Protein

Genbank accession
AGK87051.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein RIO-1_37 [Pseudoalteromonas phage RIO-1]
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,92
Protein sequence
MADTDFYNDAVQDTSFFDGVSARPPVSSVQAGERATLTAVQQEGVDGLSGDLVQRVKQELEVYGLSTDEQQARSSTRTGLKGPITEAALTSMPLETTEDAENLKGVVQDELGSIEQRDEIADMIVNTMESLPEESRKHGTFFNDLVNKTLADRASGSIIDLQIQDEFDSASGIDLTLDFVEAVFGGQIIGTRKFQTEVLEKVGVHGISAGDYVFKADDVDALYNYVQDASTAEEQIERVEEIVQIISDTQSPFGENVLYRTDFLTNLRAELEREGGGTQLAAMDDVLDATEVGFIAKSLTGFLKASGAKLFGSAAAANKTLSSEDADYIRSVMQEATEALSPSNGVAHKPTVVPVENKGSLLDTLAVNKPETLRTALNAAEASGEDLTQYLGVTKSGIASRLTPTGTADSGLSYTATEKRHKLDQISEFDYSSLDKTREEFERLVSNQNVSDILTQEELESGVERSIQTIYAQSRATLHPQSSWEALEKNGDFLKARAIFGKDGTSGFDTLRDAEIAKRNLFVEGKISARVAGENSALRELDEVNSIPEDQLEYFIDVEVEHQVTSKDVNPLEGKVDSYLPAHSYLIPFSSRVEKSVVDSAMAYTDKASRIAVTMQDFTKPIGKLRGKMEREQWTRLLTHGDEHGITFNKVAAKEYLGKMSDRVWDAYVGTRSFYDGMAIIRNKAHRSGLAERGFRGIKDGINTLEDSKGKLFGIPMAERPFIVPEAAADSLTQVNGTKIFNSVTGTAETLTDDLLDAAYAEGNIVVRTHRPLNSGGELFDFSIVRRDTVQDLPHQTMNIRKGHVDLNYLGEDSFFSKYISKIGGGGHSGGTGAKLIRKGNVVRNGIQTEATEVIGIYRDTKQAAQAAEDLGEEGLEVISSREAVSELGVDSVGTSSNVPSHARGRGQRLLGPSGYAEVADVEDSIGRALGEARRYTGMDSVNVLKSKFMATYGKHLGNAKEGFPSDFSRTQWRGKDKPEIQKLIRDAKAYHGYIKNQEAALTGTLQTKFLEDLRSFVGAWRVEGNQFQEFIGDAGVSLLDTDFVKVGTKLTAAVFIAARPLYQTLANAAQSAFLFAHNPVRAAGTFAKAPVVLAGLMMRGNRESALMNKVLGKTMGLSGEEFSKYLQDMLDSGMFSTSLVDDMFGLFESSMKVQAGKNSLMSSNFWKSMLPGGGLGGRAMSAMMFPQKVSTDVSNLLAYIHATTGFQKANKGRKLDSALAKRTILGDARRLTFTQNRADQFTYQQNLWSVQLQFMQHVHKMFLQLVVDPTVSVASLGKLSAARKGTNPWGGSFGQSAMTLGTITAMFGLESKLGTGVSTDLVTQLQEAGATEDMIDITMDGIFGKVTEQMYGEELDLASRFSPIGFVGSTLGLMFTHDGALNLAGPSGSLWKTVGNMASIAKAFHSNAEVSEEEGQLLLNEAANVFAGMKDYQRYETALNFGEYRTTAGRKIADISTDAAIPLLFSVPPKAAQRYYDTLDEIMSTKENVDAVTKSISSYMLNEMNNEPFEAITSEKAAGYMIKAFKLADLAFSTNPNAARQAKDTLAKEFIRPEGEFMTKYATKLAGRLSPTDATAHLTQLKQNNPEQTQVIDALLQVINQPLEEE
Physico‐chemical
properties
protein length:1607 AA
molecular weight: 175014,38260 Da
isoelectric point:5,05955
aromaticity:0,07530
hydropathy:-0,31525

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pseudoalteromonas phage RIO-1
[NCBI] 		1316739 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGK87051.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KC751414.1 [NCBI]
CDS location
range 23547 -> 28370
strand -
CDS
ATGGCAGACACAGATTTCTATAACGACGCAGTACAGGATACTTCATTCTTTGATGGTGTGTCTGCTCGTCCTCCTGTTAGCTCAGTGCAAGCAGGGGAGCGTGCTACGTTAACAGCAGTACAACAAGAAGGTGTTGATGGTTTATCAGGTGACTTAGTACAACGTGTTAAGCAAGAGCTTGAGGTGTACGGGTTAAGTACAGATGAACAGCAAGCTCGTAGTTCTACACGTACTGGACTTAAAGGTCCTATCACAGAGGCGGCTTTAACTAGTATGCCTCTTGAGACTACTGAAGATGCAGAGAACCTTAAGGGTGTAGTACAGGACGAGTTAGGCTCTATCGAACAGCGTGATGAAATAGCTGACATGATAGTTAATACTATGGAATCCCTTCCTGAGGAGTCACGTAAGCACGGTACGTTCTTTAATGACTTAGTTAATAAGACGCTAGCGGACAGAGCATCGGGTAGTATTATTGACTTACAGATACAGGACGAGTTCGACTCAGCTTCTGGTATCGACCTTACACTTGACTTCGTAGAAGCTGTGTTCGGTGGACAAATCATAGGTACTCGTAAGTTCCAGACTGAAGTACTAGAGAAGGTAGGCGTACATGGTATCTCCGCAGGGGATTACGTCTTCAAGGCTGACGATGTTGATGCTTTGTATAACTACGTACAAGATGCTAGTACAGCAGAGGAACAGATAGAACGTGTAGAAGAAATCGTACAGATTATATCAGATACTCAGTCTCCTTTCGGAGAGAACGTACTGTACCGTACTGACTTCTTAACTAACTTACGTGCTGAACTAGAAAGAGAAGGAGGCGGTACACAGCTAGCAGCTATGGACGATGTACTAGATGCAACAGAGGTAGGCTTCATAGCTAAGTCTTTAACAGGATTCCTTAAGGCATCAGGTGCTAAGCTGTTCGGTTCAGCTGCTGCTGCTAATAAGACACTAAGTTCAGAAGATGCTGACTACATACGTTCAGTAATGCAAGAAGCTACCGAGGCGTTGTCTCCTAGTAACGGAGTAGCACATAAACCTACTGTAGTTCCTGTAGAGAACAAAGGTTCATTACTTGATACACTAGCAGTTAATAAACCAGAGACTCTACGTACTGCTCTTAATGCAGCAGAGGCAAGTGGTGAAGATTTAACACAGTACCTAGGTGTAACTAAGTCAGGTATAGCTTCTCGATTAACACCTACTGGCACAGCTGACTCAGGTCTTAGCTATACAGCTACAGAGAAACGTCATAAGCTTGACCAGATATCAGAATTTGACTACAGTTCTCTTGATAAGACTCGTGAAGAGTTCGAACGTCTAGTATCTAATCAGAACGTTAGTGATATACTCACTCAGGAGGAACTTGAGTCAGGTGTTGAACGTAGTATCCAAACTATATACGCTCAGTCACGTGCTACTCTGCACCCTCAGTCTTCTTGGGAAGCATTAGAGAAGAACGGTGACTTCCTTAAGGCTCGTGCTATCTTCGGTAAAGATGGTACATCAGGATTCGATACACTCAGAGACGCTGAGATAGCTAAGCGTAACTTATTCGTAGAAGGAAAGATATCTGCCCGTGTTGCTGGAGAGAACAGTGCATTAAGAGAACTGGATGAGGTTAATAGTATCCCAGAAGACCAGCTTGAGTACTTCATTGATGTTGAAGTAGAGCATCAGGTTACTTCTAAGGACGTTAACCCTCTAGAAGGTAAGGTAGATAGCTACTTACCTGCGCATTCTTACTTAATACCTTTCAGCTCACGGGTAGAGAAGTCAGTAGTTGACTCAGCTATGGCTTATACGGATAAGGCTTCACGTATTGCTGTTACTATGCAGGATTTTACTAAGCCTATTGGTAAGCTACGTGGTAAGATGGAACGTGAACAGTGGACTAGGCTTCTTACTCATGGAGATGAGCACGGTATTACCTTTAATAAGGTAGCTGCTAAGGAATACTTAGGTAAGATGTCCGATAGAGTATGGGATGCGTATGTAGGTACACGTTCTTTCTATGATGGTATGGCTATTATCCGTAATAAGGCACACCGTTCAGGGTTAGCAGAGCGTGGTTTCCGTGGTATCAAGGATGGGATTAATACATTAGAGGATTCTAAGGGGAAGTTATTCGGTATACCTATGGCAGAACGTCCGTTCATTGTCCCTGAGGCAGCCGCTGACAGCCTTACTCAAGTGAATGGTACAAAGATATTCAATAGTGTTACAGGCACAGCAGAGACGCTCACAGACGACCTGTTAGATGCTGCTTATGCAGAAGGCAATATCGTAGTACGTACTCATCGTCCTCTTAATTCAGGTGGTGAGTTATTTGACTTCAGTATAGTACGTCGTGATACAGTACAGGACTTACCTCATCAGACTATGAACATCCGTAAGGGTCACGTAGATTTGAACTACCTAGGAGAGGACTCTTTCTTCTCTAAGTACATATCTAAGATAGGGGGTGGTGGTCACTCAGGTGGTACAGGTGCTAAGCTTATCCGTAAAGGTAACGTAGTACGTAACGGTATACAGACAGAAGCTACTGAAGTTATCGGTATCTACCGAGATACTAAGCAAGCTGCTCAAGCTGCTGAGGATTTAGGAGAGGAAGGTCTTGAAGTTATATCTTCTCGTGAAGCAGTATCTGAACTAGGTGTTGATTCCGTAGGTACTAGCTCTAACGTACCTTCTCATGCACGAGGAAGAGGACAACGTCTCCTAGGTCCATCAGGTTACGCTGAAGTAGCTGACGTAGAGGACAGTATCGGTCGTGCTCTTGGAGAAGCTAGACGTTATACAGGTATGGATTCAGTTAACGTACTTAAGTCTAAGTTCATGGCTACTTACGGTAAGCATCTAGGTAACGCTAAGGAGGGATTCCCTTCTGACTTCAGTCGTACCCAGTGGAGAGGTAAGGATAAGCCAGAGATACAGAAGCTTATACGTGATGCTAAGGCGTATCATGGCTACATTAAGAACCAAGAGGCTGCACTGACTGGTACATTACAGACTAAGTTCCTTGAAGACTTACGTTCATTCGTAGGTGCATGGAGAGTAGAGGGTAATCAGTTCCAAGAGTTCATTGGTGACGCAGGTGTATCATTACTTGATACGGATTTCGTTAAGGTAGGCACTAAGCTGACCGCTGCTGTGTTCATCGCTGCTCGTCCATTGTATCAGACCCTAGCTAATGCTGCACAGTCAGCTTTCTTGTTCGCACATAACCCTGTACGAGCAGCTGGGACTTTCGCTAAGGCTCCTGTTGTTCTAGCAGGCCTTATGATGAGAGGTAACAGAGAGTCAGCCTTGATGAACAAGGTACTTGGTAAGACTATGGGATTATCAGGGGAGGAGTTCAGTAAATACTTACAGGATATGCTTGATTCAGGTATGTTCAGTACGTCTTTAGTGGATGACATGTTCGGTCTGTTCGAATCAAGTATGAAAGTACAGGCTGGTAAGAACAGCCTGATGAGCAGTAACTTCTGGAAGAGTATGTTACCGGGTGGGGGTCTAGGTGGACGTGCTATGTCAGCTATGATGTTCCCTCAGAAGGTAAGTACGGACGTAAGTAATCTATTAGCTTACATTCATGCTACTACAGGGTTCCAGAAAGCTAACAAAGGACGTAAGCTTGACTCAGCACTAGCTAAGCGTACTATCCTAGGGGATGCTAGACGTTTAACGTTCACTCAGAACCGAGCTGACCAGTTCACGTACCAACAGAACCTATGGAGTGTACAGCTACAGTTCATGCAGCACGTACATAAGATGTTCTTACAGTTAGTAGTTGACCCTACGGTAAGCGTAGCTTCTTTAGGTAAACTTAGTGCGGCACGTAAGGGTACTAACCCTTGGGGTGGCTCCTTCGGTCAGTCAGCTATGACACTAGGTACGATTACTGCTATGTTCGGGCTAGAATCTAAGCTAGGTACAGGCGTAAGCACGGACTTAGTTACTCAGCTACAGGAAGCAGGTGCTACTGAGGACATGATTGATATAACTATGGATGGTATCTTCGGTAAGGTTACTGAGCAGATGTACGGAGAGGAACTGGACTTAGCATCTCGATTCAGTCCAATAGGTTTCGTAGGAAGTACATTAGGTTTGATGTTCACACATGATGGGGCGTTGAATCTAGCAGGTCCGTCTGGTTCTTTATGGAAGACTGTTGGGAACATGGCTAGTATAGCTAAAGCCTTTCATTCTAACGCAGAGGTATCGGAAGAAGAGGGTCAGCTACTTCTTAATGAAGCAGCTAACGTCTTTGCAGGGATGAAGGATTACCAGAGGTACGAGACTGCATTGAACTTCGGGGAGTACAGGACTACAGCTGGTCGTAAGATAGCAGATATCAGTACAGATGCAGCTATACCTTTACTGTTCAGTGTTCCTCCTAAGGCAGCTCAGCGTTACTACGATACCCTTGATGAAATCATGAGTACTAAAGAGAACGTTGATGCAGTAACTAAGAGTATCAGTTCTTATATGCTTAATGAGATGAACAATGAACCGTTCGAAGCTATTACCTCAGAGAAAGCTGCTGGTTATATGATAAAGGCTTTCAAGCTAGCTGACCTAGCGTTCAGTACTAACCCTAACGCAGCACGTCAAGCTAAGGATACACTAGCTAAAGAGTTCATTAGACCAGAAGGGGAGTTCATGACTAAGTACGCTACTAAGTTAGCAGGTCGTCTATCTCCTACTGATGCTACAGCACATCTAACACAACTTAAGCAGAACAATCCTGAACAGACTCAGGTTATTGATGCACTACTTCAAGTAATTAATCAACCATTAGAGGAAGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.