Protein
- UniProt accession
- A0A127KLC1 [UniProt]
- Protein name
- Major tropism determinant N-terminal domain-containing protein
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,9324
- Protein sequence
-
MANRIQLRRGSATQWSNANPTLAQGELGIELDTGRIKIGDGVTAWNSLRYERPIESVSATANTLVQRDADGNFSAGTITASIIGNASTASRLSSTRQIQLAQDVTGSGVFDGSANLTINTVLGLVSSLPHYDGTDTSSGTYTKVVVDAKGRITNASNPTTIQDYGLNGTVVGQSAQPYDNDLTSITNLADGAAGFGLMARTSTGNITVRDIVSASNLRILVDNGDGIGGNPAIDLANTTVVPDPTTYSQGLYNTESLTSVTATGANGEPVGTETVNTVKFTVDKYGRLQSATNVPIATATEGSKYATYSAGVAYSRYDIIEEGGNVYQAIQDILAGAGAPAHTDSSDTGGWRFLAAAATEQKGLASFAQEDFDVDNNGHVTIAAQGVDNTQLQNNRISFADGNTKEDFELDQELTGTSGYRGFNYLNYVKVNDTSGNLLVGANNTGDGGAGELDINVRSYFSDPDITLDGVVAQTLDKTGDGDLTLQLTQNTASNRNFNILTTNAGSGTSNIIVTAEDTVQISASQAAGKVWVEDARFQDNYIATTNATLNLDPGDDRAVTGTVRVWGDLQVDGTTTTVNSTTLQVDDPIVTLGGDTAPVANDNLDRGIEFRYYDSAAKLGFYGYDASYSDLAGHTGGYRFLYDATNTSEVFSGTDAGIIAGNLKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGVGITQDVNIGGLVDIDSTLRVHSTSRFDDNMVIQGASKTLQLNNGTGTTRIELQSTTGNADFYGIVNITNDLNVNTNKFNVASATGNTLIAGTLGVTGQTTLTSALDLNNTLNVSGFTYLENTDEPQIALNSGTGLYEIQNSDYGAFRFDGGGYIEGDFMFNSDVYVNGTVVQKEDETATFNRQNYLLVRYIMYTGSSAAYTPSYASDTTTNLRVFGGAGIGTDLHIGDDLYIGKFNSGDTVEFQVLGESGNTTIGRSGAGTNSVGTLTVHGDVTFNRDLFANGNITLGNATSDTLTVQANSEFNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLTVASTSEFNNTVDVDANFAVRTAAGVDKFTVASASGNVATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSIRNGSAVEKFGVDADNGNTSIIGTLTVGDATQINDTFGASGIVTLTNNTEQTLTGLYGADGGLRVTGGVGIQRNLAVGGSMRVYGDFEISGATTQSGNTGFSGRVSITNTSDATSFDDNSVALTVDGGFRASLNAWVGGDFHVWDDANSRDAFVVDVSTGDATLHNTLTVGGNLIVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTAPTSNDGKDRGVEFRYYDGSAKVGFFGFDRSSSQFAFLTDSTNASEVHTGTDAALRAGSLNLTGTGTILDVDANANIDGTLTVDGQIISQVTSGPALVIPNTTKINNLNADLLDGYTTATANTASTVVVRDASGDFAANQITVNNGIGALAGIQGNATTADALRTARTITIDGVVDGSVSFDGSANVTISTVYNDADITALAAMAGTGFVSRTAANTYAQRTLQVTASSGITLTNADGVAGNPTINVASASTNSANNLVIRDASGDFAANVITADLTGNVTGNVTGNVTGDLTGQADGADRVVTQEVTTDFDYPIVFASARYTTPTNTLIYTEASGGAAATYNPSTKTLEVETIKCDTISPRDPGAIQFNINANSVTATIGFTGDLTGNVDGNVSGEVTLEGAAPASATATGTAGDIRYDAEFIYICVATNTWKRAAISTWS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1733 AA molecular weight: 179555,81490 Da isoelectric point: 4,14057 aromaticity: 0,06982 hydropathy: -0,15915
Domains
Domains [InterPro]
IPR041352
5–43
5–43
1
1733
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Cyanophage S-RIM50 [NCBI] |
687803 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AMO42883.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU594605
[NCBI]
CDS location
range 88337 -> 93538
strand +
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAGTTAAGACGTGGTTCGGCTACGCAGTGGAGTAACGCAAACCCTACTCTAGCCCAAGGTGAACTCGGAATCGAACTTGATACTGGTCGTATCAAAATCGGGGATGGTGTTACTGCATGGAACTCACTTAGGTATGAACGACCTATTGAGTCTGTGTCGGCAACTGCAAACACATTGGTTCAGCGTGATGCTGACGGTAATTTCTCTGCAGGAACGATTACCGCATCTATTATTGGTAATGCTTCTACAGCATCGAGATTATCTTCTACCAGACAAATTCAATTAGCGCAAGACGTTACTGGTTCTGGTGTTTTTGACGGTTCTGCCAACCTGACAATTAATACTGTTCTAGGATTAGTTTCTTCACTTCCTCACTATGATGGTACTGATACCTCTAGTGGTACATATACAAAGGTTGTAGTTGACGCTAAGGGTAGGATTACTAATGCTTCAAATCCAACAACTATTCAAGATTATGGTCTGAATGGAACTGTTGTAGGACAATCCGCTCAACCATATGATAATGACCTAACCTCAATCACCAATCTTGCTGATGGTGCTGCTGGTTTTGGTCTGATGGCTAGAACATCTACAGGTAATATTACTGTTAGAGATATTGTTTCTGCTTCAAACTTACGTATTCTCGTTGATAATGGGGATGGTATTGGCGGCAATCCTGCCATTGATTTAGCAAATACTACTGTTGTTCCAGACCCAACAACATATTCACAAGGTCTTTATAATACAGAGAGTCTTACATCTGTAACTGCAACTGGTGCAAACGGCGAACCCGTTGGTACTGAAACTGTAAACACCGTTAAATTCACTGTAGATAAGTACGGTCGCCTTCAATCCGCAACAAACGTGCCTATTGCTACCGCTACTGAGGGCAGCAAGTATGCTACATATAGTGCTGGGGTAGCTTATTCCCGATATGACATCATCGAAGAGGGTGGTAACGTCTATCAAGCCATTCAAGATATTCTTGCGGGCGCTGGTGCCCCAGCTCATACTGATAGCAGCGATACTGGAGGATGGAGGTTCCTCGCGGCTGCGGCAACAGAGCAGAAGGGATTGGCTTCCTTTGCACAGGAAGATTTCGACGTTGACAACAACGGGCACGTTACCATTGCCGCCCAAGGCGTAGACAATACTCAATTACAGAATAATAGAATTTCTTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAACTTGATCAGGAACTTACTGGAACCTCTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTACGTCAAAGTTAATGACACGAGTGGCAATCTACTTGTTGGCGCTAATAATACAGGGGACGGCGGAGCTGGGGAACTTGATATCAATGTACGCTCGTACTTCAGCGATCCTGATATCACTCTTGATGGTGTTGTTGCTCAAACCCTGGACAAAACTGGAGATGGTGACCTCACTCTTCAATTAACACAGAATACTGCTTCTAACAGAAACTTCAACATCCTGACAACAAATGCTGGTTCTGGAACTAGCAACATTATTGTCACTGCTGAAGATACTGTTCAAATTAGTGCATCCCAAGCAGCAGGTAAAGTTTGGGTAGAGGATGCACGTTTCCAAGATAATTATATTGCTACAACCAATGCAACTCTCAACCTTGATCCTGGTGATGATAGGGCGGTTACTGGAACCGTCAGAGTTTGGGGTGATTTACAGGTTGACGGCACCACGACGACGGTCAATTCGACGACCCTTCAGGTTGATGACCCCATTGTTACTCTTGGTGGTGATACTGCTCCTGTTGCTAACGATAATCTTGATAGAGGCATTGAGTTCAGATATTATGATAGTGCAGCAAAGCTTGGATTCTACGGTTACGATGCTTCGTATTCTGATCTCGCAGGTCATACAGGAGGATACAGATTCCTCTACGATGCTACAAACACTTCTGAAGTCTTCTCTGGAACAGATGCGGGCATCATCGCTGGTAACCTTAAACTAACTACCAACACTAACTCCACCTCCAATACTACTGGCGACCTTGTAGTTGCTGGTGGTGTTGGCATTACTCAAGATGTTAACATCGGTGGTCTGGTTGATATTGACAGCACTCTGCGCGTCCACAGCACCTCTCGCTTTGATGACAACATGGTCATCCAAGGTGCTTCTAAGACACTGCAACTGAATAATGGTACTGGCACAACTCGTATTGAGTTACAATCTACTACTGGTAATGCTGATTTCTATGGTATCGTCAATATTACCAATGACCTTAACGTCAACACTAATAAATTTAATGTTGCTTCTGCAACTGGTAACACTCTCATTGCAGGCACACTTGGAGTAACTGGTCAGACTACTTTAACTAGTGCTCTTGACCTCAATAACACTCTGAATGTTTCTGGATTTACATATCTGGAAAATACAGACGAACCTCAGATTGCTCTGAATTCTGGCACTGGTCTGTATGAGATTCAGAACAGTGACTATGGTGCATTCCGATTTGATGGTGGTGGATACATTGAAGGCGACTTCATGTTTAACTCCGATGTTTATGTCAACGGTACAGTAGTCCAGAAAGAAGACGAAACGGCAACATTTAACAGACAAAACTACTTGCTGGTTCGTTATATCATGTATACAGGTTCTTCTGCGGCATATACACCATCTTATGCATCAGATACTACTACTAATTTAAGAGTTTTTGGTGGTGCTGGTATTGGTACTGACCTTCATATTGGTGATGACCTTTATATTGGTAAGTTTAATAGTGGTGATACTGTTGAATTCCAAGTCCTCGGTGAAAGTGGCAACACTACAATCGGTCGCTCTGGTGCAGGCACTAACTCTGTAGGTACACTGACTGTCCATGGTGATGTAACATTCAACAGAGACCTGTTTGCTAATGGTAATATCACCCTTGGTAACGCAACTAGCGATACTCTGACTGTCCAAGCAAACTCCGAGTTTAATGGCACGGTTGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTTAGAAATGGCACAACCGACAAGTTCTTTGTTGACAACGTAACAGGCAACACTGATATTCAGGGTACACTTACTGTTGCTAGCACTTCCGAGTTCAATAATACTGTTGATGTTGACGCTAACTTTGCAGTTAGAACTGCTGCTGGTGTAGATAAGTTTACAGTTGCTTCTGCTTCTGGTAACGTTGCAACCGATGGTACTCTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACTATCAACGATTCTCTGATTGTTGATGCTGCTAACGAAGTCTTCTCCATTAGAAATGGTTCTGCTGTTGAGAAATTTGGTGTTGATGCAGATAACGGCAATACTAGCATCATTGGCACTCTGACCGTTGGTGATGCTACTCAGATTAATGACACCTTCGGTGCATCTGGTATCGTCACTCTCACCAACAACACAGAACAGACGCTTACGGGACTCTATGGTGCCGATGGAGGTCTGAGGGTCACTGGTGGTGTCGGAATCCAGAGGAACCTTGCTGTAGGCGGTTCTATGCGTGTCTACGGTGACTTTGAAATCTCTGGTGCAACTACTCAGTCTGGCAACACTGGATTCAGCGGTCGTGTCTCTATCACCAATACTTCTGACGCCACATCTTTTGATGATAACTCTGTTGCTCTTACTGTTGATGGTGGATTCAGAGCATCTCTTAATGCTTGGGTTGGCGGCGACTTCCATGTTTGGGATGATGCAAACTCCAGAGATGCATTCGTTGTTGATGTAAGCACTGGTGATGCAACCTTACACAATACTCTGACTGTTGGAGGAAACTTAATCGTCAATGGAACGACCACTACTGTTAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATCATTACTTTGGGTGGTGACACAGCACCAACGTCTAACGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAGTGGGCTTCTTCGGATTCGACAGGTCATCCTCCCAGTTCGCATTCCTGACAGATTCCACAAATGCGTCCGAAGTACACACTGGTACAGATGCTGCTCTTCGTGCTGGTAGTCTGAATCTGACTGGCACTGGCACCATTCTTGACGTTGATGCTAATGCCAACATCGATGGCACTCTGACTGTTGATGGTCAGATTATCTCTCAGGTTACATCTGGTCCTGCTCTGGTTATTCCTAACACTACTAAGATTAATAACCTGAATGCTGACTTGCTGGATGGTTATACAACTGCAACTGCTAATACTGCAAGTACGGTTGTTGTCAGAGATGCTTCGGGAGATTTTGCTGCCAATCAAATTACAGTTAACAATGGCATTGGTGCTCTTGCTGGTATTCAAGGTAACGCAACTACTGCCGATGCACTCAGAACCGCAAGAACAATCACAATCGATGGCGTTGTTGATGGTAGTGTCTCCTTTGATGGATCTGCAAACGTAACCATCAGCACTGTTTACAACGATGCAGACATCACTGCACTCGCTGCAATGGCAGGCACTGGTTTTGTTTCTAGGACTGCTGCTAATACCTATGCACAACGCACTCTGCAGGTTACAGCATCGTCTGGTATCACCCTAACCAATGCTGATGGTGTTGCAGGCAATCCAACGATTAACGTTGCGTCTGCAAGCACCAACTCGGCAAATAACCTGGTTATTCGTGATGCATCTGGTGATTTTGCTGCTAATGTAATTACTGCAGATTTGACTGGTAACGTAACTGGTAATGTCACTGGTAACGTAACTGGAGACTTGACTGGTCAGGCAGATGGTGCAGATAGAGTAGTTACTCAAGAGGTTACAACTGATTTTGATTACCCAATTGTTTTTGCATCGGCAAGATATACAACTCCAACTAATACTCTGATTTATACAGAGGCTTCGGGTGGTGCAGCTGCAACATATAATCCATCTACTAAAACTTTAGAAGTAGAAACAATTAAGTGTGATACAATTTCACCTAGGGATCCTGGAGCCATCCAATTCAATATTAATGCAAATAGTGT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Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.