Protein

Genbank accession
AGG09390.1 [GenBank]
Protein name
Cas3 [Vibrio phage ICP1_2011_A]
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 1,00
Protein sequence
MFIRIKCFSKQPIAKKVSREVSAYLEYTGNNTWEGHISGQGVSNLQTKLINVGKGVKVVCNYQDKVLFAIGNVAMSDTGSVPKYTTKKVYKPDDSIFTLKQGLVGVAALWHDLGKANSYFQRKLRGECNPSDPVRHEWVSGVIVSTFAKGNDWLSDDFIIPEVKHSDNVFGDDQVLNAVLWLINTHHKKGLVEDPIYRATKTMFTETLQCVNVNGGWFNYGDNIDECYKIDTSFITDTYVKQLNRYRKKLLATKHIWFTLGEDQKIAILQECRVALMLGDSNFSSDLIGGDGSHLYANLDECGNLKQTLTQHLLGVTDCALKALFTINHHKPVKANFIPTIAEKGEGKFAWQNGVNMVDSSIDNMFCINMASTGKGKTLANLKLLQHFGNVRCSFGLGMVSLTKQTAKQFLDMGVDYNSAAMVTGFSKSRFNLGSESLDQDEVSVEYWGQTSSLSKVFPNNNAGFKNKKLLSAPILVTTTDHLVKASGVKKGNKQMLPYVRCMHSDLVLDEIDDYGIEDMVVLARLVYLTACYGNKVIISSATITPAISNIFYEAYSSGYKVFCANKQTTYKGVNVVWWDEFGIKVEKVTDQFSNLNTRFVNKRITNLLESTPKHKALVVDQDDNMEAVKQSITTLHNAHNSGGVSFGLIRTTTIKDCVAVTQELQNWETDLSIKILCYHSRFVGDTKAQMEEYLSKVLNRKGDEYKKFVDTTTPTAYIVVATPVVEVGRDFDFDWAIIEPSSERSIVQCAGRVLRHRSSTPTTHNIHILKYPFKFYRNSNICYDVAGYESKGYKLKSKNMLDIYKKESIVNSVNRLQGDAAFYTKSLTALEHKVLLDKLTTDIADTNVFVGGWQLTANPHEYCKWRRGTKNEDLVLTDGKWSGNVTTTKPIQSKIWRKWQGENGSITVPEYLLDKTICYNDFYGGYENE
Physico‐chemical
properties
protein length:930 AA
molecular weight: 104569,95740 Da
isoelectric point:8,55175
aromaticity:0,10215
hydropathy:-0,30269

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage ICP1_2011_A
[NCBI] 		1296592 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGG09390.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KC152959.1 [NCBI]
CDS location
range 893 -> 3685
strand +
CDS
ATGTTCATCAGGATTAAGTGTTTCTCGAAACAACCTATAGCCAAAAAGGTAAGTCGTGAAGTATCAGCCTATCTGGAATACACTGGCAATAACACATGGGAAGGTCACATAAGTGGTCAGGGTGTTAGTAATTTGCAAACAAAGTTGATTAATGTAGGCAAAGGTGTAAAGGTAGTTTGCAATTACCAAGACAAGGTTTTATTTGCTATCGGTAATGTAGCTATGTCGGACACTGGTTCTGTTCCAAAATACACCACTAAAAAAGTGTACAAACCTGACGATAGTATCTTCACACTAAAACAAGGTTTGGTTGGTGTAGCTGCACTTTGGCACGACTTAGGTAAAGCTAACTCTTATTTCCAGAGGAAACTACGTGGTGAGTGTAACCCCAGCGATCCTGTTCGTCACGAGTGGGTTAGTGGTGTTATTGTTTCGACTTTTGCCAAAGGTAACGACTGGTTATCAGATGACTTTATCATCCCAGAAGTAAAGCATAGCGATAATGTTTTTGGGGATGATCAGGTGCTTAATGCTGTGTTGTGGCTTATTAATACCCACCATAAAAAGGGTTTAGTCGAAGACCCTATTTATCGTGCAACAAAAACTATGTTTACAGAAACTTTACAATGCGTAAATGTTAATGGTGGTTGGTTTAATTACGGAGATAATATTGACGAGTGTTATAAAATTGATACATCTTTTATTACTGATACTTATGTTAAACAACTAAACCGTTACCGTAAAAAGTTATTAGCCACTAAGCACATATGGTTTACTTTAGGCGAAGACCAGAAGATTGCTATACTGCAAGAATGTAGAGTTGCATTAATGTTAGGAGATAGCAATTTCAGCTCCGATCTAATAGGGGGTGATGGTAGCCACCTTTACGCAAACTTGGATGAATGTGGCAATTTAAAACAAACACTAACACAACATTTATTAGGTGTAACAGATTGTGCATTAAAAGCTTTATTCACAATAAATCACCACAAACCTGTAAAAGCTAACTTCATCCCTACAATAGCTGAAAAAGGAGAAGGTAAGTTTGCATGGCAGAATGGTGTAAATATGGTTGATAGTAGTATTGATAACATGTTTTGTATTAACATGGCAAGTACAGGAAAAGGTAAAACATTGGCAAACCTGAAACTTTTACAACACTTCGGTAATGTGCGCTGCAGTTTTGGGTTAGGTATGGTTAGTTTAACAAAACAGACAGCTAAGCAATTTCTGGATATGGGCGTGGATTACAACTCCGCAGCGATGGTTACTGGTTTTAGCAAAAGTAGGTTTAATTTAGGTAGTGAATCTTTAGATCAGGATGAAGTTAGTGTTGAGTATTGGGGGCAGACAAGCAGTTTGTCCAAAGTTTTTCCCAATAACAATGCAGGTTTTAAAAACAAGAAATTACTGTCTGCACCAATCTTAGTTACTACCACAGATCATTTGGTTAAAGCTTCCGGCGTAAAAAAGGGCAATAAGCAAATGTTACCTTATGTGCGTTGTATGCACAGTGATTTAGTGTTGGACGAGATCGATGATTATGGTATCGAAGATATGGTTGTATTGGCACGCTTAGTGTACCTTACTGCATGTTACGGTAACAAAGTTATTATCAGCAGCGCTACTATTACACCTGCAATCAGCAATATATTTTACGAAGCGTATAGCAGTGGTTATAAAGTGTTTTGCGCCAACAAACAAACTACATACAAAGGGGTTAATGTCGTGTGGTGGGATGAGTTTGGTATTAAAGTTGAAAAGGTTACTGATCAATTTAGCAACCTTAACACACGTTTTGTTAATAAGCGGATTACTAACTTACTTGAGTCTACACCTAAGCATAAAGCTTTAGTTGTGGATCAAGATGATAATATGGAAGCGGTAAAACAAAGTATAACCACCCTACATAACGCACATAATAGTGGCGGCGTTAGTTTTGGATTGATCCGCACAACAACGATTAAAGATTGTGTAGCTGTAACACAGGAGTTGCAAAATTGGGAAACAGATTTAAGCATAAAAATCCTTTGTTACCATAGTCGGTTTGTGGGGGATACAAAAGCACAGATGGAGGAATATTTATCCAAAGTGTTGAACCGCAAAGGAGATGAGTATAAAAAGTTTGTCGATACAACAACACCAACAGCTTACATTGTGGTGGCAACTCCTGTGGTTGAAGTAGGCCGCGATTTCGATTTCGATTGGGCGATCATTGAACCTAGCAGTGAACGTAGTATTGTGCAATGTGCAGGGCGTGTATTACGGCATCGTTCGTCAACCCCAACAACACACAATATTCATATACTAAAGTACCCATTCAAATTTTACCGTAATAGTAATATTTGTTACGATGTTGCAGGGTACGAAAGTAAAGGGTATAAATTAAAAAGTAAAAATATGCTTGACATATATAAAAAGGAAAGTATAGTTAACAGCGTAAACCGTTTGCAAGGGGATGCAGCATTTTACACAAAAAGCTTGACAGCACTGGAACATAAGGTATTGTTGGATAAGTTAACCACCGATATCGCCGATACTAATGTGTTTGTGGGTGGCTGGCAACTTACAGCAAACCCTCACGAATATTGCAAATGGCGTAGAGGAACAAAAAATGAAGATTTAGTGTTGACAGATGGTAAATGGAGTGGTAATGTTACGACAACCAAGCCGATACAATCCAAAATTTGGAGAAAATGGCAAGGTGAAAATGGAAGTATTACCGTACCTGAGTATTTGTTAGATAAAACAATATGTTACAACGATTTTTATGGAGGGTATGAAAATGAATAG

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.