Protein

Genbank accession
AHZ10892.1 [GenBank]
Protein name
tail spike
RBP type
TF

evidence: GenBank

probability: 1,0000

TF

evidence: Phold

probability: 1,0000

TSP

evidence: DepoScope

probability: 0,7733

TF

evidence: RBPdetect

probability: 0,7102

Protein sequence
MSEYLHLNKEDKKDYPTIKHSSRADYQTNGLSYYDYLGEINDNMDIMEDFINDLVDKYKDRYYLNIVTLGAKGDNNTDNSCLFGSFKSDQMYYVPKGTYITSILPKGLFFGWGVINYNGELIPLSITVPQKVRVNMNKTQDERYQNFILGQNSALKANENTYALTSLGYSVLKENVEGRRLTGIGKGALSNIVNGYSNVGIGADSIGQGTYGQRNTAIGDNSLKWGGTTDAIKTLHDFWLKKGNENFVNSYFVPKYPDIWKYLGTEDTPDPSLYPKNDTEYQYNVGIGRNALLHGMKSLNNVAVGYNSQAHTMIGNGNTSIGDRSLRDNVVGHRNTANGMYALTNNITGSDNVSLGCNTLQQTLHATNNTAVGYGSMHFFKDDKNLNTPDTATFGVRNTALGTQTMQDGKNASYSTFVGSYAGRYVEGNFNVGIGTASSELLTTGERNTAIGSNSNRAIITGSKNVSVGYSAGAGGDYSNTVSLGYNSHAQGNDLIQIGTSSQLPITNNQLLTLSDNRINTDIVDTTLGLDFIKSIKPVDFKNGDYNQHGVIAQDIIEYNNTHDDKFKGIFNSNEKGGSSNYYISYTEFIAPLIKSIQDLSSQVETLTTENTAIKVDIETLKTDNETFKTDIAQMKQDIEELKGGTTK
Physico‐chemical
properties
protein length:648 AA
molecular weight: 71214,85880 Da
isoelectric point:5,40308
aromaticity:0,09568
hydropathy:-0,54552

Domains

Domains [InterPro]
AHZ10892.1
1 648
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactococcus phage WP-2
[NCBI]
1486423 Uroviricota > Caudoviricetes > Rountreeviridae > Negarvirus WP2 >
Host Lactococcus garvieae
[NCBI]
1363 Bacteria > Firmicutes > Bacilli > Lactobacillales > Streptococcaceae > Lactococcus

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AHZ10892.1_KJ528544.1_13242_15188 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ528544.1 [NCBI]
CDS location
range 13242 -> 15188
strand -
CDS
ATGAGTGAATATTTACATTTAAACAAAGAAGATAAAAAAGATTATCCTACTATTAAACATTCTTCAAGGGCTGATTATCAAACAAATGGATTATCATATTATGATTATTTAGGCGAAATAAATGATAATATGGATATTATGGAAGATTTTATTAACGATTTAGTTGATAAGTATAAAGATAGATATTATTTAAATATTGTTACATTAGGTGCTAAAGGTGATAACAATACTGATAATTCTTGTTTATTTGGTTCTTTCAAATCAGACCAAATGTATTATGTACCTAAAGGAACTTATATTACTTCTATACTTCCTAAAGGATTATTCTTTGGTTGGGGTGTTATTAATTATAATGGAGAATTAATTCCTTTATCTATTACTGTACCTCAAAAAGTAAGAGTAAATATGAATAAAACACAAGATGAAAGATACCAAAATTTTATTTTAGGTCAAAATTCAGCGCTTAAAGCAAATGAAAATACATATGCTTTAACTTCATTGGGATATTCTGTGTTAAAAGAAAATGTTGAAGGAAGACGATTAACAGGTATTGGTAAAGGTGCTTTATCAAATATTGTTAATGGTTATTCTAATGTTGGTATAGGGGCTGATTCTATAGGGCAAGGTACATACGGTCAACGTAATACAGCTATAGGCGATAATTCACTTAAATGGGGTGGCACAACTGACGCTATTAAAACACTTCATGATTTTTGGTTGAAAAAAGGTAATGAAAATTTTGTTAATAGTTATTTTGTACCTAAATACCCTGATATTTGGAAATATTTAGGCACTGAAGATACACCTGATCCTTCATTATATCCCAAAAATGATACTGAATATCAATATAATGTTGGTATTGGTAGAAATGCCCTCCTTCATGGTATGAAGTCATTGAATAATGTAGCTGTAGGATATAATTCACAAGCACATACAATGATAGGTAATGGTAATACTTCTATTGGTGACCGTTCTTTACGTGATAATGTTGTAGGTCACAGAAATACAGCTAATGGAATGTATGCATTAACCAATAATATCACAGGTTCAGATAATGTTTCTTTAGGTTGTAATACATTACAACAAACCCTTCATGCTACAAATAATACAGCTGTAGGTTATGGTTCAATGCATTTCTTTAAAGACGACAAGAACCTTAATACACCTGATACTGCTACATTTGGAGTACGTAACACTGCTTTAGGTACTCAAACAATGCAAGACGGTAAAAACGCTTCATACTCTACTTTTGTTGGTTCTTATGCAGGTAGATATGTTGAAGGTAATTTTAATGTAGGTATTGGGACTGCTTCATCTGAATTACTTACTACAGGTGAAAGAAATACAGCTATAGGAAGTAATAGTAATAGAGCTATTATAACAGGTTCTAAAAATGTATCTGTTGGTTATAGTGCAGGTGCTGGAGGTGATTATTCTAATACAGTATCATTAGGGTATAATTCACATGCACAAGGTAATGACTTAATTCAAATAGGGACTTCTTCACAATTACCTATTACAAACAATCAGTTATTAACATTATCTGATAATAGAATTAATACAGATATTGTAGATACTACATTAGGGTTAGATTTCATCAAATCTATTAAACCTGTAGATTTTAAAAACGGTGATTATAACCAACATGGTGTTATTGCTCAAGATATAATTGAATATAATAATACACATGATGATAAATTTAAAGGTATTTTTAATTCAAATGAAAAAGGAGGTTCTTCAAATTATTATATTTCATATACTGAATTTATAGCCCCTTTAATTAAATCTATTCAAGATTTATCATCCCAAGTTGAAACCCTTACAACTGAAAACACAGCAATTAAAGTTGATATTGAAACATTAAAAACAGATAATGAAACATTTAAAACTGATATAGCACAAATGAAACAAGATATTGAAGAATTGAAGGGTGGTACTACAAAATGA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID: 70

Method: ESMFold

Resolution: 0,8137

Evidence: 0,8783

Literature

No literature entries available.