Protein
- UniProt accession
- M4QHY4 [UniProt]
- Protein name
- Fiber
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,9291
- Protein sequence
-
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVTAWNTLRYERPVESTSNTANTLVQRDADGNFAAGTVTATLIGNSSTAARLASTRQIQLSGDVQASGVFDGSQNLNLTSSISLISTLPHYDGTDTASGTYTKVTVDSKGRVTNATNPTTLAEYNLNGTVEGQSAQPYDLDLVAIAGLTTTGLISRTSGGNMQTRTIAGTAGRISVNDGGGINGNPTIDIISTTVQPGDYNTESLTSVSGVGSNSEPFGTETVNATKFTVDDRGRLTSATNVPIATATEGSKYANYGAGTTYVRYDIIQNASKVYQAITGIAAGQGAPTHTSGDSGGWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTISAQGVDNNQLQNNRIGFADGNTLENFELDQELTATTGYRGFNYLNYVKVNNTSGGLLFGANNTGDSGNGEVDINVKTLFSDPDFVLDGAVDQVINKDGSGHFTISHTQNVATPRNLNILATNSGSGTSNIVIRAEDTVTINATEATGKIHVEDARFQDNYIATSNATMHLDPGDDRAITGLVRVHGDLQVDGTTTTVNSTVTTVDDPIITLGGDTAPSSDDNKDRGVEFRYYDSQARIGFFGYDDSYTDLGGHVGGFTFLHDATNTSEVFSGTASGIIGGNLKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGAGIGQDVNIGGTLDVDTNFRTHGTSRFDDNVVLQGASKTLQLNNGSGTTKVEFQSTTGNGSLAGILDVTGNLNVNTNKFNVVAASGNTTIAGTLGVTNIATFSNNIDANGDVAIAGNIHSESTNDITTAKNSGTGEWEIQSNDYGSLRVDGGAYVAGSALIDGTLHVNGPLEIKDSATETESRLNWLRVRYRGRFGDTYQASPSYASHNFSTLKAHGGAGIMKSLYVGATGSNERFAVGKLNSGDTEKFTVIGATGNTTIQGTLLVEDNVNFNGTLDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTNIEGTLTADGHTELNSTLNVDSNTTLGGTLTVANNTEINGTLDVDANFAVRSGTTDKMTVASSTGNIATDGTLVVQGQTTINDSIILNAANEEFAVQNGSGVDKFTVDSDNGNTVIAGETTIGGATQINNTVGITNVTTITRNTQQTLTGTYSADGAFRLSGGAGIGKNLAIGEGLRVYGGTELSSALDLNSSADISGALVTHDNVTVTADNKFFKVQNGSGVDKFTVDTDNGNLVSQGQLTVAGDAALQSDLVVTGNLTVNGTTTTVNSTVTTIDDPVITIGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDGSAKLGFFGFDRSSSEFALLTSASNSSEVFTGTDGALRIGSIHVTGAGTSVDIDNNLNVDGTATVDGQIISQVSSGPALVIPTTDKINNLNADLLDGMTTATAATVSTVVNRDSSGDFAANQITAASGTGSGAGFLGNASTADAWKTARTFTIDGVVSGSVSVDGSSAPTITTTFVDADSTGLAAMSGTGYVVRTGTGTYAQRTLQVTASSGITLTNADGVSGNTTINVASASTNSSNNLVIRDGSGNFAAGTITAALTGNVTGQVSDISNHDTGDLTEGSNLYYTDERVDDRVNALITAGTGITKAYNDSANTYTLTVTQSDIDTDNVTEGSSNLFTTAARTRTHFTYGNGIALAGSGELSVTQSQINTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIELSGSGELSVTQADINTSNITEGSKLFYTDARFDTRLAAKTTANLTEGSNLYFTDARADARVAAATGANLDLSSKSTSDLSEGTNQYYTEARVQTKLDNAFEQLSAMLNNLATSTTLTLNLSGDPTPGAVVTTGVSVGGGGGFTAATGVATSGAASGASGLTVDTTVDADGNITAAAVNAGGSDYLITDTVTITNANAGKVLSFNLATLAGGSNYVTGTALATTGGSGSASLVVNITASAGAITNVTINDGGTGYAVGETITIVQPTGLDGSNPGSGGTVNVATVATNATLTLTDITTMEVGATVTGATSGTTGVITALGTNQVTVDNVDGFFKKGEVVSANDVTALTISSFA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2027 AA molecular weight: 207404,28940 Da isoelectric point: 4,33741 aromaticity: 0,05723 hydropathy: -0,19003
Domains
Domains [InterPro]
IPR041352
5–43
5–43
1
2027
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Cyanophage P-RSM1 [NCBI] |
536444 | Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > Emcearvirus gerard > |
Host |
Prochlorococcus marinus str. MIT 9303 [NCBI] |
59922 | Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGH26522.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ634175
[NCBI]
CDS location
range 140257 -> 146340
strand -
strand -
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGAAGGGGTGGTGCTCAGGAATGGGCAAACGCAAACCCTACTCTTGCTCAAGGTGAATTGGGTATTGAGTTAGATACTGGTCGATTTAAGATTGGTGATGGTGTTACCGCGTGGAATACTCTGCGATATGAGAGACCTGTCGAATCTACTTCAAACACTGCTAACACTCTTGTACAAAGAGATGCTGATGGTAACTTTGCTGCAGGTACGGTAACTGCAACTCTTATTGGTAACTCTTCTACTGCTGCACGTCTTGCTTCAACTAGACAAATTCAACTCTCTGGTGACGTACAAGCATCTGGTGTATTTGATGGTTCACAAAATCTTAACTTAACTTCTTCTATTAGTCTGATTTCTACTTTACCACATTACGATGGTACTGATACTGCAAGTGGAACTTATACTAAAGTAACTGTTGATTCTAAAGGTAGAGTTACAAATGCTACAAACCCAACAACTCTTGCTGAATATAACTTAAACGGAACTGTAGAAGGTCAGTCTGCACAACCATATGACTTAGACCTTGTTGCTATTGCAGGTCTTACTACCACTGGTTTGATTTCCAGAACTTCTGGTGGTAACATGCAGACCAGAACTATTGCAGGTACTGCAGGTAGAATCTCCGTAAATGATGGTGGTGGTATCAATGGAAACCCCACGATCGACATTATTTCAACGACTGTACAACCAGGAGATTATAATACAGAATCTTTAACATCTGTCTCAGGTGTGGGATCCAACTCAGAACCATTCGGTACTGAAACTGTAAACGCTACGAAATTTACAGTGGACGACAGGGGTCGTCTAACCAGTGCTACTAATGTACCAATCGCTACTGCAACAGAGGGAAGTAAGTACGCTAACTATGGTGCAGGTACTACTTACGTTAGGTATGACATCATTCAAAATGCCTCTAAGGTTTACCAAGCAATCACTGGGATTGCTGCAGGTCAAGGTGCTCCTACTCATACTAGTGGCGACTCTGGCGGGTGGAGATACCTCGCTGCCGAGGCAACGGAGCAGAAGGGTCTCGCGTCCTTTGCACAAGAAGACTTTGACGTTGACAGCAACGGGCACGTCACGATCTCCGCCCAAGGTGTAGATAACAATCAATTACAGAACAATAGAATCGGTTTTGCTGATGGCAACACCTTAGAAAACTTTGAACTCGATCAAGAGTTAACTGCTACCACTGGATATAGAGGTTTTAATTATCTTAACTATGTTAAGGTAAACAACACGTCTGGTGGTCTTTTATTTGGTGCTAATAATACTGGTGATAGTGGTAATGGTGAAGTAGATATTAATGTAAAGACTTTATTCAGTGATCCTGATTTCGTTCTTGATGGTGCTGTCGATCAGGTCATTAATAAGGATGGATCTGGTCATTTCACCATAAGTCATACTCAAAATGTTGCGACACCTAGAAATCTCAACATTCTTGCAACAAACAGTGGATCGGGAACTTCTAATATCGTAATTCGTGCAGAAGATACTGTTACAATTAACGCAACTGAAGCAACTGGTAAGATTCATGTTGAAGATGCAAGATTCCAAGACAACTATATTGCAACTTCAAATGCTACAATGCATCTTGATCCAGGTGATGATAGAGCAATCACTGGATTAGTACGAGTTCATGGAGATTTACAAGTAGATGGAACTACTACAACAGTTAACAGCACGGTTACGACCGTTGATGATCCCATTATTACTCTTGGTGGTGACACTGCTCCAAGTAGTGATGATAACAAAGATCGTGGAGTTGAATTCAGATACTACGATTCTCAAGCAAGAATTGGATTCTTTGGTTACGATGATTCTTACACCGACCTCGGAGGACACGTCGGAGGATTTACATTTTTACACGACGCCACAAATACTTCAGAGGTCTTTAGTGGAACAGCGTCTGGCATAATCGGTGGTAACTTAAAACTTACAACAAATACAAACTCAACATCTAATACTACTGGAGATTTGGTAGTTGCAGGTGGTGCAGGTATTGGTCAGGATGTTAATATTGGTGGTACGTTAGATGTAGATACTAACTTCCGTACTCACGGTACAAGTAGATTTGATGATAATGTTGTTTTACAAGGTGCTTCTAAGACATTACAACTAAACAATGGATCTGGAACTACTAAAGTTGAGTTCCAATCTACAACAGGTAACGGTTCTCTTGCAGGTATCTTAGATGTAACTGGTAACCTCAACGTTAATACTAACAAGTTCAATGTTGTTGCTGCTTCTGGTAACACAACTATTGCAGGTACATTGGGTGTTACAAACATTGCTACCTTCTCTAACAATATTGATGCTAACGGTGACGTTGCAATCGCAGGTAATATTCACTCCGAAAGCACAAACGATATCACCACTGCGAAGAACAGTGGCACTGGTGAATGGGAGATTCAATCTAATGACTATGGTTCATTAAGAGTTGATGGTGGTGCATACGTTGCAGGTTCTGCTCTGATCGATGGTACGTTACACGTTAACGGTCCTCTTGAGATTAAGGATAGTGCGACAGAGACTGAATCTAGATTGAACTGGTTGAGAGTCAGATACAGAGGTCGTTTCGGTGACACTTATCAGGCATCTCCTTCCTATGCATCTCATAACTTCTCCACCTTGAAAGCACATGGTGGTGCAGGTATTATGAAATCCTTGTACGTTGGTGCTACTGGATCTAACGAAAGATTTGCTGTTGGTAAACTCAATAGTGGTGATACTGAGAAGTTCACTGTTATTGGTGCAACTGGTAACACAACTATTCAAGGTACATTACTTGTTGAAGATAATGTAAACTTTAATGGCACTCTCGATGTTGATGCAGACTTTGCAGTCAGAAATGGAACGACTGATAAGTTCTTCGTTGACAACGTAACTGGTAATACTAATATTGAAGGCACGCTGACTGCCGATGGTCACACTGAGTTGAACTCTACACTTAACGTAGATAGCAATACAACTCTTGGTGGTACACTGACTGTTGCTAATAATACTGAGATTAACGGCACCTTAGACGTTGACGCTAACTTTGCTGTTAGATCTGGTACAACTGATAAGATGACTGTTGCATCTTCCACAGGTAACATTGCAACTGATGGTACTCTGGTTGTTCAAGGTCAGACAACTATTAATGATTCAATTATCCTCAACGCTGCTAACGAAGAGTTTGCAGTCCAGAATGGTTCTGGAGTAGATAAGTTTACTGTTGATAGTGACAATGGTAACACTGTCATTGCAGGTGAAACAACGATTGGTGGTGCTACACAAATTAATAATACTGTTGGTATTACTAATGTAACTACAATTACTAGAAATACCCAACAAACCCTTACTGGAACCTACTCTGCCGATGGTGCATTCCGTCTCAGTGGTGGTGCAGGTATCGGTAAGAACCTCGCTATTGGTGAGGGATTAAGAGTTTACGGTGGTACAGAACTTAGCAGTGCATTAGATCTTAATAGTAGTGCTGATATCTCTGGAGCACTGGTAACTCATGATAATGTTACTGTCACAGCAGACAACAAGTTCTTCAAAGTTCAGAACGGTTCTGGTGTAGATAAGTTTACTGTTGATACAGATAATGGTAATTTGGTCTCCCAAGGTCAATTAACTGTTGCAGGTGATGCAGCATTACAATCTGATCTTGTAGTTACTGGAAACTTAACCGTAAATGGAACAACAACTACTGTTAACAGCACTGTCACTACAATCGATGACCCTGTTATTACTATTGGAGGTGACACAGCACCCGCGTCTAACGATGGTAAGGATAGGGGTGTTGAATTTCGTTACTATGATGGTTCTGCTAAACTTGGTTTCTTCGGTTTTGACAGATCCTCCTCAGAATTCGCACTCTTAACTAGTGCAAGTAACTCCTCCGAAGTATTCACTGGTACTGATGGTGCATTAAGAATCGGTTCTATTCATGTTACTGGTGCAGGTACATCTGTTGACATTGATAACAACTTAAATGTTGATGGAACTGCAACCGTTGATGGACAGATCATCTCTCAAGTATCTTCTGGTCCTGCTCTTGTCATTCCAACAACTGATAAGATTAATAATCTAAACGCAGACTTACTAGATGGTATGACAACTGCGACTGCTGCAACAGTCTCTACAGTTGTAAATCGTGACTCATCTGGTGACTTTGCTGCTAACCAAATCACTGCTGCTAGTGGCACAGGATCTGGTGCAGGTTTCTTAGGAAACGCATCTACTGCTGACGCATGGAAGACTGCTAGAACATTCACTATTGACGGTGTTGTATCTGGTTCTGTATCTGTAGATGGTAGTTCTGCTCCAACAATCACAACAACATTTGTTGATGCTGATAGCACTGGTCTTGCTGCCATGTCTGGAACTGGATATGTTGTAAGAACAGGAACTGGAACTTATGCACAAAGAACTCTCCAAGTTACTGCATCTTCTGGTATTACTCTGACCAATGCTGATGGTGTTTCTGGAAACACTACAATCAACGTTGCTAGTGCAAGCACCAATTCTTCTAACAACCTCGTAATCAGAGACGGATCTGGTAACTTCGCTGCAGGAACTATTACTGCTGCATTGACTGGTAATGTTACTGGTCAGGTATCTGATATCTCAAACCATGATACTGGTGATCTTACTGAGGGATCTAACCTCTACTACACTGACGAGAGAGTCGATGATAGAGTCAATGCTCTTATCACTGCAGGAACTGGTATCACCAAAGCATATAATGACTCCGCAAACACATATACACTGACTGTAACACAGTCCGATATCGATACTGATAACGTAACTGAAGGATCTTCAAATCTCTTTACTACTGCTGCAAGAACCAGAACTCATTTCACATATGGTAATGGTATTGCACTCGCAGGATCTGGTGAACTGTCTGTAACTCAGTCTCAAATCAACACTGATAATGTAACTGAAGGATCAACTAACCTGTTCACCACTGCTGCACGAACAAGGACACA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Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.