Protein

Genbank accession
AGE60391.1 [GenBank]
Protein name
VrlC protein [Pelagibacter phage HTVC008M]
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,63
Protein sequence
MATNFNVSPYFDDFSEAKNFHRILFRPAFAVQARELTQLQTILQNQIERFGEHMFKDGSMVIPGEIALNTKYEYVKLASHSTSTVSNLQDLIVTGSTSGITATVVNTTEATSTAAATIYVLYTASGTDNATKRFTEGETLTFTYNSTSSTAVVGTSGTSLPTDSNATGFASSVNVQAGVYFINGFFVANTEQTLILDPYSNTPTYRVGFNVTESFVTPSDDSSLNDNAAGSSNVNAPGAHRFKTSLTLVKKLITETDDENFVELLRTGSGNVETIVQRTDYNILEETLARRTADESGDYVTKSFDIDIREHKNDGSNRGIYSADGSSLYNGLSSANSEARLAIGLSPGKAYVQGYEIETTGQKFVTIEKARDFDTIQNSTTRLAIGNFVEVTNVHGTPDIGTVSGETEAFKELQLFKNANAARGTNLSTTNVDVEQIGRAKPRYFEYKSGTAGATLTNTSSIYKLGLFNVDMFTHIGVTSSVEFDTGETLTGGTSGATGVVEAISSNTSTDPDQFITEDGFNLVDETDGDDLILEQSVFTTVVLSNVSGSFATLETITDESSNSGVVIANTPERKGVTEFDFAQVKSVGMTGSPNFTADTVLTTTAANERDESNITIGGLINIDANSNVVKGNNTEFNSDLKVGDNIVFEDNNGNQQSRFVGAIADDKTITLTANVTVAVTSASTQRRRTKLQNINTTSLVYKLPENVIKTLKTTDNAGITDTSHKVRRQFVETLSSSGVATFSAGANETFDAHSEADYTLSIMTAGASAGAIGDIVSLSGNNHEGDAIFTLTGSPSGRQVQIDLGANYATAKVKLITTITKSVAGEKTKTLISDQTQTVSTQALAEEKTISLGKADAYALTSVYMSPDFSTAATTSHTDITDRFTLDTGQRDSFYDIARIVRNDGAQLPTGRLLITFQYFTHGTGNYFSVDSYSGVVDYENIPFFESPTKGRIELRDALDFRPRVADNSEVVGYGNVDSIGAKNYTGGGASTVDMPKPSSDATLDFEFYLSRIDGIFVTKDGLFKQAKGTPAIDPQRAETIDDAMPLYYLTLPPYTFSTDDVAVTVVDNRRYTMRDIGKLEQRIKNIEYYTQLSLLEQQAVNTQIQDAATGLDRFKNGIVVDSFKGHNVGDTLSSEYRCSVDMSEGELRPEHNTNVVKLIELAANDTDAERTTAGYQKTGDLITLPYTHSKLTENPYATKSVNCNPFLVFQYQGDVALTPDVDEWYDTTRRPDLIVNDNNLFDTMTSLAGTNNNLGTVWNNWQTNWSGRWSSSGSSSRRMGDTIHTTTSTIGGDITTRSRTGITREISGSNVVRQSFGERIVDVAFIPFIRSQTISFSGTRLKPNTRVYPFFDNVNVSTHVTPSGGVLGGNLVTGTTGTIEGTFTIPNTASERFRTGDRIFRLTSSSSNSSTDDDVDTFAQGTYTARGLQTTTQETVQSTRVPIIGRQTVTEQDTRRTTDSFSVSQTTQQIQNNPDPLAQTFSVDEASGVFLSKVDIYFEEKDDTVPIKVYLVETINSRPGQRILPFSEVTLQSSEVLTSATASTATVVTFPSPVYLQGGKEYAIILKPNSQKYKAWVSRLGDTDVGGTRRVTQQPLFGSLFRSQNAKLWTEDQMEDLKITLYKAAFDTTTNGTLSLTNDDIETKTLDNNAIETNATSGSGTTFGDNPAIIKINHRHHGMNDNKPSKVTISGLGGSTDYNGIQGSVINGTHDVGNVTEDSYTITLTGDTATSTGSVGGSSIVATQDRAFESIMPKIGMMNFPDTTTEHKIKTTSTTSIDGTEASYSTDSAFTNIVPNENFYFTSARAVASSINETTHLSGTKSLFYNIVLQTANANVSPVIDLARTNIFCTHNRLDNPTSSNRTGFVAETDPTGGNAAAKYITKEISLENPATALDIRIAASVFPTSSIEVFRKVKFEGDDRQMKDIPYVQMTQSNTAVSAEGRSQSPYNANFKEDFSDFEFSEEGINEFATFKIKIVMKGTNPAYPPRITDMRAIALAV
Physico‐chemical
properties
protein length:2001 AA
molecular weight: 216895,42920 Da
isoelectric point:4,81548
aromaticity:0,08246
hydropathy:-0,35987

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage HTVC008M
[NCBI] 		1283076 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGE60391.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KC465899.1 [NCBI]
CDS location
range 37918 -> 43923
strand +
CDS
ATGGCAACAAACTTTAACGTCTCTCCTTACTTTGATGACTTTTCAGAGGCAAAGAATTTTCATAGAATATTATTTCGTCCTGCTTTTGCAGTTCAAGCAAGAGAGTTAACACAACTACAAACTATCTTACAAAACCAAATTGAAAGATTTGGTGAACATATGTTCAAAGATGGTAGTATGGTAATACCAGGCGAGATAGCACTTAACACAAAATACGAATATGTTAAATTAGCAAGTCATTCTACTTCAACAGTTTCTAACTTACAAGATTTAATTGTAACAGGTTCTACTTCAGGTATTACAGCAACAGTTGTAAACACAACTGAAGCAACATCAACAGCAGCTGCAACAATCTATGTTTTATATACTGCCTCAGGTACAGACAATGCAACTAAAAGATTTACTGAGGGAGAAACTTTAACATTTACATACAATAGCACATCTTCAACGGCAGTTGTAGGTACTTCAGGTACTTCATTACCAACAGATAGTAACGCAACTGGTTTTGCTAGTTCAGTAAATGTTCAAGCAGGTGTATATTTTATTAATGGTTTCTTTGTTGCAAATACTGAACAGACTTTAATACTAGACCCGTATTCAAACACACCAACATATAGAGTTGGTTTCAATGTAACAGAAAGTTTTGTTACACCGTCAGACGATAGTTCATTAAATGATAACGCAGCCGGTTCATCTAACGTAAATGCTCCTGGTGCTCACAGATTTAAAACATCATTAACGTTAGTTAAAAAACTTATAACTGAAACAGATGATGAAAATTTTGTAGAGTTACTAAGAACAGGATCAGGTAATGTTGAAACAATTGTACAAAGAACAGATTACAATATACTAGAAGAAACATTAGCAAGAAGAACGGCAGATGAAAGTGGTGATTATGTTACTAAATCATTTGACATAGATATAAGAGAACACAAAAATGACGGATCAAATCGTGGTATATATTCTGCTGATGGTTCAAGTTTATATAATGGATTAAGTTCAGCTAACTCAGAAGCTAGATTAGCAATTGGTTTATCTCCTGGTAAAGCATATGTTCAAGGTTATGAAATAGAAACAACAGGACAAAAATTTGTTACAATAGAAAAAGCAAGAGACTTTGATACAATACAAAACTCTACTACAAGATTAGCAATAGGTAATTTTGTTGAAGTAACAAATGTACATGGTACGCCAGATATAGGAACAGTATCAGGTGAAACAGAAGCGTTTAAAGAATTACAATTATTTAAAAATGCAAATGCTGCCAGAGGTACAAACCTATCTACAACTAACGTTGATGTAGAACAAATTGGTAGAGCAAAACCTAGATACTTTGAATATAAATCAGGTACTGCTGGTGCAACACTAACAAACACATCTTCAATTTATAAATTAGGTTTATTTAATGTTGACATGTTTACACACATTGGTGTCACAAGTTCAGTTGAGTTTGATACAGGTGAAACTCTAACTGGTGGTACTTCAGGTGCAACTGGTGTTGTAGAGGCAATATCATCTAACACATCAACGGATCCTGACCAGTTTATAACTGAGGACGGATTTAACCTTGTTGATGAAACAGATGGTGATGATTTAATTTTAGAACAATCTGTATTTACAACAGTTGTATTAAGTAACGTATCAGGTTCTTTCGCAACTTTAGAAACTATAACAGACGAAAGTTCAAATAGTGGTGTAGTAATAGCAAACACACCAGAGAGAAAAGGTGTAACTGAATTTGATTTTGCACAAGTTAAGTCAGTTGGTATGACTGGTTCGCCAAACTTTACTGCTGATACAGTATTAACAACTACAGCTGCAAATGAAAGAGATGAAAGTAATATAACTATAGGCGGACTAATTAATATAGACGCAAACTCAAATGTAGTAAAAGGTAACAACACAGAATTTAATTCAGACTTAAAAGTTGGCGACAACATTGTGTTTGAAGATAACAATGGTAATCAACAAAGTAGATTTGTTGGTGCTATTGCAGATGATAAAACAATAACATTAACAGCAAATGTAACAGTTGCTGTAACATCAGCGTCAACACAAAGAAGAAGAACAAAATTACAAAACATTAATACTACTTCTCTAGTATATAAATTACCTGAGAATGTTATTAAAACATTAAAGACTACAGACAATGCAGGTATCACAGATACAAGTCATAAAGTTAGAAGACAATTTGTTGAAACTTTATCATCATCTGGTGTTGCTACATTCTCTGCCGGTGCAAACGAAACATTTGACGCACACTCAGAAGCAGATTACACATTATCAATAATGACTGCCGGTGCAAGTGCAGGTGCTATAGGTGATATAGTCAGTTTATCAGGCAACAACCATGAAGGTGACGCCATATTCACATTAACTGGTAGTCCATCAGGTCGTCAAGTACAAATAGATTTAGGTGCTAACTATGCAACTGCTAAAGTTAAATTAATTACAACAATAACTAAATCAGTTGCAGGTGAAAAAACAAAAACATTAATTTCAGACCAAACACAAACAGTTTCTACACAAGCATTAGCTGAAGAAAAAACAATCAGTTTAGGTAAAGCAGACGCATATGCTTTAACAAGTGTTTATATGTCGCCTGACTTTAGTACGGCAGCAACAACAAGTCATACTGATATTACAGATAGATTTACATTAGATACAGGTCAAAGAGATAGTTTCTATGATATTGCTAGAATAGTAAGAAATGACGGTGCTCAATTACCAACTGGTAGATTGTTAATTACTTTCCAATACTTTACACACGGTACAGGTAACTACTTCTCAGTAGATAGTTATTCTGGTGTTGTAGATTATGAAAACATTCCTTTTTTTGAAAGTCCAACAAAAGGTAGAATAGAATTAAGAGACGCATTAGACTTTAGACCTAGAGTAGCGGACAATAGTGAAGTTGTAGGTTATGGTAATGTAGATAGTATTGGTGCAAAAAATTATACTGGAGGCGGTGCTTCAACAGTTGATATGCCAAAACCTAGTTCAGACGCAACACTAGACTTTGAATTTTATTTAAGTAGAATAGATGGTATCTTTGTAACTAAAGACGGTCTATTTAAACAAGCAAAAGGTACTCCAGCAATTGATCCTCAAAGAGCAGAAACAATTGATGACGCAATGCCTTTATATTATCTAACTTTACCACCATACACTTTCTCTACAGATGATGTAGCAGTAACAGTAGTTGATAATAGAAGATATACAATGAGAGACATTGGTAAGTTAGAACAAAGAATTAAAAATATAGAATACTATACTCAGTTATCTCTACTAGAACAACAAGCAGTTAATACACAAATACAAGACGCAGCTACAGGTTTAGATAGATTTAAAAATGGTATTGTAGTAGATAGTTTCAAAGGTCATAATGTTGGTGATACTTTATCAAGTGAATATAGATGTTCAGTTGATATGTCAGAAGGTGAGTTAAGACCAGAACATAATACAAACGTTGTAAAACTTATTGAGTTAGCCGCAAATGATACAGACGCAGAAAGAACAACTGCTGGTTATCAAAAAACAGGTGACTTAATAACTTTACCATATACTCATTCTAAGTTAACTGAAAATCCTTATGCAACTAAATCAGTTAACTGTAATCCATTCTTAGTATTTCAATATCAAGGTGATGTTGCATTAACACCAGATGTTGATGAATGGTACGATACAACTAGAAGACCTGATTTAATTGTAAACGATAATAACTTATTTGATACAATGACTAGTCTTGCAGGAACAAATAACAATTTAGGTACAGTTTGGAATAACTGGCAAACTAACTGGTCTGGTCGTTGGTCGTCTTCAGGTTCTTCAAGTAGAAGAATGGGCGATACAATTCATACAACTACTAGTACAATAGGCGGAGATATTACAACAAGAAGTAGAACAGGTATTACTAGAGAAATTTCAGGTTCAAATGTTGTAAGACAATCTTTTGGTGAAAGAATTGTTGATGTTGCGTTCATACCTTTTATTCGTTCTCAAACAATTTCATTCTCAGGTACAAGATTAAAACCAAACACAAGAGTTTATCCTTTCTTTGATAATGTAAATGTATCAACACATGTAACACCATCTGGTGGTGTATTAGGTGGTAACTTAGTTACTGGTACAACAGGTACAATTGAAGGAACATTTACAATACCAAATACAGCAAGTGAAAGATTTAGAACAGGTGATAGAATATTCAGATTAACAAGTTCATCTTCAAATAGTTCTACAGATGATGATGTAGATACTTTTGCTCAAGGTACATATACTGCTCGTGGTTTACAAACAACTACACAAGAAACAGTACAGTCAACTAGAGTACCAATTATTGGTAGACAAACTGTAACTGAACAAGATACAAGAAGAACAACAGATAGTTTTTCAGTATCACAAACAACACAACAAATTCAAAATAATCCAGACCCATTAGCACAAACGTTTAGTGTTGATGAAGCAAGTGGTGTATTCTTATCTAAAGTTGATATATACTTTGAAGAAAAAGATGATACAGTTCCAATTAAAGTTTATCTAGTAGAAACTATTAATAGTAGACCTGGTCAAAGAATACTTCCTTTCTCAGAGGTTACGCTTCAATCAAGTGAAGTTCTTACAAGTGCAACTGCTTCAACAGCAACAGTTGTAACATTCCCATCTCCTGTATATTTACAAGGTGGTAAAGAATATGCAATCATATTAAAACCTAACAGTCAAAAATATAAAGCATGGGTAAGTAGATTAGGTGATACAGATGTTGGTGGTACAAGACGAGTAACACAACAACCTTTATTTGGTTCTTTATTCCGTTCTCAAAATGCAAAACTGTGGACAGAAGACCAAATGGAAGATTTAAAAATTACTTTATACAAAGCTGCATTTGATACAACTACAAACGGTACATTGTCACTAACAAATGATGATATTGAAACTAAGACACTTGATAACAATGCTATTGAAACAAATGCTACTTCCGGTTCAGGTACAACATTTGGTGA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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.