Protein
View in Explore- Genbank accession
- XNS42099.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTSPTF
- Protein sequence
-
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIALNTHGRTLAIYTKDEADNVVQLAGKGVPFLDTSGTLSVDGTTTLKDNVTISPNKAISFETTDLSGEITRHIVGKCATNDGWYIGAGGTSNNGILEIGTIDDGTETIQFVQRGAGNVEARKLVLLDGSGNTTLPGDLRLTTNKTVKINNGSTLVLEMGVGSNDVYIKNQRGVGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMNGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYVISAATAGTPRWVKVATIKHPGDASSQLDLMITGGIDSGHGRHYVDFITLSGRNLTSWSTNNLDNWVEWRRIGSPSKGNVPEYYVVKNDAATDADASFDFYAKVPRYSNGLYVTVLNTAGYNGQDSGTVIIYETNQDTGDTGPSGSILVSMKQIFDSLAKPDFGDTTGTLPVNRGGTGATSVGAARNNLGLGTAAVRDVGESAGNLLENGAYGLGGNGGKSINDIISNADMLTRLKAYGGTFWRGVTKSGVSVQNGLYSHGSGIFMNAGDTMSAINIDYASAKVRVYAANNSDLAAGNVNYNELYGTANKPSKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLTVPNLHASGPGTASVYVNAGSGNAHVWFRTGGNERGVIWATPNTADLGQINIRAKTTGDVSAGDFSFRSDGRLDVPVAVKVGGAAILTKDGNITSGSMFGGNLNNYLTSIKNDITTGDSKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPNGSMVDLGSENSDKYSRLTLARKVGSGASVAMLKITPEGYVQFGYQTAVSNPAPSKYILVKSSGLEVEGDLVFNQTYSGTEDAINITDKTNDLNNMVIKGSDLGTRLLYKCTSIGGCSNISNKPTSDGNFVLEVLSLRKISDTDWTCKQTFTTKNGNVEGTYVRYCQNGTWSAWKEVVAGVQPINLGGTGATSVAAARNNLGVGEWQSVAFGVLNVNGVSNADPAITFKNGAVVREAQGGSLGALILSASTTSPDGAKYIAFRPFGDSSGTEIRVKANESSDPLLEWSYGPGIRSNSSGAFVIYAKTGQALHLRPNGDNSNQATVIDQNGKMTVGGEFEAQNSKITGNLNVSEDNRMIVLGRNTDIGLVKKSNMPGKMAISKSNSFTVMVSTNTNNQINPADTFNDIFKVDADGNQTVYGNAQVNRQLTVSNSATVAGVINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGKLIVTGDQLKTTSLWATGDAAVNGALTVDGNVVSNYGIGSFVGAVDVKAPAADNGTTHLWFRHSNGGERGVIYMPRDNNTMMGLRAGGSEWQLHGSAGQMVGPGARWRIHPDGNIQGDVYGGYITNYINDRFNQCAQWVRTGAQQDFGPIGRPAPGKTVPAGWVLVGLNGNSNEANQNMQLIGGRLQVWKPGVQWVDSAT
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1428 AA molecular weight: 150327,22160 Da isoelectric point: 6,54969 aromaticity: 0,06863 hydropathy: -0,31618
Domains
Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–620
ATT
4–620
DC_0468
STR
484–1200
STR
484–1200
1
1428
Architecture
ATT 4-620 | STR 621-1200 | RBD 1201-1415 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Tail Spike Domain Segmentation
Tail Spike Domain Segmentation
This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.
Domain Layout
1
1428
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 780 | 780 | 0,1469 |
| Central domain | 781 | 979 | 200 | 0,2383 |
| C-terminal | 980 | 1428 | 448 | 0,7095 |
Note: Constraints were applied during segmentation.
Fixed 616 C-terminal predictions appearing before Central domain
Fixed 616 C-terminal predictions appearing before Central domain
Legend:
N-terminal
Central domain
C-terminal
3D Structure with Domain Coloring
The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).
Domain Coloring
N-terminal
1-780
1-780
Central
781-979
781-979
C-terminal
980-1428
980-1428
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Klebsiella phage vB_KpnM_Wolf_ER13 [NCBI] |
3374999 | Viruses > |
| Host |
Klebsiella pneumoniae [NCBI] |
573 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XNS42099.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP738762.1
[NCBI]
CDS location
range 76046 -> 80332
strand +
strand +
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGCGTTGAATACACATGGGCGTACTCTCGCTATCTATACCAAAGATGAAGCTGATAATGTTGTTCAGCTTGCTGGTAAAGGGGTTCCTTTCTTAGATACATCTGGAACTCTTAGCGTTGATGGAACTACTACATTAAAAGACAACGTAACTATTTCTCCGAATAAAGCAATTAGTTTTGAAACTACTGATTTGAGCGGTGAAATAACTCGTCATATCGTTGGCAAATGCGCTACTAATGATGGTTGGTACATTGGTGCCGGTGGTACAAGCAATAATGGTATTCTTGAAATCGGTACTATTGACGATGGTACTGAAACAATCCAGTTTGTACAACGCGGAGCCGGCAACGTCGAAGCCCGAAAACTTGTCTTACTTGATGGTTCTGGTAATACTACTCTTCCTGGCGATTTGAGATTAACTACTAATAAGACCGTAAAAATTAACAATGGAAGCACGCTTGTCCTTGAAATGGGTGTAGGCTCTAACGACGTCTATATTAAAAACCAACGAGGTGTAGGTGTTCTTCAATTAACTAATGACAGTAATCTGACATTCAGAAATTCACAGGTTTATTACGCCATGAACGGAAGAGGTCCTGGTAAATCCGGTACTCTTCTGACGAATGTAGAAAACAACCGTCAGGCATGGCAATACGTAATTTCTGCTGCAACCGCTGGAACTCCACGTTGGGTTAAAGTAGCTACAATTAAACACCCAGGAGATGCATCTTCACAGTTAGATTTAATGATTACTGGTGGTATTGATTCTGGGCACGGTAGACATTACGTTGATTTTATCACGTTATCTGGTCGCAATTTAACATCTTGGAGCACTAACAATTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGCAGGATTGGTTCTCCTTCTAAAGGAAACGTTCCAGAATATTACGTTGTTAAAAATGATGCCGCTACTGATGCGGATGCTTCATTTGATTTTTACGCTAAAGTTCCTCGATACAGCAATGGGCTTTATGTTACAGTGCTAAACACAGCTGGATACAACGGCCAAGATTCAGGTACAGTAATTATCTATGAAACCAATCAGGACACTGGTGATACTGGACCGTCCGGAAGTATTCTTGTTTCAATGAAACAGATTTTTGATAGTTTAGCAAAACCAGATTTCGGCGATACTACGGGTACTCTTCCAGTTAACCGTGGCGGTACAGGTGCTACTAGCGTAGGAGCAGCTCGAAATAACTTAGGTTTAGGTACTGCTGCTGTTCGGGATGTTGGTGAATCTGCTGGTAACCTTTTAGAAAATGGCGCTTATGGATTAGGTGGTAACGGTGGTAAATCCATCAACGATATTATCTCTAACGCGGATATGCTGACACGGTTAAAAGCATATGGTGGTACTTTCTGGCGAGGTGTTACTAAATCTGGTGTTAGCGTTCAAAACGGTCTTTATAGCCACGGCTCCGGTATTTTTATGAATGCTGGTGATACCATGTCAGCTATTAATATCGACTACGCTAGTGCTAAAGTTCGTGTATATGCAGCTAACAACAGTGATCTTGCCGCAGGAAATGTTAACTACAATGAGCTTTATGGTACAGCAAACAAACCATCTAAGGCTGATGTCGGACTTGGCAATCTGACAAACGATACCCAAGTCAAGAAAGCTGGCGACACCATGACTGGTGATTTAACTGTTCCTAATTTACACGCTTCCGGTCCGGGTACTGCATCAGTATATGTTAATGCAGGAAGCGGAAATGCTCATGTATGGTTTAGAACAGGAGGTAATGAGCGTGGTGTAATTTGGGCAACTCCGAATACAGCGGACTTGGGTCAGATTAATATTCGTGCAAAAACTACTGGTGATGTTTCTGCCGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGACGGCCGACTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAGTTGGTGGAGCAGCAATTCTAACCAAAGACGGGAATATTACCTCTGGTTCGATGTTTGGTGGTAACCTTAACAACTATTTGACCTCTATTAAAAATGATATCACCACTGGTGATAGTAAGCAAGTAAGCAAGACCGGTGATACTATGACCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAAGTCGAAAACCCTAATGGATCAATGGTTGATTTAGGTTCAGAGAACTCAGATAAGTATAGCAGATTGACCCTTGCACGTAAAGTTGGCTCTGGCGCTTCCGTAGCAATGCTTAAAATTACTCCTGAAGGATACGTGCAATTTGGTTATCAAACTGCGGTTTCTAATCCAGCTCCTAGTAAATATATTCTAGTTAAATCTAGCGGCCTTGAGGTAGAAGGGGACTTGGTTTTTAATCAGACATATAGCGGTACTGAAGATGCAATTAATATTACTGATAAGACTAATGACCTTAACAACATGGTTATTAAAGGCAGTGATTTAGGTACTCGTCTATTATACAAGTGTACTTCTATTGGTGGTTGTTCTAATATATCGAACAAACCTACCTCTGACGGCAACTTTGTTCTTGAAGTTCTATCTTTGCGTAAAATTTCTGATACCGATTGGACATGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAACGGTAATGTTGAAGGTACATATGTTCGATACTGTCAAAACGGTACATGGTCTGCATGGAAAGAGGTTGTTGCTGGTGTTCAACCGATTAATTTAGGTGGTACTGGAGCAACTTCTGTAGCTGCTGCTCGTAATAATCTTGGTGTTGGTGAATGGCAATCTGTGGCATTTGGTGTATTGAATGTCAACGGCGTTAGTAATGCAGACCCGGCCATCACATTTAAAAATGGGGCTGTGGTTCGTGAAGCACAAGGTGGTAGTCTCGGCGCGTTAATCCTGTCGGCTTCTACTACATCTCCAGACGGCGCGAAATATATTGCTTTTCGACCCTTCGGTGATTCGTCTGGTACTGAGATTAGAGTAAAAGCCAATGAGTCAAGTGATCCATTACTTGAGTGGTCTTATGGCCCGGGTATTCGTTCAAATTCATCTGGCGCTTTTGTTATCTACGCAAAAACAGGTCAGGCACTCCATTTAAGACCAAACGGTGATAATTCTAACCAAGCCACAGTTATTGACCAAAACGGTAAAATGACAGTCGGCGGTGAGTTCGAGGCCCAGAACTCAAAAATCACAGGCAACTTGAACGTCTCTGAAGATAACAGAATGATCGTTCTTGGCAGAAATACCGATATTGGTTTAGTCAAGAAAAGTAATATGCCAGGAAAAATGGCTATCAGTAAATCTAACTCGTTTACTGTTATGGTGTCAACCAATACCAATAATCAGATTAATCCTGCTGATACGTTTAATGATATATTCAAAGTAGATGCTGATGGAAACCAGACTGTTTACGGAAATGCCCAAGTCAACAGACAGTTAACTGTTTCTAATTCAGCTACTGTTGCAGGTGTTATTAATGCTAACGGCGGTATTATTGTTCCTACTACCAAGTATGTGCAAATTGCCGATGCTCCTACGCAGAATAACCAAGCCACCAACAAGAAATATGTTGATGATAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAATGCTGGCGACACGTATCTTCCGTTAGCGGGTGGTACTGTAACTGGTAAATTAATAGTTACGGGTGATCAACTGAAAACTACTTCTTTGTGGGCTACTGGAGACGCTGCTGTTAATGGTGCTTTAACTGTTGACGGTAATGTTGTTAGTAATTACGGTATTGGTAGCTTTGTTGGTGCTGTCGATGTTAAGGCCCCTGCCGCAGATAATGGTACAACCCACCTTTGGTTCCGACATTCTAACGGTGGTGAGCGTGGTGTGATTTATATGCCGCGTGACAATAATACCATGATGGGATTAAGAGCCGGTGGAAGTGAATGGCAATTACATGGCTCTGCAGGCCAAATGGTAGGGCCAGGCGCACGCTGGAGAATTCATCCTGATGGCAACATACAGGGTGATGTTTATGGTGGTTATATCACTAACTATATCAACGATAGGTTTAACCAATGTGCTCAATGGGTTCGTACTGGTGCTCAACAAGACTTTGGCCCAATTGGTCGACCGGCACCTGGTAAAACTGTTCCTGCTGGTTGGGTACTTGTTGGTCTTAACGGTAACAGCAACGAAGCTAACCAGAACATGCAACTTATCGGCGGACGGTTACAAGTATGGAAACCGGGCGTTCAATGGGTTGATTCTGCTACTTGA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
22f6144d8badb9dcaf7b6a9f68c23b6c2db5cdebf62a2fe89061ef78ea8ac0b0
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50