Protein

UniProt accession
A0A127KLC1 [UniProt]
Protein name
Major tropism determinant N-terminal domain-containing protein
RBP type
TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,9324

Protein sequence
MANRIQLRRGSATQWSNANPTLAQGELGIELDTGRIKIGDGVTAWNSLRYERPIESVSATANTLVQRDADGNFSAGTITASIIGNASTASRLSSTRQIQLAQDVTGSGVFDGSANLTINTVLGLVSSLPHYDGTDTSSGTYTKVVVDAKGRITNASNPTTIQDYGLNGTVVGQSAQPYDNDLTSITNLADGAAGFGLMARTSTGNITVRDIVSASNLRILVDNGDGIGGNPAIDLANTTVVPDPTTYSQGLYNTESLTSVTATGANGEPVGTETVNTVKFTVDKYGRLQSATNVPIATATEGSKYATYSAGVAYSRYDIIEEGGNVYQAIQDILAGAGAPAHTDSSDTGGWRFLAAAATEQKGLASFAQEDFDVDNNGHVTIAAQGVDNTQLQNNRISFADGNTKEDFELDQELTGTSGYRGFNYLNYVKVNDTSGNLLVGANNTGDGGAGELDINVRSYFSDPDITLDGVVAQTLDKTGDGDLTLQLTQNTASNRNFNILTTNAGSGTSNIIVTAEDTVQISASQAAGKVWVEDARFQDNYIATTNATLNLDPGDDRAVTGTVRVWGDLQVDGTTTTVNSTTLQVDDPIVTLGGDTAPVANDNLDRGIEFRYYDSAAKLGFYGYDASYSDLAGHTGGYRFLYDATNTSEVFSGTDAGIIAGNLKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGVGITQDVNIGGLVDIDSTLRVHSTSRFDDNMVIQGASKTLQLNNGTGTTRIELQSTTGNADFYGIVNITNDLNVNTNKFNVASATGNTLIAGTLGVTGQTTLTSALDLNNTLNVSGFTYLENTDEPQIALNSGTGLYEIQNSDYGAFRFDGGGYIEGDFMFNSDVYVNGTVVQKEDETATFNRQNYLLVRYIMYTGSSAAYTPSYASDTTTNLRVFGGAGIGTDLHIGDDLYIGKFNSGDTVEFQVLGESGNTTIGRSGAGTNSVGTLTVHGDVTFNRDLFANGNITLGNATSDTLTVQANSEFNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLTVASTSEFNNTVDVDANFAVRTAAGVDKFTVASASGNVATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSIRNGSAVEKFGVDADNGNTSIIGTLTVGDATQINDTFGASGIVTLTNNTEQTLTGLYGADGGLRVTGGVGIQRNLAVGGSMRVYGDFEISGATTQSGNTGFSGRVSITNTSDATSFDDNSVALTVDGGFRASLNAWVGGDFHVWDDANSRDAFVVDVSTGDATLHNTLTVGGNLIVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTAPTSNDGKDRGVEFRYYDGSAKVGFFGFDRSSSQFAFLTDSTNASEVHTGTDAALRAGSLNLTGTGTILDVDANANIDGTLTVDGQIISQVTSGPALVIPNTTKINNLNADLLDGYTTATANTASTVVVRDASGDFAANQITVNNGIGALAGIQGNATTADALRTARTITIDGVVDGSVSFDGSANVTISTVYNDADITALAAMAGTGFVSRTAANTYAQRTLQVTASSGITLTNADGVAGNPTINVASASTNSANNLVIRDASGDFAANVITADLTGNVTGNVTGNVTGDLTGQADGADRVVTQEVTTDFDYPIVFASARYTTPTNTLIYTEASGGAAATYNPSTKTLEVETIKCDTISPRDPGAIQFNINANSVTATIGFTGDLTGNVDGNVSGEVTLEGAAPASATATGTAGDIRYDAEFIYICVATNTWKRAAISTWS
Physico‐chemical
properties
protein length:1733 AA
molecular weight: 179555,81490 Da
isoelectric point:4,14057
aromaticity:0,06982
hydropathy:-0,15915

Domains

Domains [InterPro]
A0A127KLC1
1 1733
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-RIM50
[NCBI]
687803 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AMO42883.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU594605 [NCBI]
CDS location
range 88337 -> 93538
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAGTTAAGACGTGGTTCGGCTACGCAGTGGAGTAACGCAAACCCTACTCTAGCCCAAGGTGAACTCGGAATCGAACTTGATACTGGTCGTATCAAAATCGGGGATGGTGTTACTGCATGGAACTCACTTAGGTATGAACGACCTATTGAGTCTGTGTCGGCAACTGCAAACACATTGGTTCAGCGTGATGCTGACGGTAATTTCTCTGCAGGAACGATTACCGCATCTATTATTGGTAATGCTTCTACAGCATCGAGATTATCTTCTACCAGACAAATTCAATTAGCGCAAGACGTTACTGGTTCTGGTGTTTTTGACGGTTCTGCCAACCTGACAATTAATACTGTTCTAGGATTAGTTTCTTCACTTCCTCACTATGATGGTACTGATACCTCTAGTGGTACATATACAAAGGTTGTAGTTGACGCTAAGGGTAGGATTACTAATGCTTCAAATCCAACAACTATTCAAGATTATGGTCTGAATGGAACTGTTGTAGGACAATCCGCTCAACCATATGATAATGACCTAACCTCAATCACCAATCTTGCTGATGGTGCTGCTGGTTTTGGTCTGATGGCTAGAACATCTACAGGTAATATTACTGTTAGAGATATTGTTTCTGCTTCAAACTTACGTATTCTCGTTGATAATGGGGATGGTATTGGCGGCAATCCTGCCATTGATTTAGCAAATACTACTGTTGTTCCAGACCCAACAACATATTCACAAGGTCTTTATAATACAGAGAGTCTTACATCTGTAACTGCAACTGGTGCAAACGGCGAACCCGTTGGTACTGAAACTGTAAACACCGTTAAATTCACTGTAGATAAGTACGGTCGCCTTCAATCCGCAACAAACGTGCCTATTGCTACCGCTACTGAGGGCAGCAAGTATGCTACATATAGTGCTGGGGTAGCTTATTCCCGATATGACATCATCGAAGAGGGTGGTAACGTCTATCAAGCCATTCAAGATATTCTTGCGGGCGCTGGTGCCCCAGCTCATACTGATAGCAGCGATACTGGAGGATGGAGGTTCCTCGCGGCTGCGGCAACAGAGCAGAAGGGATTGGCTTCCTTTGCACAGGAAGATTTCGACGTTGACAACAACGGGCACGTTACCATTGCCGCCCAAGGCGTAGACAATACTCAATTACAGAATAATAGAATTTCTTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAACTTGATCAGGAACTTACTGGAACCTCTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTACGTCAAAGTTAATGACACGAGTGGCAATCTACTTGTTGGCGCTAATAATACAGGGGACGGCGGAGCTGGGGAACTTGATATCAATGTACGCTCGTACTTCAGCGATCCTGATATCACTCTTGATGGTGTTGTTGCTCAAACCCTGGACAAAACTGGAGATGGTGACCTCACTCTTCAATTAACACAGAATACTGCTTCTAACAGAAACTTCAACATCCTGACAACAAATGCTGGTTCTGGAACTAGCAACATTATTGTCACTGCTGAAGATACTGTTCAAATTAGTGCATCCCAAGCAGCAGGTAAAGTTTGGGTAGAGGATGCACGTTTCCAAGATAATTATATTGCTACAACCAATGCAACTCTCAACCTTGATCCTGGTGATGATAGGGCGGTTACTGGAACCGTCAGAGTTTGGGGTGATTTACAGGTTGACGGCACCACGACGACGGTCAATTCGACGACCCTTCAGGTTGATGACCCCATTGTTACTCTTGGTGGTGATACTGCTCCTGTTGCTAACGATAATCTTGATAGAGGCATTGAGTTCAGATATTATGATAGTGCAGCAAAGCTTGGATTCTACGGTTACGATGCTTCGTATTCTGATCTCGCAGGTCATACAGGAGGATACAGATTCCTCTACGATGCTACAAACACTTCTGAAGTCTTCTCTGGAACAGATGCGGGCATCATCGCTGGTAACCTTAAACTAACTACCAACACTAACTCCACCTCCAATACTACTGGCGACCTTGTAGTTGCTGGTGGTGTTGGCATTACTCAAGATGTTAACATCGGTGGTCTGGTTGATATTGACAGCACTCTGCGCGTCCACAGCACCTCTCGCTTTGATGACAACATGGTCATCCAAGGTGCTTCTAAGACACTGCAACTGAATAATGGTACTGGCACAACTCGTATTGAGTTACAATCTACTACTGGTAATGCTGATTTCTATGGTATCGTCAATATTACCAATGACCTTAACGTCAACACTAATAAATTTAATGTTGCTTCTGCAACTGGTAACACTCTCATTGCAGGCACACTTGGAGTAACTGGTCAGACTACTTTAACTAGTGCTCTTGACCTCAATAACACTCTGAATGTTTCTGGATTTACATATCTGGAAAATACAGACGAACCTCAGATTGCTCTGAATTCTGGCACTGGTCTGTATGAGATTCAGAACAGTGACTATGGTGCATTCCGATTTGATGGTGGTGGATACATTGAAGGCGACTTCATGTTTAACTCCGATGTTTATGTCAACGGTACAGTAGTCCAGAAAGAAGACGAAACGGCAACATTTAACAGACAAAACTACTTGCTGGTTCGTTATATCATGTATACAGGTTCTTCTGCGGCATATACACCATCTTATGCATCAGATACTACTACTAATTTAAGAGTTTTTGGTGGTGCTGGTATTGGTACTGACCTTCATATTGGTGATGACCTTTATATTGGTAAGTTTAATAGTGGTGATACTGTTGAATTCCAAGTCCTCGGTGAAAGTGGCAACACTACAATCGGTCGCTCTGGTGCAGGCACTAACTCTGTAGGTACACTGACTGTCCATGGTGATGTAACATTCAACAGAGACCTGTTTGCTAATGGTAATATCACCCTTGGTAACGCAACTAGCGATACTCTGACTGTCCAAGCAAACTCCGAGTTTAATGGCACGGTTGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTTAGAAATGGCACAACCGACAAGTTCTTTGTTGACAACGTAACAGGCAACACTGATATTCAGGGTACACTTACTGTTGCTAGCACTTCCGAGTTCAATAATACTGTTGATGTTGACGCTAACTTTGCAGTTAGAACTGCTGCTGGTGTAGATAAGTTTACAGTTGCTTCTGCTTCTGGTAACGTTGCAACCGATGGTACTCTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACTATCAACGATTCTCTGATTGTTGATGCTGCTAACGAAGTCTTCTCCATTAGAAATGGTTCTGCTGTTGAGAAATTTGGTGTTGATGCAGATAACGGCAATACTAGCATCATTGGCACTCTGACCGTTGGTGATGCTACTCAGATTAATGACACCTTCGGTGCATCTGGTATCGTCACTCTCACCAACAACACAGAACAGACGCTTACGGGACTCTATGGTGCCGATGGAGGTCTGAGGGTCACTGGTGGTGTCGGAATCCAGAGGAACCTTGCTGTAGGCGGTTCTATGCGTGTCTACGGTGACTTTGAAATCTCTGGTGCAACTACTCAGTCTGGCAACACTGGATTCAGCGGTCGTGTCTCTATCACCAATACTTCTGACGCCACATCTTTTGATGATAACTCTGTTGCTCTTACTGTTGATGGTGGATTCAGAGCATCTCTTAATGCTTGGGTTGGCGGCGACTTCCATGTTTGGGATGATGCAAACTCCAGAGATGCATTCGTTGTTGATGTAAGCACTGGTGATGCAACCTTACACAATACTCTGACTGTTGGAGGAAACTTAATCGTCAATGGAACGACCACTACTGTTAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATCATTACTTTGGGTGGTGACACAGCACCAACGTCTAACGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAGTGGGCTTCTTCGGATTCGACAGGTCATCCTCCCAGTTCGCATTCCTGACAGATTCCACAAATGCGTCCGAAGTACACACTGGTACAGATGCTGCTCTTCGTGCTGGTAGTCTGAATCTGACTGGCACTGGCACCATTCTTGACGTTGATGCTAATGCCAACATCGATGGCACTCTGACTGTTGATGGTCAGATTATCTCTCAGGTTACATCTGGTCCTGCTCTGGTTATTCCTAACACTACTAAGATTAATAACCTGAATGCTGACTTGCTGGATGGTTATACAACTGCAACTGCTAATACTGCAAGTACGGTTGTTGTCAGAGATGCTTCGGGAGATTTTGCTGCCAATCAAATTACAGTTAACAATGGCATTGGTGCTCTTGCTGGTATTCAAGGTAACGCAACTACTGCCGATGCACTCAGAACCGCAAGAACAATCACAATCGATGGCGTTGTTGATGGTAGTGTCTCCTTTGATGGATCTGCAAACGTAACCATCAGCACTGTTTACAACGATGCAGACATCACTGCACTCGCTGCAATGGCAGGCACTGGTTTTGTTTCTAGGACTGCTGCTAATACCTATGCACAACGCACTCTGCAGGTTACAGCATCGTCTGGTATCACCCTAACCAATGCTGATGGTGTTGCAGGCAATCCAACGATTAACGTTGCGTCTGCAAGCACCAACTCGGCAAATAACCTGGTTATTCGTGATGCATCTGGTGATTTTGCTGCTAATGTAATTACTGCAGATTTGACTGGTAACGTAACTGGTAATGTCACTGGTAACGTAACTGGAGACTTGACTGGTCAGGCAGATGGTGCAGATAGAGTAGTTACTCAAGAGGTTACAACTGATTTTGATTACCCAATTGTTTTTGCATCGGCAAGATATACAACTCCAACTAATACTCTGATTTATACAGAGGCTTCGGGTGGTGCAGCTGCAACATATAATCCATCTACTAAAACTTTAGAAGTAGAAACAATTAAGTGTGATACAATTTCACCTAGGGATCCTGGAGCCATCCAATTCAATATTAATGCAAATAGTGT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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.