Protein

Genbank accession
AFI55358.1 [GenBank]
Protein name
putative murein lytic transglycosylase [Halocynthia phage JM-2012]
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Protein sequence
MSDEEDIKLDDNELDDMDMSFDNLDMEAEEQPSNRDPVTQLKTNFFKGAVTKVSDKHYLEQEIKKAVPKGYSTTYESAKSGLDAVDKAKRNLISPIRKELPEFKRNLNRLSPLVKRMVGDRFGNKFDDLTKVKSNSPDIDPDQLEMQQGLAGIFGTWRESQLGDRQQDMADKMMDAKTEQERFRLSHTTLTSISNSLNRVNAFNDGILLKVHERALELDFKKYHILKNLLKVTTEGYNASIGELKAITKNTGLPEIIKRQNSENFKQLFLDEWQGRTTANIVDFGKDYFSKMAQNIQTRALEVGQQVADGMSSLGDAASGFADMDEMQQEMGGPQQSLKEMALSNAGSAAGGAVSKKVVGFASEQLEKYLKANPDAKRVDKFLQYANMNKAQLFDNLVTDNTEAEGLRGLFFRFIDSVRPTIDADRESITQSLAEKATMEAQWDRMSRETLIKIIPEWLSKIHLVLKQMAFGPKAEKETFDIYSEKFVTQSEAMANLQKRLIDDNSIEDVRDNIDKVIAALFVGNEDIKDKLTQEQIDGLENAIIRSANNDIGTDLDKFGRKDQYSTIPGITEGDAEVLAEALGKVLNVGAEGKTKFKLGDFSDSGGEATHRLNVLSRFKGLKDANPETQSIFNLLNATGNNELLEGLGYGTRDKDGRLGLNFGNLYNRKLGKFDNTKTNVDVEDLSVVRNNLMNERSELANNISNNFNVDTSDINLRLESIDKAVSRIDAILAQDTGVNVTLSKSSLDVIHEAIAINKPKVTANGEMSSEHTDAAVLSELQIANSTLNDVRGVLAEMYAAQQANHNETMGNSSLGKFVGNMGVKFSKILSGPFKLASKAFGKARSLVKGSFDKAKKLAMMPMKLVGGIASEIRNQFKKPDDVYLIGGSEPVLYGKDIARGIYFNRDLPKSPYATQGKLAKTPIKSITDIKGEVFNKETANVAITREEFDKGLETRNPGMAKKIGGLIGKGLAIPLKLAGNIYGLGKSVFKTGGRLLSRGKNYLTNKLNSAQSLFTGDGKLLVTKEELESGLLYVMENGKRVTVTSLKDITSTVYSYKDGEPRITIEQIKEGLRDKSGKLLKLKTIAGEVGNKLLSGAKLLGKVAMSPFKLIGKTTKSLMKMFEGKLISSLLVHVPDNVIFKANVVNLFTNKVIDKGEGSPDYLTTSSKVSDSLKDLKGKAQVKGSEIKDKATEATSKMKDKLNKYKEDNQDKLDKLQSTMSDIKDKVKDSKTSDIAGEVAATLKADKAREKALSAWGKIKKSPRGDSDGDGLRDGGWREQLKDRAKGILPSSKSKDKDGKVDAGSNKIVKTLMMLIGPIVGILGKIANMDILGGLGKAARGLGLGRLLGDVVSGMPDIDRNKPSKAGRMRGKGKLVGRALGAMKSGGGTVLNGTKNLVGKAFTKVGGKKVVGAVAKFGAKKLAGAAVAAGAAAAGLAVIAPIIGIGLAVWTAYEIGSGLWGYFSRRSSIKKIEYLRMMQYGYYVGEDGDYEDRKVALRYFENEMMDRMEPKDGIVGIKGTTEELWEEYSGDFDSSYGDSAARAEWVKWFDYRFKPVLFKWISVVASLNESKDGEHSLSSLDESLKKEQYPDFCKAVMNYKDQGRDPLDTPNSCFTKTPIQAKRKHIESFVNKNILKLDPDKVQGKTPIGKTDTTKNSKSPSGAIVKMAEDNLKAKKDLSKTHPRVGGRPRSVDVKSAKIIPFPNKPNTISTAKDLILEYLVKGDLSSRAIMDPIIDRAIRGVGNNESNLAGILKQLISTAVIIGDHGETVNDWISKSLIPLIKTLKENVGITDGTFNDIDPDDISDFKSLVNDFSNSDTTVNVLNISDGKIKEPVSSRRSRRNANADKLRKKFEARKAKYQSRILETDSNESTITTTSTSGHSSDEGYVSIKDRLKARKAKIAAMRKKYKVRGATVISKTLGGKDELTNRVEIKPVSLSGGSASGTPAPHEITDSAEERIARYNDYIYEASAKTGIDENLIRSVIRQESSGNPRAKSHAGAAGLMQLMPATAKELGVKNRLDPRQSIMGGTEYIRRQLKRFDGVPELALAAYNAGGGNVNKAIRKAGSKDPEAVLNTLPQVTGRHSKETQEYVVKITNDYRKRLGLAGESNYTSKPKPKASTQLASVSPAMTESVVEAKRSESRMPSQPTTTAVNTSSLSKSNDFTNDVERVVGINQEAKNKTKDMLVGRSDEIAQLNNQLVGINYDQLVELKVLNQQMGNIVKMMSPSEDNKTEYQERKETKDLYVAAEKTVEKPKTFQRRVVNGKPPISLDRKIV
Physico‐chemical
properties
protein length:2278 AA
molecular weight: 250016,87340 Da
isoelectric point:9,29894
aromaticity:0,05795
hydropathy:-0,52818

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Halocynthia phage JM-2012
[NCBI] 		1173297 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFI55358.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JQ340088.1 [NCBI]
CDS location
range 73093 -> 79929
strand -
CDS
ATGAGCGATGAAGAAGATATTAAGTTGGATGATAATGAATTGGATGATATGGACATGTCATTTGATAACCTCGATATGGAGGCTGAAGAACAGCCTAGTAATCGAGACCCCGTTACTCAACTAAAAACAAATTTCTTTAAAGGCGCAGTTACTAAGGTATCTGATAAACATTACCTCGAACAAGAAATTAAAAAGGCTGTACCTAAAGGTTACAGTACTACATACGAGTCAGCTAAAAGCGGCTTAGATGCTGTTGATAAAGCTAAACGAAATCTAATCTCTCCTATTCGAAAAGAGTTACCTGAATTTAAACGTAATCTAAATAGACTTAGTCCTTTAGTTAAACGTATGGTAGGTGATAGATTTGGTAATAAGTTCGATGACCTAACTAAAGTTAAGAGTAATTCTCCTGACATCGACCCTGACCAATTAGAAATGCAGCAAGGTTTAGCTGGTATATTTGGTACATGGCGTGAGAGTCAACTGGGAGACCGTCAGCAAGATATGGCTGATAAGATGATGGATGCTAAGACAGAACAAGAACGCTTCCGTCTGTCACATACAACTCTTACATCAATTAGTAATTCTTTAAATAGAGTTAATGCTTTTAATGATGGTATCTTATTAAAAGTTCACGAACGTGCCCTAGAATTAGACTTTAAGAAATACCACATCTTAAAGAATTTATTAAAGGTTACAACTGAAGGTTATAATGCTAGTATTGGTGAATTAAAAGCCATTACTAAGAATACTGGTTTACCTGAAATAATCAAACGTCAAAACAGTGAAAACTTTAAACAGTTATTCCTAGACGAATGGCAAGGTAGAACTACTGCTAATATAGTAGACTTTGGTAAAGACTATTTTAGCAAGATGGCACAAAACATTCAAACTAGAGCATTAGAGGTTGGCCAGCAGGTCGCCGACGGTATGTCGTCTTTAGGAGATGCTGCTAGTGGTTTTGCTGACATGGATGAAATGCAGCAAGAGATGGGTGGTCCTCAACAGTCACTAAAAGAGATGGCTCTATCTAATGCTGGTTCAGCCGCTGGTGGTGCAGTCTCTAAGAAAGTGGTTGGTTTTGCAAGCGAACAACTAGAGAAGTATCTTAAAGCAAACCCAGATGCTAAAAGGGTTGATAAATTCTTACAGTACGCCAATATGAATAAGGCTCAATTGTTTGATAATTTAGTTACCGATAATACTGAGGCTGAAGGTTTACGAGGACTATTCTTTAGATTTATTGACTCAGTAAGACCTACCATCGATGCTGATAGAGAATCAATAACTCAGAGCTTAGCTGAAAAAGCTACTATGGAAGCTCAGTGGGATAGAATGTCCAGAGAGACATTGATTAAGATTATTCCTGAATGGTTAAGTAAAATACATCTAGTTCTTAAGCAGATGGCTTTTGGTCCTAAAGCTGAAAAAGAAACCTTCGATATATACAGCGAGAAGTTTGTTACTCAGTCCGAAGCGATGGCTAACTTACAGAAACGTCTAATTGATGATAACAGTATCGAAGATGTTAGAGATAACATAGATAAAGTTATTGCTGCTTTATTCGTTGGTAATGAAGATATTAAAGATAAGTTAACTCAAGAACAGATTGATGGTTTAGAAAATGCCATTATCCGTAGTGCTAATAACGATATCGGTACTGACTTAGATAAGTTTGGTCGTAAAGACCAGTATTCTACTATTCCAGGTATAACTGAAGGTGATGCTGAAGTACTAGCAGAAGCTCTAGGTAAAGTTCTTAATGTTGGCGCTGAAGGTAAGACTAAGTTTAAATTAGGTGACTTTAGTGATTCGGGTGGTGAAGCAACACATCGGTTAAATGTACTTAGTAGATTTAAAGGATTAAAAGATGCTAATCCAGAAACCCAATCTATATTTAACTTACTCAATGCTACAGGTAATAACGAATTACTTGAGGGACTGGGTTACGGTACTAGAGATAAAGATGGTCGTTTAGGTTTAAACTTTGGTAATCTTTACAATCGTAAATTAGGTAAGTTTGATAATACTAAGACTAACGTTGATGTAGAAGACTTATCTGTTGTTAGAAACAACCTAATGAATGAACGTTCTGAATTGGCTAATAATATTAGTAATAATTTCAACGTTGATACTTCTGATATTAATTTAAGATTAGAGAGTATAGATAAAGCAGTAAGTCGTATCGATGCTATATTAGCTCAAGATACAGGAGTTAATGTAACTTTATCTAAATCTTCATTAGATGTTATCCATGAAGCTATAGCTATTAATAAACCTAAGGTTACTGCTAACGGTGAAATGTCTTCTGAACATACTGATGCGGCGGTACTTAGTGAGTTACAAATAGCCAATTCTACTCTTAATGATGTTCGTGGTGTTCTTGCTGAAATGTATGCGGCTCAACAAGCCAACCATAATGAAACTATGGGGAATAGTTCCCTTGGTAAGTTCGTTGGTAATATGGGAGTTAAATTCAGTAAAATACTTAGTGGTCCATTTAAATTAGCAAGTAAGGCTTTTGGTAAAGCTCGTAGTCTAGTTAAAGGTTCATTTGATAAAGCTAAGAAGTTAGCTATGATGCCTATGAAGTTAGTTGGTGGTATAGCATCTGAAATCCGTAATCAGTTTAAGAAACCGGATGATGTTTATCTTATCGGTGGAAGTGAACCTGTCCTATACGGTAAAGATATAGCTAGAGGTATCTACTTCAATAGAGACCTACCTAAGTCACCGTACGCTACTCAGGGTAAGCTAGCTAAGACACCAATTAAATCTATTACAGATATTAAAGGTGAAGTCTTTAATAAAGAAACTGCTAATGTAGCTATCACTAGAGAAGAGTTTGATAAAGGCTTAGAAACTCGTAACCCCGGTATGGCTAAAAAGATTGGTGGTCTAATCGGTAAAGGTTTAGCTATACCCCTTAAACTAGCTGGTAATATCTACGGTTTAGGTAAGAGTGTATTTAAAACTGGTGGTAGATTATTAAGTCGCGGTAAGAACTATCTTACTAATAAGTTAAATTCAGCACAAAGCTTATTTACAGGTGACGGTAAACTACTCGTTACTAAAGAAGAGTTAGAGTCTGGTCTTTTATATGTAATGGAAAACGGTAAACGGGTAACTGTTACTAGTCTTAAAGATATAACGAGTACCGTTTATAGTTATAAGGATGGTGAACCTAGAATCACTATTGAGCAAATAAAAGAAGGTCTTAGAGATAAGTCTGGTAAGTTATTAAAGCTTAAAACTATAGCTGGTGAAGTGGGTAATAAATTACTATCTGGTGCTAAGTTACTTGGTAAGGTTGCCATGTCTCCATTTAAACTTATTGGTAAAACAACTAAGTCTTTAATGAAGATGTTCGAAGGTAAACTTATAAGTAGTTTATTGGTTCATGTTCCAGATAATGTTATCTTCAAAGCAAACGTAGTTAATCTATTCACTAATAAGGTAATTGATAAAGGTGAAGGTTCTCCTGACTACTTAACTACCTCGTCTAAAGTAAGCGACAGTTTAAAGGATTTAAAAGGTAAAGCTCAAGTTAAGGGTTCTGAAATTAAAGATAAGGCTACAGAAGCCACATCTAAGATGAAAGATAAACTTAATAAATACAAGGAAGATAATCAGGATAAATTAGATAAGTTACAATCTACCATGTCAGATATAAAAGATAAGGTTAAGGATAGTAAGACATCTGATATTGCTGGTGAGGTAGCAGCTACTCTTAAAGCAGACAAAGCTAGAGAGAAAGCATTAAGCGCTTGGGGTAAGATTAAGAAGTCACCTAGAGGAGACTCAGATGGTGATGGTTTACGAGATGGTGGTTGGAGAGAACAATTAAAAGATCGCGCTAAGGGAATATTACCTTCTAGTAAATCCAAAGATAAAGACGGTAAGGTCGATGCAGGTTCCAATAAGATTGTTAAAACCTTAATGATGTTGATTGGTCCTATAGTCGGTATCCTAGGTAAGATTGCCAATATGGACATTCTTGGCGGTTTAGGTAAGGCTGCTCGTGGTTTAGGTTTAGGTAGACTATTAGGCGATGTTGTCTCTGGTATGCCTGATATAGACAGGAATAAACCATCTAAAGCCGGAAGAATGAGAGGTAAAGGTAAACTTGTAGGACGTGCTCTAGGTGCTATGAAATCTGGAGGCGGTACTGTTCTTAATGGAACTAAGAATCTAGTTGGTAAAGCCTTTACTAAAGTAGGTGGTAAGAAAGTAGTTGGTGCAGTCGCTAAGTTTGGTGCTAAGAAGTTAGCGGGTGCCGCTGTCGCTGCTGGAGCTGCTGCTGCTGGATTAGCAGTTATTGCCCCTATAATCGGTATAGGTTTAGCTGTATGGACTGCTTACGAAATTGGTAGCGGACTATGGGGTTACTTTAGTAGACGTTCTAGTATTAAGAAAATCGAATACCTACGTATGATGCAGTATGGTTATTATGTTGGTGAAGATGGTGATTACGAAGATAGAAAGGTTGCATTGCGTTATTTCGAAAATGAAATGATGGATAGAATGGAACCCAAAGATGGTATCGTTGGTATTAAAGGTACAACTGAAGAACTCTGGGAAGAGTACTCTGGTGACTTTGATAGTTCTTATGGTGACTCGGCTGCAAGAGCCGAATGGGTTAAGTGGTTTGATTACCGCTTTAAACCAGTTCTATTTAAATGGATAAGTGTTGTTGCTTCTTTAAATGAAAGTAAAGATGGAGAACATTCTTTATCTTCATTAGATGAAAGTCTTAAGAAGGAACAGTATCCTGATTTTTGTAAAGCAGTTATGAATTACAAAGACCAAGGTAGAGACCCATTAGATACGCCTAATAGTTGTTTCACAAAAACACCTATACAGGCCAAACGTAAACATATAGAATCTTTTGTAAATAAAAACATTCTTAAACTAGACCCAGATAAAGTTCAAGGTAAGACTCCGATAGGTAAAACGGATACTACTAAGAACTCTAAGTCTCCAAGTGGAGCCATTGTTAA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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.