Protein

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Genbank accession
QXV80029.1 [GenBank]
Protein name
tape measure protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,78
Protein sequence
MTDKLIRELLIDVKQKGATRTAKSIENVSDALENAAAASELTNEQLSKMPKTLYSIERAADRAAKSLTNMQASRGMLSITKSIDGIGDKLDYLAIQLIEVTDKLEAGFDGVSRSVKAMGNDVAAATEKVQDRLYDTNRVLGGTTRGFNDTAGAAGRASRAIGNTSGSARGATRDFAAMAKVGGGLPLLYAAFASNVYVLQTAFESLKVGDQLNRLEQFGTIVGTITGTPVQSLARSLQEAAGYAISFEEAMRQASSASAYGFDAEQLNKFGLVARRAAAVLGVDMTDALNRVIKGVSKQEIELLDELGVTIRLNDAYADYVKQLNAANTGITYNINSLTTFQKQQAYANAVIAESTKRFGYLDEVLRATPWEQFAANADAALRTVQQAAAKYLGPVIDAINTVFYTSQASVSAEAARAQEQTNKQIDPTNVGAVALSLAASEEGYNKALDMYRESLDKRNKLKSEFDKRMSQADASTAAAIRLVGEGMPVGLAAGGFEVGGLRIGSSEANKKFVEETAAMGLQIARLSKEVDDSTENLNAWKSAYQAAGAAAAKANPEFQKQINLHRDTTDPDAVYDFNSTVLKGLTEQQKAYNQTKKTASDLANDFQNIASSTDTAAKTSAAFEGVIRNVESLSAGTGKSADEYVKNLNLGFNTLSEMKTASQALSEYVKLTGNETKNQLAVQQKIADVYNKTKDKEKAQEAGRRLELQQLEEQEAALRRVLQTNQGNKAVEKEIEKIQLEKLKLTNQGMEAQKKVKDYTDKILGVDREIALLNNRTMTDTQYRLAQLNLELTVEKEKYEWYTKQADKQKEAEQSRRAQAQIEREIWKFRQDQIASMAAGREEEQQRQFTAKPLMGNAERLQEQLKLYEDLKQKTLGNAVAQAEYNKKIAETRAQLAGLRAQRDAEMQQQVGSSVGAVYTPTTGLSGEDKDFADMQNRMASYDQAISKLSELNSEATAVAQSMGNLTNSMIQFSQGSLDTTSMIASGMQTVASMIQYSTSQQVSAIDQAIAAEQKRDGKSEASKAKLKKLEAEKLKIQQDAAKKQIIIQTAVAVMQAATAVPYPFSIPLMVAAGLAGALALAQASSASGMSSIADSGADTTQYLALGERQKNVDVSMQASSGELSYLRGDKGIGNANSFVPRAEGGMMYPGVSYQMGEHGTEVITPMVPMKATPNDQLSEGSRSSSGRPIILNISTMDAASFRDFASNNSTAFRDAVELALNENGTTLKSLGNS
Physico‐chemical
properties
protein length:1235 AA
molecular weight: 133376,17120 Da
isoelectric point:5,65124
aromaticity:0,05668
hydropathy:-0,42308

Domains

Domains [InterPro]
IPR056207
TAS
1–81
IPR056207 DC_0073 IPR056208
Coil
Unmapped
524–544
Coil Coil Coil Coil Coil Coil
QXV80029.1
1 1235
Architecture
TAS
STR
TAS
TAS 1-81 | STR 82-1197 | TAS 1198-1233 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage HildyBeyeler
[NCBI] 		2852005 Uroviricota > Caudoviricetes > Demerecviridae > Tequintavirus > Tequintavirus hildybeyeler
Host Escherichia coli K-12
[NCBI] 		83333 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QXV80029.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ501074 [NCBI]
CDS location
range 11783 -> 15490
strand +
CDS
ATGACTGATAAGCTAATACGAGAATTACTAATAGACGTTAAACAGAAAGGGGCAACCCGTACTGCAAAGTCTATTGAAAACGTATCTGATGCACTAGAAAACGCTGCCGCTGCTTCTGAACTGACAAATGAACAGCTAAGTAAAATGCCCAAAACTCTATACTCCATTGAGAGGGCAGCAGATAGAGCAGCAAAAAGTCTTACAAATATGCAAGCTAGTAGGGGCATGCTTAGTATCACTAAATCTATTGATGGTATTGGTGATAAGCTAGATTACCTGGCTATCCAACTTATTGAAGTAACAGACAAACTAGAAGCTGGATTCGATGGAGTTTCTAGATCTGTTAAGGCAATGGGTAATGATGTTGCAGCTGCAACAGAGAAGGTTCAAGATAGATTGTATGACACCAATAGAGTTTTAGGCGGTACAACTAGGGGTTTTAATGATACTGCTGGCGCCGCTGGTAGAGCTTCTAGAGCTATTGGTAATACTTCTGGTTCAGCTCGTGGTGCAACTCGTGATTTTGCTGCAATGGCTAAAGTTGGTGGTGGTTTACCATTATTATACGCTGCTTTTGCTTCTAACGTATACGTCCTACAGACTGCTTTTGAGAGCCTAAAAGTAGGTGATCAGCTAAACAGATTAGAACAGTTTGGTACTATTGTTGGCACCATAACAGGTACTCCTGTTCAGTCCCTTGCTAGATCACTACAAGAGGCAGCCGGCTATGCAATCTCTTTTGAAGAAGCTATGCGTCAAGCATCCTCTGCCTCCGCTTATGGATTTGATGCTGAACAACTTAATAAATTTGGTCTAGTAGCTCGTCGTGCTGCTGCTGTTCTTGGTGTTGATATGACTGATGCACTTAACCGTGTAATTAAGGGTGTATCAAAACAAGAAATCGAACTTCTGGATGAACTTGGTGTTACTATTCGTCTTAATGACGCATATGCTGACTATGTTAAACAGCTAAATGCTGCTAACACTGGTATAACTTATAACATTAATAGTCTTACTACTTTCCAGAAACAGCAGGCGTATGCTAATGCTGTTATAGCAGAGTCTACCAAACGTTTTGGTTACTTAGATGAAGTTTTACGTGCTACTCCGTGGGAGCAGTTTGCTGCTAACGCAGATGCTGCACTAAGAACAGTACAACAAGCTGCTGCTAAGTACTTAGGTCCAGTAATTGATGCTATCAACACAGTATTTTATACCTCTCAGGCTTCTGTATCTGCTGAAGCAGCTAGAGCTCAAGAACAAACTAATAAACAGATAGATCCTACCAACGTTGGTGCTGTTGCTTTAAGTTTGGCTGCTTCTGAAGAAGGGTATAATAAAGCTCTAGATATGTATAGGGAATCCCTTGATAAGCGCAATAAGCTAAAATCTGAGTTCGATAAACGAATGTCCCAAGCAGACGCTAGTACTGCTGCCGCTATTAGGTTGGTGGGCGAGGGGATGCCTGTTGGGTTAGCTGCTGGGGGATTTGAAGTAGGAGGGCTACGCATAGGTTCTTCCGAAGCTAATAAAAAGTTCGTAGAGGAAACCGCAGCTATGGGGCTGCAGATAGCAAGGCTAAGCAAAGAAGTTGATGACTCTACTGAAAACCTTAATGCTTGGAAGTCAGCCTATCAAGCTGCGGGTGCCGCTGCTGCAAAAGCTAATCCAGAATTCCAAAAACAGATTAATCTACACAGGGATACTACTGATCCTGATGCTGTATACGATTTTAACTCTACTGTATTAAAAGGACTAACTGAACAACAAAAAGCATATAATCAGACTAAGAAAACTGCTAGTGACTTAGCTAATGACTTTCAAAATATAGCTAGTAGCACAGATACTGCTGCTAAAACCAGTGCAGCTTTTGAAGGGGTAATTAGAAATGTAGAATCTCTCTCCGCAGGAACTGGTAAGAGTGCCGATGAATATGTTAAAAATCTTAACTTAGGGTTTAATACCCTATCTGAGATGAAAACTGCATCCCAGGCTCTATCTGAGTACGTTAAACTAACTGGTAATGAAACTAAAAATCAGTTAGCAGTTCAACAGAAAATAGCTGATGTGTACAATAAAACTAAGGATAAGGAAAAGGCTCAGGAAGCTGGTAGACGTTTAGAGTTGCAACAGTTAGAAGAGCAAGAAGCTGCTTTACGCCGTGTTCTTCAAACAAACCAGGGAAATAAAGCTGTTGAGAAAGAAATTGAAAAAATTCAGCTGGAGAAACTTAAACTTACCAATCAGGGTATGGAAGCTCAGAAGAAGGTCAAGGATTACACAGATAAAATCCTGGGTGTAGATCGTGAGATAGCTCTCTTAAATAACCGTACTATGACAGATACTCAGTATCGTCTAGCACAGTTAAATCTTGAATTGACCGTTGAAAAAGAGAAGTACGAATGGTACACAAAACAAGCTGATAAACAGAAAGAGGCGGAACAGTCTAGACGTGCTCAAGCCCAAATTGAACGTGAAATCTGGAAATTCCGTCAAGATCAGATTGCTTCAATGGCTGCTGGTAGAGAGGAAGAACAGCAAAGACAATTTACTGCTAAACCATTAATGGGAAATGCGGAGCGCTTACAGGAACAGCTAAAATTATATGAAGACTTAAAGCAGAAAACATTAGGTAATGCTGTGGCACAGGCGGAATATAATAAAAAGATAGCTGAAACTAGGGCACAACTAGCAGGTCTAAGGGCACAGAGGGATGCGGAGATGCAGCAACAGGTAGGGTCTTCTGTAGGTGCTGTATATACTCCTACAACTGGACTATCTGGAGAAGATAAAGATTTTGCTGATATGCAAAATAGAATGGCTTCTTATGATCAGGCAATCTCTAAACTATCTGAGTTAAATTCCGAAGCAACTGCTGTAGCTCAAAGCATGGGTAATTTAACTAACTCTATGATTCAGTTCTCCCAGGGATCTCTAGATACTACGTCTATGATTGCTTCTGGTATGCAGACTGTAGCCTCGATGATTCAATATAGTACTAGCCAACAAGTTAGTGCGATTGATCAGGCTATTGCAGCAGAACAGAAACGAGATGGTAAATCTGAAGCATCTAAAGCTAAACTGAAGAAATTAGAAGCTGAAAAGCTTAAAATTCAACAGGATGCAGCTAAGAAACAGATTATCATTCAGACAGCAGTAGCGGTAATGCAAGCAGCAACAGCTGTACCATATCCGTTCTCTATTCCTCTAATGGTGGCGGCAGGTTTGGCAGGTGCACTGGCTCTTGCTCAGGCATCTTCCGCATCTGGTATGTCTTCTATCGCTGACTCTGGAGCAGATACTACTCAGTATTTAGCCCTAGGTGAACGACAGAAGAATGTTGATGTATCTATGCAAGCTAGTTCAGGAGAATTATCCTATCTACGTGGTGATAAAGGTATTGGTAATGCTAACTCCTTTGTTCCACGTGCGGAAGGCGGTATGATGTATCCTGGAGTAAGCTATCAAATGGGTGAGCACGGTACCGAGGTAATTACTCCTATGGTTCCTATGAAAGCTACGCCTAATGATCAGCTTTCCGAAGGATCAAGGTCCTCTTCTGGTAGACCTATTATCCTGAATATCAGCACTATGGATGCAGCAAGCTTCAGAGATTTTGCATCGAATAATAGTACTGCTTTCAGAGATGCCGTGGAACTGGCTCTTAATGAGAATGGAACCACCCTGAAATCTCTTGGTAATTCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
ec48631b269690df6a7bf0705601681ae00b8eefa79cd27f03df760484b2b45d
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4344
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Systematic exploration of Escherichia coli phage-host interactions with the BASEL phage collection Maffei,E., Shaidullina,A., Burkolter,M., Heyer,Y., Estermann,F., Druelle,V., Sauer,P., Willi,L., Michaelis,S., Hilbi,H., Thaler,D.S. and Harms,A. 2021 — GenBank