Protein

Genbank accession
WJZ48194.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge initiator
RBP type
TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,4224

Protein sequence
MQEKIPHKVKISQIVESQIPEYFLENNPNFEEFLRQYYISQEYQGSPIDILENINFYTNIEAFTHTNLTESTTLAADVTFYDTTISVTSTAGWPKTYGLLKINDEIITYTGITSTSFVGCIRGFCGVDSLNEVNNPDEFVFLDTVSSDHNQGDVVENLSNLFLKKFFEDFRYQYTPGFENVGINTEINVSNLTQYAKDFYKSKGTDSSFRILFDILFGVDISITKPATQLFTPSDGQWVENRFLIVEDLTGDIRKISKGITLKQNPKNGNNGAEGIVYFFTDVPRSINGKFYSRLGFDLETLSGTFTNTAVTKAVLESPVNSTSITVDSTVGFSDSGKLYIKTSKGLESFTYSSKTTNQFIGCIGLGSTTSLGESLKYGEEIYDDNLLYGTIEDKTKYFAVSNIVSDIKNPNTRYLSPEDKINIKSFGYINSVDPIFTTWIYNIANKYEVTSYNILSSNQCEFILGNYINLYKKDQVIVNVQTPGTTEIETIEGSVTSISNGVIVNLDTSELSGISTSNIFLRKKVKKASSSIYSGVDAYVTEVQNTYFDGNDVYVASSCLTDSPIETQDNSKIFQKTDIDSTTFTIYLPNHNYFSGELVTYETLGNVDIDNLENKRKYFIKKIDGDRISLCLNRSAVYKNSVIEITYSSSTSTLHKLTPSTLYGKNLTSQNLLKKFPVVPQPVIIQNEVPGVNGSIGLFLNGVEALDSKSPYNIYYGNIEEIEIKKSSNDINVIDPPVLVIEDENGSGIDAHLNISGSIKEVLIDNRGFRFLEDPKAKIIGGNGNGALLDARTTLYDQEYFLEFFATSVGINTTSDIISFEQKHNLVLGDSVLYSSNSQTSPGVLRSVGVGSTSVGIGTTLAENSQYFVGVVSERSIKLHYTNNDAVLGINTVDFTSHGSGIQKLVLNEPISVLADVRVVDPGSNYRNKKIKIDSNKYPPNDYLETSTIRTGVNTHEHYIFAKKHNFETGDLIEYSQIGSGTSIAGISSSVQYYVLKIDDDRFRLTESKISVATTSYSDGVGVTTSFVTLDTTQFLDQEKYIRISTVGVGTHIFKYPDIIAEISGMTAAGSTTLYQRVKCFGKAESIFIYDGGSLYGSEDIFNYEKQPNVWINSGSGAKINPILNDEGRLVDYVIKKGGSNYVGTPEVIVSGIGSGAVLKPTLQNGVITSLQIVDSGIGYSRGNTTITVVPVGAASSIAVSFRTKIKSWNVNSFELNKKQLTSSDDGVVLESPNQNYGNRYVNYTVSRDLREKLGDNIEKTDNGYLEAEAPIHSPILGWAYDGNPIYGPYGYSSSNSAFEVKRMESGYALVSRQNRPSTSAFPLGFFNDDYEFVNSGDLDECNGKFGITPEFPKGTYAYFCPISSLNGSGAYENSREPVYPYIIGSKFKNFVDTSNFKNSWDQNLLESKDTNLTKNLTPYDSNNYEFLDLTTSPKEEIFNIKSIVVSGNKVDAIKVITPGTNYKVNEFIKFDDINSGGSGCEAYVSSIVGKSITSVVGVNTFFYNVKFDYKGTTVTGITSVPHNLSTGDVIRINSVRSDDEIPENDTTDSAYFKQIIGSHYVSVPKITSGISTNVTSYSGVTGLTTFIELTAVNLGKSFKVNDVVGIKSESMLVLNIDESNNRLRVLRGYDPNNPDSPASSGIAFTTGDILEVKQTEFSFDLPTILFNKTILNKRSLFFDPGDSVGLGTTGIYVNYSVGIGSTSNQRRRFLKEQRIYLPNHGLATGDKLLYNPGAGIAVSVSNSINLNGVVSLASTVFVIEKGIDHIGLSTTRVGLAATGAGLYFVTAGSGRKHEFTTNFGESLIGDIQRTYATVSLGETHGLTENDEVTLNVIPNETITKIVKFDSINQNLIVGINTISSSGITTGSSGSSFTIVNHGLSNGSKIVYQSNSPALPLVNNREYYVIKVDEDKIRLSDTLFGSTNSYEFIGLTTTGSGIHTMSYINPKIDVVKGNILKFDVSDPSLSNYEFKFYKDKDFKNEFVGTGTYFEGFQFETTSFNSPGTSEAYVTLDTSVIEKGLYYSITLKDKTISPDVADFYPDTEVSNYSKIVLSNSKFNLTGLAFDTNVASSQFKIAILPQNNFETVSYSSTNTSLLNYTTSSETAIGPIDKIDVSFGGVGYLRLPTIDSIGTEYGSGAQLSVESNKIGAINRYEVYKPTFEIPSDYTVKPILEFPISLQIKDNYRLDSIGIETGGRGYYDPPTLIALNKNKEEISGLVFETKLTAQSVSEVTIIQNRNDLSRDISIIPIDNGNGFIVELAEFNSGTDTATLTLDLNLTSEQIANQIKVGDEIFVEGIESSSGIATYNSSLNDYKNFSVVGVNSAAKTVSYLITGTDPGDFNEDKSNGFVILKNDLARFTPNYVLGDFTNGEIITITKPNGQKEDFICTSDNGWDGKVLKVRYLNQFSEFVIESGDSVFGNLSLQRGIIDIINTSTADAVVNSSYVNSIGWEKDYGKLSVSNQKLSDNVYYQKMSYDIKTSLSPTEWKSTVDSLNHTSGFKSFGSVIIVSEPKV
Physico‐chemical
properties
protein length:2514 AA
molecular weight: 276052,40780 Da
isoelectric point:4,86845
aromaticity:0,10541
hydropathy:-0,22940

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage DSL-LC02
[NCBI]
3058947 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WJZ48194.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR032571.1 [NCBI]
CDS location
range 9801 -> 17345
strand -
CDS
ATGCAAGAAAAAATTCCGCATAAGGTTAAAATTAGTCAAATAGTAGAAAGTCAGATTCCAGAGTACTTTCTAGAAAATAATCCTAATTTTGAAGAATTTTTAAGGCAGTATTATATTTCTCAGGAATATCAAGGTTCTCCTATAGACATTCTTGAGAATATAAACTTCTATACAAATATTGAGGCATTTACTCATACAAATTTAACAGAGTCAACTACTCTTGCTGCAGACGTTACTTTTTATGATACAACGATCTCGGTTACTTCAACTGCAGGTTGGCCAAAAACTTATGGTTTGTTGAAAATAAACGATGAGATCATTACTTATACTGGAATCACTTCAACTTCTTTCGTTGGATGTATTAGAGGATTTTGTGGAGTTGATAGTCTCAATGAAGTTAATAATCCAGATGAATTTGTATTTTTAGATACAGTATCTTCAGATCACAATCAAGGGGATGTTGTAGAAAATCTCAGCAACTTATTTTTAAAAAAATTCTTTGAAGACTTTAGATATCAATACACTCCAGGATTTGAAAATGTAGGAATTAATACCGAAATTAATGTTTCAAACCTAACACAATACGCAAAAGATTTTTATAAGTCAAAAGGTACAGATAGTTCATTTAGAATTCTTTTTGATATTTTATTTGGGGTTGATATTTCTATTACGAAACCAGCAACTCAACTGTTTACACCTTCTGATGGGCAATGGGTAGAAAACAGATTCTTGATCGTTGAGGATTTAACTGGTGATATTCGCAAAATCAGTAAAGGAATCACATTAAAACAAAATCCCAAAAATGGGAACAATGGTGCAGAAGGAATTGTTTATTTCTTTACTGATGTTCCAAGATCAATTAATGGAAAATTTTACAGTAGATTAGGATTTGACTTAGAAACTTTATCTGGAACATTTACAAATACAGCTGTAACAAAAGCAGTTTTAGAATCTCCAGTAAATTCGACATCAATTACTGTTGACTCTACAGTAGGATTTTCTGATAGTGGAAAACTTTATATTAAAACTTCTAAAGGGTTAGAGAGTTTTACTTATTCATCAAAAACTACTAACCAATTTATAGGATGCATTGGTTTAGGATCTACAACATCACTTGGAGAATCTCTAAAATATGGAGAGGAAATCTATGATGATAATTTACTTTATGGTACAATAGAAGACAAAACAAAATATTTTGCAGTTTCAAATATAGTATCAGATATAAAAAATCCAAACACAAGATATTTAAGTCCAGAGGACAAAATAAATATCAAGTCTTTTGGATACATCAACTCTGTTGATCCAATTTTCACAACTTGGATATACAACATCGCTAACAAATATGAAGTAACTTCATACAATATTTTATCTTCAAATCAATGTGAGTTCATTCTTGGTAATTATATTAATCTTTATAAGAAAGATCAAGTTATTGTAAATGTTCAAACTCCAGGTACTACAGAAATCGAAACTATTGAGGGTAGTGTAACTTCTATTTCGAATGGAGTTATTGTAAATTTAGATACTTCAGAGTTAAGTGGAATTTCTACAAGTAATATCTTCTTAAGAAAAAAAGTTAAAAAAGCTTCTAGTTCAATTTATAGTGGCGTTGACGCATACGTTACTGAAGTACAAAATACTTATTTTGATGGAAATGATGTATACGTAGCATCTTCATGTCTTACAGATTCTCCAATTGAAACACAAGACAATTCAAAAATTTTCCAAAAAACGGATATTGATTCCACTACGTTTACAATTTATCTGCCAAACCACAACTACTTTAGTGGAGAATTAGTAACATATGAGACTTTAGGCAATGTTGATATTGATAATTTAGAAAACAAGAGAAAATATTTCATTAAAAAAATTGACGGTGATAGAATTTCTCTTTGTCTGAATCGTTCTGCTGTATATAAAAATTCTGTTATTGAGATAACTTATTCTTCTTCTACCAGCACATTACATAAGTTAACTCCATCAACTCTATATGGAAAGAATTTAACATCACAAAATTTACTTAAAAAGTTTCCAGTTGTTCCTCAACCAGTAATTATTCAAAATGAAGTACCTGGAGTCAATGGATCTATTGGACTATTTTTAAACGGAGTGGAAGCTCTTGATTCAAAATCTCCATATAATATTTACTATGGAAATATTGAAGAGATTGAAATCAAAAAATCTTCAAATGATATTAATGTCATTGATCCTCCCGTCTTAGTTATTGAAGATGAGAATGGATCTGGAATAGATGCTCATCTTAATATTTCTGGATCTATTAAAGAAGTTTTAATTGATAATAGAGGATTTAGATTTTTAGAAGATCCAAAAGCTAAGATTATTGGTGGTAATGGAAATGGAGCTTTATTAGATGCAAGAACGACTCTTTATGATCAAGAGTATTTCTTAGAATTTTTTGCCACTTCAGTTGGTATTAACACAACTTCTGATATTATCAGTTTTGAACAAAAACACAATTTAGTTCTTGGAGACTCGGTTTTATATTCTTCAAATTCTCAAACGTCTCCTGGAGTTCTTAGATCTGTGGGAGTAGGATCTACATCTGTTGGTATTGGCACTACTTTAGCTGAAAATAGTCAATATTTCGTTGGAGTTGTGAGCGAAAGATCTATTAAACTTCATTATACTAATAATGATGCTGTTTTGGGAATCAATACAGTAGATTTTACTTCTCACGGATCTGGAATTCAAAAGTTAGTTCTTAATGAACCAATTTCTGTCTTGGCAGATGTCAGAGTTGTTGATCCTGGATCAAACTATAGAAATAAAAAAATAAAAATTGATAGTAACAAATATCCACCAAATGACTATTTGGAAACAAGCACTATTAGAACAGGAGTTAACACTCACGAACATTATATTTTTGCCAAAAAACATAATTTTGAGACTGGAGATTTAATCGAATATTCTCAAATTGGATCAGGAACATCGATAGCTGGTATTTCTTCATCAGTTCAATATTACGTTTTAAAAATTGATGATGATAGATTTAGATTGACAGAATCTAAAATTTCTGTTGCAACAACATCATATTCTGATGGTGTTGGTGTTACAACTTCATTTGTAACTTTAGATACAACTCAATTTTTAGATCAGGAAAAATATATTAGAATATCAACCGTTGGTGTAGGAACGCACATTTTTAAATATCCAGATATCATTGCTGAAATATCTGGAATGACTGCGGCTGGTAGCACAACTTTATATCAAAGAGTAAAATGTTTTGGTAAAGCAGAAAGTATATTCATTTATGATGGAGGATCTTTATATGGATCTGAAGATATCTTTAATTATGAAAAACAACCTAATGTTTGGATAAATTCTGGATCTGGAGCTAAAATCAATCCAATCTTAAATGATGAAGGAAGATTAGTTGATTACGTCATCAAAAAAGGTGGATCAAACTATGTGGGAACTCCAGAAGTAATTGTATCGGGTATCGGATCTGGTGCTGTTTTAAAACCAACTTTACAGAATGGAGTGATTACATCTTTACAAATTGTAGACTCTGGAATTGGATATTCTAGAGGAAATACTACGATTACAGTGGTTCCTGTTGGAGCTGCTAGTTCCATAGCAGTATCCTTTAGAACAAAAATAAAATCGTGGAATGTAAATTCATTTGAATTAAACAAAAAACAACTTACATCTTCTGATGATGGAGTTGTTTTAGAATCCCCAAATCAAAATTATGGAAATAGGTATGTTAATTACACAGTATCTAGAGACTTAAGAGAAAAATTGGGCGATAACATTGAAAAAACTGATAATGGTTATCTGGAAGCTGAAGCACCTATTCACTCTCCAATTCTAGGTTGGGCGTATGATGGAAATCCAATTTATGGCCCATATGGATATTCATCCTCAAATAGTGCATTTGAAGTTAAAAGAATGGAATCTGGATATGCATTAGTTTCCAGACAAAACAGGCCGTCAACAAGTGCATTTCCACTTGGATTTTTCAATGATGATTATGAATTTGTAAACTCAGGAGATCTGGATGAGTGTAATGGTAAGTTTGGCATCACTCCAGAATTTCCAAAAGGGACTTATGCTTATTTTTGTCCGATATCGTCTCTCAATGGATCAGGAGCATACGAAAATAGTAGAGAGCCAGTTTATCCATACATTATAGGCAGCAAATTTAAAAATTTTGTTGATACAAGTAATTTTAAAAATTCTTGGGATCAAAACCTGTTAGAATCCAAAGATACTAATCTAACTAAAAATTTAACGCCCTACGATTCAAATAATTATGAGTTTTTAGATTTAACTACGTCACCTAAAGAAGAAATTTTTAATATTAAGAGTATAGTAGTTTCAGGAAATAAAGTTGACGCAATTAAAGTCATTACTCCAGGAACAAATTATAAAGTAAATGAATTTATAAAATTTGACGATATAAACAGTGGGGGAAGTGGGTGTGAGGCATACGTTTCTTCAATTGTGGGCAAATCAATAACTTCAGTAGTAGGAGTTAATACATTTTTCTATAATGTCAAGTTTGACTATAAAGGAACTACTGTTACTGGAATTACCTCTGTTCCGCATAATTTATCGACGGGAGATGTCATAAGAATAAATTCTGTTCGTTCTGATGACGAGATTCCAGAAAATGACACTACAGATTCCGCATACTTTAAACAAATTATAGGATCTCATTATGTTTCAGTACCAAAGATAACCTCAGGTATTTCAACTAACGTAACAAGTTATTCTGGTGTTACTGGATTAACAACATTCATCGAACTAACTGCCGTGAATTTGGGCAAGAGTTTCAAGGTTAATGATGTTGTGGGAATAAAATCAGAATCAATGTTGGTGTTGAATATTGATGAAAGTAATAATAGATTGAGAGTTTTGAGAGGTTATGATCCTAACAATCCAGATTCACCAGCTTCTTCAGGAATTGCATTTACGACTGGAGATATTCTTGAAGTTAAACAAACCGAGTTTAGTTTTGATCTACCAACGATTCT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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.