Protein
- Genbank accession
- AHZ10892.1 [GenBank]
- Protein name
- tail spike
- RBP type
-
TF
evidence: GenBank
probability: 1,0000
TF
evidence: Phold
probability: 1,0000
TSP
evidence: DepoScope
probability: 0,7733
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,7102
- Protein sequence
-
MSEYLHLNKEDKKDYPTIKHSSRADYQTNGLSYYDYLGEINDNMDIMEDFINDLVDKYKDRYYLNIVTLGAKGDNNTDNSCLFGSFKSDQMYYVPKGTYITSILPKGLFFGWGVINYNGELIPLSITVPQKVRVNMNKTQDERYQNFILGQNSALKANENTYALTSLGYSVLKENVEGRRLTGIGKGALSNIVNGYSNVGIGADSIGQGTYGQRNTAIGDNSLKWGGTTDAIKTLHDFWLKKGNENFVNSYFVPKYPDIWKYLGTEDTPDPSLYPKNDTEYQYNVGIGRNALLHGMKSLNNVAVGYNSQAHTMIGNGNTSIGDRSLRDNVVGHRNTANGMYALTNNITGSDNVSLGCNTLQQTLHATNNTAVGYGSMHFFKDDKNLNTPDTATFGVRNTALGTQTMQDGKNASYSTFVGSYAGRYVEGNFNVGIGTASSELLTTGERNTAIGSNSNRAIITGSKNVSVGYSAGAGGDYSNTVSLGYNSHAQGNDLIQIGTSSQLPITNNQLLTLSDNRINTDIVDTTLGLDFIKSIKPVDFKNGDYNQHGVIAQDIIEYNNTHDDKFKGIFNSNEKGGSSNYYISYTEFIAPLIKSIQDLSSQVETLTTENTAIKVDIETLKTDNETFKTDIAQMKQDIEELKGGTTK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 648 AA molecular weight: 71214,85880 Da isoelectric point: 5,40308 aromaticity: 0,09568 hydropathy: -0,54552
Domains
Domains [InterPro]
IPR011049
277–385
277–385
1
648
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Lactococcus phage WP-2 [NCBI] |
1486423 | Uroviricota > Caudoviricetes > Rountreeviridae > Negarvirus WP2 > |
Host |
Lactococcus garvieae [NCBI] |
1363 | Bacteria > Firmicutes > Bacilli > Lactobacillales > Streptococcaceae > Lactococcus |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AHZ10892.1_KJ528544.1_13242_15188
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ528544.1
[NCBI]
CDS location
range 13242 -> 15188
strand -
strand -
CDS
ATGAGTGAATATTTACATTTAAACAAAGAAGATAAAAAAGATTATCCTACTATTAAACATTCTTCAAGGGCTGATTATCAAACAAATGGATTATCATATTATGATTATTTAGGCGAAATAAATGATAATATGGATATTATGGAAGATTTTATTAACGATTTAGTTGATAAGTATAAAGATAGATATTATTTAAATATTGTTACATTAGGTGCTAAAGGTGATAACAATACTGATAATTCTTGTTTATTTGGTTCTTTCAAATCAGACCAAATGTATTATGTACCTAAAGGAACTTATATTACTTCTATACTTCCTAAAGGATTATTCTTTGGTTGGGGTGTTATTAATTATAATGGAGAATTAATTCCTTTATCTATTACTGTACCTCAAAAAGTAAGAGTAAATATGAATAAAACACAAGATGAAAGATACCAAAATTTTATTTTAGGTCAAAATTCAGCGCTTAAAGCAAATGAAAATACATATGCTTTAACTTCATTGGGATATTCTGTGTTAAAAGAAAATGTTGAAGGAAGACGATTAACAGGTATTGGTAAAGGTGCTTTATCAAATATTGTTAATGGTTATTCTAATGTTGGTATAGGGGCTGATTCTATAGGGCAAGGTACATACGGTCAACGTAATACAGCTATAGGCGATAATTCACTTAAATGGGGTGGCACAACTGACGCTATTAAAACACTTCATGATTTTTGGTTGAAAAAAGGTAATGAAAATTTTGTTAATAGTTATTTTGTACCTAAATACCCTGATATTTGGAAATATTTAGGCACTGAAGATACACCTGATCCTTCATTATATCCCAAAAATGATACTGAATATCAATATAATGTTGGTATTGGTAGAAATGCCCTCCTTCATGGTATGAAGTCATTGAATAATGTAGCTGTAGGATATAATTCACAAGCACATACAATGATAGGTAATGGTAATACTTCTATTGGTGACCGTTCTTTACGTGATAATGTTGTAGGTCACAGAAATACAGCTAATGGAATGTATGCATTAACCAATAATATCACAGGTTCAGATAATGTTTCTTTAGGTTGTAATACATTACAACAAACCCTTCATGCTACAAATAATACAGCTGTAGGTTATGGTTCAATGCATTTCTTTAAAGACGACAAGAACCTTAATACACCTGATACTGCTACATTTGGAGTACGTAACACTGCTTTAGGTACTCAAACAATGCAAGACGGTAAAAACGCTTCATACTCTACTTTTGTTGGTTCTTATGCAGGTAGATATGTTGAAGGTAATTTTAATGTAGGTATTGGGACTGCTTCATCTGAATTACTTACTACAGGTGAAAGAAATACAGCTATAGGAAGTAATAGTAATAGAGCTATTATAACAGGTTCTAAAAATGTATCTGTTGGTTATAGTGCAGGTGCTGGAGGTGATTATTCTAATACAGTATCATTAGGGTATAATTCACATGCACAAGGTAATGACTTAATTCAAATAGGGACTTCTTCACAATTACCTATTACAAACAATCAGTTATTAACATTATCTGATAATAGAATTAATACAGATATTGTAGATACTACATTAGGGTTAGATTTCATCAAATCTATTAAACCTGTAGATTTTAAAAACGGTGATTATAACCAACATGGTGTTATTGCTCAAGATATAATTGAATATAATAATACACATGATGATAAATTTAAAGGTATTTTTAATTCAAATGAAAAAGGAGGTTCTTCAAATTATTATATTTCATATACTGAATTTATAGCCCCTTTAATTAAATCTATTCAAGATTTATCATCCCAAGTTGAAACCCTTACAACTGAAAACACAGCAATTAAAGTTGATATTGAAACATTAAAAACAGATAATGAAACATTTAAAACTGATATAGCACAAATGAAACAAGATATTGAAGAATTGAAGGGTGGTACTACAAAATGA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID: 70
Method: ESMFold
Resolution: 0,8137
Evidence: 0,8783
Literature
No literature entries available.