Protein

UniProt accession
A0A8S5SZL8 [UniProt]
Protein name
Pectate lyase
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MDFDKIKQNILNSSETSTSESESISSSELHEEFEINNFLPEFEPLKLSGKNLAQQYVSAFNTGMNVYQCLNYLQGYVYTLVTAMNETIEAWNTVVPLLEQATKEWTDEEFDYKWSILKPQVIELVTNLTIETFNKSWEELKPVVIKLAQDTTDAEFKKQWDILKPQVITLVEETTTNKFNEEWEKLKPTIIQLSTDTTIAQFNRSWEELKPKVIELSQTTTSNKFDEKWEELRPQVIELAQTTTSNKFDEKWEALQPTLTETVNNLAKTQTTTTFNEKWEELKPQVIDLAQNTTNTKFDEKWTELQPTLTETVTNLVNTNLETFKSTLWQEVTKNESFPFLLVENYGAVGDGETDDSNAFNRCFTDANNSGKYVLLGNGLYLIANKLNDLTDIYVYGLYGVKPAIKLNDNVLTDTALNCYFYNIHFLRDVKSDKSLINNFNNSQFSECNFTNIYELFSSISPKTNMFEHVLLNNCELINSHIISVSRPRYTGIVYIINNTLFYYDGTGSRLTSIISGYVGGKFIFNSCTFSKNYGGNVNELFGLVDDMEFNNCAFNVNDNANIFFIPNISNVLTQKIEFNSCNISKQNNSLVMISLYNKTIFTCVIIKHSFIALNTLFNSQNECSVWLENNRINIKPTINSGAGKVNIVEIQQKDNDASQNIFPWTTEPTPTVENNVSINSAGTGNYYVLTENEDKTIKKLDYYFKYNQVYTKGAPYYNTGQTFNGLDLTGYTVKTFMLKNNIFKLKDSDGNLIDYVYFDLNSASVSGGTAGAIHYTMVNMQFIPAVTKWTGKEEANGNLEVNTCITLILEKTSS
Physico‐chemical
properties
protein length:815 AA
molecular weight: 92954,14860 Da
isoelectric point:4,72590
aromaticity:0,11656
hydropathy:-0,37117

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Podoviridae sp. ctnWS46
[NCBI] 		2827747 Uroviricota > Caudoviricetes >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
DAF56525.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
BK032718 [NCBI]
CDS location
range 8290 -> 10737
strand -
CDS
ATGGATTTTGATAAAATAAAACAAAATATTTTAAATTCAAGTGAGACGTCAACTAGTGAAAGCGAAAGTATTTCTAGTTCAGAACTCCATGAAGAATTTGAGATCAATAACTTTTTACCGGAGTTCGAACCTTTAAAGTTATCTGGTAAAAATTTAGCCCAGCAATATGTGAGTGCATTCAATACGGGTATGAATGTTTATCAGTGTTTAAATTATTTACAGGGATACGTTTATACCTTAGTAACGGCTATGAATGAAACAATTGAGGCATGGAATACGGTAGTACCATTATTAGAGCAGGCAACTAAGGAATGGACAGACGAGGAATTTGACTATAAATGGTCAATTCTAAAACCTCAAGTTATTGAGCTTGTAACAAATTTAACGATTGAGACTTTTAATAAGTCATGGGAAGAATTAAAACCGGTAGTTATTAAGCTGGCACAGGACACAACAGACGCTGAATTTAAGAAACAATGGGATATTTTAAAACCACAGGTTATAACACTCGTTGAAGAGACAACAACAAATAAATTTAATGAGGAATGGGAAAAGTTAAAGCCTACGATCATTCAATTATCTACGGATACAACAATCGCACAATTTAATAGATCATGGGAAGAATTAAAGCCGAAAGTTATTGAATTATCACAAACTACAACAAGTAATAAATTTGATGAAAAATGGGAAGAGTTACGGCCTCAAGTTATTGAATTAGCACAAACTACAACAAGTAATAAGTTTGATGAAAAATGGGAAGCATTACAACCAACATTGACAGAAACGGTTAATAATTTAGCTAAAACACAAACAACAACAACATTCAATGAAAAATGGGAAGAATTAAAACCTCAAGTTATTGACTTAGCACAAAACACAACAAATACTAAGTTTGATGAAAAATGGACCGAGTTACAGCCAACATTAACAGAAACAGTTACTAATTTAGTTAACACGAATTTAGAAACTTTTAAAAGCACACTGTGGCAAGAAGTCACAAAAAATGAAAGTTTCCCATTTTTATTAGTAGAGAATTATGGCGCTGTAGGCGATGGTGAAACAGATGACAGCAACGCATTTAATAGGTGTTTTACAGACGCTAATAATAGTGGTAAATATGTATTATTAGGAAATGGTTTATATTTAATTGCTAATAAATTAAATGACTTAACAGATATATATGTGTATGGACTTTATGGGGTTAAACCAGCTATAAAATTAAATGACAATGTACTAACAGATACAGCGCTTAATTGTTATTTTTATAACATCCATTTTTTACGAGATGTAAAAAGTGATAAAAGTCTTATTAATAATTTTAATAATTCTCAATTTTCAGAATGTAATTTTACTAATATATACGAATTATTTAGTAGCATTTCACCGAAAACAAATATGTTTGAACATGTTTTATTAAATAATTGTGAATTGATTAATAGTCATATTATATCAGTATCACGACCAAGATACACAGGAATAGTTTACATAATTAATAACACGTTATTTTATTATGATGGTACAGGCTCACGATTAACTAGTATTATTAGTGGATATGTTGGTGGAAAATTTATATTTAATAGTTGCACATTTAGTAAAAATTATGGTGGTAATGTTAACGAACTATTTGGTTTAGTTGATGATATGGAATTTAATAATTGCGCTTTTAATGTGAATGATAACGCAAATATATTTTTTATACCAAATATTAGCAATGTACTAACTCAAAAAATAGAATTTAATAGTTGCAATATTAGTAAACAAAATAATAGTTTAGTTATGATTAGTTTGTATAATAAAACTATATTTACGTGTGTTATTATTAAACATTCGTTTATAGCTTTAAATACATTATTTAACTCACAAAATGAATGTAGTGTATGGCTAGAAAATAACAGGATAAATATTAAACCTACTATTAATAGTGGTGCAGGTAAAGTTAATATCGTTGAAATTCAACAAAAGGATAATGATGCAAGTCAAAATATTTTTCCTTGGACAACAGAGCCTACACCAACCGTTGAAAATAATGTTTCAATTAATAGTGCTGGAACGGGAAACTATTATGTTTTAACTGAAAATGAAGATAAAACAATTAAAAAATTAGATTATTATTTTAAATATAATCAAGTTTATACTAAAGGAGCACCGTATTATAATACAGGGCAAACTTTTAATGGTTTAGACTTAACGGGTTATACAGTAAAAACTTTCATGTTAAAAAATAATATTTTTAAACTTAAAGATAGTGATGGTAATTTAATTGATTATGTTTATTTTGATTTGAATAGTGCTAGTGTTTCGGGAGGTACGGCAGGCGCTATACACTACACAATGGTAAATATGCAATTTATACCAGCGGTGACAAAGTGGACAGGAAAAGAAGAAGCAAATGGAAATCTTGAAGTTAATACTTGTATCACTCTTATTTTAGAAAAAACTAGCTCATAA

Gene Ontology

Description Category Evidence (source)
GO:0044423 virion component Cellular Component IEA:UniProtKB-KW (UniProt)
GO:0016829 lyase activity Molecular Function IEA:UniProtKB-KW (UniProt)
GO:0051701 biological process involved in interaction with host Biological Process IEA:UniProtKB-ARBA (UniProt)
GO:0019058 viral life cycle Biological Process IEA:UniProtKB-ARBA (UniProt)

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.