Protein

Genbank accession
AFE87666.1 [GenBank]
Protein name
neck passage structure protein [Lactococcus phage ASCC460]
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,99
Protein sequence
MSLDNFRNRAIVWDTVNKDFPQPIQIMQGDVNARTLSVKIIDNGGEIDLTGHSLKLTYQYTNSSNSGFVMIPPENLTKGEFILVIPTEMTKAGVIEANLILLNEDKEQVIVSKNLTFISDNSTVTDLAQEVNNKIDDFTKLLLENMPQVLRSELNDLHAQTESNKSNIELKANQADLDNLRATVDKQGVAISTKAEQTDLNNLQATVDKQGVAISTKADKSEIYEKIKILDEKIPINKFKDGQKDFSLYTSPSENSLYVVNKPLSSGSIIAHVSSNKDQAGSILIVKKNGLTFTILSKKNINLTAGHNTVDMDYTVSGDGTEYLATVGVINFKPNSGLGFYQIAYGSNVGNVGDTFETVDHTDMAIDLGVYAEYKGQLEIIHDDLLNRIEKFNSLPSLTNFLLPRYTQITEPVGFVGRWFDSTISGTNVKSTINQGSELYFKVKNTTSINVNFIVNTAYETPYFAYSIDGADMTRQLVTSPTLPTVSLDEHIIRVVVDGVTESEDKWIGEKGFAFKDITVDSTGTVTGVLPKNKKIMFFGDSITEGIRVLNMNANSDGNSATGAFPYIASTNLNAISYRVGFGGAGVTKSGNGGVPSLINFIDNMTKNKLAPYYEPDVIVVNMGTNDIDAATDVFKSQYTAVINRLLIKYSGTPLFIMVPFNGARKSEITDITNNKKGVYMVDTTGWDISTTDGLHPDVAGSIKAGTKLSDYIISTLGRNYFI
Physico‐chemical
properties
protein length:723 AA
molecular weight: 79200,41300 Da
isoelectric point:5,02203
aromaticity:0,08160
hydropathy:-0,19945

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactococcus phage ASCC460
[NCBI] 		1165150 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFE87666.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JQ740803.1 [NCBI]
CDS location
range 7079 -> 9250
strand +
CDS
ATGAGTTTAGATAATTTTAGAAATAGAGCGATTGTATGGGATACGGTCAATAAAGACTTCCCACAACCAATTCAAATAATGCAAGGCGACGTCAACGCTAGAACATTGTCAGTTAAAATAATTGATAATGGAGGCGAAATTGATTTGACGGGTCATTCATTAAAACTTACATATCAATATACTAATAGCAGTAATTCAGGCTTTGTTATGATTCCTCCTGAAAACTTAACTAAAGGAGAGTTTATTTTGGTAATTCCTACTGAAATGACAAAAGCCGGAGTTATTGAAGCGAACTTAATACTTCTCAATGAAGATAAAGAGCAGGTTATCGTCAGTAAGAACCTTACATTTATATCAGATAATTCTACAGTTACAGACTTAGCTCAAGAAGTAAATAATAAGATTGATGATTTCACTAAATTATTATTGGAAAATATGCCACAAGTACTGCGTAGTGAGTTGAATGACTTACATGCTCAAACTGAATCAAACAAGAGCAATATTGAGCTTAAAGCCAATCAAGCGGATTTAGACAACTTACGAGCTACTGTTGATAAACAAGGTGTTGCGATTTCAACAAAAGCTGAACAAACAGACTTGAACAACTTACAAGCTACTGTTGATAAACAAGGTGTTGCGATTTCAACAAAAGCAGATAAATCAGAAATTTATGAAAAAATAAAGATATTAGATGAAAAAATTCCTATTAATAAGTTCAAAGATGGTCAAAAAGATTTTTCTTTGTATACATCACCTAGTGAAAACTCATTATATGTTGTTAATAAGCCTTTATCATCTGGTAGTATCATTGCTCATGTTAGTTCAAATAAAGATCAAGCAGGTTCAATTTTAATCGTCAAAAAAAACGGTTTAACTTTTACAATATTATCCAAAAAAAATATCAATTTAACAGCAGGACATAACACCGTTGATATGGATTATACTGTATCAGGAGACGGGACTGAATATCTTGCTACGGTTGGTGTTATCAACTTTAAGCCGAACAGCGGGTTAGGATTTTATCAAATTGCTTATGGCTCTAACGTTGGTAATGTTGGAGACACTTTTGAAACAGTTGATCACACGGACATGGCCATTGATTTGGGTGTCTATGCTGAATATAAAGGTCAATTAGAAATAATTCATGATGACTTATTAAACCGTATTGAAAAATTTAATTCTTTACCATCTTTAACGAATTTCTTGCTTCCTAGATACACACAAATAACTGAACCAGTTGGTTTTGTTGGCCGGTGGTTCGATTCAACAATTAGTGGCACGAATGTTAAATCAACAATCAATCAAGGTTCGGAGTTATATTTTAAAGTAAAAAATACAACTTCTATTAACGTCAACTTTATTGTTAATACCGCTTATGAAACGCCTTACTTTGCTTATTCGATTGATGGTGCTGACATGACACGACAATTAGTTACGTCACCAACACTTCCCACAGTGTCATTAGACGAACACATTATCAGAGTTGTTGTTGATGGTGTAACCGAATCAGAAGATAAATGGATTGGTGAGAAGGGGTTCGCGTTTAAAGATATTACAGTTGACAGTACAGGCACTGTTACTGGAGTATTACCGAAAAATAAAAAAATTATGTTCTTCGGTGATAGTATAACAGAAGGCATTCGGGTCCTAAACATGAACGCTAATTCTGATGGTAATAGCGCGACAGGCGCATTCCCATATATTGCAAGCACTAATTTAAATGCTATCTCTTATCGTGTTGGCTTTGGCGGCGCTGGTGTTACTAAGAGCGGCAACGGCGGTGTTCCTTCATTGATTAACTTTATTGATAATATGACTAAAAATAAATTAGCGCCTTATTATGAACCTGATGTTATTGTCGTTAATATGGGAACAAATGATATCGACGCGGCTACTGACGTATTTAAATCACAATATACAGCCGTTATTAATAGATTATTGATTAAATATAGCGGTACACCATTATTTATTATGGTGCCATTTAACGGTGCTAGAAAAAGTGAAATAACAGATATAACTAATAATAAAAAAGGTGTCTACATGGTTGACACTACTGGGTGGGATATTTCAACAACAGATGGTCTTCACCCTGACGTTGCAGGTAGCATAAAAGCTGGTACTAAATTATCAGATTATATTATTAGCACTTTAGGTAGAAATTATTTTATTTAG

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.