATCAATCTGGAGAAACTACAGCGCAAGGGAATACTGCATCTTCTTCAATGTATGCAGTTGAATTTAGTCCTGGTGTTGCATATGTAAGAGGTTACAGAATCAAAAACCTCAGTCCTGTTTATCTTGATCTTGATAAACCCAGATCTACAAATGCTGCACAAAACGTTATTATCCCGTTTGAGATGGGTAACTACTCAAACATCAATAACATTTATGGTTTCCCCAACTGCTCTGGTGCAACAATTTCCAATCACTATCAGGTTGTAGAACTATATGATACTGCTATCGCTACTCCTGGAGACGTTAGTGGCAATTTGATTGGATACGCTCGTGTTAAATCATGCGAGTTTAGTAGCAATCCTAATGGCACGTTTGGTGATGCAGATGACATCTACAAGTTAAATCTTTCCGATGTCCAAATGATTACAGTTCTTCAACTTAACAGTAATGTTACTGTTTCGCAAGGATCTGTATTAGAAGGTGTAAATTCTGGAGCAAGAGCATATGTTATCGATGCTCTTAGCGGCACTAATGATATTCCCGTTTATCAAGTAGAGGGTGTTTTCCAGGCAGGTGAAATGCTCACAGTTGATGGTATTCAATTGGATACCATTACACATTTCCACAGTTATGTGTATTCTGACACCAGATCTTTTGCTGCTCGTGATGAAATTACACAAGCAGTAGAATTTACTGCAGATTTAATTCTTGAGAATATTAATTTAGTCCAAGGCGCATCTTTTACTTATGATGCAACTGGAGGATCTGAAACTATTACTGGTCTGAATAGTAACTTTGCTGCAGATTTGAGACCTGGAGACCGAATTTATTTCTCCGATACTGCATTTGTAACTGTAGATTTGGTTGATCCTACAGATCTTGCTGCTTCTAGAGTCGGTACAATTTTTAATTATCAGACTCAAGTTGTAAATGTAACTCCTGGTGCAGTTGCTCCTGTTGCTGGCACATATACAGCACTTCTTAGATATAGAGGAAAATTATTTGGGTTAGAAAATGCTGACCTTCTGAGCAGAATGCCTAGACCTTATGTCAAGAGCATTTCTGATGAATCGATGGTCGTTAGAAGGACATTTGATGCTCAGACTGTTGCTTCCAACTCCATCTCTATTACTCTTCCTGAAAACGAGCAATTCTCTGCACTCTCACCAGAGCATTTCAGTTTCACTGTAATGGCTAGCACCAATGGGTCTTATCCTGTTGGATCTCAGATTCCCATTGATGATACTAACACTGGTGCATTTGGATATACTTCATTTACTTCTGCAGAAAGGACTACACTTCAGATTGACAACTTAACCAATATTACTTCGGTTAAGGTTACTGGCACAATTTCCAAAAACTTCACCACAAGAAAAACCAAGTCTCCTTCTAGAATGTTTATTCTGAAGGTTAACAAAACTCAGAGTAACCTTGACAAGCAAAATTATGGTCTGACCCATTCTCTGCTCTACGGCACCAGAATTGAAGATAAGGAGATTTCTTTGGGTCTGGTTGATGCATATCACATCCATGCAGTTTATGAATCACTGGATGATTCAGATCCCGTAATTCCTTCTGTCACCTTAGTTGAGCCGTCTTTCTTTGCAACAGGATCTATTGTTATTGGTAAAACATCTGGTGCTCGTGCTCGCGTTGTAGACTTTAACTCCAGCACCCTTAAGTTGACCGTTGTATATCTTTCTGGTCAATTAGTTGCTGGTGAAGTTGTAAATGGTTTTGATAGCAGCAACAATGCAATTAGTGGAATTATCAATGACTCCGATGGATCTGTAATTGTTGGATCTAAAGTTGTTACTGATAGATATCAACTTGCAGATGGACAAACAGGTTTCTTATATACAACTTCATCTCTTGTTAGGCAGAAAGGTGTTGCAACACCTATTCGTAAGTTAAAAGTTGTCCTTGATTACTATAATCATTCTGCAACTGGTGACTATTTCGGTGGTCAGTCTTATCTGGATACTGATTATGAGGATGTCCCCTTCTTCGGTGATTCTTTCCTTGCAGATTTCTTAGATTTCCGTCCTGGTTGTAAGAATCTTTATAGTGGATCTGGCACGGTTGCCTCTCCTGCATTCGTTAATTGCTCGACATTTGATTTCAAATCAAGAGTATTCCCAACTTCTTCCACACCTGCAGCGACTCTGATCGACATTCCTAAGTTGGATAGTGATTTCAGATGCGACTTTGACTGGTATTTGCCTAGAATTGATAAGTTATTCTTACTTCCCAATGGCGAATTCCAAGTAATTAAAGGTAAGTCTGAAGAGAATCCTTCCCCTCCAGATAATATTGCTGAGGGTATGCAACTTGCTCTCTTAAGACATAGACCCTATGGATTTAGTCCAGAAGATGATGTAATCATTATTAAGTCTGACAACAGACGATATACAATGAGAGACATCGGATCAATTGAAAAGCGTCTCGATCAAGTTGAATATTACACTGCTATCAACATGCTTGAGGCAGATACAATCAACTTCCAAATTACCGATGCTCAAGGTAAAAATAGATTCAAGAATGGATTCTTGGTTGATGATTTTACCGATCATGCAAAATCTGCTGTTGGTTTACAGGACTATTCTGTATCTCTTGACTACATTGAAGGCACTTGCCGTCCATCTCACTATACAACCAATGTCCCGATGGTGATTAATGAATCACTGTCCACTAATTATAGAAAAACTGGTCCTATTATTACTCTTCCATATCAGGAGGAATTGCTGGTTGATCAACCCTATGCTTCTCGTGTAGAGAATGTTAACCCATTTAACGTTTTTGCTTACATTGGTCGTATTGATCTGACTCCTCAGTCAGACGACTGGGTAGATACTAATCGTCTTCCTACCAGAGTCACCAATATGGAAGGTGATTTTAGAGCGACCCAGGAAGAATTAAACGTTGATCAGAATGGTTTTGCACCTATTCAGTGGAATGCATGGCAAACTAACTGGTCTTCTACCTCTGGTCCTGTTGCTGGTTCTACTTGGAGAGAGCATACATTTGCTAACTTCCGGCCTGGTCGTGGTCGTAGAGTTATGCAAAACACCACAACTACTACTACCACCTCTCTGTCTAGGACTGGTATTCGGACAAGAGTTGTCCCCAGAATTGATCGTCAATCTCTTGGAGATAGTCTCTTATCCTCTACAACTATTCCTTGGATTAGATCTAGAAACGTTGATGTCAATATCGTCCGTATGAAGCCTCGGACATCATTCTTTGCATTCTTCGATGGTCAAAAGATTGATGATTATCTGGTGCCAAAAGTTATTGAATTGATCAAGGATCCCACTACAGATAGTCGGACAAACTCAACTCCTTTTGTTATTGGTGAAACTGTTGTTGGTTTAACTTCTGGTTGCAGATTCAGAGTTGCTGCACCAAATGATTACTTTAAGTGGAATCCCTATGACGATACTGAGCTTCCAACATCATATTCTTCTACTACTGCATTCCTGAATATTGATACACTTTCTCTTGCAGAGCAAGCAGCAGGTGATTTCTATGGAAACATGCAGGTTGGAGAAATCCTTCAGGGTGCTTCTGGTGCAACTGCTGTTGTCCAAAATAGAAGAATTGTCACAGACAGACTTGGACAATATAGAGGATCCTTTGCTATTCCCGATCCTGGTCTGGAAACTAATCCTCGCTGGAATACTGGCACTAGAGTCATTAGATTTACAACTAACGAAAACGATTCTCGTCTTCCTGGTGCTGTTGCATCTGCTGCACAAGCAGAATATGCGGCAACTGGCACACTGAATACTGTCCAAGAAAACGTCCTTGCCATCAGAAATGCAGAAATTGTTAGAGATACTGTAAGTCAGGATCGGACGGTCAGTTCGACTCGGACAGAATCTAGACAGGTTGGTTGGTGGGATCCCCTTGCTCAATCTTTCCTGGTTGATGAAGAGGGTGGTGTATTCATTACATCCGTCTCTGTTTATTTCAACGCTAAGGATGATAACATTCCGATCTCTAT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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.