Protein

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Genbank accession
XRM24042.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber assembly protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,62
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQNGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHLNKAPIFTDLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVNEGSFKFHYIDETGTSKYWTFNRNGNFQVDSGSLLVSNGYLVTQSNIETKAGSLIGPKVITKNINVSTKSWDTNIDTAYDLVSLPTWQYTPTETDLDTNGINYLRKFRGHVSSAIFHEVADARSGKPQNISYWTGRNAEVYQWSYTTDGRMSVANSIGIGLADVGDQGRYPLVSFGKGIAIGDNDTGIKWVRDGVIDLVANGISAGTILNNGINSTKKLMVGYSRDSGSTWDYPNNNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYNSNSKMYHYFRGTGRMAVGMSQGLLVEPGILDISTGSNTLSLRADGTVASVQTLKLNNGLYFNGDGTNASLVFKAASGIDGTKQIMWEGGKRAGQNKSYVTAKAWGNSFNASGDRNRETVFEVADGQGYYFYAQRVAPASGSTVGPIQFRIAGALLTGGGITSSGSIVTESSLVANNGMSVNGQAKFGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEAALHIIPTPKDAGESGGISNLRPLSISLNNGMVQMRHSVTLGDDGLGGNMVTVDNDSKLVVVTSNSRISPNYNMQLGQNAYIDIQASDGVRPAGCGSFASQNDVNVRAPIYMNIERTATSEYIPIVKQRYVQGDSTYSIGTLINQGDFRVHYHQGTSTTGTDLSWEFRRNGDFRASGKIIAGAATLGHDGNITGGSGNFANLNSTIESLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAIMEGQTFDAGLYPKLAAVYPSGTLPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEEDGVKSHSHSASASSTDLGTKTTSSFDYGSKTTSSFDYGTKTSNNTGAHTHSLSGSTNTAGAHSHTSALYAGSNNSPGTGSIRGSAGGGNTLGTSSSGAHSHSISGTAASAGAHAHTVGIGAHTHTVGIGAHTHSVAIGSHGHTITVNSTGNTENTVKNIAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1061 AA
molecular weight: 112176,38950 Da
isoelectric point:7,79057
aromaticity:0,08294
hydropathy:-0,36843

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–1059
DC_0538
IPR051934
Unmapped
747–1061
IPR051934
SSF88874
STR
821–969
SSF88874 IPR005003 IPR005003
IPR037053
ATT
827–880
IPR037053 IPR005003 IPR005003 IPR005003
IPR011083
ATT
832–879
IPR011083 SSF88874
XRM24042.1
1 1061
Architecture
STR
ATT
STR
STR 1-826 | ATT 827-880 | STR 881-1060 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_JQD51
[NCBI] 		3410945 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli O157
[NCBI] 		1045010 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XRM24042.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV204681 [NCBI]
CDS location
range 126440 -> 129625
strand +
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTAGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGCGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCAAAATGGAGATTATTTACAGAACGGTACATATAATCTCAATGGAAACCAGTTTGTTTATGCAGGAAAATATATTGAATTTTTACCTAAAACTGCAGGCAATGGTGCTTGGGCTAACCAACATTTGAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTAAGTTCAACTACTTCTGTTTCAGAATACCATCCGCTGATTAAACAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCTGCTGGTACATTAGTAAACGAAGGTAGTTTTAAATTCCATTATATTGATGAAACCGGGACTTCAAAATACTGGACTTTTAATCGAAACGGTAATTTTCAAGTTGATTCCGGAAGTTTATTAGTATCTAATGGATATTTAGTTACTCAAAGTAATATTGAAACTAAAGCTGGTTCTTTAATTGGTCCTAAAGTTATTACCAAAAATATCAATGTGAGCACTAAATCTTGGGACACTAATATTGATACTGCATATGATTTAGTTTCATTACCGACTTGGCAGTATACTCCAACCGAAACGGATTTGGATACTAATGGTATAAACTACCTTCGTAAATTCCGCGGACATGTTTCTTCTGCTATTTTCCATGAAGTTGCTGATGCTCGTTCAGGTAAACCACAGAATATTTCGTATTGGACGGGGCGTAATGCTGAAGTTTATCAATGGTCTTATACCACAGATGGGCGTATGTCTGTTGCTAATTCGATAGGTATAGGTCTTGCTGATGTTGGTGACCAAGGACGTTATCCATTGGTTTCGTTTGGTAAAGGTATTGCAATTGGTGACAATGATACTGGTATTAAATGGGTTCGTGACGGGGTTATCGATTTAGTTGCGAATGGTATTTCTGCCGGCACTATTCTTAATAACGGTATTAACAGTACTAAAAAATTGATGGTTGGTTATAGTCGAGATTCTGGTTCTACTTGGGATTACCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACTGCGCGTACCGATGTTGATGGTAATAATAACGGTGACGGTCAGACTCATATCGGTTATAACAGTAATTCTAAAATGTATCACTATTTCCGTGGTACAGGTCGTATGGCTGTTGGTATGTCCCAAGGTCTCCTTGTTGAACCAGGAATTTTAGATATTAGCACTGGTTCAAATACATTAAGTTTGCGTGCTGACGGTACTGTTGCTTCTGTTCAAACGTTAAAGCTTAATAATGGATTATATTTTAATGGTGATGGAACTAATGCTTCTTTAGTTTTTAAAGCAGCTTCAGGTATTGATGGCACTAAGCAAATTATGTGGGAAGGTGGTAAGCGTGCTGGTCAAAATAAAAGTTATGTGACAGCTAAAGCTTGGGGTAATTCATTTAACGCATCTGGCGATCGTAATCGTGAAACAGTTTTTGAAGTAGCTGACGGACAAGGTTATTATTTTTATGCGCAGCGTGTAGCTCCCGCTTCAGGATCTACTGTCGGACCAATTCAATTTAGAATTGCTGGAGCATTATTAACCGGTGGTGGTATTACATCATCCGGCTCGATTGTTACGGAATCAAGTTTAGTTGCTAATAATGGAATGTCAGTAAATGGACAAGCTAAATTCGGTGGAACAGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCCGAATATGGTGCTATTTTCCGTCGCTCAGAAGCAGCATTACATATTATCCCGACTCCTAAAGATGCTGGTGAAAGTGGTGGAATAAGTAATCTCCGCCCACTTAGTATTAGCCTTAATAATGGTATGGTGCAAATGCGTCATTCCGTCACGTTAGGTGATGATGGGTTAGGCGGCAATATGGTTACTGTTGATAATGATAGTAAACTTGTTGTTGTTACTAGTAATAGTCGCATTTCTCCTAATTATAATATGCAATTAGGGCAAAACGCTTATATAGATATTCAGGCTTCTGACGGCGTTCGTCCAGCAGGGTGTGGTTCATTTGCATCTCAGAATGACGTAAACGTCAGAGCTCCGATTTATATGAATATAGAGCGTACTGCTACTTCTGAATATATTCCTATTGTTAAACAGCGTTATGTGCAAGGTGATAGCACTTATTCTATTGGGACATTAATTAATCAAGGAGATTTCCGTGTCCATTATCACCAGGGTACTAGTACTACCGGCACCGATTTAAGCTGGGAATTCCGTCGTAATGGTGATTTCCGCGCTAGTGGTAAAATTATTGCTGGTGCTGCTACTCTTGGTCATGATGGTAATATCACTGGTGGTTCTGGTAATTTTGCTAACTTAAACAGTACAATTGAATCACTTAAAACTGATATTGTTTCAAGTTATCCTATTGGAGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTATGCCATAATGGAAGGTCAAACATTTGATGCTGGCTTGTATCCTAAGTTAGCTGCTGTGTATCCTTCAGGCACTCTGCCTGATATGCGTGGACAAACTATCAAGGGTAAACCATCTGGGCGTGCTGTATTAAGTACAGAAGAAGACGGTGTTAAGTCACATAGCCATAGTGCAAGTGCATCAAGCACAGATTTAGGTACTAAGACCACTTCTAGTTTTGATTACGGTAGCAAAACGACTTCAAGCTTTGATTATGGTACTAAGACCAGTAATAATACTGGTGCTCATACGCATAGTTTGAGCGGTTCCACAAACACCGCCGGTGCGCACAGCCACACAAGCGCTCTTTATGCGGGAAGTAACAACTCTCCTGGTACTGGTTCTATAAGAGGATCCGCCGGTGGTGGTAATACGCTTGGAACTTCTTCTTCTGGGGCACATTCGCACTCTATATCTGGTACTGCTGCAAGCGCAGGCGCTCACGCACATACTGTTGGTATTGGTGCTCATACCCATACAGTTGGTATTGGTGCTCACACCCATTCAGTAGCAATTGGTTCACATGGGCATACAATAACTGTAAATAGTACAGGTAATACAGAAAACACGGTTAAAAACATTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
e2fc0a5d832aa916145bcc539aca2740a004aa5c79db486077b0da72f1451ff1
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2882
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50