Protein

Genbank accession
XLM56280.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
Protein sequence
MALTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDAIDNRGNSALRPFKSIQRAFLEVARFSYRVGLSNDEFDAFSIMLYPAEYVIDNRPGEVLYTNVPPIDDNSNLDLTSPNNVLYKYNSVEGGVIVPRGCSLVGTDLRRTKIIPKYVPYPTTFPSKNINNEDQVPPRSAIFKVTGGTYFWQFSFFDGAEEGVYFKPDSTETLAPKFSHHRLTCFEFADGLNPLSKLIADGTVPNADYSAVANIQERTDLEIYYQKVSKAFATIPDTSGDPATDQIQARVEENRIVGPISDEYRVFQITRNGQTATAVTVDELGNERNHGFSVGVNINISGVTGSTGPQSELDASLYNGSFTVTSASGNVFTYQMSDEPTGNATGNSISVKTEIDTVDSASPYAFNLSLRSVWGMNGMLADGAKATGFKSMVVAQFTGLSLQKDDRAFVRYNASTGNYDVATAGDGAHLDGFAEYRKGWAHRHIVAANDAFIQAVSVFAVGYGSHFTCESGADMSITNSNSNFGNTALRSAGFKAKSFSKDKAGEITHIIPPKALNVISTTATGTSGTNTITLANDGSVNGVIQGMTITGDNIGSGATVSSVNVNTRVITLTVNNSGTVNGNIIFGEETSINWVNIDIQRTKDINAALVGQGGTAGTRLYLFGYTTEASPPSTKVQGYAIGARQDGTGVNAIPDKINCLLVPTAGAASSEVRTAKISPYGPSVSSLSAGAAGSPLQFDSNTYTVNGVAGTVGGWYLSVDSNDNEIYTTLTTNTQYNSVNFTPTTFIKRIPDPRDLQDRTYRVRYVIDKDKTNPLPRDPLSGYVIQPLNSDTTSFGLNRTFYIYDIEVVQEFERGISDGIYYLTLLCASIAPSTSNFNDRKFSQNVNEVYPTFDRDNPVADPSAAISVADNETIGLVNATDGASPTPNKDPKLSITKEATVFLLTDTGWQQPSTTPNYDSVNSRLSGVELTARAGDEETRKISIRETNDGVVSPIPVELRRHSILRSGNHTFEYLGFGPGNYSTAFPQTQVETLSADQIKFSQSIKEEAGVAFYSGLNSNGDLFIGNQVINPVTGQITNEDIAQLNVVGEENTTIETFSELVLTDKLTVIGGASNPLESIFAGPVTFQGQISSTNNIVAKKITYNNQDGTVIKQTLLAPEDAQGQPSFANITGYDTPADGDLVYNINWEPGKSLGWIYYSGTWHEFGLTDVGFIDITDKDPLIPANDLTIDSDGTVGSGIGIGRNALNSYRVAVEGDVYVDGNLVGTGQGFVGSDKYITRTYTGDGATLTFAISTYTGVQHTDDSCLVFLNGVAQIAGTNYTVDANGANIVFSAGDAPLGSDTVHIVEMPI
Physico‐chemical
properties
protein length:1335 AA
molecular weight: 143350,80410 Da
isoelectric point:4,66008
aromaticity:0,09139
hydropathy:-0,24202

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage WH25-B
[NCBI] 		3384917 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XLM56280.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ638372.1 [NCBI]
CDS location
range 154286 -> 158293
strand +
CDS
ATGGCTCTTACTCGTCTTAAGAATATTATTACGTCCAGAACTGGACGTATTATCTACGTCAACCCTGATGATTTTGACGCTTCGGATGCCATTGACAATAGAGGAAACTCTGCTCTCCGTCCATTTAAGTCAATTCAAAGAGCATTTCTTGAAGTTGCTAGATTTTCGTATCGAGTAGGTCTGTCGAACGACGAATTCGACGCCTTCTCGATTATGCTGTATCCAGCAGAATATGTCATTGATAATAGACCTGGAGAAGTTCTTTATACGAACGTTCCTCCTATTGATGACAACTCAAACTTAGACCTCACATCTCCCAATAACGTACTTTATAAGTATAATTCTGTTGAAGGTGGTGTTATTGTTCCTAGAGGTTGTTCTCTTGTAGGTACTGACCTTCGTCGTACTAAGATTATTCCTAAGTACGTTCCTTATCCTACAACTTTCCCATCCAAAAATATTAACAACGAAGACCAAGTTCCTCCCAGAAGTGCAATCTTCAAAGTAACTGGTGGTACTTACTTCTGGCAGTTCTCCTTCTTCGATGGTGCTGAAGAAGGTGTGTATTTCAAACCAGATAGTACAGAAACATTAGCACCTAAGTTCTCTCACCATAGACTGACTTGTTTTGAATTTGCTGATGGTTTGAATCCTCTCTCTAAACTAATTGCTGATGGCACTGTTCCTAATGCGGATTACTCTGCAGTTGCTAATATTCAAGAGAGAACAGACCTAGAGATTTACTACCAGAAAGTATCGAAGGCATTTGCTACAATTCCTGATACGTCTGGTGACCCCGCTACTGACCAAATTCAGGCAAGAGTTGAAGAAAACCGAATCGTTGGTCCTATTTCTGATGAATATCGTGTTTTCCAGATTACTCGTAACGGACAAACTGCAACGGCAGTTACTGTTGACGAATTAGGTAATGAAAGAAATCACGGATTCTCTGTCGGTGTTAACATTAACATCAGTGGTGTTACTGGTTCTACTGGACCTCAGTCAGAATTAGATGCATCATTATATAATGGTTCATTCACAGTTACATCTGCATCAGGTAACGTATTTACCTATCAAATGTCAGATGAACCAACAGGTAATGCAACTGGTAATAGTATTTCTGTTAAGACTGAGATTGATACTGTTGACTCTGCATCTCCATATGCGTTCAACCTGTCCCTGAGAAGTGTCTGGGGCATGAATGGTATGCTCGCTGATGGTGCTAAAGCAACTGGTTTCAAATCGATGGTTGTTGCACAGTTTACTGGTCTATCTCTCCAAAAAGATGATAGAGCATTTGTAAGATATAATGCTTCTACTGGTAACTATGATGTTGCAACTGCTGGTGATGGTGCTCACTTAGACGGTTTCGCTGAGTATCGTAAGGGTTGGGCACATAGACACATTGTTGCTGCTAATGATGCATTTATTCAGGCAGTTTCAGTGTTCGCTGTTGGATATGGTTCACACTTTACTTGTGAGAGTGGTGCTGACATGTCCATCACCAACTCTAACTCGAACTTTGGTAATACTGCTTTAAGGTCTGCTGGATTCAAAGCAAAATCCTTCTCAAAAGATAAAGCAGGTGAAATCACTCACATCATTCCACCTAAAGCACTGAACGTTATTTCAACAACTGCTACAGGTACTTCTGGAACTAATACTATTACTCTTGCCAATGATGGTTCTGTGAATGGTGTTATTCAAGGAATGACAATCACTGGTGATAATATTGGTTCTGGTGCAACAGTTTCTTCTGTTAATGTTAATACTCGTGTAATTACACTGACCGTTAATAATAGTGGAACAGTCAATGGTAACATTATCTTTGGTGAAGAAACCTCTATTAACTGGGTCAACATTGATATTCAACGCACCAAAGATATTAACGCTGCATTAGTTGGACAGGGTGGAACTGCTGGAACTAGATTATATCTCTTTGGATATACTACAGAAGCATCACCCCCATCGACAAAAGTTCAGGGTTATGCAATCGGTGCCCGTCAAGATGGTACAGGTGTTAATGCTATCCCAGATAAGATTAACTGTCTGTTAGTTCCAACAGCAGGTGCTGCATCTTCTGAAGTTCGCACAGCAAAGATTTCTCCTTATGGTCCATCTGTTTCTAGTTTAAGTGCTGGTGCAGCAGGTTCTCCATTACAATTTGATAGTAACACATATACAGTTAATGGTGTCGCTGGAACAGTTGGTGGTTGGTATCTCAGTGTAGATTCTAACGATAATGAAATTTACACAACACTCACTACCAATACTCAATACAATAGTGTAAACTTCACTCCCACAACTTTCATCAAGAGAATTCCTGACCCTCGTGACTTACAAGATAGAACATATCGTGTTCGTTATGTAATTGATAAAGATAAGACCAATCCTCTGCCTAGAGATCCTCTGTCGGGTTATGTAATACAACCTCTGAACAGTGATACTACGTCATTTGGATTGAATAGAACCTTCTATATCTACGATATTGAAGTAGTACAAGAGTTTGAGAGAGGCATTTCCGATGGTATCTACTACCTTACCCTCCTTTGTGCATCTATTGCACCTTCGACTTCTAATTTCAACGACAGAAAGTTCAGTCAAAACGTCAACGAAGTCTATCCTACGTTTGACAGAGACAACCCTGTTGCTGACCCTAGTGCTGCAATATCCGTCGCTGACAACGAAACTATCGGTCTCGTAAATGCAACCGATGGTGCATCTCCTACACCTAACAAGGACCCTAAACTTTCTATTACTAAAGAAGCAACTGTATTCCTTCTGACTGATACGGGTTGGCAGCAACCAAGTACAACTCCAAACTATGATTCTGTTAATAGCAGACTCTCTGGCGTTGAACTTACTGCTCGTGCTGGTGATGAAGAAACTAGAAAGATTAGTATTCGTGAAACTAATGACGGTGTAGTTTCTCCTATCCCAGTAGAACTTAGAAGACACTCTATCTTACGTTCTGGTAACCATACGTTTGAATATCTTGGTTTCGGTCCTGGTAACTACTCAACTGCATTCCCTCAGACACAAGTAGAGACATTATCTGCTGACCAGATTAAGTTCTCTCAGTCGATTAAAGAGGAAGCAGGTGTTGCCTTCTATTCGGGTCTTAACTCTAACGGTGACCTGTTTATTGGTAACCAGGTTATCAACCCTGTTACAGGTCAAATTACCAATGAAGATATTGCACAACTGAATGTTGTTGGCGAAGAGAATACAACGATTGAGACATTCTCTGAGTTGGTTCTTACTGACAAACTCACGGTTATCGGTGGTGCATCTAACCCGTTAGAATCTATCTTCGCTGGTCCTGTTACTTTCCAAGGTCAAATATCTTCTACTAATAATATCGTTGCTAAGAAGATTACTTACAACAACCAAGATGGTACAGTAATTAAGCAAACTCTGCTTGCACCTGAAGATGCACAGGGACAACCTTCTTTTGCTAATATCACAGGATATGATACACCTGCCGATGGTGATTTAGTTTACAATATCAACTGGGAACCTGGTAAGTCTCTTGGTTGGATTTATTACAGTGGAACATGGCATGAGTTTGGTCTGACTGATGTTGGATTTATCGACATTACTGATAAAGACCCTCTTATTCCTGCTAACGATTTAACTATCGATTCTGATGGTACTGTAGGAAGCGGTATTGGTATTGGTAGAAATGCTCTAAACTCTTATAGAGTTGCTGTAGAAGGTGATGTTTATGTTGATGGTAACCTTGTTGGTACTGGTCAAGGTTTCGTTGGTTCTGATAAATACATCACCAGAACATATACTGGCGATGGTGCAACTCTAACATTTGCAATTAGCACCTATACTGGTGTTCAACACACTGATGATTCTTGTTTAGTATTCCTCAATGGTGTTGCACAGATTGCAGGCACTAACTATACAGTAGATGCCAATGGTGCAAACATTGTCTTTAGTGCTGGTGATGCTCCATTAGGTAGTGATACCGTTCATATTGTGGAGATGCCTATCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.