Protein

Genbank accession
XLM56117.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,4700

Protein sequence
MNINKVSQSIRANTPDFFGTEYPLFNKFIEYYYRSQEKTGLGQNIINNFLQYLDIDKLDIGILDGTTKVVESVSPTDDTIVVESIDQFLEENGSILIGDEVIYYEGITSAPNIALSPGISYEQVRVKWRTLSNLIDDFDGTTTRFSLISQDIPISVPSAQHLVVSNYGEVLIPNVDYTVDGTNIVFTSAPRERIPADDNAATYIYYLSGFIENPIVAVDNLSNSFGSDVKAFKMTVNGQTYEPIVDEYVIAVYDNRLLTPKVDFFIDKDTFIFATAPLNGRILSIYSIEAPIPSFGSGAVGYSRVNDAGEITDVLISETGSGYRFDYPPQVSISSETGKNASVSSLVDGVKTVQLLDGGRGYSSTNPPIVQIEQPTKTGSKVAVFKATVTNGAVDSLSIVNSGSGYTFTPRVTFRQPGGAVLAPPTITNGQVTGSIEITEPGFGYSTAPLVYIDEPTGVNGIKAAFTTTISADGELIAVNIVNAGQGYESVPKLKIIDPVGAQILDVRVDGDGRVIGIDLLDGGSGYEDVPSVYIVDDRTDTRGVYIGGSGATAVASIFNGRITDINIDKFGTGYSADNPPKVIIQSPPSAKASVEIGLNEITGFDVNQSGEGYTKASFVGCARAASGITSYTENGNAVFSNNTTASSFSTDTEVKCLDALFVKRLLDKYTEQFLPDVPSLDYKSIDVRTSIKTIKDFYSAKGTSFSIAYLFKLLYGETVSISYPKDQIIKPSAATWSVDTILRATLVSGDPTNIKDALLTQEADIADQNIKDASALVENYISIKTSDVEIFELVLSEETINGKFVVPYKTKLAEPLNTTDSIITVDSTIGWPERNGKFLIGGTELIEYKEKSLNQFIECTRSSNGVVEDWDSATEVTSNFRVYLNRGTTQEVVMNIVGIVDAQQTTLTDTGSYYLPGDKLNISKLGGTSEIPELNTWLYNVKKLISVESITFGGVNDQSATVTCSNPHGLLVGDQVTVYGANPIIYNGTFLVTSRDSETVFQYQLPQPGLVVPQGNILVSIDLNKGKSDNSAVLNAIGPYTTNVQNSFFNDDHVYVASTGIPNYKIGPFPGTALLPGNQRKLNRFPLSSTTISNKDLINPGPIGTWINGVSIWSYKSQLTKTFGAVTGISIVNPGESYDAAFPPTITISGGGGTGASASVTVDGSITEITVLEGGSGYTSSPLVSIVGGGGSGAAATAIITKGVVSRILIVNGGTGYTSQPSISIVGGGGQGATGSASVRGPIKSISVDAGGASYTSEPSITLSSGSGAVAQPIVSDGRIISIAIISAGQGYTTPPTVTIQGDGFGAIARANIDRDGENAGRVTSIEIINRGIGYTQGQTIINMDSVGQGATFSSSVFQWSYNLQETTTFDSADGAVFTGYNNQYGGEYAHLSNPQRLRYILGDNLTEVNEVISEINDSLEHSPIIGWAFDGNPIYGPYGYNDPTDQNSSITRLQSSYRLKSNLVYDEITNPYPSRTAGPLLTDEIAGNFVEDYEYVFSLGDLDQYNGRFCKTPEYPEGRYCYFVTIDNTTAGNPVFPYVLGPSFNSVVDKWNLSSSAIQQNIPTGVVRFRDPYENVDIDVDRAPNASTNALSLENGDILLFEVEDENRDGIISQDEIDDPDEVFEESPLQLFDYFPTVRFDSKVDIEVETTTKFEDASVTGFTIENAGQNYQVDDRLLFDNTSTGGTGVSARISRIKGENISSYTFETRSGENFGVLTTEEPHNIIAGDTIFVNYTPVMNNTNKQFVVRQYKGIEKINILQTGSGYNEDIPPVITIDGDGESGQLSATVSSVGAIDAVNIDNSGSGYTQNPRVILSHPQIFKKADYYVSLISNNEYVKVNDVFVNDAKESFICGKTKDAQGNTVAFVAKLSATGVKEWEKNLELPSVQNYAEFERIFVDGNDIWIVGNNRPNSVILDAYNPDIILVKYVQSDNGLSATLSFQKAYAGISGASREDVITSIKKMSDTRFIIGGYTNTNSGNPYDAFIASINTDGTFSVKRKLASVNKSEKLTDMLVVGEDVYFTMETSATSSSDDINVAVGKVSVGTSVIQVDWINEISNTLYSFFDSSIVIDEFNELYVPCTLRLKTDDETKNAFWIGKFNTSGTAIWNYVYSAPGRDIQLAHKSSIDIFGHLNIAYTRTDNVTDLKTAATVKLDYTGKILNHTINEFNDDNIEGITVHSLDTDNSGDVHIFGQTSWNRNEFIFEFGETDSATDKTGHYTPTLIGNDATDSLTLSGDGYAKFFGKDVAVPANWENAAIKFAAADLGTKLNGDWTIEFMLYKDATNSDTHSQTQQTLLAIGDATDATGGLWFYYDINNGQLELVVTNNTTALNSAGSGLTSTQTNMYADDSWQFVGLKKDGDAFTAYVNGVQIFTGTIANTSLGAKDLHFGNIPGKNGTPAAFVSTYQGQYYLDNLRLRNRAITPTVPSDVATIPPTASFALAFDWTDDAWFTTNMNRYDYIDYVGFGMKVDKNADAVRLGDQGQQTNTGVTFERTAVTPVTGAALTLNTVGFALGEAGFQSLDFDSATTTMTQDTETLTYANDVWSSRTATVPSPGSQKLKVEAVVKDRYYFKVTPTVKIDNVQELTINQPFRFTEKTKLRLNDDAGTFVNSGYIVKVDSVNNKVYLAVNNNSWSDDLNTGNLITEQFNEQSAYGIVGPIPNDVNEINAFNFIQVENQTPGTFVINLEDYDSPTGGTDNLDEFATFKPYSDDDYSIRIDEVAGSSPFVVGSVVTINSGDISFNSAYSQATITNLTGVLKITLIANLTKRLQVTAVSNSDEVYVITGTAHYLTAGEMLYIDGNPSQEVNSVTYDEYDGSFAVDTVVSPLEFTYKLPNVAVTSPATTAANVNVFIKSPVLKMYYGHQYVFDLSHSTMVGGNLSFSKDNLYKLEYSFNSIERVGTPGVTGEGQPLPTVKLKVDGDIVTNISYYFDPSRPDDDTSPVIKDSYLDVVDSPYLGTFLVSGVSGGTITRGDDVIKFPLVNEPEGDAEVSTASYSTSSKKAVGSIANIRIVNPGGFYQKLPVVSGIQSTRNIERVQINEPGTEYAVGTYNSVPISGDGEGGLVQITVADGQDDEGITIPGQIQEVVVTSAGKGYTTASIDVEAVEGILGPGLTGSGAELEVVIPPFGTGASIFTIGTNVGKIKKLKNNNFGYDYPHDYTLRPEITFPLNAQLTSTSILDSITVTDPGSGYSQAPAVVITGGGGSGAIAEASIKNGRLDQIIVKDPGAGYSSTPTVSLRSSFNYVVNLDLGLLQFAFPHGIPNGSQVTLNVVDTGDGAEFPLAAGALGRLNGTTTYYAITGTANSLEDDQLKLAITASNAELGDAITFSNAGTGRQQVLTESFGGSATANVITSTFLEGELVYQGDSLTNATATGYVSTNSGWQVGPRLLKIVDYTGDFVKGQSITGTISKSSGVISDLKVAKGVLDIGSITETTGQFIDDVGKPSEIIQKIQDSYYYQDFSYAVKSAVSIGEWKDILIKNVHPASFKVFGELNINEYGSIPNKETDFELVKSVELAREAIVPNIQNFALVEPVYSEFNNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRLDDISSLFDGVRISFPLTVNGANVVANATQLMIVLNGVVQTPNTSFEIQNDSIVFSEPPSPPASVKYVNITLDQIDTVELTFTNISGIFPLVGNTLAGTASGARLTVTKVVGNSIFGFVTEGTFIIGELTTVSATGFASNLDTITNIDNLGLFTFGETVTNLTGDTAKVEQINLETGQENAIAELRYTIGAATASFEVVDRSAQTDAPVAEGTFEVNEFYQFGSEIFQVLTITNGTDSTTLGVLRGQQGTQASSKTQDTPIYGTQIEVTGDLTLSKTAGTYQSTPGLFDIELNDVIIGASSGVVARVTGTSIYQDPVTQEFISQVNISEGSSFFGLLFNRIASTTYPNVVIDDISQSQVNIVDFTNNTTAFDSSFPANEPINNYVIPYDNVVGTLQDDEYIRNYKIEYGNSNGDFTATEGLKVKKLTFKDQIGTGFFAAGQVIRTEDTKGEVIGYSQANKTIYLGKVGRTQSTGADYHEATFNADAQLDTAQKKFGTASLLLDGTGDYLSIPTSTEFGFGTGEFTIECWIRPANVTGTKAILDFRTTGTEVSPYLYLDGANLKYFVNGSDVITGTATLAADTWYHVTISRTGSTTKMFVDGTQDGGDYSDGSNYGSTKPIRIGITIADGDGFAGHIDELRVSTTARYTAAFTPRNGIFQGDSDTKLLLHLDGADAQTYTEDWSGGESFTNGEDFNNDAILATSRVLGAPAGFAGKTHRYVDAANLIIANKDFVAKEVVYLLTQQYPSLVIPGGNVNCEDDIRDVLDALVEDIRNGSNNHMWDASALYVDRTANPVTLNHIETEITETIWAYNKVDEMLQYIINNVLWTVSGDHGLTQKTDTTITDSSTSSLTQFTPTDVTYDHTTGDLVITIGTHSLTTASRIAIASESIAFSCASDGNQRVLLYPDPDSASYNSVIPVTATTATTITVNVGTPPTDSTGYSAHTFEAADSNLTNAVTLLDYTTSDCADVYSTIGNLIDILTDTLSEAETPTNTLTGDHLATVTKVTPAYEFVGGTVDAFLEVPLTADYHDAANDIVYTNQIDVDSRYRFFDAANLIRANASVIVDKAAADLIARYPDLALDMPRNTDGSGAGTTRCKTDLSLILDELVDDIADGGNKNTVRVAKFYLGVNGELLHIRLQVFQSVYAHERLAFYMKQAITGDLDYTNTDGIITGDWGITNDPGGCQNVKDAIDTLIATFNDIIAPTNADFAIGADRLYFNRQYIAEEITGLTTAEFTYTLNGVDYTAFSYPGDNGEVTCQRDLKLILLGMISDLQTGGTNSTIAAIQTYLNSDNTLNHIENELLATVYSIEQIKVIGEYALRNYLYEQGANAGSPNYNAQYTDEDGYRDSETPTDIDLVVFRLRDLVDIAVGILAPSGDAGRGAAKNILYNRNYYREEITQTVNSQFGAGSWIYDDFLNDMVDNVVHDIITTDT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Physico‐chemical
properties
protein length:6280 AA
molecular weight: 675331,93530 Da
isoelectric point:4,33689
aromaticity:0,09745
hydropathy:-0,13826

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage WH25-B
[NCBI] 		3384917 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XLM56117.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ638372.1 [NCBI]
CDS location
range 7120 -> 25962
strand +
CDS
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