Protein

Genbank accession
AFI55291.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein TSMG0008 [Halocynthia phage JM-2012]
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 1,00
Protein sequence
MSETISDSTNALNLYIDSIELENFLGFSKPRIRNLKASFDKKLQILNSTNGCGKTTFISELNIFPIEKSLFDVGGYKIVRFRFNEVKYKFVSDHKRNYLYNEDTGENLNDGGTITQQLAIVKQLFGLTPFLWDAAMGNITFTDSDKNVRRTWIETISGIDFDYPFQTYKKITSELNSLKGAAKHINIQLTTEASKLLREEEVLELVSHKDKYSKLVKELLLSRDTSISKEEANRLISNIRNLEQKCKDTQLSYNRLSRFINPFSDVSSLESLRDYHVAVKSEIQSVTDKVDSLVTRLEDKTSLLRKLDTGKGIDITKVDKEISYFTDIQNDARRYIAQASNKDLIKYLTSSELALSLSASIGMLPRQLSNHLISDKDYNTDSLVLPYDSEKYKALSVTLKEKMDLQMRLEYQSTQMNRELSELDDKHIVECPECSTSFSPNKVSCDTLVSKIDSITKQLNKLEEEIKHLTYDIESYDSVIARRKYVEDYINAELNEDCIWYRSFIHNYVNEIADINEITKQLDKDGRTAYQLEVGLTSKEELAKLNALKKEHDIVKGFGDVGELDKEVKALEEEIASLRGIRKEKEDLLITITDTGSLYKKHVSLLTELKDNLTSLGELRERHIKVMSNVALEAIEGDLQVQLANVTKKVNDNEILVNLISSLQGMLDNTKERIERFKVLEMAFSPSTGLIAEQLIGYVDAFAKQLSLVIAKLWGYPLTILPCSIEGKKGMDYKFPFTVGGKPIPDVSKGSKSQVSVINLAVMLCTRISLGLNGLPLFLDEVGGGFDTVHNQKLASFIRELLANYGCSNVFLVHHDAAVRNSLGPRDTIVFDATQVIVEPNYNAHVKLTYFKEKKIEDIVH
Physico‐chemical
properties
protein length:861 AA
molecular weight: 97656,23580 Da
isoelectric point:5,71695
aromaticity:0,07666
hydropathy:-0,33031

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Halocynthia phage JM-2012
[NCBI] 		1173297 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFI55291.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JQ340088.1 [NCBI]
CDS location
range 4575 -> 7160
strand +
CDS
ATGTCAGAGACTATCAGTGATAGTACTAATGCTCTCAATCTATACATAGATTCGATTGAGCTTGAAAACTTCTTAGGATTTAGTAAACCTAGAATTAGAAACTTAAAGGCTTCATTTGATAAGAAGCTACAAATCCTAAACAGTACAAATGGTTGTGGTAAAACAACATTTATTAGCGAATTAAATATCTTCCCTATTGAAAAGAGTTTATTTGATGTAGGTGGGTACAAGATTGTAAGATTTAGATTTAATGAAGTTAAGTACAAGTTTGTAAGTGACCATAAGCGTAATTATTTATATAACGAAGATACAGGCGAGAACTTAAATGATGGTGGTACTATAACTCAGCAGTTAGCTATAGTTAAACAATTATTTGGTCTGACTCCTTTCTTATGGGATGCTGCAATGGGTAATATTACATTTACCGATTCGGATAAGAATGTACGTCGTACTTGGATTGAAACTATCAGCGGTATAGACTTCGATTATCCATTTCAAACTTACAAGAAAATTACCTCAGAGTTAAACAGTTTAAAAGGTGCAGCTAAACATATAAACATTCAGCTCACTACAGAAGCTAGCAAATTACTTAGAGAAGAAGAAGTATTAGAATTAGTAAGTCATAAAGATAAGTATAGTAAGTTAGTTAAGGAACTTCTACTTAGCCGTGACACTTCTATAAGTAAAGAAGAAGCTAATCGTCTTATAAGTAACATACGTAACTTAGAACAAAAGTGTAAAGATACACAACTTAGCTACAATAGACTCTCACGCTTTATTAATCCTTTTAGCGATGTATCTAGCTTAGAATCATTACGTGACTACCATGTAGCTGTTAAGAGCGAAATACAGTCTGTTACTGATAAAGTTGATAGTTTAGTTACTAGGCTAGAAGATAAAACTAGTCTATTACGTAAACTAGATACAGGTAAAGGTATAGATATAACTAAAGTAGATAAGGAGATAAGCTACTTTACTGATATTCAAAATGATGCTAGACGTTATATAGCTCAAGCTTCTAATAAAGATTTAATTAAATACTTAACTAGTTCTGAATTAGCTCTTAGTTTATCAGCATCTATTGGTATGTTACCACGACAGTTATCTAATCATCTTATATCGGATAAAGACTACAACACAGATTCTCTTGTTCTACCTTACGACTCAGAGAAGTATAAAGCTCTCTCAGTAACTCTTAAGGAGAAGATGGACTTACAGATGCGTTTAGAGTATCAGTCCACTCAGATGAATAGGGAGCTTTCTGAACTTGATGATAAGCATATAGTAGAATGTCCTGAATGTTCTACTTCATTCTCTCCTAATAAAGTAAGTTGTGATACTCTAGTCAGTAAGATAGATTCTATCACCAAACAACTTAATAAGTTAGAAGAAGAAATAAAACATTTAACGTACGATATTGAATCATACGACTCAGTAATAGCTAGACGTAAGTATGTTGAAGATTATATTAACGCAGAACTTAATGAAGACTGTATTTGGTATAGGTCTTTTATACATAACTACGTTAACGAAATAGCAGATATAAACGAAATAACTAAACAGTTAGATAAAGATGGTCGTACTGCTTATCAATTAGAAGTTGGTCTAACTAGTAAAGAAGAACTAGCTAAACTTAATGCCTTAAAGAAAGAACATGATATTGTTAAGGGGTTTGGTGATGTTGGTGAGTTAGATAAAGAAGTTAAAGCTTTAGAAGAAGAGATTGCGTCTCTTAGGGGAATACGTAAAGAAAAAGAAGACTTACTTATTACCATTACTGATACTGGTTCTTTATATAAGAAACATGTTAGTTTATTAACGGAGCTGAAAGACAACCTAACGTCTCTTGGTGAACTTAGGGAACGTCATATCAAAGTAATGTCTAATGTAGCTCTAGAAGCTATTGAGGGCGATTTACAAGTACAGTTAGCTAATGTAACTAAGAAAGTTAATGATAATGAGATTCTTGTTAATCTTATAAGTAGTTTACAGGGGATGTTGGATAATACTAAAGAACGTATTGAACGTTTTAAAGTATTAGAAATGGCGTTTAGTCCATCTACTGGTTTAATTGCAGAACAGTTGATTGGCTACGTTGATGCCTTTGCTAAACAATTAAGTCTAGTTATAGCTAAGTTATGGGGTTATCCACTAACTATCCTACCTTGTTCTATTGAAGGTAAGAAAGGAATGGACTATAAGTTCCCTTTCACGGTTGGTGGTAAACCTATACCTGATGTATCTAAAGGTAGTAAGTCTCAAGTATCAGTTATTAATTTAGCTGTTATGTTATGTACTAGAATTAGTTTAGGTTTAAATGGTTTACCTTTATTCCTAGATGAAGTAGGTGGTGGTTTTGATACAGTACACAATCAAAAACTAGCTAGCTTTATAAGAGAACTATTAGCTAACTATGGATGTAGTAATGTATTCTTAGTTCATCATGATGCGGCTGTACGTAACTCACTTGGTCCAAGGGATACTATTGTATTCGATGCTACACAGGTAATAGTCGAACCTAATTATAATGCTCATGTTAAATTAACATATTTTAAGGAGAAGAAAATTGAAGATATTGTACATTGA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.