Protein

Genbank accession
AAX44411.1 [GenBank]
Protein name
fiber [Prochlorococcus phage P-SSM2]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,58
Protein sequence
MPLNKLENFIKNSEGRILYVNPNDLDATDGIENQGNSLTKPFKTLQRALIESARFSYLRGNDNDLVEKTTILLFPGEHLIDNRPGFGIKSVSGTATAISPSSAESGAQNTLTLTLNSNFDLTQEDNILYKFNSTEGGVIVPRGTSIVGLDLRKTKVRPKYVPNPTDDNVKSTAIFRVTGACYFWQFSIFDGDESTTVYTDPTNFSSSNRSKPVFSHHKVTCFAYADGVNKLDQFDGLTDLDVYYSKLSNAYNRASIRDIDEKYPATPGGFSKQRPEYEIVGAFNSDRLQVTSIISGDGATPGQVVTVTTSVPHELTGGTPIKIEGVNELTYNISTKVSSVLSDTQFTYLLPYVPPNLKAGPAGGLSAGSAEVSVEVDTVTGASPYIFNCSLRSVYGMQGMNADGAKATGFRSMVVAQFTGISLQKDDRAFVKYNKNSRSYDGISYQRQTGELLSSESSSLNAATVYHLDKDAVYRDGWKTAHITIQNDAILQIVSVFAIGYHIHFLGKSGGDASITNSNSNFGQFALAADGFKKESFDKDNKGFISAIIAPKAVVSTEANIELNQLDTSVHTAYKTADTSTNKILSRSKLFLLGQTNENLVPSEIAQGYRIGARVGEKFYIDLANGTKVQATICMSNKEIVGGNASTVTSSVQVTSEKEYEGTHNDTTQGSASIEHKIVLNNLRSIGAKHDLNNGESIRIIAEDADLPEGLDPHRIYYAITNEKNSSRQDGISLDDYTIQIASSKTNADRTTPQYIKTVSNPAAGKLKIISRVSDKKPGDLGHPMQFDSTVTVQLEGGGTSTGNWFIHVDGTSDNTAATYNTVWDNFANLDADDEDIPYIQRLNDSRSLDDKLYKFRYVIPKELENARDPNDSFIIQDSSSTNVRALADFTRTSLEAKDYDFNRNTRFISYLDYNSTTKIVTIRSDKSHNLNAGEQIILKNIICTVNASGAADKGYNGTFLVNSIINDKVFTYKTTDILGNVHNVGTYGNDTHTRTLSLPRFERNNNQENLFIYRTETILPYVEGAQDGVYHMYVLNGSNTIEEEFAAGKYNQNVVNLYPELDRDNVNDNPQEASSYAKRFPIGDVVTNDLKKSITRETANKLINSFGVANTISDVTDNTTSAVLTLTREHDLGGLKYGGTLAGGGGHTDGTYYNVKLFDDASAPASAVWKGATAKVVVSGGAVTEYEITEPGSAYKSTLSPLYFDSSLVAQGGIGGAPSSNIAITDANISLANSGYVQVTGISTGTDQYFRVNDATDINKININKTASETILNGQTVVSVGPIVEVSTSSGTDTTTFNCSTAHGLLKGNRFRVLNASDANLGDFIVTEVVDVDSFTALTPGGLTSPKYILKHGLSANDGNSGKQGESLGVRGVAFYDNESLVLNDTITSVTDEIKVTLPGGGTTAASIQARFPLGSFIQVDSEIMRVVDETIGSGTTLKVIRGALGTIVDNHVLNSQIKKIKPLSVELRRPSILRASGHTFEYLGYGPGNYSTGLPQVQLKSLTEREEFLSQSQETSCGTVVYTGMNDKGDFYIGNTKISSDSGEQITFDIPIPTVTGEDPSTLSVVFDEVIIKDRLLVEGGSSNTILSQFNGPVTFNGNVRFNKDLKVATNLTVDGIVKFNNETVASSTCGVTPTGSLVVKGGVSIGDKVSATGAVSLNVLDGIVRICENAASTSSTTGALIVGGGVGIAGQLSLGGVLDVTGSINAGGGLHLPDNVKLTAGGTTSGPYFSIEHDVVGGVRNNIIKDESLSNIYLRSDANIEIGNKDGTEQGLIYTAGAGIKLRHGTTLRFETNTSGAKVHGALEVTDDITAYSTSDARLKNDVKPIQDSLAKVNSISGNTFTWNEASKKEGQEDTGVIAQEISAIGLPGTVTIREDGTYAVDYEKLVPLLLEAIKELSNKVDTLS
Physico‐chemical
properties
protein length:1908 AA
molecular weight: 204906,16100 Da
isoelectric point:5,12491
aromaticity:0,07495
hydropathy:-0,28459

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Prochlorococcus phage P-SSM2
[NCBI] 		268746 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AAX44411.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AY939844.2 [NCBI]
CDS location
range 28537 -> 34263
strand +
CDS
ATGCCACTTAATAAGTTAGAGAATTTCATAAAGAATAGTGAGGGTCGCATTCTTTATGTTAATCCAAATGATCTTGATGCCACTGATGGAATAGAAAATCAGGGTAACTCATTAACAAAACCATTTAAGACCTTACAAAGAGCACTTATCGAATCCGCTAGATTTTCATATCTAAGGGGAAATGATAATGATTTAGTAGAGAAGACAACAATATTACTGTTTCCAGGTGAACACTTAATAGATAACCGTCCAGGTTTTGGTATAAAAAGTGTTAGTGGAACTGCTACTGCTATTAGTCCAAGTAGTGCAGAATCAGGTGCTCAAAATACACTTACATTAACTCTTAATTCTAACTTTGATTTAACGCAAGAAGATAATATACTTTATAAGTTCAATAGTACTGAAGGTGGTGTTATAGTTCCTAGAGGAACTTCTATTGTTGGATTAGACCTAAGAAAAACAAAGGTTCGTCCTAAGTATGTTCCAAATCCTACTGATGATAATGTAAAATCTACTGCTATCTTTAGGGTTACTGGTGCTTGTTATTTCTGGCAGTTCTCTATTTTTGATGGGGATGAATCTACAACAGTATATACAGACCCTACTAACTTTAGTAGTAGTAACAGATCAAAACCAGTATTCTCTCATCATAAGGTAACTTGCTTTGCGTATGCTGATGGTGTTAATAAGTTAGATCAATTTGATGGATTGACTGATCTAGATGTCTATTATAGTAAATTATCAAATGCATATAATAGAGCATCGATTAGAGATATTGATGAAAAGTATCCTGCTACTCCAGGTGGATTTTCAAAGCAAAGACCTGAGTATGAAATAGTTGGTGCATTTAATTCTGATAGACTTCAAGTTACAAGTATTATTTCAGGTGATGGTGCAACACCAGGTCAGGTTGTTACTGTAACTACATCTGTTCCTCATGAACTGACTGGTGGCACACCAATTAAGATTGAAGGTGTAAATGAATTAACTTATAATATTTCAACTAAAGTTAGTAGTGTTTTAAGTGATACTCAATTTACATATTTACTTCCATATGTTCCACCTAATCTAAAAGCTGGTCCTGCTGGTGGATTAAGTGCTGGTAGTGCAGAAGTAAGTGTAGAAGTTGATACTGTTACTGGTGCATCTCCTTATATCTTTAACTGTTCATTAAGATCAGTTTATGGTATGCAGGGTATGAACGCTGATGGTGCTAAGGCAACTGGATTTAGATCTATGGTTGTTGCTCAGTTTACTGGTATATCACTACAGAAAGATGATCGTGCATTTGTAAAATATAATAAGAATAGTAGATCTTATGATGGTATTAGTTATCAGAGACAAACTGGTGAATTGCTATCATCAGAATCATCATCTTTAAATGCTGCTACTGTCTATCACTTAGATAAAGATGCTGTTTATAGGGATGGGTGGAAGACAGCACATATTACAATTCAGAATGATGCAATCTTACAGATTGTTTCTGTGTTCGCTATTGGTTATCATATTCATTTCTTAGGTAAATCTGGTGGTGACGCATCGATTACAAACTCTAACTCTAACTTCGGTCAGTTTGCTCTTGCTGCTGATGGATTTAAGAAAGAATCCTTTGATAAAGATAATAAAGGATTTATATCTGCTATTATCGCACCTAAAGCAGTTGTCAGTACAGAGGCTAATATTGAGTTGAATCAGCTTGATACTTCCGTTCATACTGCATATAAAACTGCTGATACTTCAACAAATAAGATTCTTAGTAGAAGTAAGTTATTCTTATTAGGTCAAACTAATGAGAACTTAGTACCATCTGAAATTGCACAGGGATATAGAATCGGTGCGAGAGTTGGTGAGAAGTTTTATATAGATTTAGCAAATGGAACTAAGGTTCAGGCTACCATTTGTATGTCCAATAAGGAAATTGTTGGTGGCAATGCTTCAACAGTAACTTCATCTGTACAAGTTACTTCAGAGAAGGAGTATGAAGGTACTCATAATGATACTACTCAAGGAAGTGCATCTATAGAACATAAGATAGTTCTTAATAATTTACGCTCTATTGGTGCTAAACATGATCTTAATAATGGTGAGTCTATAAGAATTATTGCTGAAGATGCTGACTTACCAGAAGGTTTAGATCCTCATAGAATTTATTATGCGATTACTAATGAGAAAAACTCTTCAAGACAAGATGGTATTAGTTTAGATGATTATACAATCCAGATTGCATCATCAAAAACTAACGCTGATAGAACTACACCACAATATATTAAGACTGTTTCTAATCCTGCTGCTGGTAAATTAAAAATTATTAGTAGAGTTTCTGATAAAAAACCAGGTGACTTAGGACACCCAATGCAGTTTGATTCTACAGTAACAGTTCAACTAGAAGGTGGTGGTACTTCAACAGGTAACTGGTTTATTCATGTTGATGGTACTTCTGATAATACTGCTGCAACTTATAATACTGTATGGGATAATTTTGCTAATCTAGATGCTGATGATGAGGATATTCCTTACATCCAAAGATTAAATGATAGTAGAAGTTTAGATGATAAACTCTATAAGTTTAGATATGTAATTCCAAAAGAATTAGAAAATGCTAGAGACCCTAACGATAGTTTCATCATTCAAGATTCTAGTTCTACTAATGTAAGAGCATTAGCAGATTTTACTAGAACCTCTCTAGAGGCAAAAGATTATGATTTTAATAGGAATACACGATTTATTTCTTATCTTGATTACAATAGTACTACTAAGATAGTTACTATTAGATCTGATAAGTCACATAACTTAAATGCTGGTGAACAAATTATCCTTAAGAATATAATTTGTACTGTTAATGCTAGTGGTGCAGCAGATAAAGGATATAATGGAACATTCTTAGTTAATAGTATTATTAACGATAAAGTTTTTACCTATAAGACAACTGATATTTTAGGTAATGTTCATAATGTAGGAACTTATGGTAATGATACCCATACTAGGACTCTTTCATTACCTAGATTTGAGAGGAATAATAACCAAGAAAACTTATTCATCTATAGAACCGAAACAATTTTACCGTATGTTGAGGGAGCACAAGACGGTGTTTACCATATGTACGTTCTGAATGGTAGTAATACTATAGAAGAAGAATTTGCTGCTGGTAAGTACAATCAAAATGTTGTTAATCTTTATCCAGAATTAGATCGAGATAATGTAAATGACAATCCACAGGAAGCATCTAGTTACGCTAAGAGATTCCCTATTGGTGATGTAGTTACTAATGATCTTAAGAAGAGTATCACTAGAGAAACTGCCAATAAACTAATTAATAGTTTTGGTGTTGCAAATACAATTAGTGATGTAACTGATAATACTACTTCTGCTGTTCTAACACTTACAAGAGAACATGATCTCGGTGGTTTGAAGTATGGTGGAACATTAGCAGGTGGAGGTGGACATACTGATGGAACTTACTATAACGTAAAATTATTTGATGATGCTTCTGCTCCTGCTTCTGCTGTATGGAAAGGTGCTACTGCTAAAGTTGTTGTTAGTGGTGGAGCAGTTACCGAGTATGAGATAACTGAACCAGGATCAGCATATAAGAGTACATTATCCCCACTATACTTTGACTCTTCATTAGTAGCTCAAGGTGGTATTGGTGGAGCTCCTAGTTCTAATATTGCTATTACTGATGCAAACATTAGTTTAGCAAATAGCGGATATGTTCAAGTAACTGGTATTAGTACAGGAACAGATCAATACTTCAGGGTTAATGATGCTACGGATATTAATAAAATCAATATTAATAAGACTGCAAGTGAAACAATTCTGAATGGTCAAACTGTTGTTAGTGTAGGACCTATTGTTGAAGTTAGTACTTCTAGTGGAACTGATACAACTACATTTAATTGTAGTACAGCACACGGATTACTTAAAGGAAATCGTTTCAGAGTATTAAATGCTTCTGATGCTAATCTTGGAGACTTTATTGTTACTGAAGTTGTGGATGTAGATAGTTTTACTGCATTAACTCCAGGTGGATTAACATCTCCTAAGTATATTCTTAAGCATGGATTATCTGCTAATGATGGTAACTCTGGTAAGCAAGGTGAAAGTTTAGGAGTAAGAGGAGTTGCTTTCTATGATAATGAATCTCTAGTTCTGAATGATACTATTACTTCAGTTACGGATGAAATTAAAGTTACTCTACCTGGTGGAGGTACGACTGCTGCATCTATTCAGGCAAGATTCCCATTAGGTTCATTCATTCAAGTTGATAGTGAAATAATGAGAGTTGTTGATGAAACTATTGGTAGTGGAACAACACTTAAAGTTATTCGTGGTGCATTAGGTACTATTGTTGATAACCACGTTCTTAATTCTCAGATTAAGAAGATTAAACCTCTTTCTGTTGAACTAAGAAGACCATCTATTCTAAGAGCATCTGGTCATACATTTGAATACCTTGGTTATGGTCCAGGTAACTACTCAACTGGTTTACCTCAAGTTCAACTTAAATCTCTAACTGAGAGAGAAGAGTTCTTATCACAATCACAAGAAACTTCTTGTGGTACTGTTGTTTACACAGGTATGAATGATAAGGGTGATTTCTATATTGGAAACACTAAGATTTCATCTGACTCTGGTGAACAGATAACATTTGATATTCCAATTCCAACTGTAACAGGTGAAGATCCAAGTACGCTTAGTGTTGTATTTGATGAAGTAATCATTAAAGATAGACTACTTGTTGAGGGTGGAAGTTCTAATACAATTCTATCTCAGTTTAATGGACCTGTAACATTCAACGGTAATGTAAGATTCAACAAGGATCTTAAAGTTGCAACCAACTTAACTGTTGATGGTATAGTTAAATTTAATAATGAAACAGTAGCATCATCTACTTGTGGTGTGACTCCTACAGGATCATTAGTGGTTAAAGGTGGAGTTTCTATTGGTGATAAGGTAAGTGCTACTGGTGCAGTATCCTTAAATGTACTAGATGGTATTGT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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.