Protein

Genbank accession
ADO19600.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,66
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYSVLSDGVNVDFFIEENTVQQYDATRGYKKNFAVINDNRIWVAQRDIAAPAGTFTPQYWLATRTDPKWETVASPTRQLSSGEFIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTIVIKDIGGNTGYNEIKVQSSNVPGQGNQKIVRFGNQFTEILISKPFSYNMLIFSNRLWQFWEAGNEERGIRIEPSSGKYRAQAADFIMRHYTTAEKITFVLPKYANQGDIVKSVDIDGLGPLYHLDVETFDESSSLGKQGQHSMEFRTTGDGFFVYNATEKLWVTWDGDNKTRLRVIRDNVKLLPNESIIVFGNDNNTSQTINIDLPTGVRPGDVVKIALNYLRKAQTVNIKASATDKIASSVQLLQFPKRSEYPPDTEWVFVDSLTFNGNISYTPVIELSYMEDTVNNVNYWVVAQNVPTIERVDSKDDLTRARLGVIALANQAQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIANTAQVNQDTTFAFQDDIIISPKKLNERTATETRRGLAEIATQQETDAGTDDTTIITPRKLQARQGSESLSGIVKYVPTTGTTPAASRITVGTNVYNKNTTTLVISPKALDQYKADQNNQGAVYLATQSEVNAGATNTGFSNSVVTPETLGARRATDSNHGLIEIATQVETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATESLSGIAEIATQSEFDTGTDDTRIATPLKIKTRLNNTARTSVIAASGLVETGTLWDHYTLNILEANETQRGTARLATQLEVNTGTDDKTIVTPLKLMSKKATEGTEGIVRIATRAETIAGTSSILAVSPVSLKWIAQSEPTWAATTTTRGFAKMSEGAITFVGNATAGSTQALDLYEKNSYAISPYELNKTLGNFLPRLAKAADSDKLDNLDSTQFVRRDIDQTVEGTLTLRKNIRIDGQLTTGGTGEFGGSLAANSTFTIRNTGASTRLIFEKGPQTGNNPFQTMNIRVWGNQFAGGSDTSRSTIFEVGDETSNHFYSQRNNLGNITFSINGTVQPINVNASGTLNANGVATFGRSVTAQGEFITYSANAFRAINGQYGFFIRNDNSNIYFMLTNANDQTGGFNGLRPLAISNTSGQVTIGESLIIAKGATINLGGLTVNSRIRSQGTKPADLYSRKPNADNTGFWSVEVNDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLNSLYQDWITYPNTANASTTRWTRTWQQNKNAWSGFVQVFDGGNPPQPSDIGALPADNASMSNLTIRDWLRIGNVRIVPDPVTKSVKFEWIDTP
Physico‐chemical
properties
protein length:1299 AA
molecular weight: 141981,20450 Da
isoelectric point:5,54722
aromaticity:0,08314
hydropathy:-0,41055

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage SP18
[NCBI] 		645664 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO19600.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GQ981382 [NCBI]
CDS location
range 151397 -> 155296
strand +
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCAGCATTCAGAGCAACATCCGGTCTCGATGCTGCTGGTGAGAAAGTCATTAATGTCGCAAAAGCTGATTACTCAGTTTTATCAGACGGCGTTAACGTAGATTTCTTTATAGAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATGCGACACGAGGATACAAAAAGAACTTTGCCGTTATTAACGATAACCGTATTTGGGTTGCTCAACGTGATATCGCGGCTCCGGCAGGGACATTTACCCCTCAGTATTGGTTAGCAACCCGTACTGACCCGAAATGGGAAACTGTTGCATCTCCAACTCGTCAGCTTAGCTCGGGTGAATTTATCGCGGTCGACTCAGCTGCAAGCTTTACCACATTTACATTGCCTCCAAACCCGACTGATGGTGATACCATCGTTATTAAAGATATCGGTGGCAATACCGGTTATAATGAAATCAAAGTTCAATCGAGCAATGTACCTGGTCAAGGTAACCAAAAGATTGTTCGTTTCGGTAACCAATTTACTGAAATATTAATCAGTAAGCCGTTCTCTTACAACATGCTTATTTTCTCCAACCGCTTATGGCAGTTCTGGGAAGCAGGTAACGAAGAACGCGGAATAAGAATTGAACCAAGCTCTGGCAAATATCGTGCACAGGCAGCAGACTTTATTATGCGCCATTACACGACCGCAGAGAAAATTACATTTGTTCTTCCTAAGTATGCTAACCAAGGCGATATTGTCAAATCAGTAGATATAGATGGATTAGGGCCATTATACCACCTGGATGTTGAAACGTTTGACGAGTCAAGTTCTCTGGGTAAACAAGGCCAACACAGTATGGAATTCCGTACTACTGGTGATGGTTTCTTCGTTTATAATGCCACCGAAAAATTGTGGGTGACCTGGGACGGTGATAATAAAACTCGTTTGCGTGTAATTCGTGACAATGTAAAATTGTTACCAAACGAAAGTATTATCGTGTTCGGTAATGATAACAACACCTCACAGACAATTAACATCGACCTTCCGACGGGTGTTCGTCCTGGTGATGTTGTTAAGATTGCTCTGAACTATCTCCGCAAGGCACAGACTGTTAATATTAAAGCTTCGGCTACTGATAAAATTGCATCTTCTGTTCAGCTGCTTCAGTTCCCGAAACGTTCGGAATATCCACCTGACACTGAATGGGTATTTGTTGACTCTTTGACTTTCAATGGTAATATAAGTTATACTCCGGTTATTGAATTAAGTTACATGGAAGATACGGTTAATAACGTTAACTACTGGGTTGTTGCTCAGAACGTTCCGACTATTGAGCGTGTTGACTCGAAGGATGATTTGACCCGTGCTCGTCTGGGTGTTATTGCATTGGCTAACCAGGCTCAGGCTAACGTTGACCATGAAAATAACCCTGAAAAAGAATTAGCAATTACCCCGCAGACTTTAGCTAACCGTGTGGCTACTGAATCACGTCGTGGTATTGCACGAATTGCTAACACTGCACAGGTGAACCAGGATACGACTTTTGCTTTCCAGGATGACATCATCATCTCTCCGAAAAAGTTAAACGAACGTACAGCTACAGAAACAAGACGTGGGCTCGCAGAAATTGCCACACAGCAAGAAACTGATGCAGGCACTGATGATACTACCATCATCACTCCGCGCAAGCTACAAGCTCGTCAGGGCTCCGAAAGCTTATCTGGTATCGTTAAGTATGTTCCTACTACCGGGACTACTCCAGCAGCAAGCCGTATAACGGTTGGGACAAACGTTTATAATAAAAATACAACCACTCTGGTAATTTCTCCGAAAGCTTTGGACCAATATAAAGCTGACCAGAATAACCAAGGTGCTGTATATCTGGCTACTCAGTCAGAAGTTAACGCGGGTGCAACAAATACAGGATTCAGTAACTCGGTCGTGACTCCGGAAACATTAGGCGCACGCAGAGCAACAGATTCAAACCATGGTTTAATCGAGATTGCAACTCAGGTTGAAACTAATGCAGGAACCGATTATACCAGAGCTGTGACTCCTAAAACGTTAAATGACCGTAAAGCAACAGAATCATTATCCGGCATAGCCGAGATTGCTACGCAATCAGAATTTGATACTGGCACTGATGATACTCGTATCGCAACGCCATTAAAAATTAAAACTAGACTTAATAATACTGCTCGTACTTCTGTTATTGCAGCAAGTGGTTTAGTAGAAACAGGGACGCTCTGGGACCATTATACGCTGAATATTCTTGAAGCAAATGAGACTCAACGTGGCACCGCACGACTGGCAACTCAACTTGAAGTTAATACCGGCACCGACGACAAAACAATCGTTACTCCGCTTAAGTTGATGTCGAAAAAAGCCACAGAAGGCACCGAAGGTATAGTTCGCATCGCTACTCGCGCAGAAACTATCGCAGGAACAAGTTCGATTCTGGCTGTTTCTCCTGTTAGTCTGAAATGGATTGCACAGTCCGAACCAACATGGGCGGCAACCACGACGACCCGCGGCTTTGCTAAGATGTCTGAAGGCGCAATTACTTTTGTCGGTAATGCAACTGCAGGTTCGACCCAGGCTCTTGACCTGTACGAGAAAAATAGCTATGCTATCTCTCCGTATGAGTTAAACAAAACCCTTGGTAACTTCCTGCCGCGTCTGGCTAAAGCAGCAGACTCGGATAAACTGGATAACCTGGATAGTACACAGTTCGTCAGGAGAGATATTGACCAGACAGTTGAAGGAACATTAACCCTTCGTAAAAACATCAGAATCGATGGCCAGTTAACTACAGGTGGTACAGGTGAGTTTGGTGGTTCTTTAGCTGCTAATTCTACATTTACTATTCGTAATACAGGTGCTTCAACTCGTTTGATATTTGAAAAAGGACCACAAACTGGAAATAACCCGTTTCAAACCATGAATATCCGAGTATGGGGTAACCAATTCGCTGGTGGTTCTGATACAAGTCGTTCTACGATATTTGAAGTTGGCGATGAAACATCCAACCATTTTTATTCTCAACGGAATAATCTTGGTAATATTACTTTTAGTATCAACGGCACAGTTCAACCGATTAACGTTAATGCATCCGGAACATTGAATGCTAATGGGGTGGCAACATTTGGACGTTCAGTGACCGCACAGGGTGAATTTATAACCTATAGTGCAAACGCATTTAGAGCTATTAATGGACAGTATGGGTTCTTTATTCGTAATGATAACTCGAACATCTATTTCATGCTTACAAATGCAAATGACCAGACTGGTGGCTTTAACGGATTAAGACCATTAGCTATTAGTAATACATCTGGCCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTTGGGTGGTTTAACGGTTAATTCAAGAATTCGTTCACAAGGTACTAAACCTGCTGACCTTTATTCGAGAAAACCTAATGCCGATAATACAGGCTTCTGGTCCGTTGAAGTTAATGATTCAGCTACATATAATCAGTTCCCGGGTTATTTCAAAATGGTCGAAAAGACTAACGAAGTAACTGGTCTGCCTTATTTGGAGCGTGGTGAAGAAGTTAAATCACCTGGCACATTGACTCAGTTTGGTAACACGCTGAATTCACTCTATCAAGACTGGATTACTTATCCGAATACTGCTAATGCAAGCACCACTCGTTGGACTCGTACATGGCAGCAGAACAAAAACGCATGGTCTGGTTTTGTTCAGGTCTTTGATGGTGGCAACCCACCTCAGCCGTCGGATATTGGTGCATTGCCTGCTGATAATGCTTCGATGAGTAACCTGACTATCAGGGATTGGTTAAGAATCGGTAACGTACGCATTGTTCCAGACCCAGTAACCAAATCCGTTAAATTTGAATGGATTGATACACCATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.