Protein
View in Explore- Genbank accession
- WNT47152.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MAKKENHRFDDDLNFDFDEGDFGADPFNPTQNQKADRNPVTKAGGSLLRGAKDETKNLSFYKGIIKAGMPDSFTTTLDSVDDVLDLTNRSYQQAMREARPMMTQVRKIAGSLNRTIPSPFQSKIDNYLKSKDKKGLEDVQVDMEEAAVTQGVGDIFAEREEDDRKVEQAEKLVEFVNQRDYRKNVLMQLANINRQLTIQTENSLRVQRAWQHKSLEVSLRQLFVQRRTMEITQKGMEENSMLLRDVVKNTALPDIQKEQQSETMTRLTRERIYGAAQSRVADWARSNKYLRNVAQRFNNALKQRMQSFQMGLQSGADMFESVEEQMKAAKEFGIDTNQMAGEMAGGSLANKAGQWMGKNVGKRLRLDRADNFFRSVNFRKDMAGHYLSRYGKQLKRGNNRFGQWAGDILDVPFQADTTVATGRLADMDLRAGKMNVEDRKLQALEVTLPGFLSRLLQEVSAIRTGNMGDRIVFDPQKGNFTTMRESTQGLAQRVLSDDSINNAQSSLNDLIDRVGGKGITRAQRNELGKFLRNKSKDQTWGFTPEALLDPSNGMSPSLRNRLAGNLSGRYGLIEDKTTGRWKAPLGGMKGIGQLERDARSFGSFRDYAADAYTNIKSIHSLGGIEQLLEMGAVYWDDNQQTYELNPDYVENRSNAKFRQQNLRNKSILSSDRSDLTNFARSRGIVSGDVQSGPRATGASFGGGEDSEQESGLKRMMGRGKETGIARAIRDQTEALLDAYDNMPIREVQEEQADILADILDKLHAGVDTNATGMLKKGPSLLRRAGRAARAGVKAWWKIGGLPFKAANWARKKLSRPASWVGGKAWNAVKGIKNAIFDRGAKMVSDVYVQGQEGLRRALESAWIKLGKYTDVKTGKVIKSIKDITGPVINNETGEIVLTQEDFDKGLLNSMGERIKTGALGMAKSLLKGLGRFVINPVAKPLAMARTGLNAIRKMIMTPPDVYLRGQMDKPVLYGQQMFNGMYWSNSTNKVVRYIGDIDGDIYTWDKEAQQKRIVLTAQQIADPGLVDVNGKPLVGFMKKWKDRIKGGINFITKNINPMTWIRRGKNAAGKAWNGIKSVAGGVSGGLNIGGGSWNKRIYTLLWNKFNGLPLDTGLTGGAGEAVGGFFRKTGEWARDKAKNLMGFGGEKWKALTSLFGGINIRAIPTKLRHAFGFGKTKLKDRLDAEKDREGSWVNRLAAAGSAVKSRLPKRDEITGKFPWMKMVMGGFGLVTGALATIRKVFSSFGSKVLGWIPKLIKAIGNTRLGASAMDLAGNLFGRKGRIGRTIGKAVKGIGRGIGSLVRTPGKALLGGAKLAGRGALGAARLATSGVGLALRAVPMLFSPVGLAAAAAAGVGYLIYKGFKAYSGRITSVREMRLAQYGFAKQDDSDKLGRVLALEEACLKSVKWDSMGVPQLGNLNYDELMNAFEISPTAEKSRRNWAIWFVKRFRPVFLHNLKAIRDKDPKGDITDPYAGLPKGKLPDYAIASRLPDKNPDGTPGPYFVDAAPFPNMAAAIGPRLVDATINKVVAEFKKDAKKFKTEERKADGMANVKNEAFGAKGGSKMAPGMQFEAGKDRMFDSSEASKAIGNITGDVDTDRKIVAGNIIDNVTSVRMRLYGMMQLNRSQVDLLMKFEQDLIDRNIVIRNKVAEFTGDIGDIANSWAPAFGITLTDEAAMADWRMWFTKRFMPVFLNFCTRGEKWVGLKDLITKVRTAHPERQFSIAEFMSIATTEINGAKKSIWVVSSYPFPEESANTDSLIIKPIMDAMRLAIKEQAYKDQVQKDKASGKGESLAGQKARRELAGYAKANPDAARASVFGEGAGGTAIAKTNYTDEEMSGGFSSNIGEGNGGTAAGIPQVDAGAIQTMKSMDARAKALMPVFEAVSSMTGVDVATLMAFVQKESSFQPYAKAPTSSASGLMQFINSTWESYVPKLKALGFASPDKFDPAASIAAGALYIKDNAKLITKVTGKPPTLGELYLAHFMGGGGAQKVLSMDPGADWSRGMEAAAKANASIHKANPTAGALRAWAASSMEKNLDTPRRLGVSIGTSAISPSSGTFTTNTTGPVETGSAPVAPSVGGAPSSGGSAPISPAETLRAPVAPSDTGGGSNNPFPAFTADAGISRQANRQYTESVEEAHSERVIAQTNQARNRYEAESMEKTRADSNVRERIAVATESTAETIKKIHEYLTGKGSGGGNPPSNNQIKDDMLIKNASSSVSVGQKSGALPFSTSN
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2232 AA molecular weight: 243178,31360 Da isoelectric point: 9,74473 aromaticity: 0,07392 hydropathy: -0,44099
Domains
Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–1943
STR
1–1943
Coil
Unmapped
159–179
Unmapped
159–179
IPR023346
STR
1869–1999
STR
1869–1999
IPR008258
ENZ
1880–1963
ENZ
1880–1963
cd00254
ENZ
1892–1959
ENZ
1892–1959
1
2232
Architecture
STR 1-1999 | RBD 2000-2036 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Salmonella phage SPLA10 [NCBI] |
3077593 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Salmonella enterica [NCBI] |
28901 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WNT47152.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR413575.1
[NCBI]
CDS location
range 100330 -> 107028
strand +
strand +
CDS
ATGGCCAAGAAAGAAAATCATAGATTCGATGACGATTTGAATTTTGACTTTGACGAAGGTGATTTCGGAGCTGATCCGTTTAATCCTACTCAGAATCAAAAAGCAGATCGTAATCCAGTTACGAAGGCAGGCGGTTCTCTTTTACGCGGCGCGAAAGATGAAACCAAGAACCTTTCCTTTTATAAAGGTATTATAAAGGCGGGTATGCCTGATTCATTCACCACTACGCTTGATAGCGTAGATGATGTATTGGATCTGACTAACCGTTCTTATCAACAGGCGATGCGCGAAGCTCGCCCAATGATGACGCAAGTACGTAAAATAGCAGGGAGCTTAAACCGTACTATTCCTTCTCCTTTCCAATCCAAGATAGATAATTATCTTAAGTCAAAGGATAAGAAGGGACTAGAGGACGTCCAGGTCGACATGGAGGAAGCGGCTGTCACTCAGGGTGTCGGTGATATTTTTGCTGAACGTGAGGAAGATGATCGCAAAGTCGAACAAGCTGAAAAATTAGTTGAATTCGTTAACCAGCGTGACTACCGTAAAAACGTATTAATGCAATTGGCTAACATTAACCGACAACTAACCATTCAGACTGAAAACAGCTTACGCGTTCAACGTGCGTGGCAGCACAAGTCTCTGGAAGTAAGCCTACGTCAGTTGTTTGTTCAGCGGCGGACGATGGAGATCACTCAGAAGGGCATGGAAGAAAACTCCATGCTGTTACGTGATGTTGTTAAAAACACCGCGTTGCCTGATATCCAGAAAGAGCAACAATCTGAAACTATGACTCGCTTAACCCGTGAACGTATTTACGGTGCAGCGCAGAGTAGGGTAGCGGATTGGGCACGTAGTAATAAATACCTTCGTAATGTAGCTCAACGATTCAATAATGCATTGAAGCAACGTATGCAATCCTTCCAGATGGGATTACAATCCGGTGCTGACATGTTTGAATCTGTTGAAGAGCAGATGAAGGCAGCTAAAGAGTTCGGTATCGACACCAACCAGATGGCAGGGGAAATGGCAGGTGGTTCTCTTGCTAACAAAGCCGGTCAATGGATGGGTAAGAATGTCGGCAAGCGTCTTCGTTTAGACCGTGCAGACAACTTCTTCCGTTCCGTTAACTTCCGTAAAGATATGGCAGGCCATTACCTGAGTCGTTACGGTAAACAACTGAAACGCGGTAACAATCGTTTCGGTCAATGGGCTGGTGATATACTGGACGTTCCGTTCCAAGCTGATACGACAGTAGCCACGGGACGGTTAGCGGACATGGATCTCCGCGCTGGGAAGATGAACGTTGAGGATCGTAAGTTACAGGCATTGGAAGTTACATTACCTGGATTCTTAAGTCGTCTTCTTCAAGAAGTCAGTGCGATACGCACTGGTAACATGGGCGACCGCATTGTCTTTGATCCGCAAAAGGGTAACTTTACCACGATGCGCGAATCTACGCAAGGGTTAGCTCAGCGTGTATTGAGTGATGATAGCATTAATAATGCACAGAGCTCACTGAACGACTTAATAGATCGAGTGGGCGGTAAAGGTATTACTCGTGCCCAACGAAACGAATTAGGTAAGTTTTTACGCAACAAATCGAAGGACCAAACGTGGGGCTTCACTCCAGAAGCGTTGTTGGATCCTTCGAATGGAATGTCTCCTAGCTTGCGTAATCGTTTAGCTGGTAACTTGAGCGGACGTTACGGATTAATAGAAGACAAAACGACAGGTCGTTGGAAAGCACCTCTCGGTGGGATGAAAGGAATTGGTCAGTTAGAACGTGATGCAAGAAGTTTCGGGTCATTCCGTGACTATGCAGCGGATGCGTACACTAACATCAAATCTATTCACTCTCTAGGTGGGATTGAACAACTCCTGGAAATGGGTGCCGTATACTGGGATGACAATCAGCAGACCTATGAACTTAATCCTGATTATGTCGAGAACCGCAGTAATGCAAAATTCAGACAGCAGAATCTCAGAAATAAAAGCATTCTCTCATCTGACAGAAGCGACCTTACTAATTTTGCTCGGAGCAGGGGTATTGTTAGCGGGGATGTTCAGTCTGGTCCAAGGGCTACTGGCGCTTCCTTCGGCGGTGGTGAAGATAGTGAGCAGGAAAGCGGTTTAAAACGCATGATGGGGCGCGGTAAGGAAACAGGTATCGCTCGTGCTATCCGCGATCAAACTGAAGCGTTGTTGGATGCCTACGACAACATGCCTATTCGCGAGGTTCAAGAAGAGCAAGCGGATATCTTAGCGGACATTCTGGATAAGCTCCATGCTGGCGTTGATACTAACGCTACCGGGATGTTGAAGAAAGGTCCTAGTTTATTACGCCGGGCGGGTCGCGCGGCAAGAGCTGGGGTTAAGGCATGGTGGAAGATTGGCGGACTGCCATTCAAGGCGGCTAACTGGGCAAGAAAAAAATTGTCTCGTCCTGCTAGCTGGGTAGGAGGTAAAGCATGGAACGCCGTTAAAGGGATTAAAAACGCGATCTTTGATCGTGGCGCTAAAATGGTTAGCGACGTTTACGTACAGGGCCAAGAAGGGTTGCGCAGAGCCTTAGAGTCAGCTTGGATTAAGTTGGGTAAATACACTGACGTTAAGACAGGTAAAGTCATTAAGTCTATCAAGGATATTACCGGTCCTGTTATCAATAATGAGACTGGTGAGATAGTGTTAACGCAGGAGGACTTCGATAAAGGATTATTGAACTCCATGGGCGAGCGTATTAAGACAGGTGCGTTAGGGATGGCTAAAAGTCTTCTGAAAGGCTTAGGTCGTTTTGTAATTAACCCTGTAGCAAAACCTTTGGCGATGGCACGTACTGGTCTGAACGCCATACGTAAAATGATCATGACTCCTCCTGATGTATATCTCCGTGGGCAAATGGACAAACCTGTTCTTTACGGGCAGCAGATGTTCAATGGAATGTACTGGAGTAACTCTACTAATAAAGTTGTTCGTTACATCGGTGATATCGATGGCGACATTTATACCTGGGATAAGGAAGCACAGCAAAAGCGTATCGTGTTAACTGCTCAACAGATCGCTGACCCAGGATTAGTAGATGTAAATGGTAAGCCGCTTGTTGGTTTCATGAAGAAATGGAAAGACCGTATTAAAGGCGGTATAAACTTCATTACCAAAAACATTAACCCAATGACTTGGATACGCCGTGGTAAAAATGCGGCGGGTAAAGCATGGAACGGAATCAAGTCTGTAGCGGGTGGTGTATCAGGCGGATTAAATATCGGCGGAGGTAGCTGGAACAAACGCATCTATACCTTGCTCTGGAATAAATTCAACGGTCTTCCTCTAGATACCGGGTTAACCGGCGGAGCTGGAGAGGCTGTAGGCGGATTCTTCCGTAAGACAGGGGAATGGGCGAGGGACAAGGCTAAGAACCTTATGGGGTTCGGTGGAGAGAAATGGAAAGCTCTAACAAGTCTGTTTGGCGGGATTAACATTCGTGCTATTCCTACTAAACTTCGTCATGCGTTCGGGTTCGGTAAGACCAAACTGAAGGATCGGTTAGATGCTGAGAAAGATCGTGAGGGGTCTTGGGTAAATAGATTGGCTGCTGCTGGTTCGGCAGTGAAGAGTCGTTTACCTAAACGTGATGAAATAACCGGTAAGTTCCCTTGGATGAAGATGGTGATGGGCGGGTTTGGTTTAGTGACAGGTGCGCTGGCTACTATCCGTAAAGTCTTCTCTTCGTTCGGCTCTAAAGTATTGGGATGGATTCCTAAACTAATTAAAGCCATTGGGAATACCAGACTGGGTGCAAGTGCTATGGATTTAGCAGGTAACTTGTTTGGTCGGAAGGGGCGTATCGGTCGAACGATCGGTAAAGCAGTTAAGGGAATTGGTCGAGGAATTGGATCGCTGGTCCGAACTCCTGGTAAAGCGTTGTTAGGCGGGGCGAAGTTAGCGGGTCGTGGTGCGTTAGGAGCTGCGCGACTAGCAACTAGCGGTGTAGGTTTAGCATTACGTGCTGTCCCGATGCTGTTTAGTCCTGTCGGGTTAGCAGCTGCTGCGGCTGCGGGTGTAGGGTACTTGATCTATAAAGGCTTTAAAGCATACTCTGGTCGTATTACGTCTGTACGTGAAATGCGTTTAGCGCAATACGGGTTCGCTAAGCAAGATGATTCAGATAAACTGGGTCGTGTACTGGCATTAGAGGAAGCGTGCCTGAAATCAGTCAAGTGGGATTCCATGGGAGTTCCTCAGCTCGGTAACCTGAACTATGATGAACTCATGAACGCATTCGAGATCTCGCCTACTGCGGAGAAATCTCGTCGTAATTGGGCTATCTGGTTTGTCAAGCGTTTCCGGCCTGTGTTCTTACACAACCTGAAAGCTATCCGTGATAAGGATCCGAAAGGAGACATTACCGATCCGTACGCAGGATTACCAAAAGGTAAACTTCCTGATTACGCTATCGCTTCTCGTCTTCCGGATAAAAACCCAGATGGAACGCCTGGACCTTACTTCGTGGATGCGGCTCCATTCCCTAACATGGCCGCTGCAATAGGACCACGACTTGTTGATGCTACTATTAACAAGGTAGTTGCCGAGTTTAAGAAAGACGCTAAGAAGTTCAAAACTGAAGAACGTAAAGCTGATGGAATGGCTAATGTTAAGAACGAAGCATTCGGTGCTAAGGGTGGTAGTAAGATGGCCCCTGGTATGCAGTTCGAAGCTGGCAAAGATCGGATGTTCGATTCTTCAGAGGCGTCTAAGGCAATTGGGAATATCACAGGTGACGTAGACACTGACCGTAAGATCGTTGCTGGTAACATCATCGATAACGTAACGTCTGTGCGTATGCGCTTGTACGGTATGATGCAACTCAACCGTAGTCAAGTAGACCTGCTGATGAAGTTTGAGCAAGACCTCATTGATCGTAATATTGTTATCCGTAACAAGGTAGCAGAATTCACCGGCGATATCGGTGATATTGCGAACTCTTGGGCTCCGGCGTTCGG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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
a2e65bbf9e1b1185e2509541ec5c57b03420deae4416414da45b3e5f43c85d71
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Collateral sensitivity increases the efficacy of a rationally designed bacteriophage cocktail to control Salmonella enterica | Acton,L.J. | 2024-03-19 | — | GenBank |