Protein

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Genbank accession
XYS96200.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,79
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPSADIVARGEIALNTHGRTLAIYTKDENDKVVQLAGKGVPFLDTSGTLNVDGTTTLKDNVTVAPNKSISFETTDLSGEITRHIVGKCATNDGWYIGAGGTSNSGILEIGTIDDGAETIQFVQRGAGNVEARKLVLLDGSGNTTLPGDLRLTTNKTVKINNGSTLVLEMGVGSNDVYIKNQRGVGVLQLTNDSNLTFRNYQVYYAMNGRGPGKGGTLLTNVENERQLKQDNFPVTTGTETRWIKVALLKDPGSGQSRLQLMVSNGGNYGSTYSSIDFIDCSARNFPSSLTSSNIRNHLQIRRLGNPALEDTNQLRYSLVLTSEGLELWFMQRAFIGSVKVALLSIAGDTEYYLPNGYTSSSTAPEGLVESTVIRIYDEFNKPNIDGGTEGILPISRGGTGGTSSAAARNNLGLGTAAIRDVGEGTGNLLENGAYGLGGNGGKSIENITSNVDMMTRLKAYGGTFWRGAIKSGVSVQNGLYSHGSGIFMNAGDTMSAINIDYASAKVRVYAINNTGLAAGNVNYNELYGTANKPSKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLTVPNLHASGTGTASVYVNAGTGNAHVWFRTDGNERGVIWATPNTADLGQINIRAKTTGGTSAGDFSFRSDGRLDVPVAVKIGGAAMLTKDGNITSGSMFGGNLNNYLTSIKNDIVAGDNKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPNGTMADFGSENSDKYSRITLARKVGSGAAVAMLKITPEGYVQFGYQDAVATPSPSKYIRVKPDGLDVEGDLVFNQTYRGTEEAVDISDKTIDLNDLVIKRTDPGTRQLYKCVSSGGGSKIANKPISDGNFVLEVLSLRKVSDNDWTCKQTFTTKNNTTVGTYVRYAQNGSWTAWEEVVSGVQPINLGGTGATSVAAARNNLGVGEGQTATFGGLNVNGIGTNDPYITFKNGARIREGQGGGIGALILSASSSTDSKYLALRPYGDTSGVDIKVKANGSSEALLEWSYGPGIRSNSTGAFVVYAKAGQALHLRPNGDTASQATVIDQNGKMTVGGEFEAQNSKITGNLNVSEDNRMIVLGKNSDIGLVKKNGMPGKMAIGKSNSFTVMVSTNTNNQINPADTFNDIFKVDADGNQTVYGNSTISRALTVSSVINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGRLTITGDQLKTTSLWTTGDAAVNGVLTVDGKARFNQEFSVSTSVNVQNTGNSHVFFRKADGTEKGLLWVDEPGSVNIRAGGASGPTWNFWNSGSCQFPGAISNFNGISSTTNYPAGQPNGTYSNTAGLVTRFSNGAYASLYFQEYVGNYHQAILNVNGFGRDDNFYFRSGGDFFCTRNGSFDNVEIRSDRRAKSDIKVIENALEKVETLSGNTYELHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDNEEDGGMLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKGLKAEIEELKSK
Physico‐chemical
properties
protein length:1500 AA
molecular weight: 158918,60110 Da
isoelectric point:5,94839
aromaticity:0,07067
hydropathy:-0,34467

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–604
DC_1942 cd19958 DC_0246
DC_1159
STR
443–1107
DC_1159 IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
1400–1494
IPR030392
XYS96200.1
1 1500
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 4-604 | STR 605-1107 | RBD 1115-1500
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XYS96200.1
1 1500
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 338 338 0,0965
Central domain 339 537 200 0,1802
C-terminal 538 1500 962 0,6640
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-338
Central
339-537
C-terminal
538-1500

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage HMGUkp2
[NCBI] 		3434165 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Klebsiella sp.
[NCBI] 		576 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYS96200.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV683292.1 [NCBI]
CDS location
range 78005 -> 82507
strand -
CDS
ATGGCCGATCAGAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCTAGTGCCGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATAGCATTGAATACCCATGGGCGTACTCTTGCCATTTATACTAAAGATGAAAATGACAAAGTAGTACAGTTAGCCGGTAAAGGCGTTCCATTTTTAGATACCTCCGGTACTCTCAATGTTGATGGAACTACCACATTAAAAGACAACGTTACTGTTGCTCCGAATAAATCTATCAGTTTTGAAACTACTGATTTAAGCGGTGAAATAACTCGTCATATCGTTGGCAAATGTGCAACTAACGATGGTTGGTATATCGGTGCAGGTGGTACAAGCAACAGTGGTATTCTTGAAATTGGTACTATTGACGATGGTGCTGAAACTATTCAATTCGTACAACGCGGCGCGGGCAACGTTGAAGCCCGAAAACTGGTCTTACTTGATGGTTCAGGTAATACTACTCTTCCTGGCGATTTAAGATTAACCACTAATAAAACTGTTAAAATTAACAATGGAAGCACACTTGTCCTTGAAATGGGTGTAGGCTCTAACGACGTCTATATTAAAAACCAACGAGGCGTGGGTGTTCTTCAATTAACTAATGATAGCAATTTAACGTTCAGAAATTACCAGGTTTATTACGCCATGAACGGAAGAGGCCCTGGTAAAGGTGGCACTCTTCTGACTAATGTAGAAAACGAGCGCCAACTTAAGCAGGATAATTTCCCTGTAACTACAGGCACAGAAACTAGATGGATCAAAGTTGCTCTTTTAAAAGACCCTGGGTCAGGCCAGAGTCGCCTGCAATTAATGGTGTCTAACGGCGGTAACTACGGTAGTACTTATAGTTCTATTGACTTTATCGATTGTAGTGCTAGAAACTTTCCATCCTCATTAACAAGCAGTAACATTCGTAATCATCTACAGATTCGTCGTCTCGGTAATCCGGCACTTGAAGACACCAACCAACTGCGTTATAGTCTAGTTCTTACCTCCGAAGGTTTAGAACTGTGGTTTATGCAGCGCGCATTTATCGGTAGTGTTAAAGTTGCATTGTTATCTATTGCTGGTGATACTGAATATTATCTGCCTAACGGTTACACATCTTCTTCAACTGCGCCAGAAGGTTTAGTTGAGAGTACAGTTATTCGTATCTATGACGAATTTAACAAGCCTAATATTGACGGTGGTACTGAGGGTATTCTGCCTATTAGCCGAGGCGGTACTGGTGGTACTTCTTCTGCGGCTGCTCGTAATAACTTAGGCCTAGGTACTGCTGCTATTCGCGATGTCGGTGAAGGCACTGGTAACCTTTTAGAAAATGGCGCTTATGGCTTAGGTGGTAATGGCGGTAAATCAATCGAAAACATTACCTCTAATGTAGATATGATGACCCGTTTGAAAGCATACGGCGGTACTTTCTGGCGCGGTGCTATTAAATCTGGGGTTAGTGTTCAAAATGGTCTTTATAGCCATGGCTCTGGTATTTTTATGAATGCTGGTGATACCATGTCAGCTATTAATATCGACTACGCCAGTGCTAAAGTTCGTGTATACGCAATTAACAACACAGGCCTTGCCGCGGGAAATGTTAACTACAACGAACTCTACGGTACAGCAAATAAACCATCTAAGGCTGATGTCGGACTTGGTAATCTGACAAACGATACCCAAGTTAAGAAAGCCGGCGATACCATGACTGGCGATTTAACTGTTCCTAATTTACATGCTTCCGGCACTGGCACTGCATCAGTATATGTTAACGCAGGAACCGGAAACGCTCATGTATGGTTTAGAACAGACGGTAACGAACGTGGTGTAATTTGGGCGACGCCTAATACTGCTGACTTAGGTCAGATTAATATCCGTGCAAAAACCACTGGAGGCACTTCTGCTGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGATGGCCGCCTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAATTGGCGGAGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGAAACATTACCTCTGGTTCGATGTTTGGTGGTAACCTTAACAACTATTTGACTTCTATTAAAAACGATATCGTTGCTGGCGATAATAAGCAAGTAAGTAAGACTGGTGACACCATGACCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAAGTCGAAAACCCTAATGGAACAATGGCTGATTTTGGTTCAGAGAACTCAGATAAGTATAGCAGAATAACTCTTGCACGTAAAGTTGGCTCTGGCGCCGCCGTAGCAATGCTTAAAATTACTCCTGAAGGATACGTGCAATTTGGCTATCAAGATGCAGTTGCTACTCCGTCTCCCAGCAAGTACATCCGAGTTAAACCTGATGGTCTTGATGTAGAAGGAGATTTGGTTTTTAACCAGACATATCGCGGCACCGAAGAGGCAGTTGATATTTCTGATAAGACCATTGACCTTAATGATCTTGTCATTAAAAGAACCGATCCAGGCACTCGTCAGCTGTATAAATGTGTATCTTCTGGCGGTGGTTCTAAGATAGCAAACAAACCCATATCTGATGGTAACTTTGTTCTCGAAGTTCTGTCTTTACGTAAAGTTTCTGATAACGATTGGACATGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAATAACACCACTGTTGGCACATATGTTCGCTATGCCCAAAATGGCTCATGGACTGCATGGGAAGAAGTTGTATCTGGTGTTCAACCAATTAATCTAGGCGGTACTGGAGCAACTTCTGTAGCTGCTGCCCGTAATAACCTCGGTGTTGGTGAAGGGCAAACGGCAACGTTTGGTGGATTGAATGTCAACGGCATTGGAACCAACGACCCCTATATCACATTTAAAAATGGCGCAAGAATACGAGAAGGGCAGGGCGGTGGTATTGGAGCTTTGATTTTATCAGCTTCTTCATCCACTGACTCAAAATACCTTGCATTACGCCCTTATGGTGATACCTCTGGTGTTGACATTAAAGTAAAAGCCAACGGCTCGAGTGAAGCATTGCTTGAATGGTCTTATGGTCCAGGCATTCGTTCAAATTCAACAGGCGCTTTTGTCGTCTATGCAAAAGCTGGTCAAGCACTTCATTTAAGACCAAATGGCGATACTGCAAGCCAAGCTACAGTTATTGACCAAAACGGTAAAATGACTGTTGGTGGTGAGTTCGAGGCCCAGAACTCGAAAATCACAGGTAACTTGAACGTTTCTGAAGATAACAGAATGATTGTTCTTGGCAAAAACTCTGATATTGGTTTAGTCAAGAAAAACGGTATGCCAGGAAAAATGGCCATCGGTAAATCTAACTCATTTACCGTTATGGTATCAACAAATACCAACAACCAAATTAATCCTGCTGATACGTTTAATGATATATTCAAAGTAGATGCTGATGGAAACCAGACTGTTTACGGAAATTCAACAATTTCTAGGGCTTTGACGGTATCAAGCGTTATTAATGCCAACGGCGGTATTATTGTTCCTACTACCAAGTATGTGCAAATTGCCGATGCTCCTACGCAGAATAACCAAGCCACCAACAAGAAATATGTTGATGACAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAATGCTGGCGATACTTATCTTCCGTTAGCGGGTGGTACTGTAACTGGGCGGTTAACAATTACAGGCGATCAGTTAAAAACTACCTCTCTGTGGACTACCGGGGACGCTGCTGTTAACGGCGTTTTAACGGTTGACGGAAAGGCTAGATTTAATCAAGAGTTCAGCGTATCAACTTCTGTTAACGTTCAGAACACTGGTAACAGCCATGTGTTCTTCCGTAAAGCAGATGGTACAGAAAAAGGTCTTCTTTGGGTTGATGAGCCTGGTAGCGTTAATATAAGAGCAGGCGGTGCCTCCGGACCAACGTGGAACTTCTGGAACAGCGGTTCTTGTCAATTCCCAGGTGCTATTAGTAACTTTAACGGAATTAGCTCAACTACTAATTATCCCGCAGGACAGCCTAACGGTACGTACAGTAATACCGCAGGATTAGTAACTAGATTTAGTAATGGTGCTTATGCTTCGTTATATTTCCAAGAGTATGTAGGAAATTATCACCAAGCTATTCTTAATGTTAATGGATTTGGTCGAGATGACAATTTCTATTTCAGATCCGGTGGCGACTTCTTCTGTACTCGTAACGGTTCTTTTGATAACGTTGAGATTCGTTCTGACCGTAGAGCTAAATCTGATATCAAAGTTATTGAAAATGCTTTGGAAAAAGTAGAGACCTTAAGCGGTAATACTTATGAGCTTCATAATACTTCCGGCGGTACTACTCGTTCTGCTGGGTTGATTGCTCAAGAAGTTCAAGAAGTTCTTCCGGAAGCAGTTACTCAGGATAATGAAGAAGATGGCGGTATGCTTCGTCTGAATTATAACTCAGTAATTGCTCTTCTTGTTGAATCAGTGAAAGAACTTTCAGCTGAGGTCAAAGGTCTTAAAGCAGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
1181394280863e489fedb89bfec9a95c99d58582de952343fa851959a2a1e266
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6607
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50