Protein

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Genbank accession
XYM57343.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSFQLNSDRETIRAIAPTLVGTQELSIRNGLGSDEKEVLRTLLDPNTDLPRVGINRTGNRIDRIVVNLGGTGYTTQPTVNIAPPPAGGTQALGTAIISEGFVTAVLVDNPGLGYTSAPAVTITGGNGTGAQVEAFLDTVDFELDINGAIRTSTSIISDTARILNLDIDNFITPDAKFRAPDLKTYMNATGIPWSANIIVQKDAYRYRGPNVYQALNAGETGSTPPLHTDGTELNGEVNFKHIGFRVNDSGGYKYQDTGDSGEFPRSITPLLGDRSTKIATTEYVLNLATNDVGGRIYVSAQIGSDLNDGRSAVAPVRTIKKAAQLAWATPGVKETIIVSGGDYVEDNPISLPPDASVVGDNLRLVIIRPANPRKHIFKFGDKNYVIGVTYRDQIDSSGDAVATWDFAMVFDDKQRINYDYTVNGDFGTQFPIGTQIFGPEKFRADFQTNTGLANLVSSLPVRGVNTGAQGVLERVEFTTILGPSAYVSGNVDFSVTSGTFTAGETFQFGGQGTIEWQPNTAYTVGQLLWATDNVYTVAVAGTSAASSPVHDTGTVASGPDTLELTYLRDAYEFVSTDIKSIRAEGEVVFEDTNITDALPIVRVDFSLQGDPSIATGGFQDPGSAEDLGGIVFYTNALVGRQNTHDFKEGQEIVIEGMPTSSPDLSFLNGKQRIYKVLEDADGRSRRFVIPKKTTITTTDNFDPGQFCSVRSYEKSITISLLNSPNRFPMATPIARRYQDACLQIRNNVEFIADEVVGKINDQFKKEYYSVYGIGGTPDAQFTPTNVTYDPATGDAVFTVNNHGLSIGDGVSIADQSITFTCTMDGNKTEHALPDTDQYASGKSLPITAVTTNTFTLNVGASGPNQLFTPSAATYNPATGALNLTIGAHTLSVGEGIVIDDNSLSFTCDMDNNQSTKTYPRPGIDPFAGRSMPITEISETSITVNAGVSRPNQYFTPSAATYDASTGDLTVTVGQHGLGIGRSVVLEDNSFTFTCDQNGHATEHTYPRPGQDPYAGQSIAITAVGTTSHTVSDAVYTPTTGNLQLTINNHGFTNGDYIMVLNGTLLFTCDLDGNTVQKSYPRNEYDYPSNRWLQISNVTTNTFDINVGPSSYTGAHTFTGAISGGVRRQDGTFTINVGNAGSASGSTHLFVSASTNAIKHEPQSVHTFVGATSNAVRHLPQSAHTFVRSQTNSLSIGGSELKIYLGTSRFVHDYVSGGTVTFGGSTYNITNFVYDNVVNGEATITLNAPVANLSEDATVQIADILLECTVDGVVTQKVYPSFSIPVSDDKCRRDVGHFISAITRDLEFGSNYNVIDAAKKYIDGTNTEIDFVNNEIIQTVRALEYARELMIHAMRKWRTGTGAPGQPIYTPQYSSLPQYFDPTVIDDISSPACANVASAIDTLAYLFIDVLANNSSGTYLDGAYLIARNRDLIADEAYKQTLVQYPNLALNNIDERKCRRDINHIISALLRDLVLGGNFGIVNAAEFYFTGAALTGIPASELAPTRFAFQEAKDLCIAAMRNWTDDAGNAVLTPLSDIPQFTDTSILPDPAGIPLCANVQASINTAFTLLDNILLYAVDTTNGIAPGATTRDTGTLFDTSSIISYPESTIYDQTGLRITPRSDFADNPIIEASPYTQNSSVISFLGGGGAEVDGAKVKQPNCPFPGLELDGSATFPNQGKSMVASAFTIVSFGGTGYKVVNDGYTQLVSVFVIFCADGVLAESGGYCSITNSATNFGIFALRGRGFREEAYEFDVGQITNVSSTPTGRTIFTVNGLGREPLEHYVVKVDGFSNINPDIEYFVDVVEGVTVGPPFSAQLTLESGSGGGAEFKEDATNNPVSVGSMVGETLRLHRPSIVNSSSHTWEFAGSGTNYNALPENGGTKVEAYEQVSENYGRVYVSGTDELGDFKVGTFARIENRTGAITFTGTVTISEVEFLKLKGGDVVVTGFDASNTLGGANSTDSKLPTQKAVKDYITNNLGPYLNKPYSTNPVPRALVELTDSGKISEDQIPPLRPFQVYTVANQSERTAIEGALAGDIAIQQDTSTSFILNNDNDSLFVSFPVDATLQFTIGDVFTGSNTGGKIQATEYREGVVYQINITDGGSGYVTPPVVTISGGNPQAGAISANATCEIANGIVVLVTIELFNGLIGGKGYTSAPVVTFAAPAGSGTQAQGNALIESRLYGDIVNNIKMEDTDEFESSDVPSETINISRVVNTSASNSNNWVSLSSNQIAANDITSGVIATARLAFNNAAANSFSFLRGDQSYAPVIQSLKGAETRYFAKLTSQANSGSSQLIFSTNSDVLLGHEVVANINGIQPNTNISGILTAAGTTTVSIDNPLTATIPINSVIEFERGQSPLTFESSLTQGDFIDSVVIAAGGSGFTDGQYFDVELTGGAGTGLKANIIVSAGAVTELTLTASGSGYLADFTVSSAPAEIGSGSGLVLLAKLSTVNKQFANVAIDIARVSDLTISADEYGTIGVSRFYKDQFEIGLSGNGSIKLKTGADSGLDADKLDGAQGTFYLNSSNQNAGTLPVDRLSGTYNISIANQSGSTLRLVSSTSNLNSNPTPDAYNVGIIADTRNNSADGLADGGNQHVTLTIRNGGSGFDANLGGVRQLAFTDNDNMYLRGSGSTLATFGSWAKIWSSGNHGPDSGLDADRLDTRQGKFYQNAINVNEGIFSDNRMPPHQTAKDFQDSVRVLDWSGQPRYKILVRDELLTATPFLVGQQVNLYAANGTAPGRISITDIEVNQDINDASNNFTLITGTLTTGNFIGAVEIGTTALSYPFQDFSIATLDANADGLPDGTFEVAAMESAGGAARLKLGRQDGASATDPSVFFRSSLASAPNYNSAIIATGGNSADGSGSLEFKTANVNAMTLLGNVLWNEGNLVPYVSNVGSSYGTNNNDWDAANPDDNVTLRSIVMRDKDGNFNAGTITANLTGAASLNVLKAGDTMSGTLIISGIAAANQALSVSGRADFLSNITVNDDLTVNGTTLHVDAIDDTVSIGTTSSDSAVKLLIVEDADQDVVLRMYSSYNVGGAANQRDAVIQLLGQDGTRDEGLEIKYDNSVGDVYFKQLFNQLTTDAAIRFGTGAYGDDALTITGNGNLGIQMTADDAYELDVNGSARVKTALNIARAANNGGAPVIFAGATGASDGAGGYLSNFRIGNQMLQADTFEITPSDGSQGALVWKSTPALAIQGSENRVAINTLQFGGTDTTVSPQVQREYQLNIQGDININGLVFQNNAEFVTSRWTESDNELDIYRESKVWINPDSTEAGFTGDPDYDLQVGGGNNAGHLGLHGVMYIRDTPQWIDTTGIIKNSADTIAEDVTIPANANAMSIGPITIQPGVTIDVVGNWNII
Physico‐chemical
properties
protein length:3358 AA
molecular weight: 355933,25840 Da
isoelectric point:4,48337
aromaticity:0,08160
hydropathy:-0,15119

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Sf-CH1a
[NCBI] 		3413212 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYM57343.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340849.1 [NCBI]
CDS location
range 92776 -> 102852
strand +
CDS
ATGAGTTTTCAGTTAAATTCCGATAGAGAAACGATTAGAGCTATTGCTCCTACTCTAGTTGGTACACAAGAATTATCTATTAGAAATGGATTAGGTTCTGACGAGAAAGAAGTTCTCAGAACTCTACTTGATCCGAATACGGACTTGCCCCGTGTTGGTATCAACAGAACTGGAAACAGGATTGATAGAATTGTTGTAAATCTAGGTGGTACTGGATACACCACCCAACCGACTGTAAATATTGCTCCACCTCCTGCTGGTGGAACTCAAGCACTTGGCACTGCTATTATTAGTGAAGGTTTTGTTACTGCCGTTCTAGTTGACAACCCTGGTCTAGGTTATACCTCTGCTCCTGCTGTAACTATTACTGGTGGCAATGGTACAGGTGCTCAAGTCGAAGCATTCCTGGATACTGTTGATTTTGAACTTGATATTAATGGTGCTATTAGAACCTCTACGTCGATCATTTCCGACACGGCGAGAATTCTAAACCTGGATATTGATAACTTTATCACCCCAGACGCTAAATTTAGGGCACCTGATCTTAAGACCTACATGAATGCCACTGGTATTCCCTGGTCAGCGAATATCATTGTTCAGAAAGACGCTTACAGATATAGAGGTCCAAACGTATACCAGGCACTCAATGCTGGTGAAACTGGATCTACACCTCCACTACACACGGATGGTACTGAACTCAATGGCGAGGTAAACTTCAAGCACATTGGTTTCCGTGTCAATGATTCTGGTGGATATAAGTATCAAGATACTGGAGACTCTGGTGAGTTCCCACGTTCTATTACTCCTCTTCTTGGAGATAGATCTACTAAGATTGCAACCACAGAATACGTCCTCAACCTAGCAACGAATGACGTTGGTGGTCGTATCTATGTTTCCGCACAGATTGGTTCTGACTTGAACGATGGTCGTTCTGCAGTTGCTCCTGTTCGTACTATCAAAAAAGCAGCACAACTTGCATGGGCAACTCCTGGTGTCAAGGAAACTATTATTGTTTCTGGTGGAGATTATGTAGAAGATAACCCAATCTCTCTACCACCTGACGCATCTGTTGTTGGTGACAACTTGCGTCTGGTTATCATCCGCCCAGCAAACCCAAGAAAGCATATCTTCAAGTTTGGTGACAAGAACTATGTCATCGGTGTTACCTATCGTGACCAAATTGACTCCTCTGGTGATGCTGTCGCAACTTGGGACTTTGCGATGGTCTTTGATGACAAGCAAAGAATCAACTATGACTATACAGTCAATGGAGATTTTGGTACTCAGTTCCCAATTGGTACTCAAATCTTTGGACCAGAAAAGTTCCGTGCTGACTTCCAAACAAACACTGGTCTTGCAAATCTAGTATCAAGTCTTCCTGTTAGAGGTGTCAACACTGGTGCTCAAGGTGTTCTTGAAAGGGTAGAATTTACTACTATTCTTGGACCATCTGCATATGTGAGTGGTAATGTTGACTTCTCAGTTACTAGCGGTACGTTTACTGCTGGTGAGACATTCCAGTTCGGTGGTCAAGGTACTATTGAGTGGCAACCCAATACAGCATATACTGTAGGTCAACTACTTTGGGCAACAGATAATGTATACACAGTTGCTGTTGCTGGTACTTCCGCTGCCTCTTCTCCTGTACACGATACAGGTACAGTTGCTTCTGGTCCCGACACACTAGAACTAACTTATCTTAGAGATGCTTACGAATTTGTTTCTACTGACATTAAGTCAATTAGAGCAGAAGGTGAGGTTGTTTTTGAAGATACAAATATTACTGATGCTCTACCTATTGTTAGAGTTGACTTCTCCCTCCAAGGAGATCCAAGTATTGCAACTGGTGGTTTCCAAGATCCAGGATCTGCAGAAGATCTTGGTGGTATTGTTTTCTATACGAACGCACTGGTTGGTAGACAAAATACACACGACTTCAAAGAAGGTCAAGAGATTGTTATTGAGGGAATGCCCACAAGTTCTCCAGACTTGTCGTTCCTAAATGGTAAGCAAAGAATTTATAAAGTTCTAGAAGATGCTGATGGTCGTTCTAGAAGATTTGTTATTCCTAAGAAGACCACAATCACTACTACAGATAACTTTGATCCTGGTCAGTTCTGTTCTGTTAGATCTTATGAGAAGTCGATTACTATTTCCCTTCTCAACTCTCCAAACAGATTCCCAATGGCAACACCGATTGCCAGAAGGTATCAAGACGCTTGCCTGCAGATTAGAAACAACGTAGAGTTCATCGCAGATGAAGTTGTAGGTAAGATCAATGATCAATTTAAGAAAGAATACTATTCAGTATATGGCATTGGCGGTACTCCTGACGCTCAATTCACACCAACAAACGTAACTTACGATCCTGCTACTGGTGATGCTGTATTTACAGTTAACAATCACGGATTGTCTATTGGTGATGGTGTATCAATTGCTGATCAGTCCATCACATTTACATGTACGATGGATGGTAATAAGACTGAGCACGCATTACCTGATACAGATCAGTATGCTAGCGGCAAGTCTCTGCCAATTACAGCAGTCACAACTAATACGTTTACTCTAAACGTAGGTGCATCTGGTCCAAACCAACTATTCACACCATCTGCTGCAACTTATAATCCAGCAACAGGTGCTCTTAATCTAACAATTGGTGCTCATACACTATCTGTTGGTGAGGGTATCGTTATTGACGATAACTCCCTGTCGTTCACTTGCGACATGGATAACAACCAGTCTACTAAGACTTATCCACGTCCAGGAATCGATCCTTTCGCTGGTAGGTCTATGCCTATCACCGAGATTTCGGAAACTAGCATCACAGTTAACGCTGGAGTATCAAGACCAAACCAATACTTTACTCCATCCGCTGCTACTTACGATGCTTCTACTGGAGATCTGACAGTTACTGTAGGACAGCATGGTCTGGGTATTGGTCGTAGTGTTGTTCTCGAAGACAATTCCTTCACCTTCACTTGCGATCAAAACGGACATGCCACTGAGCATACGTATCCTCGCCCTGGTCAAGATCCTTATGCAGGTCAGTCAATTGCTATCACTGCTGTTGGTACTACATCACACACCGTCAGCGATGCCGTTTATACACCAACAACAGGCAACCTACAACTAACCATTAACAATCATGGTTTTACTAATGGCGATTACATCATGGTTCTCAATGGAACCTTGCTGTTTACCTGTGATCTAGATGGAAATACAGTACAGAAGTCTTATCCACGTAATGAATATGATTATCCATCCAATCGTTGGTTGCAAATTAGCAATGTAACCACAAATACATTCGATATCAATGTTGGTCCTTCTTCTTATACAGGTGCTCATACATTTACTGGAGCTATCTCTGGTGGTGTTCGCAGACAAGACGGAACTTTCACTATCAACGTAGGTAATGCTGGTTCTGCATCTGGTTCTACTCACCTCTTTGTAAGTGCTAGCACTAATGCTATTAAGCATGAACCACAATCTGTCCACACATTTGTAGGTGCAACATCAAATGCTGTTAGACATCTTCCACAATCTGCTCACACATTCGTAAGATCTCAAACGAACTCCCTAAGCATTGGTGGTTCCGAACTGAAGATTTACCTAGGAACATCTAGATTTGTACATGACTATGTAAGTGGCGGTACTGTTACTTTCGGTGGATCCACATACAATATCACCAACTTTGTATACGACAACGTTGTCAATGGCGAAGCAACTATCACGCTTAATGCTCCCGTTGCTAATCTATCTGAGGATGCAACTGTACAAATTGCAGATATCCTCCTAGAGTGTACTGTAGATGGTGTAGTTACCCAGAAGGTCTATCCAAGTTTTAGCATCCCTGTAAGCGACGACAAGTGCCGCAGAGACGTTGGTCACTTCATTAGTGCAATCACTAGAGACCTTGAGTTTGGAAGTAACTATAACGTTATCGATGCAGCGAAGAAATACATCGATGGAACTAATACAGAAATTGATTTTGTCAATAACGAAATCATTCAAACAGTACGTGCTCTAGAATATGCTAGAGAACTGATGATTCACGCCATGAGAAAGTGGCGTACTGGTACAGGTGCTCCTGGTCAACCAATTTATACTCCTCAGTATTCTTCTCTTCCACAATACTTTGACCCAACAGTCATTGATGACATCTCGTCACCTGCTTGTGCTAACGTTGCATCTGCAATCGATACGCTTGCATATCTGTTTATTGATGTTCTTGCAAACAATTCTTCTGGAACATATCTAGATGGAGCATATCTGATTGCTAGAAACAGAGACCTGATTGCTGATGAAGCATACAAGCAGACTCTGGTTCAATATCCCAACCTAGCACTCAATAATATTGATGAGCGTAAGTGCCGTAGAGATATCAACCACATCATCAGTGCTCTCCTAAGAGACCTTGTTCTTGGTGGCAACTTTGGTATCGTCAATGCTGCTGAGTTCTACTTCACTGGTGCCGCACTGACTGGCATTCCTGCTTCCGAACTAGCACCTACTAGATTTGCATTCCAGGAAGCAAAAGATCTTTGTATCGCAGCAATGCGTAACTGGACAGATGATGCTGGCAATGCAGTTCTAACACCTCTATCTGATATTCCTCAGTTCACCGATACTAGCATTCTTCCTGACCCTGCTGGTATTCCTCTCTGTGCAAACGTACAGGCGTCTATCAACACAGCATTTACTTTGCTGGATAATATTCTCCTCTACGCAGTTGACACAACTAATGGTATTGCTCCTGGTGCTACCACTAGAGACACAGGAACTCTCTTTGATACCTCTTCAATCATCTCTTATCCAGAGAGCACAATCTACGATCAGACTGGACTTAGAATTACTCCACGTTCTGACTTTGCAGATAACCCAATCATTGAAGCATCTCCATACACACAGAACTCTTCTGTTATCTCCTTCCTAGGTGGTGGCGGTGCTGAGGTTGATGGTGCTAAGGTTAAGCAACCCAACTGCCCATTCCCTGGTCTAGA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ACGCTATGTCTATTGGTCCTATTACGATTCAACCAGGCGTCACTATCGACGTGGTTGGTAACTGGAACATTATCTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
b4e1c8513cf78c059e391b6f659b26cc3ab3d767540be2a3c767e5543b8ae5b1
AlphaFold3
Source AlphaFold3
Method AlphaFold3
Resolution 0,8453
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50