Protein

Genbank accession
CCI88821.1 [GenBank]
Protein name
phage long tail fiber proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,56
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,84
Protein sequence
MADLIKASFRATNGLDAAGEKVINVATADKTKLTDGVNVDFFFKENTIQLYDTTRGYDSGFAIIYNNRLWVSNRIIPEPAGAFQETFWTAIRTDPKWTYVDVGPVTMQSGDYISANTSVNDLVLTLPNTPNDGETIFVRDVGGNLGYKSLKINTSNQRINFRNSQITSFTATRPYSQLMFVFSNRLWQLYVGENESIGTIITPSTGMFRSQAGDIIIRRYTTSAPCQIGLPKNAVTGDIIRTIDLDGLSPQNHLIVTTFDNTSSIGTIGTHSAEFRTAGDGFLVYDASDSIWRVYDADLRTRISVVTETTDLSPNQSVIVFGDNNATSKDITLNLPTDVAFGDTVEICLSYIRHGQTVTIKANAPDLIASTKLLLQFPRRSDYPPDVSWYTSEELIFNGYDDYAPTLELAFLQDPITLDKYWVVSENIPTIERVDATNNTTRKRLGVIALASQEQANVDLENNPEKSLAITPELLANRTSTESRRGIARLASTAEVNQDSTSTFLDTVIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAETNTGTDDTTIVTPKKFAARKATTSMNGIITLVSSGAIAASDRDNPGTLVYNYNDTVKAITPATLHEARATKTTLGQLYQATETEVISAPIENPLVPLAVSPEMLHKKTATTTRIGFTQTATQAEVNAGTDNFKYVTPNTLNGRNASEILTGIAKISTQNEFDAGLLDNVISTPLKIAAHFSDVNRTEVISSSGLTQSGNLWNHYTLNILEATNVQRGTARLATQSEVDAGVEAKSIVTAATLSSKKATETTEGIIRVATQAESVAGTSSILAISPKNLKYIAQTESTWESTPLRRGFVKMTEGALTWVGNNTVGNTQDVELYAKNGYAISPYELNLTLSHYLPIEATAVNSTKFDNLASTQFIRRDINQTVDGILTLTKQLNTSAPVLSSSTGTFVDVVGTNTVNAGNSLGTASISILGKANNWKFNAVADGTTLLINDVLTLNQNGNASVKQTFNIGNRADSVNGYSVGGVVVLQNNALTTEVGNIVRPLVLKSPDASNIIADDGTQYKVLTEKNAVSLIGTSFVKKIGDTMTGRLTVNSAITVQLSEASISVIPTETTRGMWTAEVTTPAQYNLLPGYAVPVFGTNQDGSDNAIIVSYNLIKGPGTLAQFGVGTNYSYQVWNPRPTAIVPNHFARTQWIRNFNPLINGWDEWARVFTSQTPPTASDIGAVSSTGSAFNNMTVRDWLQIGNVRITPNVATRTVEFDWID
Physico‐chemical
properties
protein length:1245 AA
molecular weight: 134999,41690 Da
isoelectric point:5,17845
aromaticity:0,07470
hydropathy:-0,18956

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Yersinia phage phiR1-RT
[NCBI] 		1206558 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CCI88821.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HE956709 [NCBI]
CDS location
range 155079 -> 158816
strand +
CDS
ATGGCTGATTTGATAAAAGCCAGTTTTCGAGCTACAAATGGTCTCGATGCAGCTGGTGAAAAAGTAATTAACGTGGCAACAGCCGATAAGACCAAATTAACTGATGGCGTTAACGTTGATTTCTTCTTTAAAGAAAATACTATTCAACTTTATGATACAACTCGTGGATATGATTCAGGATTTGCTATCATTTATAATAACCGTTTATGGGTTTCTAACCGTATTATTCCTGAACCTGCTGGTGCCTTCCAGGAAACTTTTTGGACTGCTATAAGAACAGACCCAAAATGGACTTATGTTGATGTAGGTCCTGTTACAATGCAATCGGGTGATTATATTAGTGCAAATACCTCAGTTAATGATTTAGTATTAACTTTGCCTAATACGCCAAATGATGGGGAAACAATTTTTGTTCGAGATGTTGGCGGTAATTTAGGATATAAATCACTAAAAATTAATACATCTAACCAACGAATCAATTTCCGTAATAGCCAAATAACATCATTTACCGCAACTCGCCCTTATTCACAATTGATGTTTGTTTTCAGTAATAGATTATGGCAGCTTTATGTCGGTGAAAATGAATCGATTGGAACAATTATCACTCCTTCAACAGGCATGTTTCGTTCTCAAGCCGGTGATATAATTATTCGTCGTTACACAACGAGTGCGCCATGTCAGATAGGTTTGCCAAAGAATGCTGTAACAGGTGATATAATTCGTACAATAGATTTAGATGGATTAAGCCCTCAAAACCATTTAATTGTTACTACATTTGACAATACATCATCTATAGGAACAATTGGAACTCATAGCGCTGAATTCAGAACAGCCGGCGACGGTTTCTTAGTATATGATGCTTCTGATTCTATCTGGCGTGTATATGATGCAGATTTAAGAACACGCATCAGTGTAGTAACTGAAACTACCGATTTATCTCCGAACCAATCAGTTATAGTTTTTGGCGATAATAATGCTACATCTAAAGATATAACATTAAATCTTCCAACTGATGTTGCATTTGGCGATACAGTTGAAATTTGTTTAAGTTATATTCGCCATGGCCAAACTGTTACTATTAAGGCTAATGCTCCTGATTTAATAGCTTCTACTAAATTATTACTTCAGTTCCCACGTCGTTCAGATTATCCACCAGATGTTAGTTGGTATACTTCTGAAGAATTGATATTCAATGGGTATGATGATTATGCTCCGACTTTAGAATTAGCTTTCTTACAAGACCCTATTACTTTAGATAAGTATTGGGTAGTTTCAGAAAATATTCCTACAATTGAACGTGTTGATGCTACTAATAATACAACACGTAAACGTTTAGGTGTTATTGCACTAGCTTCTCAAGAACAAGCAAACGTTGATTTGGAAAATAACCCAGAAAAATCTTTGGCTATTACACCTGAATTGTTAGCTAATAGAACTTCGACTGAATCTCGACGTGGTATTGCTCGTTTAGCATCTACCGCTGAAGTTAACCAAGATTCTACTTCTACTTTCTTAGATACAGTTATTGTTACGCCTAAGAAATTAAATGAAAGAACCGCAACTGAAACACGTCGTGGTTTGGCTGAAATCGCTACCCAAGCAGAAACAAATACTGGAACTGACGATACAACAATTGTAACTCCTAAGAAATTTGCTGCTCGTAAAGCGACAACTTCTATGAATGGTATTATTACGTTAGTTAGTTCAGGCGCTATTGCTGCTTCTGATCGTGATAATCCAGGTACATTAGTTTATAATTATAACGATACTGTTAAAGCTATTACTCCAGCTACGCTTCACGAAGCGCGTGCAACGAAAACTACTTTAGGCCAATTGTATCAAGCAACTGAAACTGAAGTTATAAGTGCTCCAATAGAGAATCCACTAGTTCCATTAGCGGTTTCTCCTGAAATGCTTCATAAGAAAACTGCAACTACAACTCGTATTGGTTTTACTCAAACCGCTACTCAAGCTGAAGTTAATGCAGGAACTGATAATTTTAAGTATGTTACTCCAAATACTTTGAATGGCCGAAATGCCTCAGAGATATTAACCGGTATTGCTAAAATTTCTACACAGAATGAATTTGATGCAGGTTTATTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTGCTGCGCATTTCTCAGATGTTAACCGTACTGAAGTAATATCATCTTCCGGCCTGACCCAAAGTGGAAATCTCTGGAACCATTATACACTGAATATTCTTGAAGCAACAAATGTTCAACGTGGCACGGCAAGATTAGCTACACAATCAGAAGTTGACGCAGGCGTAGAAGCTAAATCTATTGTAACAGCAGCTACTTTGTCAAGTAAAAAAGCGACTGAAACCACCGAAGGTATAATTCGTGTGGCAACACAAGCTGAATCGGTTGCAGGCACTTCAAGTATATTAGCGATTTCTCCTAAGAACTTGAAATATATTGCTCAAACAGAATCTACTTGGGAATCAACTCCACTTCGTCGCGGTTTTGTTAAAATGACTGAAGGCGCTTTAACATGGGTTGGTAATAATACTGTAGGTAATACTCAAGATGTAGAATTATATGCAAAAAATGGTTACGCTATTTCACCGTATGAATTGAACTTGACTTTATCTCATTATTTACCTATTGAAGCTACAGCTGTCAATAGTACTAAATTTGATAACCTAGCCTCCACTCAGTTCATACGTAGGGACATTAATCAAACGGTTGATGGAATACTAACCCTTACTAAACAATTGAATACGAGTGCTCCTGTGCTCTCCAGTTCAACTGGTACTTTTGTTGATGTTGTTGGAACTAACACAGTTAATGCTGGTAATTCTTTAGGCACTGCTTCTATTTCTATTCTCGGCAAAGCCAATAATTGGAAATTTAATGCTGTTGCCGATGGCACAACTTTATTGATCAATGACGTATTAACTTTGAATCAAAATGGTAATGCTTCTGTCAAGCAAACATTTAATATTGGCAACCGTGCAGATTCAGTTAATGGCTATTCTGTTGGTGGTGTTGTTGTCTTGCAGAATAATGCTTTAACTACTGAAGTTGGTAACATTGTTCGTCCATTAGTATTGAAATCTCCCGATGCAAGTAATATTATAGCTGACGACGGAACTCAATATAAAGTATTAACAGAAAAAAATGCTGTTTCATTAATTGGCACTTCATTTGTTAAAAAAATTGGCGATACTATGACAGGACGTTTAACTGTTAATAGTGCAATAACTGTTCAGTTATCAGAAGCTTCTATAAGTGTTATTCCTACTGAAACCACACGAGGTATGTGGACTGCTGAAGTTACTACGCCGGCACAATATAATTTACTTCCTGGCTATGCTGTTCCGGTATTTGGAACCAATCAAGATGGCAGCGATAATGCTATTATTGTAAGTTATAATCTGATTAAAGGCCCTGGTACATTAGCACAGTTTGGTGTTGGAACTAATTATTCATACCAAGTATGGAACCCACGTCCAACTGCCATTGTTCCTAACCACTTTGCTCGTACTCAATGGATAAGAAACTTTAACCCGTTGATTAATGGCTGGGATGAATGGGCCCGTGTATTTACAAGTCAAACACCTCCTACTGCTTCTGATATTGGTGCTGTATCTTCTACAGGTTCTGCATTTAACAACATGACAGTTAGAGATTGGCTACAGATTGGTAATGTTCGTATTACTCCTAATGTAGCAACGCGTACTGTTGAATTTGATTGGATTGATTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.