Protein

Genbank accession
XPO97720.1 [GenBank]
Protein name
tail spike protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MATFPTYPATSLEQGVDLVIFSSNQLHDVINGSATESIETESGLIPTLRKALVDNFFFKSPLDWAQGTNETVFNQLRYFQNGVLSGYYYAPNATLVNPIPMQGTPVGDNNWVLWGLKTEQLATEVTPWVYSGATGYETVISPPYIFDSAIVTINGVIQVLGEAFRIEDSKIILSEPLGHDPATGLPNKLFAYIGKIVASADTDPNLENRLVSLETKTEELTESMDKVPLQTIARKYGLLDDEVAYATAGQSLTGIKALYDPVAQSSYTLPPNITGTLTSLSVSGVMTYSGGSVDLSALAVERGQFVHLPTSFGNNVTLTAKNQTIGRGAGRYRWAGSLPKSILASDTLETSGGLGPNAWVLTNTEGLLTPRGGTYNDLFDVVYLSEFANNTTTYTTPEAAFQAALLAAKASKSKILDAYGCDMTFTTSSFDIQGITLRGGVFRGQRDYRVQNATVEGTTFRNSRVMYWGGAVRMFDCLWDGAPRAGQVGSLVFQGNPISGTFEIDNCTFKNGLYGILQQGTGEPVTRGVFRNLTFMDMQGDAIELNVINKHYDDGCVIENIYLSNIDGTNAPIPLSNWGIGIGVAGKGPYGYGIPDDQYCKNITIRNVFAKRCRQIVHVEVGRNISIENIHGDPDQTVSVGTGLATGAVVMYGSKDFTIDGVYGEPKTDGSTLASNIRMIYLEWGTNAVLDGEGNPVVPAQGRPSNPCFNYSVRNIHTKTGRVFAGVSAGPGYENRVSFENIRCAALQLFGIASWLSMSNITCNIFDCVGQPESGPGTFYDGFFRREKSVLEMVNVNCYPDGKTMVTGRPQWSRCRYSDIHRVNCNVEANMYTNIAGGIGAIVGTTGKVYYLEPNPSRNIDGMHFPTGKEFDKGDMIVKADNTFFLVTTSGAYIPDIPAFGIRATQAGDTFLTQNLTPNGTATNASWLYHYPLSAGTRIRIPGAGVGGADLDTVITRAPYQDNDTWTNPVKIDIADPIVTPTSAGVRIKTIPNDSSNVSVGNTAVIRPTPVVDVPTT
Physico‐chemical
properties
protein length:1017 AA
molecular weight: 109795,21360 Da
isoelectric point:5,05318
aromaticity:0,09538
hydropathy:-0,13540

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage SF1-1
[NCBI] 		3385252 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XPO97720.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ571307.1 [NCBI]
CDS location
range 128293 -> 131346
strand -
CDS
ATGGCAACATTCCCAACATATCCAGCAACGTCTCTCGAACAGGGCGTAGACCTGGTTATTTTCTCATCTAACCAACTCCATGATGTTATTAATGGAAGTGCTACAGAGAGTATTGAAACAGAATCAGGGTTGATACCAACCCTGAGAAAAGCCCTTGTTGACAACTTTTTCTTTAAAAGCCCATTGGATTGGGCGCAAGGCACAAACGAAACAGTTTTTAACCAACTTCGTTATTTCCAGAATGGAGTATTGAGCGGTTATTACTATGCCCCTAACGCTACGTTGGTTAACCCAATCCCTATGCAAGGGACTCCAGTAGGAGATAACAACTGGGTATTGTGGGGACTGAAAACAGAACAATTGGCAACAGAAGTCACCCCGTGGGTATACTCTGGTGCAACGGGTTATGAAACAGTAATTAGTCCTCCTTACATCTTTGATAGTGCTATTGTTACGATCAATGGTGTTATTCAGGTTCTGGGGGAAGCTTTCCGTATAGAAGATAGTAAGATCATCTTATCTGAACCTTTGGGACACGATCCTGCAACAGGACTGCCAAACAAGCTTTTTGCTTATATTGGTAAAATCGTAGCTTCAGCAGATACAGATCCTAATCTAGAGAATCGTCTTGTTAGTTTAGAAACAAAAACGGAAGAACTAACAGAAAGCATGGATAAAGTCCCTCTGCAAACTATTGCTCGTAAATATGGTTTGTTAGATGATGAGGTGGCTTACGCAACAGCAGGTCAATCGTTAACAGGGATTAAAGCTCTGTATGATCCAGTAGCACAGTCTTCCTACACATTACCTCCTAACATCACAGGAACTTTAACATCCTTGTCTGTTTCTGGAGTAATGACTTATTCTGGGGGGTCTGTAGATCTTTCTGCACTAGCTGTTGAACGTGGACAGTTTGTTCATTTGCCTACAAGCTTTGGTAATAACGTAACTCTGACAGCTAAAAATCAGACGATTGGACGTGGTGCTGGTCGTTATCGTTGGGCTGGAAGTTTACCAAAAAGTATTTTGGCCTCCGATACATTGGAGACAAGCGGTGGATTAGGTCCAAATGCATGGGTTCTGACCAATACAGAAGGACTATTAACCCCTCGTGGTGGAACATACAACGATTTATTCGATGTTGTCTACTTGTCAGAATTTGCTAACAACACAACAACATATACCACACCAGAAGCAGCCTTCCAAGCGGCACTGTTAGCAGCAAAAGCTTCGAAAAGCAAGATTCTCGATGCTTACGGTTGCGATATGACTTTCACGACAAGCTCTTTTGATATTCAAGGTATCACTTTGCGTGGGGGTGTGTTCCGTGGTCAACGCGACTATCGTGTGCAAAATGCTACAGTAGAAGGCACAACTTTCCGTAACTCTCGTGTTATGTATTGGGGTGGTGCTGTGCGCATGTTCGATTGTTTGTGGGACGGTGCTCCTCGCGCAGGTCAAGTTGGTAGCTTGGTATTCCAAGGCAACCCAATATCAGGTACTTTTGAAATTGATAATTGTACTTTTAAAAACGGGTTATATGGCATCCTTCAACAAGGGACAGGAGAACCAGTAACACGCGGTGTCTTCCGTAACCTTACCTTCATGGACATGCAAGGTGATGCAATAGAACTGAACGTCATCAATAAACATTATGACGATGGTTGTGTGATTGAGAATATTTACCTGTCTAATATCGATGGGACTAACGCTCCTATTCCTCTGTCCAACTGGGGTATCGGTATCGGTGTAGCTGGTAAAGGACCATATGGTTACGGAATCCCTGATGATCAATATTGCAAGAATATTACAATTCGTAACGTTTTTGCAAAACGTTGTCGTCAGATTGTCCACGTAGAAGTTGGTCGTAATATCTCTATCGAAAACATTCATGGCGATCCAGACCAGACCGTATCTGTTGGGACAGGTTTGGCAACTGGCGCAGTTGTAATGTATGGAAGTAAAGATTTTACGATTGACGGTGTTTACGGAGAGCCTAAAACAGACGGTAGCACACTTGCAAGTAATATCCGTATGATTTATTTGGAGTGGGGAACTAACGCAGTTCTGGACGGAGAGGGTAATCCGGTAGTTCCGGCACAGGGTAGACCTTCAAACCCATGCTTTAACTATTCTGTTCGTAATATTCATACCAAAACTGGGCGTGTTTTTGCAGGAGTTTCCGCTGGGCCAGGTTATGAAAACAGAGTTAGCTTTGAAAATATTCGTTGCGCTGCATTGCAGTTGTTCGGTATAGCTTCTTGGCTTTCAATGTCTAACATCACCTGTAATATCTTCGATTGTGTTGGTCAACCTGAATCTGGTCCAGGGACATTTTATGATGGATTCTTCCGTAGAGAAAAATCTGTTCTTGAAATGGTTAACGTAAACTGTTACCCAGATGGCAAGACGATGGTTACTGGTCGTCCACAGTGGAGCCGTTGCCGTTACTCGGATATTCATCGTGTCAACTGTAATGTTGAAGCTAATATGTATACCAATATCGCAGGTGGTATTGGAGCTATTGTAGGGACAACGGGCAAAGTTTATTACTTAGAGCCTAATCCTAGTCGAAACATTGATGGAATGCATTTCCCAACAGGGAAAGAGTTTGACAAAGGTGATATGATAGTCAAGGCGGATAATACGTTCTTCCTTGTAACAACAAGTGGGGCATATATTCCAGATATCCCAGCTTTCGGTATTCGAGCTACACAGGCAGGAGATACCTTCCTGACACAGAACTTGACTCCTAACGGGACAGCAACAAATGCTTCTTGGTTGTATCATTACCCTCTGTCAGCAGGGACACGTATCCGTATTCCTGGTGCTGGCGTAGGTGGAGCAGATTTGGACACAGTTATTACTCGTGCACCTTATCAAGATAATGATACGTGGACTAACCCAGTTAAAATAGACATTGCAGATCCAATTGTAACGCCTACAAGTGCTGGAGTTAGAATTAAAACCATACCTAATGATTCCAGTAATGTTTCTGTAGGTAATACTGCGGTTATTCGCCCAACGCCAGTAGTAGATGTGCCAACAACCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.