Protein

Genbank accession
AGI61819.1 [GenBank]
Protein name
terminase large subunit [Vibrio phage JA-1]
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 1,00
Protein sequence
MSDLPEKTKVAMTVEDYLNNCDYSDINDYVPSEFAVKMVNLIKLIEGGNPENKTPVVHLRMLDNFVKKGLDTINMCHRGIAKALSLDTQIPTPTGNITISDLKVGDTIFTRNGKKTKVTHKSEVFHKPMYKIILEDGRELKVSEDHINIVQKRRTGKRSLGGFAEFELTTNQLLDKGVVYTRHVSDRNPNGYESKWFIPTIECINLDPVEFPLDPYTVGCILGDGSIDKYTGFTRFHTHKDDLKFFLSELQGADENSVRFDSKNPNGVRFSLKGLGKVIKKYVGTANVYNKRIPQELLWGSAVQRLSLLQGLMDTDGTVYNNSSSFCTVSKGLANDVLWLVRSLGFEAKLCNEKTYFRIYIYADKCIFRLPRKVNRWVPNKKGRIAIKSITTIELEPSQCIAVDDITHSFLAESFIVTHNTTLKEYLIWYIAIFNELPNLGSVPYALYVSDSIDNGVKKMRLSLEKRWNNSEFLQQYIPDKRFTDIRWEFINKEGKSFVVSGHGAQTGVRGTRENNSRPVLALLDDLVSDKDARSPTVIKAIEETVYNAIEFALHPNKRKVIWSGTPFNASDPLYKAVESGAWAVNVYPVCETFPCSREEFRGSWEDRFDYDSILKLYNKMKGLHKLDAFNQELMLRIMSEEDKLIEQGDIQYFVRSDVIRNLGNFNIYITTDFATSEKKQADFSVISVWAVNNKGYLYWIDGICKRQTIDVTIEDLFRLVQIYKPIDVGIEVTGQQGGFVSLIKSMMMDKNIFFNIASEGNNNKPGIRPTNQKFTRFLTVLPWFKQRMIYFPEDMSEHPAMVEAHNELSLVSRSGFKSKHDDFIDTISMLSLMKIWKPSESIELKYNDASGLWEDEVQTESYAMSSYIV
Physico‐chemical
properties
protein length:870 AA
molecular weight: 99533,63940 Da
isoelectric point:6,97792
aromaticity:0,10690
hydropathy:-0,33379

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage JA-1
[NCBI]
1283071 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGI61819.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KC438282.1 [NCBI]
CDS location
range 60468 -> 63080
strand -
CDS
ATGAGTGATTTACCAGAGAAAACGAAAGTAGCAATGACAGTAGAGGATTATCTGAATAACTGTGATTATTCGGATATCAACGATTATGTACCTTCAGAATTTGCTGTGAAGATGGTTAACTTAATTAAGTTAATTGAAGGTGGTAATCCTGAAAACAAAACACCAGTAGTCCATCTACGTATGTTGGATAACTTTGTTAAAAAAGGTTTAGATACTATCAACATGTGCCATCGTGGTATAGCAAAAGCTTTGAGCTTAGATACACAAATACCCACGCCAACCGGAAATATTACTATAAGCGATTTAAAAGTGGGTGATACTATTTTTACTCGAAATGGTAAGAAAACTAAAGTTACCCATAAATCAGAAGTTTTCCACAAACCAATGTATAAAATTATTTTGGAAGATGGCAGAGAATTAAAAGTTTCAGAAGACCATATAAACATTGTCCAGAAACGTAGAACAGGCAAAAGAAGTCTAGGGGGTTTTGCAGAATTTGAGCTAACAACAAATCAATTATTGGATAAAGGTGTTGTATACACTCGTCACGTGTCGGATAGGAATCCAAATGGTTATGAGTCCAAATGGTTCATCCCTACCATAGAATGTATAAATCTAGACCCTGTAGAATTTCCTTTAGACCCTTATACTGTTGGATGTATTTTGGGTGATGGTTCTATAGATAAATACACAGGTTTTACTAGATTTCACACACATAAAGATGATTTGAAGTTTTTTTTATCAGAACTACAAGGAGCTGACGAAAATAGTGTTCGGTTTGATTCTAAGAATCCAAACGGGGTTAGATTTTCCCTCAAAGGTCTTGGAAAAGTAATCAAAAAGTATGTAGGAACAGCAAACGTATATAATAAACGAATCCCTCAAGAATTGTTGTGGGGGAGTGCTGTACAACGTTTGAGTCTACTACAAGGTTTAATGGACACCGATGGCACTGTGTACAATAATTCATCCAGTTTTTGTACAGTGTCTAAGGGTTTAGCTAATGATGTATTATGGTTAGTTAGAAGTCTTGGTTTTGAGGCTAAGTTGTGCAACGAAAAAACATATTTTCGTATTTACATTTATGCTGATAAATGCATTTTTAGGTTGCCCCGTAAAGTGAATAGGTGGGTACCTAATAAAAAAGGAAGAATAGCTATTAAATCTATCACTACAATAGAATTGGAACCTTCCCAATGTATAGCTGTTGATGATATTACACACTCCTTTTTAGCAGAATCTTTTATAGTTACACACAATACGACCTTGAAAGAATACTTGATTTGGTACATTGCTATATTTAATGAATTACCTAATCTTGGTTCAGTCCCTTATGCATTATATGTTTCTGACTCTATAGATAATGGTGTGAAGAAAATGCGGTTATCCTTAGAGAAGCGTTGGAATAATAGTGAATTCTTACAACAATATATACCTGATAAACGTTTCACAGATATACGTTGGGAGTTTATAAATAAAGAAGGTAAGTCTTTTGTAGTTAGTGGTCATGGCGCACAGACAGGTGTACGTGGAACTCGTGAAAACAACAGTCGACCAGTATTAGCTTTATTGGATGACTTGGTTAGTGATAAAGATGCACGTTCACCAACAGTAATTAAAGCTATTGAAGAGACCGTATACAATGCTATTGAATTTGCTCTGCACCCAAACAAGAGAAAAGTAATCTGGTCAGGTACGCCATTTAATGCAAGTGACCCATTGTATAAAGCAGTTGAATCCGGGGCTTGGGCAGTAAACGTATATCCAGTATGTGAAACATTTCCTTGTAGTAGAGAAGAGTTTAGAGGTAGTTGGGAAGATCGGTTTGATTATGATTCTATTCTAAAACTCTATAACAAGATGAAAGGACTGCATAAACTGGATGCATTTAACCAAGAGTTAATGTTACGTATTATGTCTGAAGAAGATAAGCTAATTGAGCAAGGTGATATCCAATACTTTGTAAGGTCGGATGTAATCCGAAACTTAGGTAACTTTAATATTTACATTACTACTGACTTTGCTACTAGCGAGAAGAAACAAGCTGACTTTAGTGTGATATCTGTATGGGCAGTAAATAATAAAGGGTATCTCTATTGGATTGACGGTATTTGTAAGAGACAAACCATAGATGTAACTATTGAAGATTTATTTAGGTTGGTTCAGATATATAAACCAATTGATGTAGGTATAGAGGTTACCGGTCAACAGGGTGGGTTTGTATCTCTTATCAAATCTATGATGATGGATAAGAATATCTTCTTTAATATTGCTTCAGAAGGTAACAATAATAAACCGGGTATAAGACCTACGAACCAGAAGTTCACTAGATTCTTAACTGTATTACCTTGGTTCAAACAAAGAATGATATACTTCCCTGAAGATATGTCTGAACATCCTGCAATGGTAGAAGCTCATAATGAATTATCATTGGTTTCACGTAGTGGTTTTAAATCTAAACATGATGACTTTATAGATACTATTTCTATGTTGAGTTTAATGAAGATTTGGAAACCAAGTGAAAGCATTGAATTGAAATATAATGATGCTTCTGGCTTGTGGGAAGATGAAGTACAGACTGAATCTTATGCAATGTCTTCTTATATAGTATGA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.