Protein

Genbank accession
XKC22355.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQLAGSTMIGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITIGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNNFNIRQAIIIDGEQLTLKKATNAGASYIQGRDANNQQTWYVGQGKENNTNVYLYNHATGSMLTIDATASFNKTLRITGQVQPSDWSNIDSRYIPAATLSTIARTNAQNTFNGVQKVVTDDEALIVKNYTQNRPLYIRGVDTANVSRWRVGVGWVGTNDVVLDNSFSGTQLVLGNLSASINKTLTLAGQIQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAANNTFTGANTFTNLVVKENANAITLQNTDAGTALYILCKKSDGTNKWHVGTDSDETRLNIYNYLTGSQVSLGTTVGINKTVQINGQVKPSDFSNLDARYFTQSASDSRYLRIRSTNFNNGNDDKWAKIATVVMPPTASTAVIEVFGGSGYNYGFPYQASKTEIVLRAGGNSPKGLNIVAWKNSENLIITDIGYVNTSGDTYDIYCRVGPFQNDTTSRVQSSSNASVQLFEAPQTFDDAPQGIVKGTIARYYTSMQKPTPSDIGAYTKAETDHKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTTNTTGAHTHQFGGYINSFYGDSSHTSFQPGGGAWTQAAGDHSHSVGIGAHSHTVSGNTGSTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:812 AA
molecular weight: 87928,34040 Da
isoelectric point:8,13941
aromaticity:0,09113
hydropathy:-0,36786

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage HMD-P8
[NCBI] 		3378324 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XKC22355.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ568382.1 [NCBI]
CDS location
range 24558 -> 26996
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGACACAATCCGTTCAGACGACCTTCTTCATGTCAGAGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTAGAATGACCTATCAAGATTTCTTAGCTTCCTTCAAACTAGAAAGGTTTGTTCAGCTTGCTGGGAGTACTATGATTGGGGATTTAGGTATTGTCAAGTTACTTTACGGTGGCAAGGCTGTATTTGACCCAACAGGTTCTTCTGAGATTACTATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAACGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCAGCAACTGTTTATCATACTTTGAATAAACCAAGCCCTAATGAACTTGGTATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATACGCAAGACTTGCTGTTACAAATAACTTCAACATTAGGCAAGCAATTATCATTGATGGTGAGCAGTTAACCCTTAAGAAAGCAACTAATGCAGGAGCTTCATATATTCAGGGTAGAGATGCTAATAACCAGCAAACGTGGTATGTTGGACAGGGAAAGGAAAACAATACTAATGTTTATCTGTACAATCATGCCACTGGCTCAATGTTAACCATTGACGCAACAGCGTCATTTAACAAGACACTAAGAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCTGACTGGTCTAACATTGATTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACAATTGCAAGAACTAATGCACAAAATACTTTTAATGGTGTACAGAAAGTTGTTACTGATGATGAAGCCCTAATTGTGAAAAACTATACTCAGAACAGACCATTGTATATCCGTGGTGTGGACACTGCTAATGTGTCAAGGTGGCGGGTAGGTGTTGGTTGGGTAGGTACTAATGATGTAGTCCTAGATAACAGTTTTTCTGGCACTCAGTTAGTTTTAGGTAACTTATCTGCAAGTATCAATAAGACATTAACCCTAGCAGGGCAGATTCAACCCTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTCACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGCTAATAACACTTTTACAGGTGCTAATACTTTCACTAACCTTGTTGTTAAGGAGAATGCTAATGCTATTACTTTGCAGAATACTGATGCAGGTACAGCACTTTATATTCTCTGTAAGAAGTCTGATGGAACAAATAAATGGCATGTTGGTACAGATTCTGATGAGACACGTCTGAACATTTATAACTACCTTACAGGTTCACAGGTTTCACTAGGCACTACTGTTGGTATTAATAAAACCGTGCAAATCAATGGTCAAGTTAAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAAAGTGCTAGTGATAGTAGATACCTGAGAATCAGAAGTACTAACTTCAATAATGGAAACGATGACAAGTGGGCTAAAATTGCTACTGTTGTAATGCCGCCTACCGCATCTACTGCGGTGATTGAAGTGTTTGGTGGGTCAGGTTATAACTATGGTTTCCCTTACCAAGCTAGTAAAACGGAAATTGTTCTCAGAGCAGGGGGTAATAGCCCAAAAGGTTTAAATATTGTTGCTTGGAAAAACTCGGAGAATCTCATTATTACGGATATCGGTTATGTTAATACATCTGGTGATACTTATGACATTTACTGTAGAGTTGGTCCATTCCAAAATGACACAACATCAAGAGTTCAATCTTCTAGCAATGCAAGTGTGCAATTGTTTGAAGCCCCACAAACATTTGATGATGCTCCACAAGGTATTGTAAAGGGTACAATTGCAAGATACTACACAAGTATGCAAAAACCAACCCCTTCAGATATCGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCATAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGATTCAACAGACCTTAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACCGCACTTCCTGGATTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGGATTGCAGCAGCGAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGAGGTTCAGATTCTGTTACATTAGCAGTTGGAAACTTGCCTTCACACACTCATAGTTTCTCTGCGACAACCTCTAGCTTTGACTACGGTACTAAAACCACTAACACTACTGGTGCTCATACTCACCAGTTCGGCGGTTATATCAACTCGTTCTATGGAGACTCCAGTCACACCTCATTTCAGCCTGGAGGTGGTGCGTGGACACAGGCCGCTGGCGACCATTCCCACTCTGTAGGTATTGGTGCTCACAGCCACACAGTTAGTGGTAACACTGGTAGTACAGGCTCTGGTTCGGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTGAGAACTGCTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.