Protein

View in Explore
Genbank accession
QJT71852.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,75
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADLTAIQFLRTSTAGKLPTAAQLHEGALAINLADRTIYTKNAAGQIIDLGFGKGGSVNGSIDATGTVKAGKLETALADLATANITTLNVTNLNNTGLTNIANSLKIYGVYGNEDTRLTLSAASNQTAPIGIYTGRSGNNNTLSIDIGSSRLATLRLSNNPTTDGYTSRFDIPSMLWLDGESRVNRNMLFRQPFNEYALDLQAGYTYSGSGDANGLNYLLKTRGHNTATPFYMIVDSRSGANEITWSSGATGPSNGIWGFGVNYFNSRKPLSVGFTGASALGDTSIAIGVNNAGLALSNNAIHTFVGGASMANVSSAGILTVLRSITGLGTGLTTNNAIFKANTDSDGNAVGDGVTHIGYKDSSGNFNHYFRGKGSTNIDTHAGLIVNYDLFVRRNASISGVLNAGTLTGSGSSTSYKGLTIENISAGWSYIELKALNAVAHIALKTEVAEGAVANSLHLRPNGQQNGSLIIQPAGQMLHLNQYGSVSIGALNGQYAHFNTSNPQFYFYKDIVSGGNFYAEGGQKVFHQGFLPTLGQLGAMPSGSALLPGNDITAYYGRQGLQVSNFAGLGGAGTNGVQLSNPVDGWHHHITLNHANSAGYYVDIAASFEGAMYIKSVSNGSHSGWARFYTTSFKPTPNDIGAISTSGNGIINGNLSASNLGVNNTSASTGYGLSLYGGANTGMPSYGISFSGTPSFGTHGSVIGDWATYFTMTGATNRGWIFKTGNGSGGNIASISASGVITASSFVGSGASLSGITASQVGAIPISGLIATGQIGGTGNGDLYTGAGIETRSSGAATPSIGFHKPGSYAGTLRMLNSTTFGFLNQDNSSYADLTVRNLTAADNVTGVALNGTTYVTGGRIFSGWDSGVVGSISCSQWFRSSGATGWFSDTYGGGIWMKDDSYVRVYAGKKFAVESGDFDSINTIGGIYAAGSISSQSNITAVGDLSTQRNVGCTGDVYARSFYGNANIGGTGSAINCPGGIYSQGTNWLYGQIITNNSPINAGSGVITGNGSGLSNLQWNNIVGKPNEVNSWINVYNSTTKQKQISVPTALINHLNNGGAADVRVLMVTDGDGQKCVQQTIFGGGVWTSGKYKADMTWSGLGNLYLHNSSSAWGATYQNKIDCRYTWITRVDYRLL
Physico‐chemical
properties
protein length:1138 AA
molecular weight: 118214,37010 Da
isoelectric point:8,42558
aromaticity:0,09402
hydropathy:-0,11230

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
QJT71852.1
1 1138
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 881 881 0,0541
Central domain 882 1080 200 0,4401
C-terminal 1081 1138 57 0,9919
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-881
Central
882-1080
C-terminal
1081-1138

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shewanella phage Thanatos-1
[NCBI] 		2734808 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QJT71852.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT457552.1 [NCBI]
CDS location
range 127601 -> 131017
strand -
CDS
ATGGCAGATTTAACCGCTATCCAGTTCCTACGAACTAGTACGGCTGGAAAGTTACCCACCGCAGCTCAGTTGCATGAAGGTGCTTTGGCTATTAACTTAGCAGACAGGACAATTTATACAAAAAATGCTGCAGGCCAAATCATTGATTTAGGTTTCGGTAAAGGTGGATCAGTAAATGGAAGTATTGATGCCACAGGCACGGTAAAAGCCGGAAAATTAGAAACAGCTTTAGCTGATTTGGCTACAGCGAATATTACTACTTTAAATGTAACCAATTTAAACAATACAGGCCTTACAAACATTGCTAATAGTTTAAAGATTTATGGTGTTTACGGTAATGAAGACACAAGATTAACTTTAAGCGCCGCATCGAATCAGACAGCACCTATTGGGATTTATACAGGACGTTCAGGTAACAATAATACTCTTTCTATAGACATCGGTTCATCTAGGCTAGCCACACTAAGATTATCTAACAATCCTACTACAGATGGCTATACATCTAGATTCGATATACCTAGTATGCTATGGCTTGACGGTGAAAGTCGTGTAAATAGAAATATGCTGTTCCGTCAACCATTCAATGAATATGCGTTAGATTTACAGGCTGGGTATACATACTCCGGCTCAGGCGATGCAAACGGTTTAAATTATTTGCTTAAAACCAGAGGCCATAATACTGCAACTCCATTTTATATGATTGTAGATTCTAGGTCTGGTGCTAATGAAATAACTTGGTCTAGTGGAGCTACAGGTCCTTCTAATGGTATCTGGGGATTTGGTGTTAATTATTTTAATAGCCGTAAACCATTAAGTGTAGGATTTACCGGAGCAAGTGCATTAGGCGATACTTCTATTGCTATTGGTGTTAATAACGCCGGTTTAGCATTATCAAATAACGCAATACATACATTTGTAGGCGGGGCCAGTATGGCCAACGTTAGCTCTGCCGGTATATTAACTGTATTGAGAAGTATTACTGGGCTAGGTACAGGATTAACAACAAATAATGCTATATTTAAAGCAAATACTGATTCTGATGGTAATGCTGTTGGTGACGGTGTAACCCATATTGGGTATAAAGACAGTTCCGGGAATTTCAATCATTATTTTAGAGGCAAAGGCTCTACAAATATAGACACCCACGCAGGGTTAATAGTAAATTATGATTTATTTGTAAGACGTAATGCTAGTATTTCGGGTGTTTTAAATGCTGGTACTTTAACTGGTTCAGGAAGTTCTACTAGTTATAAAGGTTTAACAATAGAAAATATTAGTGCAGGTTGGTCATACATAGAGCTAAAAGCATTAAATGCCGTAGCTCATATCGCACTTAAAACAGAAGTAGCTGAAGGTGCTGTGGCTAATAGTTTACATCTAAGACCTAATGGGCAGCAGAATGGGTCTTTAATTATTCAGCCTGCTGGCCAAATGCTCCATTTAAACCAGTATGGCAGTGTAAGTATAGGTGCATTAAACGGCCAGTATGCACATTTTAATACAAGTAATCCACAATTTTATTTTTATAAAGATATTGTAAGTGGTGGGAATTTCTATGCTGAAGGTGGGCAAAAAGTATTTCACCAAGGATTTTTACCTACTTTAGGTCAACTTGGTGCTATGCCTTCTGGTTCTGCTTTATTACCCGGTAATGATATTACAGCATATTACGGTAGACAAGGATTACAAGTAAGTAATTTTGCTGGTTTAGGTGGAGCAGGTACAAACGGTGTACAATTAAGCAACCCTGTTGATGGATGGCACCATCATATCACATTAAACCATGCCAATTCCGCTGGATATTACGTTGATATTGCTGCATCATTTGAAGGAGCCATGTATATAAAATCTGTGTCTAATGGTTCTCATTCAGGCTGGGCTAGATTTTACACTACATCATTTAAGCCTACGCCGAATGATATTGGTGCTATTTCAACTAGTGGTAATGGTATAATTAATGGTAATCTATCGGCTAGTAATTTAGGCGTTAATAATACGTCTGCATCTACTGGATATGGTTTATCGTTATATGGCGGTGCTAATACTGGTATGCCTAGTTATGGTATATCATTTAGTGGAACACCATCATTTGGTACACATGGTAGTGTTATTGGTGATTGGGCTACATATTTTACAATGACTGGCGCTACTAATAGAGGATGGATATTTAAAACTGGTAATGGTTCTGGTGGAAATATTGCATCTATATCAGCATCTGGTGTCATAACTGCATCTAGTTTCGTCGGTTCTGGTGCTAGTTTGTCTGGTATTACGGCTAGTCAAGTTGGTGCTATTCCTATATCGGGGCTTATTGCTACAGGCCAAATTGGTGGTACAGGTAATGGTGATTTATATACTGGTGCTGGTATAGAAACTCGTAGTTCTGGTGCTGCTACACCATCTATTGGATTCCATAAACCTGGATCTTATGCCGGCACTTTAAGGATGCTTAACTCTACTACATTTGGATTCTTGAACCAAGATAACAGTTCATATGCTGATCTAACTGTTAGAAATTTGACTGCAGCAGATAACGTCACTGGTGTTGCATTAAATGGTACTACTTATGTTACAGGTGGTCGTATATTTTCCGGTTGGGATTCTGGTGTTGTAGGGTCTATATCATGCTCCCAATGGTTTAGAAGTTCAGGTGCTACAGGTTGGTTTAGTGATACCTATGGTGGTGGTATCTGGATGAAAGATGATAGCTATGTCCGTGTGTATGCTGGAAAGAAATTTGCAGTTGAAAGTGGAGATTTTGATTCCATTAATACTATTGGTGGAATATATGCAGCTGGGTCTATATCCTCACAATCTAATATAACCGCTGTTGGAGATCTTTCTACCCAACGCAACGTAGGTTGTACTGGTGATGTGTACGCCAGAAGTTTCTACGGTAATGCTAATATAGGTGGTACTGGTAGTGCTATCAATTGTCCCGGCGGTATTTATAGCCAAGGTACTAATTGGTTATATGGTCAGATTATCACTAATAATAGCCCTATTAATGCTGGTTCTGGTGTTATTACAGGCAATGGTTCTGGATTATCTAATCTTCAATGGAATAACATTGTAGGCAAACCCAATGAAGTTAATTCATGGATTAACGTTTATAATAGTACTACAAAACAAAAGCAAATTTCAGTTCCTACTGCATTAATAAACCATCTTAATAATGGAGGAGCCGCAGATGTTCGGGTATTAATGGTAACTGACGGCGATGGTCAAAAATGTGTACAACAAACTATATTTGGTGGTGGTGTGTGGACTTCAGGCAAATATAAAGCAGATATGACCTGGAGTGGATTAGGTAATTTATATTTACATAATTCGTCTTCTGCATGGGGTGCTACTTACCAGAATAAGATAGACTGTCGATACACATGGATAACCAGAGTAGATTATAGATTATTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
8f0816dee79fa78a73815fdf92ec156aca4c583bdaea55cc73a41ddd2185efc4
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4810
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation and characterization of phage Thanatos infecting and lysing Shewanella oneidensis and promoting nascent biofilm formation Kreienbaum,M., Doerrich,A.K., Brandt,D., Leonhard,T., Hager,F., Brenzinger,S., Hahn,J., Ruwe,M., Briegel,A., Kalinowski,J. and Thormann,K.M. 2020-09-18 — GenBank