Protein
View in Explore- Genbank accession
- AND75519.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MTNIVGNIGFSFTGKLGITLRGTIIDDSTTPDTVYLPNIERLFNITAGVITSASFPETETQNVSCRIAIYTLDGSSNPVLPPIDEFDAIIPNQASVEFSVLRPTGVVNNQLDTSALRIAKLIANDPALAQKVAGAPYPRGAYDNAETYLYGEMVSYFGKNYISKSLSPITGILPTNTTNWYELVITLPPEVSVIATGSDTAYGTGWNGSLLVPTQNAVYDKIITVDAAIATANTNITALGTSKADLTYVNAELTSDQVILDALRTGKADLSYVNAQLNTKANLNAPVFTGNPTLTASPSVTDNDTSIATTEHVRNFGNSRLAFNAFRGGQQGVPALGYVTTTTQFNAFTTRSGWGDSFGSNRWTVGQTGVYLVSVTARFLSVGGTPPTYFDTLLFVGLSASGVENFLVRSQTNYASFGYSLAFTGILTFTVGQTVFLNYQINAVGGGGYSVFLEDARFNAIQLS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 464 AA molecular weight: 49402,68290 Da isoelectric point: 4,66798 aromaticity: 0,10345 hydropathy: 0,08039
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Nostoc phage N1 [NCBI] |
1775255 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Nostoc sp. [NCBI] |
1180 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AND75519.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU234532.1
[NCBI]
CDS location
range 25140 -> 26534
strand +
strand +
CDS
ATGACTAATATTGTAGGTAATATAGGATTCAGTTTTACTGGTAAATTAGGCATTACTTTGAGGGGTACTATTATCGATGATTCGACTACCCCAGACACGGTTTATTTACCAAATATTGAAAGGTTGTTCAACATAACAGCAGGTGTTATCACTTCCGCATCATTCCCCGAAACGGAGACACAGAATGTTAGTTGTAGAATAGCTATTTATACTCTTGATGGATCTAGTAACCCCGTTTTGCCACCTATAGATGAGTTTGACGCTATTATCCCCAACCAAGCTAGTGTTGAGTTTTCAGTATTAAGACCCACTGGTGTGGTTAACAACCAACTTGATACATCGGCTTTAAGAATTGCTAAACTCATTGCTAATGATCCAGCTTTAGCTCAGAAAGTAGCTGGTGCGCCATATCCACGGGGAGCATATGATAACGCTGAAACTTATTTATATGGTGAAATGGTTTCTTACTTCGGTAAGAATTATATCAGTAAATCATTATCACCAATCACGGGTATTTTGCCAACTAATACTACCAATTGGTATGAACTAGTAATCACATTACCGCCTGAAGTAAGTGTTATCGCTACAGGTTCAGACACCGCTTACGGAACAGGTTGGAACGGTTCGTTATTAGTACCAACACAAAACGCGGTATATGACAAGATAATTACTGTTGATGCTGCGATCGCAACCGCTAACACAAACATAACAGCTTTAGGAACTAGCAAAGCTGATTTAACTTATGTCAATGCTGAGTTAACATCTGATCAAGTTATTTTAGACGCTTTAAGGACTGGTAAAGCCGATTTAAGCTATGTTAACGCACAGTTAAACACCAAAGCTAATTTGAATGCACCTGTGTTTACTGGTAATCCAACTTTAACCGCTTCACCTTCTGTTACTGATAATGATACTTCAATAGCAACAACAGAACACGTACGTAATTTTGGAAACAGCAGATTAGCTTTTAATGCTTTTAGAGGTGGTCAACAAGGTGTACCTGCTTTAGGTTATGTCACAACGACTACACAGTTTAACGCTTTCACAACTAGAAGCGGATGGGGTGATAGCTTTGGTAGTAACAGATGGACTGTAGGTCAGACAGGAGTATATCTAGTTTCAGTGACCGCAAGATTTTTAAGTGTTGGCGGTACACCACCAACATATTTTGATACTTTATTGTTTGTGGGTTTATCAGCAAGTGGTGTAGAAAACTTTTTAGTTAGGTCACAAACTAATTATGCCAGTTTTGGGTATTCTTTGGCTTTCACAGGTATTTTAACTTTCACTGTCGGTCAGACAGTTTTTCTCAACTACCAAATCAATGCTGTTGGTGGCGGAGGATATTCAGTGTTTTTGGAAGATGCCCGTTTTAATGCTATTCAACTTAGTTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
3c890eaca8f543818bc392e0d1f7f43cdcd3fe9638aa9627d12305c54d80fbbe
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50