Protein
View in Explore- Genbank accession
- UQT03570.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MAKKEKVDLGRANEYDFEESWGNDLNYNDLQPDNKSRDRNPTIRVGKTVLREMGKSTLTTTMAREILKGALPPSFSVTLENADRAALGTKELLTDVRREAGPAVREFKAAARSLNRLFPKNPFNKRLAKWGQENKQNPYSLNNINVEDAVTSRVLEEVFANQENDRLQDQADKTIDRLSELKYRQVVADSLFGIQNELSKQTAYTFNVQRAYQKKSLELRIRQLMVSRATLDVAQKSAIETSNLLRDVVKNTGLPEVVKQRQSEEYMRYAREGVFGKINQTIGEWTRNYRTNITNRAKSAVSRQIQNFQYGLETANSGLEGMEMQRELLESMGIDPLEFAAGAVGNQAALRGGRWLGRRVRNNRFLKRTDGIFQQANYLFNNRERLLSEYGSSGQSYGRWHSPVTNLLKDVLRSGYRDQGTVRATGLNGLKDSAIGFEDRKLRALEEIIPGYLSRILHSIDGIRTGDKNTPRVVYNQQRGTFTTFNESVEDTHNSLIGKDEIERQRRTMSSLLKSIDPNDSLSPQGRDAIIRELMRRGRTSAAFNPNKLMNLNVSGMSEADKDTWRKLLVERYGMTQGNDGRYSTNIFSGRNQNLNRDAGLFNYGSNQTVGIYNRAHALASTGGIEALIATGAVKFRNGRWDINPDYYGNRTDNEGVENGEGGLSGSPSQAPSISSLLSGNTGPLGAARFSQLRNYPGPSSINYSARVDNNSILDLTRRRQAEKGNGVVSAIEEQTAKLLAQLGIQQEFTHHAVGSLADNVEAIRSIIAAGGMGGGSGGGGEGTGSSTSSAARGPWWRRALSTAWRGHKAVWNATGLPFRAFNAALRKSISPAMAVGRTAMNVLTGGLTGVIGRARDRFSDVYIQGAQGFKKVISKEGFGTGRYIDQNSGKVISSIKDITGPVFDTVEQTQVLSADDVKQGLFNKDGKRLSANIFGTVGKVVAGIHNATGAPFRMATGVARGFLNTAKRLLSRMPDVYVAGEKAPRLYSSKLNAGEYYQIATGKIVRSPRDIVGDIGEMDPTTRQLRPVLLDSEIREKGIVDRSGKPIRSGYGTVGALITGGVGTAFRIGKDLLSLPWRAANGVVNMAGNALGAITGIGRRGGKGTDKQTFWLKRIYRLLANQFTGQNPLEGLGDSVEDLRSGGQGALSKLTGWARNVGKNSIDRANDIRERLSARAGSWLNRLKDNGGKAADVAKAEKVAAKTEGGWSKLIWMALSGIGAAIGGIRSGLGKFAGWIKDLPKWLALRKGADALGDIGDLAGGGRKGGILRRGGRLLGKVGRLAGRGALAAGRFALGGAGTVLRMGAAALGGLVSAPGLAIAAAVAGTGYLIYKGWQMYSNRMTPLRDYRIAQYGADVNDGESRGKILALEEAVLKKTTVMPNGGVRIGSLEFESLLESFGIELQNQRQVVEWMRWYNKRFVPVFSKNLTVLRKMDPKAKLTDADFLEPGQRPQFARETFIESSGENSPYNISASPFPGKRSVVGSGYPAKYRDIVIEKYSQQEKAYQSKKSVDQAKSTFATKPITPVQNALRNMQQQDDRAINPSTDLFYSPGDKVSIPGGITGNVQQDEMIQISNRIDDLSSIRVKTYGLNQLVKEEVNLLLVMESELIKQVQYNAKFQATFNGDMDKTFALWAPRFGINTADKEAKTNWMTWFQHRFLPAFLNFCAQAKKISPQTSPIDSWKTLKSSDLLKIANFLVGAKTEFNGNTYSVWQVLASPWPGRRMNADSSSVNDNLDSLRDQSKKEVYQEKVRTQKEIDKTTFDGKKLDDTKTGQAIKMALQNQIAVSGKYSGSAQGGNTNSYSTSYGTTGTSFENAGTSGIYGNELQHGTGTGGSVNDLPQSQGRGWAENRDLIVAAARMVGVDAGALAAMVAQESRFNPAAKNPKSSAAGFGQFIDSTWKEILPTLVKKYGVNPNATQMDPRANMLATAEYMRKNQEALGSIGRPLTAEDLYAAHFLGTGGARKMLSKSDDTDIRQAMTDYDKVSKANPEIFNGVRTVGDFRRSLSGYLNRNGGQYVDEANALSNRAASEAGDRNVGGTPTTPALPAETPTTPGATASTPTPFDPKGALPKGSTLGTPNFTGSTDTVPTITAPSTVAPEIAAAQDQRNESRELQRSSVTRRQEVVREKTKSEMSSVDFMKDSLTYQKLTSENTTGILNALLKHLKGSRTQGEDIPANSKNSDTDDLLRRTSTSGGMPEKTGGLPFDTRVTR
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2213 AA molecular weight: 241240,72330 Da isoelectric point: 9,78303 aromaticity: 0,07185 hydropathy: -0,53032
Domains
Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–1991
STR
1–1991
Coil
Unmapped
164–184
Unmapped
164–184
IPR023346
STR
1850–1971
STR
1850–1971
IPR008258
ENZ
1854–1970
ENZ
1854–1970
1
2213
Architecture
STR 1-1991 | RBD 1992-2213
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Serratia phage vB_SmaM-Kodama [NCBI] |
2943835 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Serratia marcescens [NCBI] |
615 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UQT03570.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
ON287376.1
[NCBI]
CDS location
range 100210 -> 106851
strand -
strand -
CDS
ATGGCTAAAAAAGAAAAGGTTGATCTCGGTCGTGCTAACGAATACGACTTCGAGGAAAGTTGGGGCAATGACCTCAACTATAATGACCTGCAGCCTGACAATAAAAGCAGGGATCGTAACCCGACAATTCGCGTAGGTAAAACTGTACTTCGCGAAATGGGTAAGAGTACGCTAACGACTACCATGGCGAGGGAAATCCTCAAAGGTGCGTTACCTCCCTCTTTCTCAGTCACTTTGGAAAACGCAGACCGTGCGGCGTTAGGTACCAAAGAATTACTGACCGACGTACGAAGAGAAGCAGGGCCTGCTGTACGTGAATTCAAAGCTGCTGCTCGGTCACTAAACCGATTGTTCCCTAAGAACCCATTCAACAAGCGCTTGGCTAAATGGGGACAGGAGAATAAACAGAACCCTTATTCGCTAAATAACATTAACGTAGAAGATGCTGTTACTTCTCGTGTCTTGGAAGAAGTTTTCGCTAACCAGGAAAACGATCGCTTACAAGATCAAGCGGATAAGACAATTGATCGTCTCAGTGAACTGAAATATCGTCAAGTAGTTGCGGATAGCCTTTTCGGTATCCAGAACGAACTCAGTAAACAAACCGCGTATACATTCAATGTCCAGCGTGCGTATCAAAAGAAATCGTTAGAGCTCCGTATTCGTCAGCTCATGGTTTCTCGTGCGACATTGGACGTAGCGCAGAAGTCTGCGATTGAAACGTCTAACCTGTTACGTGACGTAGTCAAGAACACCGGCTTACCTGAAGTTGTTAAACAACGTCAGAGTGAAGAGTACATGCGTTATGCGCGTGAAGGTGTCTTTGGCAAGATCAACCAGACCATTGGTGAGTGGACACGTAACTACCGCACCAACATCACTAACCGTGCTAAGAGCGCGGTATCTCGTCAGATCCAAAACTTCCAATATGGTTTAGAGACTGCTAACAGCGGTCTGGAAGGGATGGAGATGCAGCGTGAGCTGTTGGAGTCCATGGGTATTGATCCATTGGAATTCGCAGCAGGTGCGGTCGGTAACCAAGCAGCTCTGCGTGGTGGCCGTTGGTTAGGTCGTCGTGTTCGTAATAACCGTTTCCTTAAAAGGACAGACGGCATATTCCAGCAGGCTAACTATCTCTTCAATAACCGTGAACGTCTGCTTTCCGAATACGGTAGTAGCGGTCAATCATACGGCCGTTGGCATTCCCCGGTAACGAATCTCCTGAAAGACGTATTGCGTTCAGGGTACCGTGACCAGGGAACCGTAAGAGCAACTGGACTCAATGGACTGAAGGATAGTGCGATCGGTTTTGAAGATCGTAAACTCCGTGCTCTGGAAGAGATTATTCCAGGCTACCTCTCGCGGATATTACATAGTATCGATGGTATCCGTACTGGAGATAAAAATACTCCTCGCGTCGTTTACAATCAACAACGTGGTACATTCACGACATTTAACGAGTCCGTAGAAGACACGCATAATTCTCTCATCGGTAAAGATGAGATCGAACGTCAGCGTCGTACCATGTCTTCTTTATTGAAGTCGATTGACCCTAACGATTCGTTGAGTCCTCAAGGTAGGGACGCTATTATTCGTGAGCTGATGCGTCGGGGCAGAACCAGTGCTGCGTTCAACCCTAACAAGCTCATGAACTTAAACGTTTCCGGTATGTCCGAAGCCGATAAGGATACGTGGCGTAAACTCCTCGTAGAGCGCTACGGGATGACTCAGGGTAATGATGGTCGTTATTCGACTAACATCTTCTCTGGTCGTAACCAAAACCTTAACCGTGATGCTGGGTTATTCAACTACGGTTCAAACCAAACCGTTGGGATTTATAATCGTGCACATGCGTTGGCGAGTACCGGTGGAATCGAAGCATTAATTGCAACAGGCGCAGTTAAGTTCCGTAACGGTCGTTGGGATATCAATCCTGACTACTACGGTAATCGTACTGATAATGAAGGGGTTGAAAATGGTGAAGGCGGTTTATCAGGATCTCCGTCACAAGCTCCATCTATTTCGTCGTTGCTTTCTGGAAACACTGGGCCTCTTGGTGCTGCTCGTTTTAGCCAGCTTCGTAATTATCCTGGACCTAGTTCTATTAACTATTCTGCTCGGGTTGACAACAATTCGATACTTGACCTCACTCGTCGTCGACAAGCTGAGAAAGGTAACGGGGTAGTTTCTGCCATTGAAGAACAAACGGCTAAGTTGTTGGCTCAGTTGGGTATCCAACAAGAGTTCACGCATCACGCTGTAGGTTCGTTGGCTGACAACGTTGAAGCTATCCGGTCTATCATCGCCGCTGGCGGTATGGGTGGTGGTTCAGGCGGTGGTGGAGAAGGTACGGGCTCCTCTACTTCAAGTGCTGCTCGCGGTCCTTGGTGGAGACGTGCTCTCAGCACAGCATGGCGTGGGCATAAAGCAGTATGGAACGCTACTGGATTACCTTTCCGTGCATTCAATGCCGCTCTGCGCAAATCGATCTCTCCTGCTATGGCGGTAGGTCGTACTGCCATGAACGTTCTCACCGGTGGATTGACTGGTGTAATTGGTCGTGCTCGTGATCGGTTCAGTGACGTTTACATCCAAGGTGCTCAAGGATTTAAAAAGGTCATCAGTAAGGAAGGCTTCGGGACTGGTCGGTACATTGATCAGAACTCCGGTAAAGTTATTTCCTCTATTAAGGATATCACCGGTCCGGTATTTGATACCGTTGAGCAAACACAAGTTCTGAGTGCAGACGATGTCAAACAAGGTCTGTTCAATAAGGACGGTAAACGCCTCTCTGCCAATATCTTTGGTACAGTAGGTAAAGTAGTTGCCGGTATCCACAACGCAACAGGTGCTCCTTTCAGGATGGCTACTGGTGTTGCGCGCGGTTTCCTTAATACGGCCAAACGACTGCTGAGCAGAATGCCTGATGTTTACGTAGCAGGTGAGAAGGCTCCCCGGCTTTACAGCTCTAAGCTGAATGCTGGTGAATACTATCAAATCGCTACAGGCAAGATTGTTCGTAGTCCAAGGGACATTGTTGGCGACATCGGTGAGATGGATCCTACTACCCGTCAATTGCGTCCTGTACTGCTCGATAGCGAGATTCGCGAGAAGGGGATTGTAGATCGTTCAGGTAAACCTATCCGTAGCGGCTACGGTACCGTAGGGGCGTTAATTACCGGCGGTGTTGGTACTGCGTTCCGTATCGGTAAAGATCTCCTGAGTCTTCCATGGAGAGCGGCTAACGGTGTTGTAAACATGGCAGGTAATGCCCTGGGTGCAATTACTGGCATTGGTCGTCGTGGCGGTAAAGGTACCGATAAACAAACCTTCTGGCTGAAACGTATCTATCGTCTGTTAGCTAACCAATTCACTGGACAGAATCCGTTGGAAGGGTTGGGTGATAGCGTAGAGGATCTGCGTAGCGGTGGTCAAGGTGCGCTTTCCAAACTGACCGGTTGGGCACGTAATGTCGGTAAGAACTCTATCGATCGTGCTAATGACATCAGAGAACGTTTAAGTGCTCGTGCAGGTAGTTGGTTAAACCGTTTGAAAGATAACGGCGGGAAAGCTGCAGACGTAGCCAAAGCTGAGAAGGTTGCTGCTAAGACTGAGGGCGGCTGGTCTAAACTTATCTGGATGGCTCTGTCTGGTATCGGTGCTGCTATTGGCGGCATTCGTTCTGGTCTGGGTAAATTCGCAGGTTGGATCAAAGACTTGCCTAAATGGTTGGCGCTTCGTAAAGGTGCTGATGCTCTAGGTGACATCGGTGATTTGGCAGGCGGTGGTCGTAAAGGCGGTATCCTTCGTCGTGGTGGTCGTCTCTTAGGTAAGGTTGGTCGTTTGGCTGGTCGCGGTGCATTGGCAGCAGGTCGCTTTGCATTAGGTGGCGCAGGTACAGTTCTCCGTATGGGTGCAGCTGCACTCGGTGGATTAGTCTCTGCTCCTGGTCTGGCTATTGCCGCTGCTGTAGCAGGTACAGGTTACCTGATCTATAAAGGTTGGCAGATGTACAGTAACCGCATGACTCCACTTCGTGACTATCGCATTGCTCAATATGGTGCCGATGTTAACGATGGTGAATCTCGCGGTAAGATCTTGGCGTTAGAAGAAGCTGTACTCAAGAAAACGACGGTCATGCCTAACGGCGGTGTTCGTATTGGCTCTCTTGAGTTCGAGTCTCTCCTCGAGTCGTTCGGTATTGAGTTGCAAAACCAACGTCAGGTCGTAGAGTGGATGCGTTGGTACAACAAACGCTTTGTTCCGGTGTTCTCTAAGAACCTTACGGTACTCCGTAAGATGGATCCTAAAGCTAAGTTGACTGATGCTGACTTCCTCGAACCTGGACAACGACCACAGTTCGCAAGGGAAACCTTTATCGAAAGTTCTGGTGAAAACTCACCTTACAACATCTCCGCCTCACCGTTCCCTGGTAAGCGTTCTGTTGTAGGCTCTGGCTATCCGGCTAAATACCGCGATATCGTTATCGAGAAATATTCCCAGCAAGAGAAGGCGTACCAGTCGAAGAAATCTGTCGACCAAGCTAAGAGTACGTTTGCGACTAAGCCGATCACTCCTGTTCAGAATGCCCTGCGCAATATGCAACAGCAAGATGACCGTGCCATTAACCCATCAACTGATCTGTTCTACAGCCCAGGTGATAAAGTCAGTATTCCTGGCGGTATCACGGGTAACGTCCAGCAAGACGAGATGATCCAAATCTCTAACCGAATTGATGACCTCAGTTCTATCCGTGTAAAAACGTATGGTCTTAATCAATTAGTGAAAGAAGAAGTCAACTTGCTGCTGGTAATGGAATCCGAGCTGATTAAACAGGTTCAGTACAATGCTAAGTTCCAAGCTACCTTCAATGGTGACATGGATAAAACCTTCGCATTGTGGGCACCTCGGTTTGGTATCAACACCGCAGATAAGGAAGCGAAGACTAACTGGATGACTTGGTTCCAGCATCGTTTCTTACCGGCCTTCTTGAACTTCTGCGCTCAGGCTAAAAAGATTTCTCCACAGACATCTCCTATTGATTCTTGGAAAACGCTTAAGTCTAGTGATCTCTTGAAGATTGCTAACTTCCTGGTTGGCGCTAAGACTGAGTTCAATGGTAATACGTATTCTGTCTGGCAAGTACTGGCGTCTCCATGGCCAGGTCGTCGGATGAATGCGGATTCCAGTTCCGTGAACGATAACCTCGACTCGTTGAGGGATCAGTCTAAGAAAGAAGTTTATCAAGAGAAAGTCCGTACCCAGAAAGAGATCGACAAGACTACCTTTGACGGTAAGAAACTTGACGACACTAAGACGGGTCAAGCGATTAAGATGGCGTTGCAAAACCAGATTGCTGTTTCTGGCAAGTACAGTGGATCCGCTCAAGGTGGTAACACTAACTCGTACTCAACCAGTTACGGTACTACGGGCACGTCGTTCGAGAACGCTGGGACTTCAGGTATCTACGGTAATGAGTTGCAACATGGTACAGGTACTGGCGGTAGCGTAAATGACCTTCCTCAGTCCCAGGGCAGAGGTTGGGCAGAGAACCGCGATCTCATCGTGGCTGCTGCTCGGATGGTAGGTGTGGATGCCGGTGCTCTTGCTGCGATGGTTGCACAGGAGTCGAGGTTTAACCCGGCTGCCAAAAACCCTAAGTCCAGTGCCGCAGGTTTCGGTCAGTTCATCGACTCGACTTGGAAGGAAATACTCCCTACTCTGGTTAAGAAGTACGGAGTTAACCCTAACGCTACTCAGATGGATCCTCGTGCTAACATGTTAGCCACAGCTGAGTACATGCGTAAGAACCAAGAAGCTTTAGGTAGCATTGGTCGTCCATTGACTGCAGAAGACCTCTACGCTGCTCACTTCCTAGGAACGGGCGGTGCACGTAAGATGCTAAGTAAATCTGACGATACGGATATTCGTCAGGCGATGACCGACTACGATAAGGTATCTAAGGCTAACCCGGAGATCTTTAACGGTGTTAGAACGGTCGGTGATTTCCGGAGAAGTCTGTCCGGTTATCTGAACCGTAATGGTGGTCAGTACGTGGATGAAGCTAACGCTCTGTCTAATCGTGCTGCTTCCGAAGCGGGCGATCGTAACGTAGGTGGTACGCCAACTACTCCGGCGCTCCCTGCTGAAACGCCAACTACCCCTGGTGCTACTGCATCAACTCCTACCCCGTTCGATCCTAAAGGTGCCTTGCCTAAAGGTAGTACGTTGGGTACGCCTAACTTTACCGGTTCTACTGATACGGTTCCAACTATCACTGCACCGAGTACTGTGGCCCCGGAGATTGCTGCAGCGCAAGATCAGCGTAATGAAAGTCGTGAACTCCAACGCAGCTCTGTCACTCGTAGACAAGAAGTCGTGAGGGAGAAAACGAAGAGTGAGATGAGCTCTGTTGATTTTATGAAGGATTCACTCACTTATCAGAAACTGACCAGCGAAAACACCACAGGTATTCTCAATGCTCTCCTTAAGCACTTAAAAGGAAGTAGGACTCAAGGTGAAGACATCCCGGCTAACTCCAAGAACTCTGATACCGATGATTTACTTCGTCGGACATCGACTTCTGGAGGGATGCCAGAGAAGACCGGCGGTTTGCCGTTCGATACCCGAGTGACACGATAG
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
63bbc355034e7a4cb139db4b647df07d3c02839e437975803469ab37beb035f5
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50