Protein
View in Explore- Genbank accession
- AXH71503.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber
- RBP type
-
TFTFTF
- Protein sequence
-
MANSFVRYTGNNSTTSYSIPFSYRATGDLTVTLAGVATTAYTLNAAGTTLTFNSAPAQDVAIEIRRKTSQTTRLTDYADGSVLTENDLDTDSTQAFYMGQEAIDDANDVIKPSNTNFQWDANNKRIINVANPTSNQDVATKHYLENTWLSASDKTAITTVNSNIANINTVNSNITNINSAVSNATNINTVATNISSVNTVAADITKVIAVANDLAEAVSEIETVADDLNETSSEIEVVGANIANVNTVGGISANVTTVAGVASNVTTVAGIQANVTTVAGISGDVTAVANISSDVAAVEDIKTNVTAVAGIASDVTAVANISSDVAAVENIAANVTTVAGNNANITTVAGANSNITAVAGAITNVNNVGGAIANVNNVGGSIANVNTVATNLASVNSFANTYRIAASAPTSSLDVGDLYFDTTANELKVYKSSGWAAAGSTVNGTSARFNYTATANQTTFTGADTAGNTLAYDAGFADVYLNGVRLSAADITITSGTSVVLASGANAGDILDVVGYGTFNVAAVNGSAINAGTINIDRLPSITDAKLAGSISNAKLSNSSITINGSAVALGGSVTVGETKPTATGCTPSTITNSATNVVIAGTNFASIPQVWAINTATGIWYLANSVSFTSATSITANFTLTVDAQYKIRVENPDGNATLSGSNILTVSDAPTWSTASGSLGSVAGDFSGTVTTLSASSDSAITYSETTNVLTNASQANCALNSSTGAITTSDFGGSSTTATTYNFTIRATDAESQTTDRTFSLTSSFGATGGGQFN
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 777 AA molecular weight: 78468,51650 Da isoelectric point: 4,10857 aromaticity: 0,05663 hydropathy: 0,09755
Domains
Domains [InterPro]
IPR005604
ATT
3–114
ATT
3–114
DC_0265
STR
28–145
STR
28–145
DC_0265
STR
223–295
STR
223–295
1
777
Architecture
ATT 3-114 | STR 115-777
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Pelagibacter phage HTVC121P [NCBI] |
2283022 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Candidatus Pelagibacter sp. HTCC7211 [NCBI] |
439493 | Pseudomonadota > Alphaproteobacteria > Candidatus Pelagibacterales > Candidatus Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AXH71503.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH598803.1
[NCBI]
CDS location
range 32006 -> 34339
strand +
strand +
CDS
ATGGCTAATAGTTTTGTACGTTATACAGGTAATAACAGTACAACATCTTATTCCATTCCTTTTAGCTATAGAGCTACAGGAGACCTTACAGTTACCCTAGCAGGGGTGGCGACAACTGCTTATACACTAAATGCGGCAGGGACTACTCTTACATTCAATTCTGCACCTGCACAAGATGTGGCTATTGAGATAAGAAGAAAAACGTCTCAAACAACAAGATTAACAGACTATGCTGATGGTTCAGTATTAACAGAAAATGATTTAGATACAGATAGTACCCAAGCGTTTTATATGGGTCAGGAAGCTATTGATGATGCTAATGATGTTATTAAACCTTCCAATACGAACTTTCAATGGGACGCAAACAACAAAAGAATTATAAATGTTGCTAACCCAACAAGTAACCAAGATGTTGCTACCAAGCATTATCTTGAAAATACATGGTTATCAGCGTCAGATAAAACAGCTATAACAACAGTAAATTCAAATATAGCAAATATTAATACTGTAAATTCTAATATTACTAATATAAATTCCGCAGTATCTAATGCTACAAACATAAACACAGTAGCTACAAATATTTCTTCAGTAAATACAGTAGCCGCAGACATTACAAAAGTAATTGCTGTAGCAAATGATTTAGCAGAAGCAGTTTCAGAAATAGAAACAGTTGCAGATGACCTAAATGAAACAAGTTCAGAAATTGAAGTAGTAGGTGCAAATATCGCAAATGTTAATACAGTTGGTGGTATATCCGCTAATGTTACAACAGTAGCAGGTGTTGCGAGTAATGTAACTACAGTGGCAGGTATACAGGCAAATGTTACAACAGTAGCAGGAATTTCAGGAGATGTTACAGCAGTAGCTAACATTTCAAGTGATGTTGCGGCAGTAGAAGATATTAAAACTAATGTAACTGCAGTGGCAGGGATAGCTTCTGATGTAACAGCAGTAGCAAACATATCAAGTGACGTAGCGGCAGTAGAAAACATTGCGGCTAACGTAACAACAGTTGCAGGAAACAATGCAAACATTACGACAGTTGCAGGTGCTAACTCAAATATTACAGCAGTTGCAGGAGCAATAACTAATGTTAATAATGTTGGTGGAGCAATTGCTAACGTAAATAATGTTGGCGGTTCTATTGCAAACGTAAATACAGTTGCTACAAATTTAGCTTCCGTAAATAGTTTTGCTAACACATATAGAATTGCGGCTTCAGCACCAACATCTTCTTTAGATGTAGGAGATTTATATTTTGATACAACGGCAAATGAATTAAAAGTTTATAAAAGTTCAGGTTGGGCGGCGGCAGGTTCTACAGTTAATGGAACGTCTGCAAGATTTAATTATACAGCAACAGCAAACCAAACGACATTCACAGGAGCAGACACAGCAGGAAATACACTTGCGTATGACGCAGGGTTCGCTGATGTCTACCTAAATGGTGTAAGATTATCTGCGGCAGATATTACAATTACTTCTGGTACTTCTGTAGTCCTAGCTTCAGGTGCTAATGCAGGAGATATTTTAGATGTAGTTGGATATGGAACATTTAATGTTGCGGCAGTAAATGGTTCAGCAATTAACGCAGGAACAATTAACATAGACAGATTACCAAGTATAACTGATGCAAAATTAGCAGGTTCAATATCAAATGCTAAATTATCTAATTCAAGTATTACAATAAATGGTTCAGCAGTAGCATTAGGTGGAAGTGTTACAGTTGGAGAAACTAAACCAACAGCAACAGGTTGCACACCAAGTACAATCACAAATTCAGCAACCAATGTAGTTATTGCAGGAACTAACTTTGCTTCTATTCCGCAGGTATGGGCGATTAATACTGCAACAGGAATATGGTATTTAGCAAATAGTGTTTCTTTTACAAGTGCAACTTCAATTACAGCTAACTTCACTTTAACTGTAGATGCACAATATAAAATTAGAGTTGAAAACCCAGATGGTAATGCAACACTTTCTGGTTCAAATATTTTAACAGTTTCAGATGCACCTACTTGGAGTACAGCTTCAGGTTCTTTAGGTTCTGTAGCAGGAGATTTTTCAGGAACAGTTACTACATTATCTGCGAGTTCAGATAGTGCAATAACTTATTCTGAAACAACAAACGTATTAACAAATGCTTCACAAGCGAATTGTGCTTTAAACAGTTCAACAGGAGCAATCACTACTTCCGATTTCGGTGGTAGTTCAACAACAGCAACAACTTATAACTTTACAATCAGAGCAACAGACGCAGAAAGTCAAACTACAGATAGAACTTTTAGTTTAACTTCTAGCTTCGGTGCAACAGGGGGCGGACAATTTAATTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
f53594caf0ab4aaca31c08689383b00f05bd27accebfc16270584843e3b0f9b5
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50