Protein

Genbank accession
XTQ13597.1 [GenBank]
Protein name
colanic acid degradation
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
Protein sequence
MAVFSNLEGTMMPTFKLGKRGASINFVNDSVAIKDFLGETFLPVKVGTPNDDDSAVNVRYLEDNPNALFGVLPPTNDIGKNNNTYFQVDSEGIVDIFAKTNDVWVKSLYINKNVLSSVNGADYIGLITGGTLQQAQFYITPEEFGAKGDGITDDTAAVNACAVYAKEHQIQIQAGGNYRIRTAVYLNDIQWFGGTITGNGGTMVSVLNSTIQQATLTGCYLKFFGGNGKFYFNKFINITSTAAFLMQGMTESGTIDFCFNEMTQCKYGVLQQGTGEKMTVGRYSYNHIHDIYGDAIELNVVNSHYPDGFVIEGNLIENVDGTNAPIPLSNWGIGIGVAGSGPYDVNADDSQYVKKFVIKNNRLYNVRQCIHVELGKDFKILNNEVYPSTLVSIGTGLTTAGVITYGSVDFIIDGLSGHLLNDPSVTNRMVSINWGVTSGKFAGPPRNFKLCNLHIPESSIIVYTSGSDNWLNTTELSNITCSRIQWRGLPSSSKFNNISTKELDVIGQHLATEGEGGGLYTRSKYTYTNWTNCVVQDDCNISKYSFSRMYVDRIDQSSNNFKVTTAIDGTGHRGPVVIPVVEQYYVPYDVFPGGRYFPAGTIIHKQSGGKFIVTVGGSFFGRYDTIRQTVAGQTYIEALGVSWGDNQYAKAAGTEILITGAGENGEDLKTYITRAVYVVNNAYRIDIADPIVTATAAGALLKAAQPITYITLS
Physico‐chemical
properties
protein length:713 AA
molecular weight: 77647,37120 Da
isoelectric point:5,33499
aromaticity:0,10940
hydropathy:-0,11641

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage WPEC3
[NCBI] 		3421660 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XTQ13597.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV611058 [NCBI]
CDS location
range 222210 -> 224351
strand +
CDS
ATGGCAGTTTTTTCCAATTTAGAAGGGACCATGATGCCAACATTCAAGTTGGGTAAACGTGGTGCTTCTATTAATTTTGTAAACGATTCTGTCGCAATCAAAGACTTTTTAGGCGAAACGTTCCTACCTGTTAAGGTGGGAACTCCTAATGACGATGATTCCGCAGTAAACGTTAGGTATCTTGAAGATAACCCAAATGCTTTATTTGGCGTACTTCCACCAACAAATGACATTGGTAAAAATAACAACACTTATTTTCAAGTTGATTCTGAGGGTATTGTTGATATCTTTGCAAAAACAAATGATGTTTGGGTAAAATCATTATACATTAATAAAAATGTCCTTTCCAGTGTTAACGGTGCTGATTATATCGGACTTATTACTGGAGGAACACTTCAACAGGCACAGTTTTACATAACTCCAGAAGAGTTTGGTGCAAAAGGTGATGGTATCACTGATGACACGGCGGCGGTTAACGCATGTGCAGTTTATGCTAAAGAACACCAAATCCAAATTCAAGCTGGTGGTAATTATCGTATCAGAACTGCTGTTTATTTGAATGATATTCAATGGTTTGGCGGTACAATCACTGGTAACGGTGGCACAATGGTATCAGTACTGAATAGTACAATCCAACAAGCAACATTAACAGGATGTTATTTAAAATTCTTTGGTGGTAATGGTAAATTTTATTTTAATAAATTTATTAATATTACAAGTACTGCTGCATTTCTAATGCAAGGTATGACTGAATCAGGTACTATCGACTTCTGCTTTAATGAAATGACACAATGTAAGTACGGTGTTCTTCAGCAAGGCACTGGTGAGAAAATGACCGTTGGGCGTTATTCATACAACCACATCCATGATATATATGGTGATGCAATTGAATTGAACGTAGTCAACTCACATTACCCAGACGGATTTGTAATAGAAGGTAACTTGATTGAAAACGTAGATGGTACAAATGCACCAATTCCTCTTTCAAACTGGGGTATTGGTATCGGTGTTGCAGGTTCTGGTCCTTATGATGTGAATGCTGATGATTCACAATATGTAAAAAAATTCGTTATAAAAAATAACCGCTTGTACAATGTCCGTCAATGTATTCACGTTGAGTTGGGTAAAGACTTTAAAATTCTCAATAATGAAGTTTATCCATCAACGTTGGTATCAATTGGTACTGGTTTGACAACCGCTGGTGTAATTACTTATGGTTCTGTTGATTTTATTATTGATGGCCTATCTGGGCATCTATTAAATGATCCATCAGTAACTAACCGTATGGTTTCTATTAACTGGGGCGTAACATCTGGTAAATTTGCTGGTCCTCCACGAAACTTTAAATTATGTAATCTCCACATTCCTGAGTCGTCTATTATTGTGTATACTTCAGGCTCTGATAATTGGCTAAATACTACTGAACTTTCTAATATTACATGTAGTAGAATTCAATGGCGTGGATTGCCGTCATCTTCCAAGTTTAATAATATCAGTACTAAAGAACTTGATGTTATTGGACAACACCTTGCAACTGAAGGTGAAGGAGGGGGCTTATATACTCGCTCTAAATATACATATACCAACTGGACTAATTGTGTTGTTCAAGATGATTGTAACATATCAAAATATAGTTTCTCAAGAATGTATGTTGACCGTATTGACCAATCATCTAATAACTTTAAAGTAACCACTGCAATTGATGGAACGGGTCATCGTGGACCTGTAGTAATACCTGTAGTTGAACAGTATTACGTGCCTTATGATGTTTTTCCTGGTGGGAGATATTTCCCAGCAGGAACAATTATCCATAAACAATCAGGTGGAAAATTTATTGTTACAGTAGGTGGTTCTTTCTTTGGTCGATATGACACAATTAGACAAACAGTTGCAGGACAAACTTATATCGAAGCATTGGGTGTATCATGGGGTGATAATCAATATGCTAAAGCTGCTGGAACCGAAATCCTAATCACAGGAGCAGGGGAAAATGGCGAAGATTTAAAAACATATATCACTAGAGCAGTTTATGTTGTTAATAATGCGTATCGTATCGATATTGCCGATCCGATTGTTACTGCTACCGCAGCAGGGGCATTATTAAAAGCTGCTCAACCAATAACATATATCACCCTATCTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.