Protein

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Genbank accession

XMR01801.1 [GenBank]

Protein name

tail fiber protein

RBP type

Evidence Phold

Probability 1,00

Evidence RBPdetect2

Probability 0,96

Protein sequence

MYSIKTDLDITGGAVVGKDLLVKGDAVFNKNLTVNGTVSFANATFTAIEAATANITSTLDVAGKASLNGGVEVVGSTVIGAVAPGTDTATINSAATFNSGVSFGGNIRQTAGNVDLKATSVDSLSVDGISTFKGNINADAGTTAAFDKLSANEATIATLNATDINSTGTASFNDVTISGTLGGAFSLSDVNATTLTVSGQSSLQGAVTLGANITGNNTTATFKDVKIGANSASSAYRLSFTYTAPGQRPTVILQNEIQSELMSPASLTVLKSATFGDASLSTFGITGNGLNKLDYVTISGNAVQSPATPLLEVTKGLTKVTDFEVTGSATIPNIESTGTANFNNINVSGVLGGTFSLGDIEAQTLKVSGLTSLEGSVTLGGNISGTNTTANIKALNLGPASASADTKVGFAYTAVGQRPTVLLQNEIQSELMSPATLTVQKTATFGDASLATYGITGKGLNKLDYLEIAGNATQAPGTPQLSVAGKSVLGDVEFTGTVTGLTVDVSGQDLTPNSVTATSGIQGTTLTSTGKTTAGYLEVTGGTSLGGTLGVTGDSILDGNVTVQGQTVTVKDLVVTGTTTGVTAVADVDGLDIAPNKVDVTTTLSVAGETTLAAVNASSATISGAASAGYLTLNGASGTGLHVVSNATVGGTLGVTGAVTLGNSLGVSGKATAGSLEVTGAATVGSLTAPTISGNTTFANDVTITGTLTPSGIDLSTTDVSAASLTTTGNVTVGGSLAVSGAIDLSAADVTAKSITATNPSTFGVVNASSVVASGDVSGGTITTTGAAKVGTLTSTGVVSGSRLSSTTATISTSVTTPTVQAEAAGAGTLNLASNVVAAKDLTVTGVFTPQGGLDLSSVDITSNSITTTEGATIGGNLSVAGTVDLSGADVSALSFVSTDALKTNTFPKLSSTDSTLGAAKATTLNVSGESTVANINTSNISASGSLDVVGASTLAAVSATAIDASSVAATGAISGASFTAPGATVEISKSTNVTGDFHASGTLTAGAIDLSTTDVSVKSLNSLGNAHVAGNLTVDGTFDLSGTNLQAATLASTGNTTVGADLVLTTGVITGAPVISGNTTVGGTLGVTGTTSLAGLTAGASTLSSASVTTTLGVTGTSTLGVVQAGATSVSTLSTSGKATAASLEVTGATVAKGNVTVEGTLIPQGGLDLTGADVSANSLSSSTTLSVTGLSTLSGGISTADINATSLTASGTVGAGVLSSTGNTTVGGTLGVTGATTVADLTASGAVKTGTSFTVGTPLAVQPETVHIVPDTYIAGKLRVDGGINADIDVSGQTLEPFAIAADSTVSAVGNITSGATMIAKAATIGDSGSLNNNLTVNGNVVTNGDFTVTGVLNAQLNQADSDVAVKSLTATNNVNAGTSISAGTTITATGKITGGSLETGSTLAVTGLASLNGGVAVTGAATFSENLSVQSEISTATITTTGLATLASVAVTGSATFTGTLTANGNVVLGDAAADTITVNGTATFKENVVIDKALTVTGALNTTDADFTTSTVITKKYSVLPTSVVASTAAVAGTWTPDGSSNVYRLTLDQNTTLAPITGLIGSGEACSVYIYVTPTVSDAVLTIPAEYAVVSGQVSSVVNQVSIIQVVYDGFSTVFDTFIAQRV

Physico‐chemical properties

protein length:	1628 AA
molecular weight:	158100,98610 Da
isoelectric point:	4,20776
aromaticity:	0,03317
hydropathy:	0,32998

Domains

Domains [InterPro]

DC_0092
STR
125–330

DC_0092 DC_0092 DC_0092 DC_0931

DC_0092
STR
307–602

DC_0092 DC_0092 DC_0092 IPR058970

XMR01801.1

1 1628

Architecture

STR

RBD

STR 125-1294 | RBD 1295-1628

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Domains [InterPro]

Domain ID	Category	Cluster	Start	End	Layer	Name	Pref Zone	Confidence	Evidence	Support
DC_0092	STR	DC_0092	125	330	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	307	602	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	598	779	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	761	953	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	904	1124	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	1095	1294	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0931	RBD	DC_0931	1257	1628	Novel HMM	DC_0931	C-terminal	Low	Positional only	65 proteins / 65 hits
IPR058970	RBD	DC_0552	1539	1616	InterPro cluster	Putative phage tail fibre, C-terminal domain	C-terminal	Low	Positional only	292 proteins / 292 hits

Taxonomy

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Escherichia phage Turkey5 [NCBI]	3375711	No lineage information
Host	Escherichia coli [NCBI]	562	cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

XMR01801.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

PQ471516.1 [NCBI]

CDS location

range 149501 -> 154387
strand -

CDS

ATGTACTCGATTAAAACTGATCTAGATATTACTGGTGGTGCTGTAGTCGGTAAAGATCTATTAGTTAAAGGTGATGCAGTATTCAATAAGAATCTTACCGTAAATGGTACAGTTTCTTTTGCAAATGCTACATTCACTGCAATTGAAGCAGCAACTGCTAATATCACTTCTACCCTAGATGTAGCTGGTAAAGCATCTCTTAATGGTGGTGTTGAAGTGGTAGGTAGCACTGTGATTGGTGCAGTAGCACCAGGTACTGATACTGCTACAATTAACTCCGCAGCAACTTTTAACTCTGGTGTTTCATTTGGTGGTAATATTCGTCAAACTGCTGGTAATGTTGATTTGAAAGCAACATCTGTTGACTCACTATCAGTTGATGGAATTTCAACTTTTAAAGGTAATATTAATGCTGACGCAGGAACTACTGCTGCATTTGATAAACTATCTGCAAACGAAGCAACTATTGCAACTTTAAATGCAACCGACATTAATAGTACTGGTACAGCCAGCTTTAACGATGTTACCATAAGTGGTACACTAGGTGGTGCATTCAGTCTTTCTGATGTAAACGCAACTACCCTAACTGTGTCTGGTCAAAGTAGCCTACAGGGTGCTGTTACTCTAGGTGCGAACATCACTGGTAACAACACAACTGCAACATTTAAAGATGTCAAAATCGGTGCTAACTCCGCAAGCAGTGCTTACCGTTTAAGCTTCACTTATACCGCACCAGGCCAACGCCCAACTGTAATTCTACAAAACGAAATTCAGTCCGAGCTAATGTCACCAGCATCCCTAACTGTTCTTAAGTCTGCTACTTTTGGTGATGCATCTTTAAGTACTTTTGGTATCACTGGTAATGGTCTAAACAAATTAGATTATGTAACTATTAGTGGTAACGCAGTTCAATCACCAGCTACCCCTTTACTTGAAGTTACTAAAGGTTTAACTAAAGTAACTGATTTCGAAGTAACTGGTTCTGCTACTATTCCTAATATTGAAAGTACTGGCACTGCAAACTTCAATAACATTAACGTAAGTGGTGTTCTTGGTGGTACATTCAGTTTAGGTGATATCGAAGCACAAACACTAAAAGTATCTGGCCTAACTAGTCTTGAAGGTTCTGTAACTCTAGGTGGTAATATCAGTGGTACTAACACTACTGCAAATATTAAAGCACTAAACCTAGGTCCAGCATCTGCAAGTGCTGATACCAAAGTTGGTTTTGCTTATACTGCCGTTGGTCAACGCCCAACTGTTCTTCTACAGAACGAAATTCAATCTGAATTAATGTCTCCTGCTACATTAACTGTTCAGAAAACTGCAACCTTTGGTGATGCTTCACTAGCAACATATGGTATCACAGGTAAAGGTCTAAACAAACTAGATTATCTAGAAATCGCTGGTAACGCTACTCAAGCTCCAGGAACTCCACAACTTTCTGTTGCTGGTAAATCGGTTCTAGGTGATGTAGAATTCACAGGAACTGTTACTGGCCTAACTGTTGATGTTAGTGGGCAGGATCTAACTCCTAACTCCGTAACTGCAACGTCTGGTATTCAGGGAACAACATTAACTTCTACTGGAAAAACCACTGCTGGTTATCTAGAAGTCACTGGAGGAACGTCTCTTGGTGGAACATTAGGTGTAACTGGAGATAGTATTTTAGATGGCAATGTAACCGTACAAGGCCAAACCGTAACTGTTAAGGATCTAGTAGTAACTGGAACCACAACTGGTGTAACTGCCGTAGCCGACGTAGATGGCCTTGATATTGCTCCTAACAAAGTTGATGTAACAACAACACTAAGTGTTGCTGGTGAAACCACATTGGCTGCTGTTAATGCAAGTTCAGCAACTATATCTGGTGCTGCATCGGCAGGGTATCTAACACTAAATGGTGCATCTGGTACTGGTCTTCATGTAGTGAGTAATGCTACAGTTGGTGGTACATTAGGTGTAACTGGTGCTGTTACTTTAGGTAATTCACTAGGTGTGTCCGGTAAAGCAACTGCTGGTTCTTTAGAAGTAACTGGTGCTGCGACTGTTGGTTCACTAACTGCTCCAACTATCAGTGGAAATACTACATTTGCTAATGATGTTACTATCACTGGAACACTAACTCCAAGTGGGATTGATTTAAGTACTACTGATGTAAGTGCTGCATCTTTAACTACAACTGGAAACGTAACCGTAGGTGGTTCTCTTGCTGTATCTGGTGCAATAGATCTTAGTGCTGCTGATGTAACTGCAAAATCTATTACTGCAACTAACCCAAGTACCTTTGGTGTTGTTAACGCATCTTCTGTAGTAGCTTCCGGTGATGTATCTGGTGGAACTATCACAACTACTGGTGCTGCAAAAGTTGGAACATTGACCAGTACTGGTGTTGTTTCAGGTTCACGTTTATCTTCTACAACTGCTACAATTTCAACTTCTGTAACAACTCCTACGGTTCAAGCTGAAGCGGCTGGTGCGGGAACATTAAATCTTGCTAGTAATGTAGTAGCAGCTAAAGACCTAACCGTAACAGGTGTCTTTACCCCGCAAGGTGGTCTTGACCTAAGCTCAGTTGACATAACTTCTAACTCAATAACCACAACTGAAGGTGCTACTATCGGTGGAAACCTATCTGTAGCAGGTACTGTTGATTTAAGTGGTGCAGATGTATCTGCATTAAGTTTTGTTAGTACTGATGCATTAAAAACCAATACATTCCCTAAACTATCTTCAACCGATAGTACATTAGGTGCAGCAAAAGCAACAACATTGAATGTATCTGGGGAAAGTACTGTAGCTAATATTAATACAAGTAATATTTCTGCTTCTGGCTCACTTGATGTTGTTGGTGCTTCTACCCTTGCTGCTGTATCTGCAACTGCAATTGATGCTAGTTCTGTAGCGGCAACTGGTGCAATTAGTGGTGCATCCTTCACGGCTCCTGGTGCAACAGTTGAAATTTCAAAATCCACAAATGTTACTGGTGATTTCCATGCATCTGGTACTTTAACTGCTGGTGCAATTGATCTAAGCACTACTGATGTTTCTGTTAAGTCACTTAACTCTCTTGGTAATGCACACGTTGCAGGTAATTTAACAGTTGATGGTACATTTGACCTAAGTGGTACAAACCTACAAGCTGCAACACTAGCAAGTACTGGAAACACAACTGTTGGTGCTGATTTAGTACTAACAACTGGGGTAATTACTGGTGCTCCTGTAATCTCTGGTAATACTACCGTTGGTGGTACACTAGGCGTAACTGGTACAACATCTCTTGCTGGGCTAACTGCTGGGGCAAGTACCCTATCAAGTGCATCCGTAACAACCACTCTTGGTGTTACTGGAACCTCAACTCTTGGTGTAGTACAAGCTGGTGCAACAAGTGTTTCAACTCTATCTACCTCTGGTAAAGCAACTGCTGCGTCTTTGGAAGTAACTGGTGCAACCGTGGCAAAAGGTAACGTAACAGTTGAAGGTACATTGATTCCACAAGGTGGATTGGATCTAACTGGTGCTGATGTTTCTGCAAATAGCTTGTCTTCATCAACTACTTTAAGTGTTACTGGTTTGAGTACATTGAGTGGTGGAATATCCACAGCAGACATCAATGCAACATCATTAACTGCATCTGGAACTGTCGGGGCAGGAGTTTTATCTTCTACTGGTAATACTACAGTTGGTGGTACACTAGGTGTAACTGGAGCAACAACCGTTGCAGATCTAACTGCAAGTGGTGCAGTGAAAACTGGTACATCATTTACAGTTGGCACACCTCTAGCAGTTCAACCAGAAACAGTTCATATTGTTCCTGATACATATATTGCTGGTAAACTACGTGTTGATGGTGGTATTAACGCCGATATCGATGTAAGCGGTCAAACATTAGAACCATTCGCAATTGCGGCTGATTCAACTGTTAGTGCAGTTGGTAACATCACTTCTGGTGCAACCATGATTGCTAAAGCAGCAACAATTGGTGATTCTGGATCACTAAACAACAACCTAACCGTAAATGGTAACGTTGTAACCAACGGTGACTTCACAGTAACAGGAGTACTAAACGCACAATTGAACCAAGCGGATTCTGATGTAGCTGTTAAATCTTTAACTGCCACCAACAATGTGAATGCGGGGACTTCAATTTCTGCTGGTACAACAATTACTGCAACTGGTAAAATTACTGGTGGAAGTTTAGAAACCGGCTCTACCCTTGCAGTAACTGGACTAGCGAGTCTGAATGGTGGTGTAGCCGTAACAGGTGCAGCAACATTCTCTGAAAACTTAAGCGTTCAAAGTGAAATTTCAACTGCAACCATAACTACAACAGGTTTAGCAACACTAGCAAGTGTAGCCGTAACTGGTTCTGCAACCTTTACTGGTACATTAACCGCTAATGGTAATGTTGTTCTAGGTGATGCTGCCGCTGATACTATCACTGTTAATGGCACTGCAACCTTCAAAGAGAACGTTGTGATTGATAAAGCCCTAACTGTGACTGGTGCATTGAACACTACTGATGCTGATTTCACAACCAGTACTGTAATCACTAAGAAATACTCTGTTCTACCAACTTCTGTAGTAGCTTCTACTGCTGCTGTAGCAGGTACATGGACTCCAGATGGTTCTAGTAACGTATATCGTCTAACTCTTGACCAAAACACTACCCTAGCACCAATTACTGGTCTAATCGGTAGCGGTGAAGCATGTTCTGTATACATTTATGTAACACCAACTGTTAGTGATGCTGTTCTAACTATCCCTGCTGAATACGCAGTTGTATCTGGTCAGGTAAGTTCTGTTGTGAACCAAGTTAGTATCATTCAAGTTGTTTATGATGGTTTCAGTACTGTATTTGATACCTTCATTGCTCAACGTGTATAA

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID

3fbdabbe2c8dee2007b98baf61d5aafefb7cd14e2e845e8609681bd956e457c7

ColabFold

Source ColabFold

Method ColabFold

Resolution 0,5262

Oligomeric State monomer

Download PDB

Model Confidence

Very high
pLDDT > 90

High
90 > pLDDT > 70

Low
70 > pLDDT > 50

Very low
pLDDT < 50

Literature

Title	Authors	Date	PMID	Source
Transient expression effect of genes from a Jumbo E. coli phage	Petrzik,K. and Brazdova,S.	2023-07-26	—	GenBank

Protein

Domains

Domains [InterPro]

Domains [InterPro]

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

Predicted Aligned Error (PAE)

Model Confidence

Literature