Protein

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Genbank accession
XQU63094.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MSTYNDKINLINQNIKKNEQRKISGEILQSVLKGMLDENAATVDGVDVDGNVYTQDQIDKMTALRYIDETIATDIVQKINLISGVSFNYREETMWYDGTPLTDARVDGDIYHKANNKYYRKTVPDDFIPKIDNIANLRIFNAYFEGQEIMLLGYTSPGDKNIVRYKFTVSNYNTLVDDGGSIIKTDRGTWIAQFGEVLDARDFGFFPVPFIPDSSNFTSQQALFERVRDFCVINKKELVLAPGNYCINIFRTGLGVGQMKIKITCNGIANVYLKYTTSPTMVQIWDDAYLENIYFYSLEADLNNQRGSVENRSNIYLKNIGFFDFKNPTNGNAWGLYHKNCSNIVLDSCIFGGNTQSDIAVVDGVNGLTIINPLNNVDGGVYLNIEPNTNIINRNIQLQGGHYRRVNLLTNTITENPIQNMSIIGCEIDWLMYDGADVDIIGSQVKLITNQDFVTAPMGALDMSLRMGDNLIKDPYMVDYDYASTDRFWKYSFSSSLQTNRVDKYFTRIGDRATSATTVLKTDFIPVNPTKKYLFAVNGRGNYFGSTINNISRFCRVRLYDSSFNPIVITKPVAGVPTNFDYITVSAFRFPTGTTGTTEFINQVTILEFLQYAPTTAYIVLEVGKFSSNTNEYDLKYLSLNEITGYEKGEDIGSYISRNMPNGKYMITGTPPDNATANRTSGFKTGDILQNNTGGTFLILDGSVRPAIYRSLTDSIIKIDTISRLRTFDSYEGQIIELLGYYVAGDKNAILYKYTTLNYSSYTDNGGSIIKTTKGTWLAQFNGIIDARDFGCSASLADNSTMFNTLIANSAANEVSIRGLNLKFTNSITINLRAKIVGSAVRATIFDFIGLPASSYGLRIASSAAVNGLEISNITIIGNASITAGDPTNNCLWLNTSNNSAFAVTDSVFKNLRIEGFNIGCRSNYAWCNIFNNVRFQNTSEPLQLNAQTNNTKFDRCSFASFKRALKHTNCEGITYDTCNFTDFNIGLAPDATQSFMSLSQSNVVIINSYWEKLFNGVLAVGGSSEDPNVRSSITSIGGKVTDDTVRVRINGNDNKITLKGLNNKLSRDTFVFENADNTLAPINYIRELYVDNDQYSKNNVIVKFDGNQAWTFGTYGGGASNSITVNKGSKTVQMNGGVNTGFRVTNSLVANEYYTLIYIINKRVATGSLRIHHGTDYQVLNIQNLGDNYEVRYVPFKSMATNLDLACTVVGDTFDIRYLMIVKGTYIPNAFEKIDMPVSNGIPSTVGEDFVNGDLIKDSVLGDTYYTLASGVWKAVRLVGRNESGQVKVNYTGLQITGFTANTAVQFNIGAATPTIVASPTTKYPNSTPNNYAGFFDTARNGGTTTFAGRLIENPIVGQAHRWRVQGSYSGKITSPPNTQMLYIRLRNPASGFTVIWNTAIPPDQSSGNFTLDFISIADNASIPSPNGYILDAIYTATDTGLSVSFASITRFSDAIEP
Physico‐chemical
properties
protein length:1459 AA
molecular weight: 161433,54730 Da
isoelectric point:5,61680
aromaticity:0,10966
hydropathy:-0,20267

Domains

Domains [InterPro]
Coil
Unmapped
1–21
Coil DC_2004
DC_2004
STR
6–430
DC_2004
XQU63094.1
1 1459
Architecture
STR
STR
STR 6-430 | STR 635-978 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XQU63094.1
1 1459
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 206 206 0,9937
Central domain 207 484 279 0,9849
C-terminal 485 1459 974 0,3435
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-206
Central
207-484
C-terminal
485-1459

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Chryseobacterium phage MA9V-3
[NCBI] 		3410970 No lineage information
Host Chryseobacterium sp. MA9
[NCBI] 		2966625 Bacteroidota > Flavobacteriia > Flavobacteriales > Weeksellaceae > Chryseobacterium >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XQU63094.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV245944 [NCBI]
CDS location
range 89216 -> 93595
strand -
CDS
ATGAGCACTTATAACGATAAAATTAATCTGATTAATCAGAATATTAAAAAAAATGAGCAAAGAAAGATTAGTGGAGAAATTCTTCAATCAGTTTTAAAAGGAATGTTGGATGAAAATGCAGCTACAGTAGATGGGGTAGATGTAGATGGGAATGTATATACTCAAGATCAAATTGACAAAATGACTGCCCTAAGATACATTGATGAAACGATAGCTACAGATATTGTTCAAAAAATCAATCTAATCTCAGGGGTAAGTTTTAATTATAGAGAGGAGACTATGTGGTATGACGGTACTCCTTTAACAGACGCTAGAGTAGATGGTGATATCTATCATAAAGCTAATAATAAATATTATCGCAAAACAGTTCCGGATGATTTTATTCCAAAGATAGACAACATTGCAAATCTTCGTATTTTTAATGCATATTTTGAAGGACAAGAAATTATGCTTTTAGGCTACACAAGTCCTGGAGATAAAAATATTGTACGTTATAAATTTACGGTTTCAAATTATAATACTTTAGTAGATGATGGAGGCTCGATTATTAAAACAGATAGAGGTACCTGGATCGCTCAATTTGGAGAAGTACTTGATGCAAGAGACTTTGGCTTTTTCCCCGTTCCTTTTATTCCTGATTCTAGCAACTTTACATCGCAACAGGCTTTATTTGAAAGGGTAAGAGATTTCTGTGTTATTAATAAGAAGGAATTAGTATTGGCGCCAGGTAATTATTGTATTAATATTTTTAGAACTGGACTGGGAGTTGGACAGATGAAAATAAAGATAACTTGCAATGGAATAGCAAATGTTTATCTTAAATATACTACATCGCCTACTATGGTTCAAATATGGGATGATGCTTATTTAGAAAATATATATTTTTATTCATTAGAAGCTGATTTAAATAATCAAAGAGGTTCTGTAGAAAATAGAAGTAACATATATTTGAAAAATATAGGATTCTTTGATTTTAAAAATCCTACAAATGGAAATGCTTGGGGATTATATCATAAGAATTGCTCTAATATAGTTCTAGATTCTTGCATTTTTGGAGGAAATACTCAAAGCGATATAGCTGTAGTAGATGGAGTTAATGGACTTACTATCATTAATCCATTAAACAATGTTGATGGAGGTGTTTATTTAAATATAGAGCCAAATACAAATATTATAAACAGAAACATTCAACTTCAAGGAGGACATTATAGAAGGGTTAATTTGCTTACAAATACTATCACAGAAAACCCCATACAAAATATGTCTATCATCGGCTGTGAAATTGATTGGCTTATGTATGATGGCGCGGATGTAGATATTATTGGATCTCAAGTTAAGTTGATAACCAACCAAGACTTTGTAACAGCTCCTATGGGAGCGTTAGATATGTCTTTAAGAATGGGCGATAATTTAATTAAAGATCCTTATATGGTAGATTATGATTACGCTTCAACCGATCGTTTTTGGAAATATAGTTTTTCCTCTTCCTTACAAACGAATAGAGTAGATAAATATTTTACACGAATAGGCGATAGAGCTACATCAGCTACAACAGTATTAAAGACTGATTTTATACCTGTAAATCCTACAAAAAAATATTTATTTGCTGTAAATGGTAGAGGTAATTATTTTGGATCAACGATAAATAATATATCACGTTTCTGTCGTGTTAGATTATATGATTCATCATTTAATCCTATCGTAATTACAAAGCCAGTAGCAGGAGTTCCTACAAATTTTGATTATATAACAGTAAGTGCTTTTAGATTTCCTACCGGAACTACCGGAACTACAGAGTTTATTAATCAGGTAACAATTCTTGAGTTTTTACAGTATGCACCAACGACTGCATATATAGTTTTAGAAGTAGGGAAGTTTAGTTCAAATACAAATGAATATGACTTAAAATATCTTTCTTTGAATGAAATTACTGGATATGAAAAAGGAGAAGATATTGGATCGTATATTTCAAGGAATATGCCTAATGGGAAATATATGATTACTGGAACACCTCCAGACAATGCAACTGCAAATAGAACTAGTGGATTTAAAACAGGAGATATTCTACAAAATAATACAGGAGGAACATTTTTAATTTTAGATGGATCAGTAAGACCAGCTATATATCGAAGTTTAACTGACTCTATTATTAAGATAGATACTATTAGTAGATTAAGAACTTTTGATAGTTATGAAGGACAGATAATCGAATTATTAGGTTATTATGTAGCTGGAGATAAGAACGCAATTCTATATAAATATACAACTTTAAATTATTCTTCTTACACTGATAATGGAGGCTCTATCATAAAGACTACAAAAGGAACTTGGTTAGCTCAATTCAATGGCATTATAGATGCAAGAGATTTTGGATGCTCTGCGTCGTTAGCAGATAACTCTACTATGTTTAATACTTTAATTGCAAATAGTGCTGCAAATGAAGTATCGATAAGAGGATTAAACTTGAAGTTTACTAATTCTATCACTATTAATCTAAGAGCAAAAATTGTAGGGAGCGCAGTAAGAGCAACTATCTTTGATTTTATTGGCCTACCTGCTTCTAGTTATGGATTAAGAATAGCCTCCTCTGCAGCAGTTAATGGTTTGGAAATATCCAATATAACCATTATAGGAAATGCAAGTATAACAGCAGGAGATCCTACAAACAATTGCCTCTGGTTAAATACTTCGAACAACAGTGCTTTTGCTGTGACGGATTCTGTATTTAAAAATCTTAGAATAGAAGGATTTAATATCGGATGTAGATCGAACTATGCTTGGTGTAATATATTTAACAATGTTAGGTTTCAAAATACTAGTGAACCTCTTCAATTAAATGCGCAAACAAATAATACTAAGTTCGATAGATGTTCATTTGCTTCTTTTAAAAGAGCATTAAAACATACAAACTGTGAGGGTATTACATATGATACTTGTAACTTTACAGACTTTAATATCGGATTGGCACCTGATGCTACTCAATCTTTTATGTCTTTATCTCAAAGTAATGTAGTTATAATTAACTCTTATTGGGAAAAATTATTCAATGGTGTATTAGCAGTAGGAGGAAGTTCAGAAGATCCTAATGTTAGATCGTCTATAACTTCTATAGGAGGCAAAGTAACAGACGATACTGTGAGAGTGAGGATTAATGGTAACGATAATAAAATTACCTTAAAAGGACTTAATAATAAGTTAAGCAGAGATACATTCGTTTTTGAAAATGCTGACAATACATTAGCGCCTATTAACTACATAAGAGAACTCTATGTAGATAATGATCAATATTCTAAGAATAACGTTATTGTAAAGTTTGATGGAAATCAAGCATGGACATTTGGAACATATGGAGGTGGAGCATCAAATAGTATTACAGTTAATAAAGGCTCCAAAACAGTTCAGATGAATGGGGGAGTAAATACTGGATTTAGAGTTACTAATAGTCTCGTTGCTAATGAATATTATACACTTATATATATCATTAATAAAAGAGTTGCTACAGGAAGTCTACGCATACATCATGGAACAGATTATCAAGTATTGAATATTCAAAACTTAGGAGATAATTATGAAGTTAGATATGTTCCATTCAAGTCTATGGCTACCAATCTAGACTTAGCTTGTACTGTAGTTGGCGATACCTTTGATATACGTTACTTAATGATAGTAAAAGGAACTTATATTCCAAACGCTTTCGAAAAGATAGATATGCCTGTTTCTAATGGAATACCATCAACAGTAGGAGAAGATTTTGTTAATGGTGATCTTATTAAAGATTCTGTTCTAGGAGATACTTATTATACATTAGCTTCGGGAGTTTGGAAAGCAGTCAGACTGGTAGGAAGAAACGAATCTGGTCAAGTTAAAGTAAATTATACAGGATTACAAATTACAGGATTTACAGCTAATACAGCTGTGCAATTTAATATTGGAGCAGCAACTCCAACGATAGTAGCTTCGCCAACTACAAAATATCCCAATAGTACACCTAATAATTATGCAGGATTTTTTGATACAGCAAGAAATGGAGGAACAACCACTTTTGCAGGAAGATTAATAGAGAATCCTATTGTAGGACAAGCTCATCGATGGAGAGTGCAAGGTTCATATTCAGGGAAAATAACAAGTCCACCTAATACTCAAATGTTGTATATTAGATTAAGAAATCCAGCGAGTGGGTTTACTGTAATTTGGAATACAGCAATTCCACCTGATCAAAGTTCAGGAAATTTTACTTTAGACTTTATATCTATTGCAGATAATGCATCTATTCCATCTCCTAACGGATACATTCTTGATGCTATATATACCGCAACGGATACGGGATTAAGTGTCAGCTTTGCAAGTATAACGAGATTTTCAGACGCAATAGAGCCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6cf1b5105fe1e8f08e1f77a547c0372708207448508d61aef23ad84827161bb6
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6663
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50