Protein

Genbank accession
XLM56124.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,9361

Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSAWNTLRYERPVESTSNTANTLVQRDTDGNFSAGTITATLIGNASTAARLASTRQIQLSQDITASGVFDGSANLNLNAELTLVSTLPHYDGTGTPTGTYTSVTVDAKGRIINASNPSTLAAYNLDGNVEGSSAQPYDLDLAAISGLTTTGIISRTSGGSMATRTITGTATRIAINDGAGISGNPTIDLIVTAVTPGDYNTESLTSVSGVGGNSEPFGTETVNATKFTVDAYGRLTSATNVPIATATEGSKYASYSAGTTYARYDIIEEGGNVYQAIQGITAGSGAPSHTDSSDAGGWRYLAAAATEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAALGVDNTQLQNNRISFADGNTKEDFELDQELTSTTGYRGFNYLNYIKVNDTSGNLLVGANNTGDGGAGALDVNVRSYFSDPDITLDGVVAQTLDKTGDGDLTLQLTQNTASNRNFNILTTNAGAGTSNIIVTAEDTVQISASEATGKVWVEDARFQDNYIATANATMNLDPGDDRAVTGLVRVWGDLQVDGVTTTVNSTTMTVDDVVLTLGGDTAPASDDNLDRGVEFRYYDTQARLGFYGWDTNYTDLGGHEGGYRFLHAATNSSETFSGTDSGIIAGNLKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGVGITQDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDTMVLRGASKSLQFQNGTGTVKSEIHTTSGNAEFGGILTVTGATDLNNTLNVAGFTYLENTDEPQIALNSGTGIYEIQNSDYGAFRFDGGGYIEGDFMFNSDVYVNGQIVQKEDATATFNRQNYLEVRYRQIIGTRAALTPSYATDSNSNLRVYGGAGVTTSLHIGGTDAGEGLFVGKEGSGDTVKFSVLGASGNTDIEGTLNVEGQVTIQDSVIINAANEVFSIRNGSGVAKFDVDTDNGNTLIEGTLNVNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTTIQGTLNSVGAVDFDSTLNVDNNTTLGGTLTVTGTSEFNNTVDVDANFAVRTSLGVDKFTVASASGNVATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSIRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTLGVTGVTSITNSTDQTLTGLYGADGAVRITGGVGVQRNLAVGGNMRVYGDFEITGSTTQSGNTGFSGRVSITNTSDATSFSDNSVALTTDGGLRVSKNAWVGGDFYVWDDANSRNAFYVDTSTGDATLHNTLTVGGNLVVNGTTTTINSTVTTLDDPIITLGGDTAPVSNDGKDRGVEFRYYDGSAKVGFFGYDRSSSQFTFLTDATNNAEVHTGTDASVRAGSLRLTSAGTALDVDNNANIDGTLTVDGQITSNVATGNAPFVVASTTKVINLNADLLDGLTTATAATGNTVVIRDASGDFAANVITMATGTITGAATVGTTLGVTGATTLSSTLGVTGATTLSSTLGVTGVTTLTGLLNANGGIAVDTNNFTVDGTTGAVVTASTLNVGSTSSFTGAITATGGVIGNVTGNLVAAISTGKTFNPETDSTYNLGASTLRWATAYVDSLNAGTSITTAGTLSVTGTSTFTGEISANGGIALQDTDKATFGNDDDMQIYWSGTQNRIDTEGPFQIRNSNTSSGISFYDGDNTNFMFKALPLGAIELYHNGTKTFETTATGATLTGVLVATSLTGNVTGNVTGTVSDISNHTTDALAEGSTNLYYTDERVDDRIDALFVASTGITKVYDDVAGTYTLSVTQVDINTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIEHDGSGTLSVTQADINTDNVTEGSTNIFYTEARFTTSLGTKTTTDLAEGTNLYYTDARADARIAAATTDNLSEGATNLYYTDARADARIAAADTDNLSEGLTNLYYTDARAEASFDTKIAAASTTDLSEGTNQYYTEARVQTKLDNAFAQLQAMLNNLATTTTLTLNLSGDPTPGAVVTAGAVTEGGVGGFTAGTGVATSGGTGNGLTVDTTVVGGVITAVAVNAGGSDYLIDDTITITNPNAGGVATFNLATIVGGTNYVTGTALATTGGTGGATLTVDITASAGAITNVTINNAGTGYTAGDTITIVQPIGADGVNPASGGTVDVSTVFVDATFALADITTMEVGATVTGATSGTTGVITALGTNQITVDTVSGFFKVGEVVSANDVTTLTISSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:2182 AA
molecular weight: 224021,52430 Da
isoelectric point:4,11494
aromaticity:0,06737
hydropathy:-0,11109

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage WH25-B
[NCBI] 		3384917 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XLM56124.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ638372.1 [NCBI]
CDS location
range 41234 -> 47782
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGAAGAGGTGGCGCTCAGGAATGGGCAAACGCTAACCCAACCTTGGCACAAGGTGAACTCGGAATCGAACTTGATACTGGTCGTTTCAAAATCGGTGACGGTGTTTCTGCTTGGAACACGCTGAGATATGAACGTCCTGTTGAGTCTACCTCTAATACGGCAAATACTCTTGTACAGAGAGATACTGATGGTAACTTCTCTGCAGGTACTATTACTGCAACTCTGATTGGTAATGCTTCTACTGCTGCGCGTCTGGCATCTACCAGACAAATTCAGTTATCTCAAGACATCACTGCTTCTGGTGTTTTTGATGGTTCTGCAAACCTGAACCTTAATGCAGAACTCACGCTTGTTTCAACTCTGCCTCATTACGACGGTACAGGAACACCTACAGGAACATACACCTCTGTTACTGTAGATGCGAAGGGTAGAATTATTAATGCTTCAAATCCATCTACTCTTGCTGCATACAATCTTGACGGTAACGTAGAGGGTTCTTCTGCACAACCTTATGACTTAGACCTTGCTGCAATTTCTGGTCTGACCACTACTGGTATTATTTCCAGAACTTCTGGTGGTAGCATGGCAACCAGAACTATTACTGGTACTGCAACTAGAATTGCTATTAACGATGGTGCTGGTATTTCTGGTAACCCAACAATTGACCTTATTGTTACAGCAGTAACACCTGGTGACTATAATACGGAATCTCTGACATCCGTAAGTGGTGTTGGTGGTAACAGCGAACCATTCGGTACAGAAACTGTAAACGCTACGAAATTTACAGTTGATGCCTATGGTCGTTTAACAAGTGCCACAAATGTACCTATTGCTACTGCTACTGAGGGTAGTAAGTATGCTAGCTATAGTGCAGGCACAACTTATGCTCGCTATGACATCATCGAAGAAGGCGGTAACGTTTACCAAGCAATTCAAGGTATTACTGCAGGTTCTGGTGCCCCAAGTCATACTGATAGCAGCGATGCTGGAGGATGGCGCTACCTCGCGGCTGCGGCAACAGAGCAGAAGGGATTGGCTTCCTTTGCACAGGAAGATTTCGATGTTGACAGCAACGGGCACGTTACCATCGCCGCCCTCGGTGTAGATAATACTCAATTACAGAATAATAGAATTTCTTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAACTTGATCAAGAACTTACTAGCACCACTGGATACCGAGGATTCAATTATCTTAACTATATCAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTTGTTGGCGCTAATAATACAGGGGACGGCGGAGCTGGGGCACTTGATGTCAATGTACGCTCGTACTTCAGTGATCCTGATATCACTCTCGATGGTGTTGTTGCTCAAACCCTGGACAAAACTGGAGATGGTGACCTCACTCTTCAATTAACACAGAATACTGCTTCTAACAGAAACTTTAATATCCTGACAACCAATGCTGGTGCAGGAACTAGTAACATCATTGTTACTGCCGAAGATACTGTGCAGATTAGTGCATCTGAAGCAACAGGTAAAGTTTGGGTAGAAGATGCACGTTTCCAAGATAATTACATCGCCACAGCGAATGCGACGATGAATCTTGACCCTGGCGATGATCGCGCCGTAACTGGTCTGGTTCGTGTCTGGGGTGACCTCCAAGTTGATGGTGTAACGACAACTGTCAACTCAACAACCATGACAGTTGACGATGTTGTACTCACTCTTGGTGGCGACACTGCTCCTGCATCTGATGACAACCTCGATCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTATGACACTCAAGCACGTCTTGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTACACTGATTTGGGTGGTCACGAAGGCGGTTATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATAGTAGCGAAACTTTTTCTGGTACTGATTCTGGTATTATTGCTGGTAATCTTAAGTTAACAACTAATACCAACTCGACTTCTAATACGACTGGCGACCTTGTAGTTGCTGGTGGTGTTGGTATTACTCAGGATGTAAATATCGGTGGTCTGTTAGATGTTGATGGCACCTTCCGTGCTAACAGCACTTCCCGCTTTGATGACACCATGGTTCTTCGCGGTGCATCTAAGTCACTTCAGTTCCAGAATGGTACTGGCACTGTTAAATCTGAGATTCATACAACTTCTGGTAATGCTGAGTTTGGTGGTATTCTTACTGTAACTGGTGCTACTGACCTTAATAACACTCTGAACGTTGCTGGATTTACATATCTGGAAAATACAGACGAACCTCAGATTGCTCTGAACTCTGGCACTGGTATCTATGAGATTCAGAACAGCGACTACGGTGCATTCCGATTTGACGGTGGTGGATACATTGAAGGCGACTTCATGTTTAACTCCGATGTATACGTCAATGGTCAGATTGTTCAGAAAGAAGACGCTACCGCAACCTTTAACAGACAAAACTACCTGGAAGTTCGTTATCGTCAGATTATTGGTACTAGAGCTGCTCTTACTCCTTCTTATGCAACTGATAGTAATTCTAACTTGAGAGTATATGGTGGTGCTGGTGTTACTACAAGTCTGCACATCGGTGGTACGGATGCTGGCGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAAGAAGGCAGCGGCGATACCGTTAAGTTCTCTGTTCTTGGTGCATCTGGTAACACTGACATTGAAGGCACTCTGAACGTTGAAGGTCAAGTAACTATTCAAGATAGTGTAATCATCAACGCTGCAAATGAAGTCTTCTCTATTAGAAATGGTTCTGGAGTTGCAAAGTTTGATGTTGATACTGACAACGGCAATACTTTAATTGAAGGCACTCTGAATGTTAATGGCACAGTTGATGTTGACGCAGACTTCGCTGTTAGAAACGGCACAACCGACAAGTTCTTTGTTGACAACGTAACTGGTAATACAACAATTCAAGGTACTCTCAACTCTGTTGGTGCAGTTGACTTTGACAGCACACTGAACGTTGATAACAACACAACTCTGGGTGGTACTCTGACAGTTACAGGAACCTCTGAGTTTAATAACACTGTTGATGTTGACGCCAACTTTGCTGTTAGAACTTCTCTTGGTGTTGACAAGTTTACCGTTGCATCTGCTTCTGGTAACGTCGCAACTGACGGTACTCTGGTTGTTCAGGGTCAGACAACTATCAATGATTCTCTGATTGTTGATGCTGCTAACGAAGTCTTCTCCATCAGAAATGGTTCTGCCGTTGAGAAGTTTGGTGTTGACGCAGACAACGGTAATACAAATATCATCGGCACGCTGACTGTTGGTGATGCAACTCAGATTAATGATACTCTGGGTGTTACTGGTGTTACTTCCATCACTAATTCCACTGATCAAACTCTGACAGGTCTCTACGGTGCTGATGGTGCAGTTCGTATTACTGGTGGTGTTGGTGTTCAAAGAAACCTCGCTGTTGGCGGCAACATGCGTGTCTATGGTGACTTTGAGATTACTGGTAGCACCACACAGTCTGGTAACACTGGTTTCAGTGGTCGTGTTTCGATTACCAATACTTCAGATGCTACATCATTCTCTGATAACTCTGTCGCTCTTACAACCGATGGCGGTTTAAGAGTAAGCAAGAATGCATGGGTCGGTGGTGATTTCTATGTCTGGGATGATGCAAACTCTAGAAATGCATTCTATGTTGATACAAGCACTGGTGATGCAACTCTACACAATACACTGACAGTTGGAGGAAACTTAGTTGTAAATGGAACGACCACTACTATTAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTCTGGGTGGTGACACAGCACCAGTCTCTAACGACGGCAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAGTGGGCTTCTTCGGATATGACAGATCCTCCTCGCAATTCACATTCCTGACTGATGCAACTAACAATGCTGAAGTTCATACTGGTACAGATGCTTCAGTTCGTGCTGGTTCTCTGAGACTCACTAGTGCTGGCACTGCACTTGACGTTGATAACAATGCCAACATCGATGGTACTCTGACCGTTGATGGTCAAATCACTTCTAACGTTGCTACAGGAAATGCTCCTTTCGTAGTTGCTTCTACTACTAAGGTCATTAATCTGAACGCTGACCTTTTAGATGGTCTGACGACTGCGACAGCAGCAACTGGAAATACAGTTGTGATTCGTGATGCATCTGGTGACTTTGCTGCTAACGTCATTACGATGGCAACAGGTACAATCACTGGTGCAGCGACGGTTGGTACAACTCTCGGTGTCACTGGTGCAACAACATTAAGTTCCACACTTGGTGTTACGGGTGCAACGACACTCAGCAGCACCTTAGGAGTTACTGGTGTTACTACACTTACTGGTCTTCTGAATGCTAATGGTGGTATTGCAGTCGATACAAACAACTTTACTGTTGATGGAACAACTGGTGCAGTTGTAACAGCAAGTACATTGAATGTTGGTAGCACGTCTTCCTTTACAGGCGCTATTACAGCAACTGGTGGAGTCATTGGTAATGTTACTGGTAATTTGGTCGCTGCTATTTCTACTGGTAAGACCTTTAACCCAGAAACTGATAGTACATACAACTTGGGTGCTAGCACACTGAGATGGGCAACTGCATATGTTGATTCTCTTAACGCTGGAACATCTATTACAACCGCTGGCACCCTGTCTGTAACAGGTACTTCCACCTTTACTGGTGAGATTAGTGCTAATGGTGGCATCGCTCTCCAAGATACCGATAAAGCGACATTCGGTAATGACGATGATATGCAGATTTACTGGAGTGGAACTCAGAATAGAATTGATACTGAAGGTCCTTTCCAGATTAGAAATAGTAATACATCATCGGGCATTTCTTTCTACGATGGCGATAATACTAACTTTATGTTCAAAGCGTTACCTCTGGGTGCGATTGAACTCTATCATAATGGTACAAAGACTTTTGA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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.