Protein

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Genbank accession
YP_009210007.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,74
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATLKAIQFKRSKTAGAKPTVDQLVEGELAINLRDRTIYTKTDQNQIIDLGFAKGGQVDGDILQNGTFNLNGNMFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWSNQHLNKAPIFADLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVNEGSFKFHYIDETGQSKYWTFARSGNFQVDSGNLLVSGGYLVAQNNIETRTGSLIGPSVVTKNISFDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGEENGINYLRKVRAKSGGTIYHEIASAQTGKNDEISWWNGNTPTTKLMGLRNDGAMVLRRSLAIGTITADENTNNYGSPTPLGERYIALGDAATGLKYIKQGVYDLVGNWNSVASITPDSFRSTRKGLFGRSEDQGTTWIMPGINAALLSVQTQADVNNAGDGQTHIGYNSGGKMSHYFRGKGQTNINTQEGMELNPGILKLVTGANNVQFYADGTISSIQPVKLDNELFLNSSNNTAGLKLGAPSKVDGSRTIQWNAGTRAGQNKSYLTMKAWGNAFDSTAGERETVFELYDGQGYHFYSQRLAPTGSETVGTLQFRISGALRVGGGIISAGSIVTESSLVANNGLSVNGQAKFGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEAALHIIPTPKDAGESGGISNLRPLSISLNNGMVQMRHSVTLGDDGAGGNMITVDNDGKLVVVTSHSRISPNYNMQLGQNAYIDIEATEGARPAGWGSFASQNDANVRAPIYMNIDRAATSEYLPIIKQRYVQGDSTYSMGTLISRGDFRIHYHQGNSTTGTDLSWEFRRDGDFRASGKIIAGSVTLDHDGNITGGSGNFANLNSTIESLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPAGYALMTGQPFDKSTYPKLAVAYPSGTIPDMRGQTIKGKPSGRAVLSAEADGIKSHNHSASASNTDLGTKTTSSFDYGTKTTSSFDYGTKTSNTTGNHNHTVSGTTAAAGNHQHARSGPQVQGGIPTSVFYDGYNTVGPNGNAKFTATVSGATASSNMAKTSTEGNHTHTWSGTTSATGNHAHTVGIGAHTHTVGIGAHSHSVAIGSHGHTITVNSTGNTENTVKNIAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1067 AA
molecular weight: 113619,27350 Da
isoelectric point:8,56129
aromaticity:0,08341
hydropathy:-0,42081

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–1065
DC_0538
IPR048390
ATT
503–626
IPR048390 IPR051934
SSF88874
STR
809–936
SSF88874 SSF88874
IPR037053
ATT
815–868
IPR037053
IPR011083
ATT
820–867
IPR011083
YP_009210007.1
1 1067
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 1-502 | ATT 503-626 | STR 627-814 | ATT 815-868 | STR 869-1066 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_VR25
[NCBI] 		1567028 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Tevenvirinae > Gaprivervirus
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009210007.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_028925 [NCBI]
CDS location
range 156885 -> 160088
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAAGCGATACAATTTAAAAGAAGTAAGACAGCTGGTGCCAAGCCTACTGTAGACCAGTTGGTTGAAGGTGAACTGGCTATTAACTTACGCGACCGCACGATTTATACCAAAACCGACCAGAACCAGATTATCGACCTTGGATTTGCTAAAGGTGGTCAGGTTGATGGTGATATTCTCCAGAACGGCACATTTAACCTCAATGGTAATATGTTCGTTTACGCTGGTAAGTATATTGAATTCCTGCCTAAAACTGCCGGTAATGGCGCATGGTCCAACCAGCACTTGAATAAAGCTCCTATCTTTGCAGATTTAAGTTCAACTACCTCAGTATCAGAATACCATCCTCTGATTAAGCAACGTTATAAAGACGGTACTTTTTCTGCCGGTACATTAGTAAATGAAGGTAGTTTTAAATTCCATTATATTGATGAAACTGGTCAATCTAAATATTGGACATTTGCGCGCTCAGGTAATTTTCAAGTTGATTCTGGTAATTTATTAGTATCTGGTGGGTATTTAGTCGCTCAGAATAATATTGAAACAAGAACAGGTTCTTTGATTGGTCCATCTGTTGTAACTAAAAATATTTCATTTGATACAAAAGCGTTCGGACAATACGATTCGCAGTCATTAGTTCAATATGTTTATCCTGGAACAGGTGAAGAAAATGGTATAAACTATCTTCGTAAAGTTCGAGCTAAATCAGGTGGAACCATTTACCATGAAATCGCTTCAGCTCAAACTGGTAAGAATGATGAAATTTCTTGGTGGAATGGAAATACACCTACTACTAAATTAATGGGTCTTCGTAATGATGGCGCCATGGTATTACGTCGTTCACTTGCTATTGGCACAATTACTGCTGACGAAAATACTAACAACTACGGCTCTCCTACTCCATTGGGAGAAAGATATATTGCTTTGGGCGATGCTGCCACTGGTTTAAAATACATTAAGCAGGGCGTTTATGATTTAGTAGGTAATTGGAATTCTGTCGCATCTATTACACCTGACAGTTTCCGCAGTACTCGCAAAGGTTTATTTGGACGTTCAGAAGACCAAGGCACTACATGGATTATGCCTGGAATCAACGCCGCTCTTTTATCAGTCCAAACTCAGGCTGATGTGAATAACGCAGGTGATGGTCAGACGCATATTGGCTATAACTCTGGTGGAAAAATGTCACATTATTTCCGCGGTAAAGGTCAAACGAATATTAACACTCAAGAAGGCATGGAACTTAATCCAGGTATTCTTAAACTGGTAACCGGTGCAAATAATGTACAATTTTATGCTGACGGCACTATTTCTTCTATCCAACCTGTTAAATTAGACAACGAATTATTTTTAAATAGTTCTAATAATACTGCAGGCCTTAAACTTGGTGCCCCTAGCAAAGTTGATGGCTCGAGAACTATCCAGTGGAACGCCGGGACCCGTGCAGGACAAAATAAAAGTTATCTGACTATGAAAGCTTGGGGTAATGCATTCGACTCCACTGCCGGCGAACGCGAAACTGTATTTGAATTGTATGACGGCCAGGGCTATCATTTTTATTCTCAACGTTTAGCTCCGACGGGTTCTGAAACTGTCGGTACTCTTCAATTCAGAATTTCTGGCGCTTTACGTGTAGGTGGCGGTATTATATCGGCAGGTTCTATTGTTACTGAATCAAGTTTAGTTGCAAATAATGGATTATCTGTAAACGGACAAGCTAAATTCGGTGGAACAGCAGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATACGGTGCTATTTTCCGTCGTTCAGAAGCAGCATTGCATATTATTCCAACTCCTAAAGACGCTGGTGAAAGCGGTGGAATAAGTAATCTCCGTCCATTAAGTATCAGCCTTAATAATGGTATGGTGCAAATGCGACATTCTGTTACGTTAGGCGATGATGGAGCTGGCGGTAATATGATTACTGTGGACAATGACGGTAAACTTGTTGTTGTTACGAGTCATAGTCGCATTTCTCCTAATTATAATATGCAATTAGGACAAAATGCTTATATAGATATTGAGGCTACTGAAGGTGCACGCCCGGCGGGTTGGGGTTCATTTGCATCTCAGAACGATGCAAATGTCAGGGCTCCGATTTATATGAATATAGACCGTGCCGCTACTTCTGAATATCTCCCTATTATCAAACAACGTTACGTACAGGGCGATAGTACTTATTCTATGGGCACCTTAATTTCTCGAGGAGACTTCCGCATCCATTATCACCAAGGTAATAGTACTACCGGCACTGATTTAAGCTGGGAATTCCGCCGCGACGGTGATTTCCGCGCTTCGGGTAAAATTATTGCCGGTTCTGTTACTCTTGACCATGATGGTAACATCACAGGTGGTTCTGGTAATTTTGCTAACTTGAACAGTACAATTGAATCACTTAAAACCGATATTGTATCAAGCTATCCAATTGGTGCTCCTATTCCATGGCCAACAGATACTCCTCCTGCGGGTTATGCTTTAATGACGGGTCAGCCCTTTGACAAGAGCACATATCCCAAGCTTGCCGTTGCTTATCCATCAGGTACTATTCCGGATATGCGTGGACAAACTATTAAGGGTAAACCGAGTGGTCGTGCCGTGCTGAGTGCGGAAGCTGATGGTATTAAGTCTCATAATCATAGTGCTTCTGCATCTAATACTGATTTGGGTACTAAAACCACATCAAGCTTTGATTATGGTACTAAAACCACATCAAGCTTTGATTATGGTACTAAGACCAGTAATACCACTGGTAACCATAACCATACAGTAAGTGGAACTACTGCCGCTGCAGGTAACCACCAACACGCGCGTTCAGGTCCTCAGGTACAAGGCGGCATACCCACTAGCGTATTCTATGACGGATACAATACTGTAGGTCCAAACGGCAACGCTAAATTCACTGCAACCGTGAGCGGTGCTACTGCATCGTCGAATATGGCCAAAACATCAACAGAAGGTAACCATACTCATACTTGGTCAGGTACTACTAGCGCTACGGGTAACCATGCTCATACTGTAGGTATCGGTGCTCACACTCACACTGTAGGTATCGGTGCCCACTCGCATTCAGTAGCGATTGGTTCGCACGGACATACTATCACTGTAAATAGTACAGGTAATACAGAAAACACGGTTAAAAACATTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
90968bd6fafd79f8775c223c384215920b031aed5d837967859003e3d7803034
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5252
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
VR bacteriophages - a small but diverse group of low-temperature viruses Kaliniene,L., Meskys,R., Simoliunas,E., Zajanckauskaite,A. and Truncaite,L. 2015-03-10 — GenBank