Genbank accession
XYL03860.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,57
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,63
Protein sequence
MSDLIKQHFRATNGLDAGGNKVINVAKADRTVMSDGVNVEYLIQENTIQPWANDRGYPEGFAVTMEKRIWVARADIPAPIPPAVNTFRQGDWISMRVDPKWEQYSSGTSELLPGTYANIDTRVNPVTLVLPKNKVEQGDTIVIRDIGGKPGINQALIKVQDSAPAMIFQGSILRELQLTRPYSMLLMTFTSAGWYVTLSDLSSLARTIDSTTLDAATDVGAQVQSSEYIVLYYTSNKKLTVRLPRYANHGDMITFAEPKGETPLYHFTIKTYDANSSIGTEGATSWTSKIKGGGILIYDGPRKVWRINSIDMQQRVKIVTDDVVMQPNEAIAIFGANNSTVKTITVTLPTLVAPGDTVRIGMNYMRKGQTVNIVTPPAPAGGTKDRIASTVGLLQFPKRSEYPPEAAWTQVDSLSFNGTSDYPPVLELAYVEATPNNYWIVSENIPTVERVDSTNDTTKARVGVIALATTAQAQATSGHNDDRAITPLTLSQRTATESRTGIAEIATQAEANSTTDDTRIITAKKLNDRLATETMRGVAEIATQAETNGSTVDDRIVTPKKLNGRKATATLDGIIQLVNTGGTPGTSRSDPGTSNGTGVYDHTDFSKAVTPKTLREYKATELASGCVWLATEAEVRNGTPASNNIPTVVTPATLHAKTSTTKDIGLIRIATQDEANAMSNALGNAAITPATLNGRSASYTQTGITRYAIQEEFDGGSLENVAVNPRKIKDYFSRPARMTTRPEAGLAQSGNLWDGWTLNIQIPTETQRGTPKIATQALVNAGTDDVDYLTSKKLQAKKGTESAYGIVKYATQADTNTGTANDVAVSPVHLKYVIQTSADWRAQDNVRGTVRVANGAVAWTGNSTTGSDNTPKESNGYAVSPNGLKQALANYLPLNAKADNSALLNGLTSDQFIRRDINQTVNGSLTLTKVTTSSANIETSAILKSSKVETTGDIRISNATARLLLTSDTNAWSVQASANSGRIAFISENDTQNVHLSVYNDSRGVTANVKFEAPVINATTQFQLAGTGVIALAGTNSIRLATSGKGLELASSDAGNIIAAEGSTTYKVLTTKNKDSILDSRYVKSAGDTMTGNLTMNGSALVINGSEGWYDHTTTANTEKYARAGSWTVEIKNSAKLATLPGYVVPIREENPLVPGSMIVTGYEEKTGAGGLLAQISVSSDYTYQTWTPYPANAEQSAKARTHTMWTRVYNPYIKKFDSWMRVYTSATPPTAADIGAPSSVSTSVKTLEVQEWIKIGPVKIYPDRTSQTVKFEWVGD
Physico‐chemical
properties
protein length:1277 AA
molecular weight: 137403,29950 Da
isoelectric point:7,16765
aromaticity:0,06578
hydropathy:-0,33305

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
7–130
IPR048391
ATT
1123–1224
XYL03860.1
1 1277
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 7-130 | STR 356-1122 | ATT 1123-1224 | STR 1225-1270 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage THK_07
[NCBI]
3453358 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI]
573 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYL03860.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV963843 [NCBI]
CDS location
range 99582 -> 103415
strand +
CDS
ATGAGCGACTTAATCAAACAGCATTTTAGAGCAACCAACGGGCTTGATGCTGGTGGAAACAAAGTAATCAACGTCGCTAAAGCCGATCGTACTGTGATGAGCGATGGGGTCAACGTTGAGTATCTTATCCAAGAAAATACCATCCAGCCTTGGGCCAATGATCGTGGGTATCCTGAAGGTTTTGCGGTTACCATGGAAAAACGTATCTGGGTGGCACGTGCAGATATCCCAGCCCCGATCCCACCGGCAGTAAATACCTTTAGACAGGGTGATTGGATCTCCATGCGTGTAGACCCGAAGTGGGAACAGTATAGTTCAGGAACCTCAGAACTTTTACCAGGGACTTATGCAAACATCGATACCCGAGTTAATCCGGTTACACTAGTTCTTCCTAAAAATAAAGTAGAACAAGGTGATACGATTGTTATTCGTGACATCGGCGGTAAACCAGGTATCAACCAGGCATTAATTAAAGTACAAGACTCTGCGCCAGCAATGATCTTCCAAGGAAGTATCCTTCGTGAACTGCAGCTGACTCGTCCTTATAGTATGCTTCTGATGACGTTTACATCGGCTGGGTGGTACGTAACTCTTTCAGATCTGAGTTCTTTGGCTCGTACTATTGATTCTACCACACTGGATGCTGCTACCGATGTAGGTGCTCAGGTACAAAGTTCAGAGTACATTGTACTTTATTACACTTCTAATAAAAAATTAACGGTTCGTCTTCCGCGGTACGCTAACCATGGAGATATGATTACCTTTGCTGAACCGAAAGGCGAAACACCATTATACCATTTTACTATTAAGACTTATGATGCAAATAGTTCTATTGGAACAGAAGGGGCCACGTCTTGGACCTCTAAGATTAAAGGTGGTGGTATTCTGATTTATGATGGCCCTCGTAAGGTGTGGCGCATCAACTCTATAGACATGCAGCAACGTGTAAAAATCGTTACTGATGATGTAGTGATGCAACCTAACGAAGCTATTGCTATATTTGGTGCTAATAACTCGACTGTTAAAACTATTACTGTTACTTTGCCTACTTTAGTTGCTCCTGGCGATACCGTTAGAATTGGCATGAACTATATGCGCAAAGGACAGACAGTCAACATTGTTACTCCTCCTGCTCCGGCTGGTGGTACTAAAGATAGGATTGCATCCACAGTTGGCTTACTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAGTATCCGCCTGAGGCCGCGTGGACCCAAGTTGATAGTTTATCATTCAATGGAACTTCGGACTATCCTCCGGTCCTAGAGTTGGCCTATGTTGAAGCTACTCCTAATAACTACTGGATCGTTTCTGAAAATATCCCTACCGTAGAGAGGGTTGATTCTACCAACGATACAACTAAAGCTCGCGTAGGTGTTATTGCGTTAGCAACCACCGCGCAGGCTCAAGCAACCAGTGGGCATAATGATGACAGAGCTATTACTCCGTTAACTTTGTCCCAGCGTACTGCTACTGAGTCTCGTACCGGTATTGCTGAAATTGCTACTCAAGCTGAAGCTAATTCAACAACAGATGATACCCGCATTATTACGGCTAAAAAATTGAACGATCGTTTAGCTACAGAAACTATGCGTGGCGTTGCTGAAATTGCTACCCAAGCTGAAACAAACGGTTCTACGGTAGATGACAGGATCGTTACTCCTAAAAAATTAAACGGGCGTAAAGCTACTGCTACGCTAGACGGAATTATCCAGCTGGTTAATACAGGCGGCACGCCGGGAACAAGCCGATCAGATCCGGGTACTTCTAATGGTACTGGCGTATACGACCACACTGATTTCTCTAAGGCGGTAACTCCTAAAACTTTACGCGAATATAAAGCTACGGAACTTGCCTCCGGATGCGTATGGCTTGCTACCGAAGCAGAAGTTCGTAATGGTACTCCGGCTTCTAATAATATTCCGACCGTTGTTACGCCGGCAACATTACATGCTAAAACTTCTACTACAAAAGATATTGGTTTAATCCGTATCGCTACACAAGATGAAGCTAATGCAATGTCTAATGCTTTGGGTAATGCAGCTATTACTCCGGCAACATTAAACGGACGGTCGGCAAGTTATACTCAAACAGGTATAACCCGTTATGCTATTCAGGAAGAATTTGATGGTGGGTCTTTAGAAAACGTTGCAGTGAACCCTAGAAAAATTAAAGACTATTTTTCTAGACCAGCTCGTATGACAACAAGACCCGAAGCTGGGTTGGCCCAATCTGGAAACTTGTGGGACGGATGGACGCTTAATATCCAGATTCCAACAGAAACGCAGCGTGGTACTCCTAAGATTGCAACGCAGGCACTTGTTAATGCTGGTACAGACGATGTTGATTATCTGACGTCTAAAAAGCTTCAAGCTAAAAAAGGTACTGAATCCGCATACGGTATTGTTAAATATGCAACCCAAGCCGATACTAACACCGGTACTGCTAACGATGTAGCCGTTTCTCCGGTCCACTTGAAGTATGTTATTCAGACTTCAGCCGATTGGCGTGCACAAGATAACGTTCGCGGTACAGTCCGTGTAGCTAATGGCGCTGTTGCTTGGACCGGTAACAGTACTACAGGTTCTGATAATACGCCAAAAGAATCTAACGGATATGCAGTATCACCTAATGGGCTTAAGCAGGCATTAGCTAACTATCTTCCTTTGAATGCCAAAGCTGATAACTCTGCTTTATTAAATGGTCTTACGTCGGATCAGTTTATTCGCCGAGATATTAACCAGACCGTCAACGGTTCTTTGACCTTGACTAAAGTTACTACTTCTTCAGCGAATATTGAAACATCGGCTATCCTGAAGTCTTCTAAAGTAGAAACTACAGGCGATATCAGAATTTCTAATGCTACAGCTAGATTGCTTTTAACTTCTGATACTAATGCTTGGTCCGTTCAAGCGTCAGCTAACTCAGGTCGTATAGCCTTTATTAGCGAAAATGATACCCAAAACGTCCATTTATCTGTTTACAACGATTCTCGCGGCGTAACAGCTAATGTTAAGTTTGAAGCTCCTGTTATTAATGCCACTACTCAATTCCAGTTAGCTGGAACTGGTGTTATTGCTTTAGCCGGTACGAACTCGATCAGGTTAGCTACCTCTGGCAAAGGTCTTGAACTTGCTTCTAGTGATGCTGGTAATATCATAGCGGCTGAAGGTAGTACAACTTATAAAGTTCTCACTACTAAGAACAAAGATTCTATTCTTGATTCACGGTACGTTAAGTCAGCTGGTGATACAATGACTGGCAACTTAACTATGAACGGTTCTGCTCTTGTTATTAATGGGTCTGAAGGCTGGTACGACCACACTACCACGGCAAACACTGAGAAATATGCAAGAGCTGGTTCTTGGACCGTAGAAATTAAAAACTCTGCTAAGCTGGCCACGCTGCCAGGGTATGTTGTTCCGATCAGAGAAGAGAATCCTTTAGTTCCAGGTTCTATGATCGTAACAGGTTACGAAGAAAAAACAGGCGCCGGCGGTCTTTTAGCTCAGATAAGTGTTTCTTCTGATTATACCTATCAGACATGGACTCCTTATCCAGCTAATGCTGAACAGTCAGCTAAAGCAAGAACTCATACTATGTGGACCAGGGTATATAACCCGTATATTAAGAAGTTTGATAGCTGGATGCGTGTATACACTAGCGCCACTCCTCCTACAGCTGCAGATATCGGTGCCCCGAGTTCAGTAAGTACTTCTGTTAAAACCTTGGAAGTTCAAGAATGGATTAAGATTGGCCCTGTCAAGATTTATCCTGATCGTACTTCTCAGACCGTTAAGTTTGAATGGGTAGGTGATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
262c20b799e1431f86a73a0240df887c192eff642c75092a04d74283d46a8fb0
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7389
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50