Protein
- Genbank accession
- DBA51958.1 [GenBank]
- Protein name
- TPA_asm: ORF42 [Nitrosopumilaceae spindle-shaped virus]
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MTELPNNGGTTPVDFTDNELLLHGFETVSATPTYTADLSTSSWTTGGTGTQVTIDTTNEEIDFSVPSTNSHLAQAYYDLTTVSNTNWIIRSQLDIDTVTQGSAVNDVFFSHGIGSINSNINDSQDFLGLMIRVDNTKTDIFAVETDGSAPNNETTTLFTRQAQAETLYVEMKRDSATSFTINLYSDSGYSTLLESKTITIPSSLTGLRYIKVTSIQGFSDSELIGSVSNIKFYNDMTTTTEDIIPDKSTNNISVTANAGTTTTGQISDAISTPNLEVTSSLLPDATDSFTVGSWVKQALTRDSTLDGTQIGGVTTSATGKVDSYAWDFDGSNDYVDLPSNPFDNSNSYTLSTWVNTDTNTEDNIFFKTGDGSNGDQFFGMNSAGKFYCVSYGTGTTVDDIYDSATSSVGVWYHVACVRDSTANTLTLYVNGVQKAQDTSLVTSGAGYFTNTDHFIGARLTSGTAFWNGQIDQTLTYSRALSSSEISSIYNSGSGTTTVPTTNLVMSYNFEQTGSTLENQIYNPPTNTKLFGFTNSNGGAVFNVGTTSANFVKLATAPSYSTNFGTSTGWTVTDSEISIDTANNRIYYNGDLDTTDTSAYYDYYTSQGANLQTWTVDIDITKISNNNLSHRTEFLITDTLGGVGVAQNAIGITTQANNNMNCRYYDGTATSTDIGTHTTSNGVTNYVRLSYDGTTFTCDLMNSSRTSVSLSHSATVSGVDMSNARYIIISDRDNTNSSVNNVVIEFENLAVTPTNSMESTIISATGLTDNTSDFQHYALTRDGSSWTLYQNGQSVATATDSTDLGTVSGSHKINLDGAIDEYFIDSTALTSNEIQTVYDMGTEPTQIATTGTTPSYDDSGVVGGNTYYYYVKSTNAVGDSGFSAQATGLAGTPPDAPTGLSATIQNTATAPRDVFLQWSAPTNVGSGTLTGFEIWRDGSLVTTVGLISSYVDIVPTAGTYTYTVKAVSTHGTSVDSNSAQVTTPNLPDAPQGLTLSIDNPDPNPLTVTVTVSPPLNDGGSAVGSYNIYTSSDDVTYTLQASNVSNPSNITVPSAGVWYFKASAVNGVGEGNLSPSNLIGTPTVPSAVSDLAFTSSTPTTLSVNWTAPDNGGSAITTYKMFVDGIQVDTTTFTTYTFTGLTTKTNYDFTVVTTNNVGDSNSSNTLNETVWGVPDAVTNLTASSTLSSITLNYDAAVPYGYPVTGYKLERESPVGGGFTVLSANIGIVTTYTDTGLSPVVEYNYRITPLSSIGDGVSATINYTTLPPAPTGLTASSTITGNMDLSWTAPSPSTGVTGYHIQRADGVGNAYATIVADTGNTNTTYTDTGLTQGIVYVYRVAAITPFGESNYSNTYSMTTYYLPNAVTDLTVTTNNLLQFVLNWSQPTLYGTFTGYQLNYTTPAGVPQTIYSSSIQDTNTKISGFDPTVEFSFRVAPITIHGTNATGNIVTGQVTSQIEIGDITVSGQATPDTRDIVFTMESLDNTTNVITATFDPALELNCEISQPALGTTQEYPSISETLDGVDAYHEFTINNSAGNIVEIDCHDTTDNTITASYTLRTDEVGNNTTDSIISIQQIKDFTDGTLGGSDSIGGVSLIILAVGIIGMIGFNRTHPAIGIGMFVVVMGGARYFNLIGDIEGIIGIIALIIVLGVAGAERITR
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1656 AA molecular weight: 175596,52080 Da isoelectric point: 4,05003 aromaticity: 0,09058 hydropathy: -0,16479
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
DBA51958.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
BK067787.1
[NCBI]
CDS location
range 24588 -> 29558
strand -
strand -
CDS
ATGACCGAACTACCAAACAATGGTGGTACAACACCAGTTGACTTTACTGATAATGAATTGTTGTTACATGGATTTGAAACAGTTTCAGCAACACCAACATATACTGCTGACCTGTCAACGAGTTCATGGACAACTGGTGGAACTGGAACACAAGTAACCATAGATACAACAAATGAAGAAATTGATTTTTCAGTACCGTCAACCAATTCACATTTAGCACAAGCATATTATGATTTGACAACTGTTTCAAATACTAACTGGATAATTCGTTCACAGTTAGACATTGATACAGTTACACAAGGTAGTGCTGTCAATGATGTTTTCTTTTCACATGGAATTGGAAGTATAAATAGCAACATCAATGATTCACAAGACTTTTTGGGATTGATGATTAGAGTTGATAATACAAAGACTGACATATTTGCAGTAGAAACTGACGGTTCAGCACCTAACAATGAAACAACAACATTGTTTACAAGACAAGCACAAGCAGAAACACTTTATGTTGAAATGAAAAGAGATTCAGCAACATCTTTTACAATTAATCTTTATTCTGATTCAGGATATTCAACATTATTAGAGTCAAAAACAATAACAATTCCGTCTAGTCTTACAGGATTACGGTATATCAAAGTGACCAGTATACAAGGATTTTCTGATTCAGAATTAATCGGTTCAGTTTCTAATATCAAATTCTATAATGATATGACTACCACAACAGAAGATATAATTCCAGATAAATCAACTAACAATATTTCAGTTACAGCAAATGCTGGAACAACAACCACAGGTCAAATCTCTGACGCAATTTCCACACCAAACCTCGAAGTAACATCTAGCCTATTGCCTGACGCTACTGATTCATTTACGGTTGGTAGTTGGGTGAAACAAGCATTGACTAGAGATTCAACTTTAGACGGTACACAAATTGGTGGGGTAACAACAAGTGCAACAGGCAAAGTAGATTCCTATGCTTGGGATTTTGACGGAAGTAATGATTATGTAGATTTACCCTCAAACCCATTTGATAATTCAAACTCATATACACTTTCAACATGGGTAAATACCGATACTAATACTGAAGATAATATATTCTTTAAAACAGGCGACGGTAGTAATGGTGATCAATTTTTTGGAATGAATAGTGCAGGGAAATTCTATTGTGTTTCTTATGGTACAGGTACTACGGTAGATGATATTTATGATTCAGCCACATCTAGTGTAGGGGTTTGGTATCATGTAGCGTGTGTTAGAGATTCAACAGCAAATACATTAACATTGTACGTTAATGGTGTACAAAAAGCTCAAGATACATCATTAGTGACAAGTGGTGCAGGGTACTTTACAAACACTGATCATTTTATTGGTGCACGATTAACATCTGGAACGGCTTTTTGGAATGGTCAAATTGATCAAACATTAACATATTCAAGAGCATTATCAAGTTCTGAAATTTCTTCAATTTATAATTCAGGCAGTGGTACAACCACAGTACCAACTACTAATTTAGTGATGAGTTATAATTTTGAACAAACAGGTTCAACTTTAGAAAACCAAATTTACAACCCACCAACCAACACCAAACTATTCGGATTCACAAATTCAAATGGTGGTGCCGTTTTCAATGTTGGAACAACAAGTGCAAATTTTGTTAAACTAGCAACTGCACCATCATACTCAACTAACTTTGGAACTTCAACTGGCTGGACTGTAACTGATTCAGAAATAAGTATCGATACTGCAAATAATAGAATTTATTATAATGGGGATTTGGACACAACTGACACTTCTGCATATTATGATTACTATACAAGTCAAGGTGCTAACTTGCAAACATGGACAGTTGATATTGATATTACAAAAATAAGTAATAACAATCTCTCACACAGAACTGAGTTCTTAATCACTGACACACTTGGTGGGGTTGGTGTAGCTCAAAATGCAATCGGTATAACCACACAGGCAAATAATAATATGAATTGTAGATATTATGACGGAACAGCAACCTCAACTGATATTGGCACTCATACAACAAGTAACGGTGTAACAAATTATGTTAGACTATCTTATGACGGAACAACTTTTACCTGTGATTTGATGAACAGTTCAAGAACAAGTGTCAGTCTTTCACATTCAGCAACAGTGTCAGGTGTTGATATGTCAAACGCTAGATACATCATCATTTCTGATAGAGATAACACAAATTCTTCTGTTAATAATGTTGTAATTGAATTTGAAAACTTGGCAGTTACACCAACAAACAGTATGGAATCAACAATCATCTCAGCCACAGGTCTAACTGACAACACTTCAGATTTCCAACACTATGCACTCACTCGTGATGGCTCATCATGGACACTATACCAAAACGGACAATCAGTAGCAACAGCAACTGATTCAACTGATTTGGGTACAGTTTCAGGTAGTCATAAAATTAACTTAGACGGTGCAATAGATGAATACTTTATCGATTCCACCGCATTAACTTCAAATGAAATTCAAACTGTTTATGACATGGGAACTGAGCCAACACAAATTGCAACAACTGGAACAACCCCAAGTTATGATGATTCGGGTGTTGTTGGTGGTAACACTTACTACTATTATGTAAAATCCACTAACGCCGTTGGTGATTCTGGCTTTTCAGCACAAGCCACAGGTTTAGCTGGTACGCCCCCTGACGCACCAACTGGATTAAGTGCAACAATCCAAAACACAGCCACAGCACCTAGAGATGTTTTCCTACAATGGTCAGCACCAACGAATGTTGGTAGTGGAACTCTTACAGGCTTTGAGATTTGGCGTGACGGTTCTTTGGTAACAACAGTTGGGCTAATTTCAAGTTATGTGGATATTGTACCAACAGCCGGTACTTACACATACACCGTTAAGGCAGTATCAACTCATGGTACTTCTGTTGATTCAAATTCTGCACAAGTTACAACACCAAACCTACCTGACGCACCACAAGGATTGACACTCTCAATCGACAACCCTGATCCAAACCCCTTAACCGTAACCGTTACCGTATCACCCCCACTAAATGACGGTGGTAGTGCTGTTGGAAGTTACAATATTTACACTTCAAGTGATGATGTTACATATACCCTACAAGCAAGTAACGTCAGTAACCCATCAAACATCACAGTACCAAGTGCAGGGGTATGGTACTTTAAAGCGTCAGCCGTTAACGGTGTAGGTGAGGGTAATCTATCACCTAGTAATTTGATTGGTACTCCAACAGTACCTAGTGCTGTTTCTGATTTGGCATTTACTTCTAGCACTCCAACAACATTATCTGTAAATTGGACAGCACCGGATAACGGAGGTTCAGCCATCACGACTTACAAGATGTTTGTTGATGGGATACAGGTTGACACTACAACATTTACCACATACACTTTCACAGGATTAACCACTAAAACAAATTATGACTTTACCGTAGTTACAACAAATAACGTTGGAGATTCAAACTCATCCAATACATTAAACGAAACTGTATGGGGTGTACCTGACGCTGTAACAAACCTTACAGCCTCATCCACACTATCATCAATCACTCTAAATTATGACGCTGCTGTTCCTTATGGCTATCCTGTAACCGGATACAAACTTGAAAGAGAATCTCCGGTTGGAGGAGGCTTTACTGTCTTATCTGCAAACATTGGAATCGTTACAACATACACCGACACAGGACTATCACCTGTGGTTGAGTACAATTACCGTATCACGCCATTGTCTAGCATTGGGGATGGTGTTTCGGCAACAATCAATTACACAACTTTGCCTCCAGCTCCAACAGGGTTGACAGCTTCATCAACCATAACCGGTAACATGGATTTGAGTTGGACAGCACCATCCCCATCTACCGGTGTAACCGGCTATCACATACAGAGGGCTGACGGTGTTGGTAATGCTTATGCCACAATAGTAGCCGACACCGGTAACACAAATACAACATATACTGATACCGGATTGACACAAGGCATAGTCTATGTTTATCGTGTGGCTGCAATCACACCATTTGGAGAGTCAAACTATTCCAACACCTATTCCATGACAACATATTATCTTCCTAACGCTGTAACTGATTTGACAGTAACCACAAACAACTTGCTTCAGTTTGTCCTTAATTGGAGTCAACCAACTCTCTATGGTACTTTCACAGGATACCAACTAAACTATACAACCCCTGCCGGTGTACCTCAAACGATTTACTCTAGTAGCATACAGGATACTAACACAAAGATTTCAGGCTTTGATCCTACCGTAGAGTTTTCATTTAGAGTAGCACCAATTACAATTCATGGAACAAATGCAACGGGTAATATTGTAACCGGACAGGTTACAAGCCAAATTGAGATTGGAGATATTACAGTATCCGGTCAAGCTACTCCTGACACTAGAGACATTGTTTTCACAATGGAGTCATTAGACAATACTACTAATGTTATTACTGCAACATTTGATCCGGCTTTAGAATTAAACTGTGAGATTAGTCAACCGGCATTAGGAACAACACAAGAATACCCATCAATATCAGAGACACTTGACGGTGTTGACGCTTATCACGAATTTACAATTAACAATTCAGCCGGTAACATAGTTGAGATTGATTGCCATGATACAACCGATAACACAATAACAGCCTCATACACTCTTAGAACTGATGAGGTAGGGAATAATACAACTGACTCTATAATTTCAATTCAACAAATCAAGGACTTTACTGATGGTACACTTGGAGGAAGTGATAGTATTGGAGGTGTCAGTTTGATAATTTTGGCTGTTGGTATTATAGGTATGATTGGATTTAACAGAACCCATCCGGCAATAGGAATCGGTATGTTTGTTGTAGTTATGGGAGGAGCTAGATACTTTAATCTGATTGGAGATATTGAGGGAATAATAGGTATCATAGCTTTGATAATTGTGTTAGGCGTAGCCGGTGCAGAGAGGATCACTAGATGA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.