Protein
- Genbank accession
- CAB5508683.1 [GenBank]
- Protein name
- Phage tail fibers
- RBP type
-
TF
evidence: GenBank
probability: 1,0000
TSP
evidence: DepoScope
probability: 1,0000
TSP
evidence: RBPdetect
probability: 0,9377
- Protein sequence
-
MANKPTQPLFPLGLETSESSNIKGFNNSGTIEHSPGAVMTFPEDTEVTGLPSSVRYNPDSDEFEGYYENGGWLSLGGGGIRWETLPHAPSSNLLEGRGYLINNTTGASTVVLPPPTRIGDSVTICDAYGKFATYPLTVSPSGNNLYGSTEDMAITTDNVSATFTWSGPEQGWVITSGVGLGQGRVYSREIFTQILASETSAVTLNTPPTIVDVYADGKRLAESKYSLDGNVITFSPSLPASTELQVIEYTPIQLGNGGDSSSSTITWVYNGGSAIGGETEITLDVVVDDVPAIDINGSRQYKNLGFTFDPLTSKITLAQELDAEDEVVVIINGTPNIYNQIDYTLREVARVTNVKDTEVVYFSVGAVLSGYKVIYDKITQRSYFIPELPTGTTAVSLSSSAVLVHSAGSVDLGALAVSREEYVTLAGTFDSGAVINTKNELLTHTDGKYRWDGTLPKTVAAGSTPATTGGVGSGAWLSVGDATARQWVANNYINSKFEKFGSFLQGSVLTTNEQALVDSSGLFWVKYGAIQSGGYTVAPGTVPDYPDFYCVGYLTDYDWQSVTNWGADNNYSIADKIGVDAVDAINLAGYHAEKRAELFGSQQVVMVPAGTYLLDKTTLVEGTAHGLTIYRNQEVMIFLRNNVTFIGDGDATLLYVADGVVERNKENGGTKGFVVFGDGIREIQNAYVHDMLIDENGDNNLVPPLNWSGAQAHCPAVACYEGSNGVTVSGVNVKNAPGANVMVFQEAQAAFNSYNTRVENCNFYRVADAVTGNSNLIDHSSIRIHSDGYVINNVKCIQPTMSDMCTVFECHGNGIVDGCITKKARYPFLKANDGATSTSIVTFTNNVCEDAGSALVLDTVPNVTTVARFIGNTVTLRSEKQVIGYPNTAAFTTQQPSVLSSDPTTINAIIYSANNNILQKNRAADWTTEQKAANVAYDLDYFKEVVSENNTFSGFWGCVRLGKQKTGATFNSNDSFVSCGTNGSPQLSDNTAIRFTNKFANDYLVHLDEMHIKWNMTKCQFGGVLGLLQQAAGVTVGVVQFTADIKTDRWMHPALGIAPLSVQDYYFNIDVYSDVNTSEPLYGYAGIHGQINVDSPTQPYVKQFYKYKPNTQNGWWFKGILATDTTSVPDRPFGNASGDRYDVIAGASNIFGYRHNGTTWDAMKFTS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1167 AA molecular weight: 125876,39620 Da isoelectric point: 4,69430 aromaticity: 0,10197 hydropathy: -0,17772
Domains
Domains [InterPro]
IPR040775
416–481
416–481
1
1167
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Salmonella phage Se_EM1 [NCBI] |
2736930 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB5508683.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR811967.1
[NCBI]
CDS location
range 149453 -> 152956
strand +
strand +
CDS
ATGGCCAACAAACCAACACAGCCTCTTTTCCCTTTGGGTTTAGAAACTTCTGAGTCTTCGAACATAAAAGGCTTCAACAACTCCGGCACTATTGAGCATTCCCCTGGTGCCGTAATGACATTTCCTGAAGATACTGAAGTTACAGGTCTTCCATCTTCTGTGCGTTACAATCCTGATAGTGATGAATTTGAAGGTTATTACGAAAACGGTGGTTGGTTGTCTTTGGGGGGTGGTGGAATACGCTGGGAAACGCTCCCTCACGCTCCCTCTAGCAATTTGTTAGAAGGTCGTGGCTATCTCATTAATAATACCACAGGGGCATCTACAGTGGTTCTCCCTCCCCCTACGCGTATTGGGGATTCCGTTACTATTTGTGATGCTTATGGGAAATTTGCCACTTACCCATTGACCGTGTCTCCTTCTGGAAATAATTTGTATGGCTCCACTGAAGACATGGCTATAACAACTGATAACGTATCAGCAACGTTCACTTGGTCTGGACCTGAACAAGGTTGGGTTATTACATCCGGCGTCGGTCTTGGTCAAGGCCGTGTCTACAGTCGTGAAATCTTTACACAAATTTTGGCGTCTGAAACAAGTGCTGTCACTCTCAATACTCCACCAACAATCGTGGACGTGTATGCTGACGGAAAACGTCTTGCGGAATCCAAATATTCACTAGATGGGAATGTAATCACTTTCAGTCCTTCTTTGCCAGCCAGCACAGAACTTCAGGTGATTGAATATACTCCTATTCAATTGGGTAATGGCGGTGATTCTAGTTCTTCTACGATTACTTGGGTCTATAATGGGGGTTCAGCGATTGGCGGTGAAACCGAAATCACGTTAGACGTCGTTGTTGATGATGTTCCGGCCATTGATATAAACGGAAGTCGCCAGTATAAAAATCTGGGGTTCACATTCGATCCATTAACCAGTAAAATCACTCTTGCGCAAGAACTGGATGCAGAGGATGAAGTTGTTGTAATTATCAATGGAACGCCAAACATCTATAATCAAATTGATTATACTTTGCGGGAAGTGGCTCGTGTAACCAATGTTAAAGATACAGAGGTCGTTTATTTTAGTGTTGGTGCTGTGTTAAGCGGGTATAAAGTTATCTACGATAAAATAACACAGAGATCATATTTTATTCCAGAGTTACCGACTGGAACCACGGCAGTCAGCCTTAGTTCTTCGGCTGTGCTTGTACATTCTGCTGGTAGTGTTGATCTGGGCGCATTAGCTGTATCTCGTGAAGAATATGTTACCTTGGCTGGGACATTTGATTCTGGTGCTGTCATCAATACTAAAAATGAATTACTCACCCATACTGATGGAAAGTATCGTTGGGATGGTACACTTCCTAAAACTGTAGCTGCTGGCTCAACACCTGCAACAACTGGAGGCGTTGGTTCGGGAGCGTGGTTGAGTGTTGGTGATGCAACTGCCCGCCAGTGGGTAGCTAATAATTATATCAATAGTAAATTCGAGAAGTTTGGGTCTTTCTTGCAAGGTTCAGTTTTAACCACCAACGAGCAAGCTCTTGTTGATTCAAGTGGTCTTTTCTGGGTTAAATATGGTGCTATACAAAGTGGTGGTTATACAGTAGCGCCGGGAACTGTTCCAGACTATCCCGATTTTTACTGTGTTGGATATTTAACAGATTATGATTGGCAGTCTGTTACAAACTGGGGTGCTGATAACAACTATTCTATCGCAGATAAGATCGGTGTAGACGCGGTCGATGCTATAAACCTCGCAGGTTATCATGCGGAGAAACGTGCGGAACTATTCGGATCCCAGCAAGTTGTCATGGTTCCTGCTGGCACTTATCTGTTGGATAAAACGACTCTTGTGGAAGGCACGGCGCATGGTCTGACTATTTATCGTAATCAGGAAGTTATGATTTTTCTTCGCAACAACGTTACTTTCATCGGCGATGGCGACGCAACGTTACTGTATGTTGCCGATGGTGTTGTTGAGCGCAATAAGGAAAACGGGGGCACTAAAGGCTTTGTAGTTTTCGGTGATGGTATTCGTGAAATTCAGAACGCATATGTCCACGATATGCTAATTGATGAAAATGGTGACAATAACCTTGTCCCGCCATTGAACTGGTCTGGAGCACAAGCTCATTGTCCAGCAGTAGCTTGTTACGAAGGTAGTAATGGTGTGACTGTTTCTGGAGTTAACGTCAAGAATGCTCCTGGTGCAAACGTAATGGTATTCCAGGAAGCTCAGGCAGCGTTCAACAGCTACAATACGCGTGTAGAGAATTGCAACTTCTATCGCGTTGCTGACGCTGTGACTGGAAACAGTAACCTAATAGACCACTCATCAATAAGAATTCATTCCGATGGCTACGTTATAAATAACGTTAAATGTATCCAGCCAACCATGTCAGACATGTGTACGGTATTTGAGTGTCATGGTAATGGGATCGTTGATGGATGCATCACCAAAAAAGCTCGCTACCCATTCCTGAAGGCTAACGACGGTGCTACATCGACATCTATAGTCACCTTCACAAATAACGTCTGTGAGGACGCAGGTAGTGCTTTGGTTCTGGATACCGTACCTAACGTTACAACTGTTGCCAGATTTATTGGTAATACTGTAACGCTACGATCAGAAAAGCAAGTTATCGGGTATCCTAATACTGCGGCATTCACAACACAGCAGCCGTCTGTTTTGTCATCTGACCCAACCACTATTAATGCAATTATTTACTCTGCAAATAATAACATATTGCAAAAAAACAGAGCCGCAGATTGGACAACTGAACAAAAAGCTGCAAACGTTGCTTATGACCTGGACTATTTCAAAGAAGTTGTTAGTGAAAATAACACTTTCTCAGGTTTTTGGGGGTGTGTTCGCTTGGGTAAACAAAAAACAGGTGCTACTTTCAACAGCAATGACTCTTTTGTCTCTTGCGGGACCAACGGTTCACCTCAATTATCAGACAACACAGCCATAAGGTTTACCAATAAATTTGCCAACGATTATCTTGTTCACCTTGATGAAATGCATATTAAATGGAATATGACAAAATGTCAGTTTGGTGGTGTCCTGGGTTTATTGCAACAAGCAGCAGGAGTGACTGTTGGTGTTGTGCAATTCACTGCTGATATTAAAACAGATAGATGGATGCATCCAGCGCTTGGGATAGCTCCACTATCCGTACAGGATTACTACTTCAACATTGATGTATACAGTGATGTGAATACCAGTGAACCTTTATACGGATACGCTGGTATTCATGGGCAAATTAATGTTGACTCGCCAACTCAACCATATGTTAAACAATTTTACAAATACAAACCAAACACCCAGAATGGATGGTGGTTTAAAGGCATTTTAGCAACTGACACAACTTCTGTTCCTGACAGGCCTTTTGGTAATGCGTCTGGTGACAGATATGATGTTATTGCTGGGGCATCAAATATTTTCGGGTATCGACATAATGGTACAACATGGGATGCAATGAAATTTACATCATAG
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.