Protein

Genbank accession
XLV54135.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,85
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,80
Protein sequence
MADIKVVRIESLPATTAVTEDDYLVVQQPDLTRRVKIGDVVHVDGTVSHVISFKEGGKLNGPMDFAYFEEEDLYLRWKGEFPHTVPALSSPYADGGITDAAWMVYTDPSLREELESTIGASMIMTAEGQSVQDVMDVTVQTANDAKALAQRVDFGTVHTVGDVIHLVNFVGPAVIEEGRTTNYPSEAAGEKFLNGVVSRRDTTTVDGIFRGATSGAMYTIAVTNGVATTKRIALRDEFKRLEANNPTRTVIRAGDDLNTAGYLQLDATGRWGMWNQQTASWQPLAIEQGGTGARDAAGVRINIGAFYKQRAALEANFNINNLTGNQDGIYYQPMTANATEANGYPAGSGAGHLIVWQNNANGGTGCRQEYYPFSNVDVWYLRTYQANTNQWTAWQPMVRPRNDDTFRSHIGLGKNNSPAFGHLYLAQYSGDVKSASGILHGDKYNTDGVLEHGYRIYSEVRNDNKAWLTIHLHKGAKGSETHRYLGFREDGVLDCPKYMQVGDLTGQLTNWGLGEWIRSSGAERGFWGSKKAAKMVVWDGGMDESGNGSLEWGVYNNRKAKWEPLPQAAGGTGATTLADAQNLFKVPIAAGVKDFLTLPRTAGMEDGKYYPIIVRTDPYYAPATGTDITLVTRSSSGGDPMNCATLQCHYRTGGWTDRGDSFYGVVNFYQNEKALLGMVAPTRGKQEYVAFYAEARAFPVSIYASRNVVEVFTREQDYQVGSVTNNQDGVKFVAPLQSADLNLAVLGDNNTNTRPIVDFKGTSGFYTGGGTQWHYIGTAERYAVMSKMNMPKVELWADGIDYLCYGSPRKALFSNAGFQCASDGTDDLTNGTFTSKCGNGAGLQGQAEFRSTPEAGQVIVRDVVGSAHRFYNFNKDGTFSAPSGFVCHTGADWNNQFGNNNPSKILAGNVNGPEGSMVVGGLSVAFSGNYAFQMAGRLDQLYTRSIEQGNHRAWNKVIQHRGQGLGTSDLNDYKADREGIYHQEANANATAERHYPPGQQMAGTLIVLRNSANEGTGCVQIYKMYLGGTWERYYNNTGSGMNWSPWKRTSFPESTTAPVMPDLWLPLTSNLKPVLGEGEMVFSRPSTATYFTKRGVMAVAQANQPRFERDGLLIEGQRTNLMLNSEDPSKWGAQSQITVGNTVTNTNGTKGARFTVSNVSGVETTALNLATVPATRGADVTGAEKFCTGSIIARGGKAHQRLRVRFDMYNGSTTVFQGDAYVNLSTLEVKTTGVAAGRIKVKAERWQTAGPAWIRVVATFEAVDSDMNIGCQFQIAPPDGSQHAAGDWIDVAIPQFELGSCESSFIPTGSSPVTRAADLCKFPMTDNLAPRPFTIAATVDANWRGWGKAPNAAPRVIDTELHQSGAAFIMGFGSSANIADDGYPYCDIGGSNRRVYEMAKTRKLKIGFRIKDDGKTCSFANGLVSTETQSSWEFLAGGAFIRIGGQTATGERHLFGHIKDIRVWNSALTDTQLMMESVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1479 AA
molecular weight: 161011,87120 Da
isoelectric point:6,06622
aromaticity:0,09939
hydropathy:-0,38296

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage HMD-6
[NCBI]
3375969 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XLV54135.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ505080.1 [NCBI]
CDS location
range 85881 -> 90320
strand +
CDS
ATGGCTGATATTAAAGTTGTCAGAATTGAATCTCTTCCTGCCACTACCGCAGTGACAGAGGATGATTACCTGGTTGTTCAACAACCAGACCTGACCCGTCGTGTAAAAATTGGCGATGTTGTCCATGTGGATGGGACTGTTTCTCATGTAATCTCCTTTAAGGAAGGTGGTAAGTTAAACGGCCCAATGGATTTTGCCTACTTCGAAGAGGAAGACCTCTACCTGCGTTGGAAAGGCGAATTTCCGCACACTGTTCCTGCACTGTCTTCACCTTACGCTGATGGTGGGATTACCGATGCTGCATGGATGGTATATACAGATCCGTCCTTAAGGGAGGAGCTGGAATCTACCATTGGTGCATCCATGATCATGACAGCCGAAGGGCAGTCTGTCCAGGATGTAATGGATGTTACGGTTCAGACAGCCAACGATGCTAAAGCGCTTGCACAGCGGGTAGATTTTGGTACAGTGCATACTGTAGGCGATGTCATTCACCTTGTCAACTTTGTTGGTCCTGCAGTTATTGAAGAGGGAAGAACCACTAACTACCCTTCTGAAGCAGCTGGTGAAAAATTTCTGAACGGTGTGGTATCTCGTCGTGATACTACAACTGTTGATGGTATTTTCCGTGGCGCTACCTCAGGAGCCATGTATACCATTGCAGTAACCAACGGTGTAGCAACAACAAAAAGAATAGCACTTCGTGATGAATTTAAACGCCTGGAGGCAAACAATCCAACAAGAACAGTTATCCGTGCTGGAGATGATTTAAACACAGCAGGGTACTTGCAGCTTGATGCAACAGGCCGTTGGGGTATGTGGAACCAGCAAACAGCCTCGTGGCAACCTCTTGCTATAGAGCAAGGCGGTACAGGAGCCAGAGATGCCGCTGGAGTCCGTATCAATATCGGTGCTTTCTATAAGCAACGTGCAGCCCTTGAGGCAAATTTTAATATCAATAACTTGACTGGTAATCAGGACGGCATATACTACCAGCCTATGACTGCTAATGCAACTGAGGCAAATGGTTATCCTGCAGGTTCTGGTGCTGGTCACTTGATTGTTTGGCAGAACAATGCTAACGGTGGTACAGGTTGTCGTCAGGAGTACTATCCATTCTCTAACGTGGATGTTTGGTATTTGAGAACCTATCAGGCCAACACAAACCAGTGGACTGCATGGCAGCCGATGGTCAGACCTCGGAATGATGACACCTTCAGATCTCATATCGGCCTTGGTAAAAACAACTCCCCTGCTTTCGGGCACCTTTACTTAGCTCAATACTCAGGAGATGTTAAATCTGCCTCAGGTATTCTCCATGGAGATAAATATAACACTGATGGTGTTCTTGAGCATGGTTATAGGATCTACTCAGAGGTAAGAAACGACAATAAGGCTTGGTTAACAATCCACCTGCACAAAGGTGCAAAAGGATCTGAAACTCATCGGTATTTAGGATTCCGTGAAGATGGTGTGTTAGATTGTCCTAAGTACATGCAGGTTGGGGATCTTACTGGTCAGCTGACAAACTGGGGACTGGGAGAATGGATTCGTAGTTCAGGGGCAGAAAGAGGGTTCTGGGGTTCCAAGAAAGCCGCTAAGATGGTCGTCTGGGATGGCGGTATGGATGAATCCGGTAATGGTTCTCTAGAATGGGGTGTTTATAACAACCGGAAGGCCAAGTGGGAGCCTTTACCTCAAGCTGCAGGTGGTACAGGGGCTACAACCCTGGCAGATGCTCAGAATCTGTTCAAAGTTCCTATAGCTGCGGGTGTCAAAGATTTCTTAACACTGCCAAGAACTGCAGGTATGGAAGATGGGAAATATTACCCAATCATCGTTAGAACAGATCCGTATTATGCTCCAGCAACTGGCACCGATATTACCCTAGTCACCAGATCGTCATCTGGCGGTGACCCTATGAACTGCGCCACCTTACAGTGTCACTATAGAACTGGCGGTTGGACAGATAGAGGGGACTCTTTCTACGGGGTAGTGAATTTCTATCAAAATGAAAAAGCACTTCTTGGGATGGTTGCTCCAACAAGGGGTAAACAAGAGTATGTTGCTTTCTATGCAGAGGCTCGTGCTTTCCCTGTCAGCATATACGCAAGTAGAAATGTTGTCGAAGTGTTTACCAGAGAGCAAGATTATCAAGTCGGCTCTGTAACAAACAATCAGGACGGTGTTAAGTTCGTTGCACCTCTCCAGTCAGCAGATTTAAATCTGGCTGTTCTCGGAGATAACAATACCAACACCAGACCTATTGTTGACTTCAAAGGTACCTCTGGGTTCTACACTGGCGGCGGCACACAGTGGCACTATATAGGCACTGCTGAACGCTATGCGGTGATGAGCAAAATGAACATGCCTAAAGTCGAACTATGGGCTGACGGTATTGACTATTTGTGCTACGGCAGTCCTAGAAAGGCGTTATTCTCTAATGCAGGATTCCAGTGTGCATCAGATGGGACAGATGATCTGACTAACGGTACGTTTACCTCTAAATGCGGTAATGGTGCTGGACTTCAAGGTCAGGCAGAGTTCAGATCTACCCCAGAAGCTGGTCAAGTTATTGTTCGTGATGTTGTAGGTTCCGCTCACAGATTCTACAATTTCAACAAAGACGGTACTTTCTCGGCCCCTAGTGGTTTTGTATGCCACACAGGTGCAGACTGGAACAACCAGTTCGGAAATAATAATCCGTCCAAAATACTGGCTGGCAACGTCAACGGGCCTGAAGGTTCAATGGTTGTTGGCGGGTTGTCTGTGGCGTTTTCTGGAAACTATGCTTTCCAGATGGCAGGTCGTTTAGATCAGCTGTACACCCGTTCCATAGAGCAGGGTAACCACAGAGCGTGGAACAAAGTTATTCAGCACCGTGGTCAAGGGTTGGGGACTAGCGACCTTAACGATTACAAAGCGGATCGCGAAGGTATCTACCATCAAGAGGCAAATGCCAACGCCACAGCGGAAAGACACTACCCACCAGGGCAGCAGATGGCTGGTACGCTGATCGTGCTTAGAAACTCTGCCAACGAAGGTACAGGTTGTGTCCAGATATATAAAATGTATCTTGGGGGAACGTGGGAAAGGTACTATAATAACACTGGCAGCGGAATGAACTGGAGCCCTTGGAAGAGAACGAGCTTCCCAGAAAGTACAACTGCCCCAGTCATGCCTGACCTGTGGTTGCCTTTAACCTCTAATCTAAAACCTGTACTAGGTGAAGGTGAGATGGTGTTCTCCAGACCTTCTACAGCAACATATTTCACTAAGCGCGGTGTCATGGCTGTTGCACAGGCAAACCAACCACGTTTCGAAAGAGATGGTCTGCTCATTGAAGGTCAAAGGACAAATCTGATGCTTAACAGTGAAGACCCGAGCAAATGGGGAGCCCAGTCACAGATTACGGTCGGTAACACTGTAACAAACACCAACGGCACAAAAGGTGCAAGATTTACAGTAAGCAACGTATCCGGTGTAGAAACAACGGCGTTAAACCTGGCTACAGTTCCAGCCACTCGGGGTGCAGATGTAACAGGTGCTGAGAAATTTTGTACTGGATCTATTATTGCAAGAGGTGGTAAAGCTCACCAGAGACTGCGTGTAAGATTCGACATGTATAACGGATCCACCACAGTATTCCAGGGTGATGCCTATGTTAACCTGTCAACACTTGAAGTTAAAACAACAGGTGTTGCAGCTGGGAGAATTAAAGTAAAAGCTGAGAGATGGCAAACAGCCGGACCTGCTTGGATAAGGGTTGTTGCTACGTTTGAGGCAGTGGACTCTGACATGAATATTGGGTGCCAGTTCCAGATTGCACCACCGGATGGTTCTCAACATGCCGCAGGGGATTGGATTGACGTCGCAATACCTCAGTTTGAGTTAGGATCTTGTGAGTCCTCGTTTATCCCTACAGGGTCTTCACCAGTGACTAGGGCAGCAGACCTTTGTAAATTCCCAATGACTGATAATTTAGCACCTAGACCGTTCACCATCGCCGCTACGGTGGATGCCAACTGGAGAGGTTGGGGAAAAGCTCCTAACGCAGCTCCTAGGGTTATTGATACAGAGCTCCATCAATCCGGTGCTGCATTTATCATGGGTTTTGGCTCTTCAGCAAATATTGCAGATGATGGTTATCCATATTGCGATATTGGCGGTTCAAACAGACGTGTCTATGAGATGGCTAAAACACGTAAATTGAAAATTGGGTTCAGGATAAAAGATGACGGTAAAACCTGCTCTTTTGCTAACGGATTGGTAAGTACGGAAACGCAATCTTCTTGGGAATTCCTAGCAGGAGGCGCTTTCATCCGTATCGGTGGGCAAACAGCAACTGGTGAAAGACATTTGTTTGGTCATATTAAGGATATAAGGGTTTGGAACTCTGCACTGACCGACACCCAGCTTATGATGGAGAGTGTTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.