Protein

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Genbank accession
YP_009779504.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGATAWNTLRYERPVESNTNTPNSLVQRDADGSFSAGTITSTLIGNASTSTRLEQTRQIQLSNDVTATGNFDGSQNLNLSTALSLINTLPHYLEGGVSNTTRTFTEVTVDQKGRVVNARTPSQLNLTDYGLDGSATSDTTLAQPWNANLEAISDETGTGLYSKTAAGVVETRLITGAAGQIVITDGGGISGNPLVSLSIQANVVPGDYNTESLTSVSQAGSGGEPFGTETVNASKFSVDDKGRLTTVTNVPIATATEGSKYAAYAAGTTYVRYDIIEDSSRVYQAITGIAAGGGAPTHTDGSDAGGWRYLAAAAVEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIAAVGVDNTQLQNNRIGFADGNTVENFELDQELTATTGYRGFNYLNYLKVNDTSGNLLVGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDPDITLDGALNQTLDKTGDGNLTFQLSQNTATNRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDTIQISASEATGKVHVEDAKFQDNYIATTNATMNLDPGDDRAVTGLVRVWGNLQIDGTTTTINSTQLTVDDVTILLGGDTVPTTDDNLDRGIEFNYYDTEARLGFYGWDTNYSDLGGHAGGYRFLHAATNTNEVFTGTDSGIIAGNVKLTTGTNSTSNTTGDLVVAGGVGITQDVNIGGLLDVDSTLRVTSTSRFDDNVVLQGASKTLQLNNGSGTTKIEFQSTTGNGSLAGILDVTGNFNINTDKFNVVATSGNTSIAGTLGVTNIATFSNDIDANANMTLAGNLHMESTNDITVAKNVGTGVWEIQSSDYGSLRIDGGAYVAGSALVDGTLHVNGAIEVQDSATETESRLNWLRVRYRGRFGDTYQATPSYASHNTSTIRAHGGAGIERTLHVGGTGSGEGLFVGKRYSGDTVKFSVLGATGNTDIQGTFDVAGNSEFNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSVRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTFGVSGIVTLTNNTEQTLTGSYGADGSLRLTGGAAVQRNLAVGGAARVYGNTELTGTLDLNNSADISGALVTHDNVTITADNKTFAIQNASAANKFTVDTDNGNTDLRGTLDIGGDVTAESNLTVTGNLTINGTTTTVNSTVTTIDDPIITVGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDSSAKIGFFGYDRSANQFAFVVDATNSSEVLSGTDGNLRAGSLNLTGAGTALDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGAALVIPNTTKINNLNADLLDSMTTASAATATTVVARDSSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNALTADTLKTARNITVAGVVSGDAEFNGSGDITITTTYVDADITALAAMAGTGFVSRTAANTYAQRTLAVTASSGITLTNADGVSGNPTINVASTASNSANNLVLRDASGDFAAGTITAALVGNVTGQTSDISNHDTGDLSEGSNLYFTNERVDDRVNALIVAGTGVTKAYNDSAGTYTLTVTQADIDTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIELSGAGALSVTQADIDTDNVTEGSTNIFYTEARFNTSLATKDTDDVSEGSSNLYFTNTRADTRADLRVAAATGANLDLSSKSTTNLSEGTNQYYTEARVQDKLDNAFAQLSAMLNNLATSTTLTLNLSGDPTPGAAVTTSVTNGGGGGFTAGTAVATTGGTGTSLTVNTTVVGGVITAAAVNAGGSGFLVNETVTVTNANAGKVLSLNLASLAGGSNYVTGTALATTGGSGSASLTVDITASAGAITNVTINDGGTGYVVGETITIVQVGGTGGTVDVATVATDATLQLTDVTTMEVGATVTGATSGTTGVITALAASAITVDTVDGFFKVGEVVSANDVTTLTVQSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:1987 AA
molecular weight: 203392,39010 Da
isoelectric point:4,18610
aromaticity:0,05687
hydropathy:-0,12516

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
STR
4–202
SSF69349 DC_1607 DC_1607 DC_0029
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352 DC_1607 DC_0029
YP_009779504.1
1 1987
Architecture
ATT
STR
STR
RBD
ATT 4-43 | STR 44-202 | STR 345-1569 | RBD 1658-1987
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-RIM12 isolate W1_08_0910
[NCBI] 		2790660 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Brizovirus > Synechococcus virus SRIM12-08
Host Synechococcus
[NCBI] 		1129 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009779504.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_047717 [NCBI]
CDS location
range 89582 -> 95545
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATACAGTTAAGACGCGGTGGTGCTCAGGAATGGGCAAACGCAAATCCAACTCTTGCACAGGGTGAACTTGGAATTGAACTTGATACTGGTCGGTTCAAAATCGGTGATGGTGCAACGGCATGGAACACGCTGAGATATGAGCGTCCTGTAGAGTCCAACACTAATACTCCAAACAGTCTTGTACAGAGAGACGCAGACGGAAGTTTTTCTGCGGGTACTATTACATCAACTCTTATTGGTAATGCTTCAACATCAACTAGACTTGAACAGACTAGACAGATTCAGTTATCTAATGATGTAACAGCGACTGGTAACTTTGATGGTTCCCAAAACTTAAATCTAAGTACTGCTTTATCACTGATCAATACCCTTCCCCATTACTTGGAAGGTGGTGTAAGTAATACTACTAGAACTTTTACTGAGGTTACTGTTGACCAGAAGGGTAGAGTTGTAAATGCTAGAACTCCTTCTCAACTAAATCTTACTGATTATGGTCTTGATGGTTCTGCAACTAGTGACACAACTTTAGCACAACCTTGGAATGCAAACTTAGAAGCAATTTCAGACGAAACTGGTACTGGTTTATATTCAAAAACTGCAGCGGGTGTTGTTGAGACCAGACTTATTACTGGTGCTGCTGGTCAAATTGTTATCACTGACGGTGGTGGTATTAGTGGCAATCCTCTTGTCTCATTGTCGATTCAAGCAAACGTTGTTCCTGGAGACTATAATACAGAATCTCTCACTTCAGTATCTCAAGCTGGTAGTGGTGGAGAACCTTTTGGTACAGAGACTGTTAATGCTTCTAAGTTCTCTGTTGACGATAAAGGACGTTTAACAACCGTAACGAATGTACCTATTGCTACTGCTACCGAGGGTAGTAAGTATGCGGCATATGCAGCAGGTACAACATATGTTAGATATGATATCATTGAAGATAGTAGTAGAGTATATCAAGCAATTACAGGAATTGCTGCAGGTGGTGGCGCTCCAACTCATACTGATGGTTCAGATGCTGGTGGGTGGAGATATCTTGCTGCTGCAGCAGTAGAGCAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTTGATGTTGATGCCAACGGACATGTAACTATTGCTGCTGTTGGTGTAGATAATACACAACTCCAAAACAATCGTATTGGTTTCGCTGACGGTAATACCGTAGAAAATTTTGAACTGGATCAAGAACTTACTGCAACCACTGGATACCGAGGATTCAATTATCTTAACTATCTTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAATGTACGGTCGTACTTCTCTGACCCTGATATTACTCTCGACGGCGCTCTTAATCAGACATTGGATAAGACTGGGGATGGTAACCTTACCTTCCAGTTAAGTCAGAATACTGCTACAAATAGAAACTTTAACATTCTGACAACTAATGCTGGTTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACTGCTGAAGATACTATACAGATTAGTGCATCAGAAGCAACTGGTAAGGTCCATGTAGAGGATGCAAAATTCCAAGATAATTACATCGCCACAACCAATGCGACGATGAACCTCGACCCTGGTGATGACCGTGCAGTCACTGGTTTAGTTCGTGTCTGGGGTAACCTTCAGATTGATGGCACAACAACTACAATTAATTCCACACAATTGACTGTAGATGATGTCACCATTCTACTTGGTGGTGATACTGTTCCTACAACTGATGATAATCTGGATCGTGGTATTGAATTCAACTATTATGACACTGAAGCACGCTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACCAATTATTCTGATTTAGGTGGTCATGCAGGCGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCCACAAATACCAACGAAGTCTTTACGGGTACTGATTCTGGTATTATTGCAGGTAATGTAAAACTGACAACTGGTACTAACTCAACCTCTAATACAACTGGTGACCTTGTAGTTGCTGGTGGTGTTGGTATTACTCAGGATGTAAATATCGGCGGTCTTCTAGATGTTGATAGTACATTGCGTGTTACTAGCACCTCTCGTTTCGACGATAATGTAGTTCTGCAGGGTGCTTCTAAGACTTTACAACTGAATAATGGTAGTGGTACAACCAAGATTGAATTCCAATCTACAACTGGTAACGGTTCTCTTGCTGGTATTCTGGATGTAACTGGAAACTTCAATATTAATACTGATAAGTTTAATGTTGTTGCTACTTCTGGCAATACCTCCATTGCTGGCACATTGGGTGTTACAAACATTGCAACATTCTCTAACGACATTGATGCTAACGCCAACATGACATTGGCTGGTAACCTTCACATGGAGAGCACCAATGACATTACGGTTGCTAAGAATGTTGGCACTGGTGTTTGGGAGATTCAGTCTAGTGACTATGGATCTCTGAGAATTGATGGTGGTGCATACGTTGCAGGATCTGCTCTAGTTGATGGTACACTTCATGTTAACGGTGCTATTGAAGTTCAAGATAGTGCAACAGAGACTGAATCTAGACTGAACTGGTTGAGAGTTAGGTATAGAGGTCGTTTCGGTGACACTTATCAGGCAACTCCTTCCTATGCATCTCATAACACTTCCACCATCAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGAACTCTACATGTTGGTGGCACAGGATCTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACTCTGGTGATACAGTTAAGTTTAGCGTTTTAGGTGCAACTGGTAATACTGACATTCAAGGCACATTCGATGTTGCTGGTAACTCCGAGTTCAATGGCACAGTTGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTAAGAAATGGCACAACGGATAAATTCTTTGTTGATAATGTAACTGGCAACACCGATATCCAAGGCACTCTGGATGTCAATGGTGCAACTGAGATTACAAATACTCTGGATGTTAGCAACGCTGTTACATTCGACCAGACACTGTTAGTCCAAGGCAACTCTGAGTTTAACGGTACTGTTGATGTTGATGCTAACTTCGCTGTAAGAAGTGGTAGCACGGATAAGATGACCGTTGCTTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACCATTAACGATTCACTGATTGTTGATGCTGCTAATGAAGTCTTCTCTGTCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCTGATAACGGTAATACAAATATCATCGGCACACTGACCGTTGGTGATGCAACTCAGATTAATGACACCTTCGGTGTATCTGGTATTGTCACACTTACTAATAACACTGAGCAAACCCTGACAGGTAGTTATGGTGCTGATGGTTCTCTAAGACTTACTGGTGGTGCTGCTGTCCAAAGAAACCTCGCTGTTGGTGGTGCTGCAAGAGTCTACGGCAACACTGAACTGACTGGTACTCTCGACCTTAACAATAGTGCAGACATCTCTGGTGCTTTAGTAACACATGATAATGTTACGATTACTGCAGACAATAAGACATTTGCAATTCAGAATGCATCTGCTGCTAATAAATTTACGGTAGATACCGATAATGGAAACACTGATCTTCGTGGCACCTTAGACATCGGTGGTGATGTAACTGCTGAGTCCAATCTTACTGTTACTGGAAATCTTACTATCAATGGAACGACAACTACTGTCAACTCTACGGTCACAACTATCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCAGCGTCTAACGACGGTAAGGATCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACAGCTCTGCGAAAATTGGTTTCTTCGGATACGATAGATCCGCCAACCAATTCGCATTCGTAGTAGACGCAACTAATTCATCAGAAGTTCTTTCTGGTACTGACGGTAACCTTCGTGCTGGTAGTCTTAATCTTACTGGTGCTGGCACTGCACTCGATGTTGATGCAAATGCAAATATTGATGGCACTCTGACTGTAGATGGTCAAATCATCTCTCAGGTTTCTTCTGGTGCTGCTCTGGTCATTCCTAACACAACCAAGATTAACAACCTCAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTGCAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGTAGGTGCCGCTGCTGGTATTCAAGGTAATGCTCTTACTGCAGATACACTTAAAACGGCAAGAAACATCACAGTTGCTGGTGTTGTTTCTGGAGATGCTGAGTTTAATGGTTCTGGTGATATTACAATCACCACAACATATGTTGATGCAGACATCACTGCACTTGCTGCAATGGCAGGAACTGGTTTTGTTTCCAGAACTGCTGCCAATACATATGCTCAACGCACACTCGCTGTCACAGCATCTTCTGGTATTACACTGACAAATGCTGATGGTGTTTCTGGCAATCCAACCATTAATGTCGCTTCTACAGCAAGTAACTCAGCAAACAACCTCGTCCTTCGTGATGCATCTGGTGACTTTGCTGCTGGGACTATTACTGCAGCATTAGTTGGTAATGTTACTGGTCAAACATCTGATATTAGTAATCACGATACTGGAGACCTTTCTGAGGGATCCAATCTATACTTTACTAATGAGCGTGTTGATGACAGAGTTAATGCTCTGATTGTTGCGGGTACAGGTGTCACTAAGGCATATAACGATTCTGCAGGCACCTATACGCTTACTGTAACGCAGGCAGACATCGATACCGACAATGTAACCGAAGGTTCCACAAACCTCTTTACAACCGCTGCTAGGACCCGTACACACTTCACATATGGTACAGGTATTGAACTTAGCGGTGCAGGTGCTCTGAGTGTCACTCAGGCAGACATTGATACTGATAATGTAACTGAAGGTTCTACTAATATCTTCTA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
abfacb736c977c5cb53f9ba1ce1efb2c1d36475982d5320b15d9c012865f584f
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5119
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50