Protein

View in Explore
Genbank accession
YP_008242177.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MRKLILFFGLIFCLEMAAQVEQVEAVVLAKKSTAELNALPSRLKQIGGIYFDVTLDDFVTWNGSNFVDFSGETYIFTGGISESGGTVTLENEYTAAEKSKVSNLPNDQSAVNETTVKFDKNNANTFKIKTADDDAAADVILTINDDDTPGGVEYFDEYVEEISGAVSDGNLTITLGRTNLSDLISAAIPLPSPTGSGSYSAGTGLSLGGSVFSLAPSVQSDIDSKLNKGLTNLGGTLLDVKSDVGFRFQPNEGLSGFLVTPTLTSFLMGTADLSKMTSFSLTADYFRTNLSDAKILAQGDDSMLTYGFVKNYFLTKDAAAALYAPIGSSTGGGDVDDADADPLNEIQTLSVSGNTVTLSKDGGAFVIPSGGINQTIGNSVLTLKGITQGDITTTAKWSLTGSVLTLHYRFVMSGNKTTNGLVTIDGLPYRPEGLTHHAMFITGSTSNSMIGAFTDANYSNGNVLRPFVYLSGGNNPIQLNTGQSLNSGTQILGTVTYIIN
Physico‐chemical
properties
protein length:500 AA
molecular weight: 52675,18780 Da
isoelectric point:4,39413
aromaticity:0,08400
hydropathy:-0,00260

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cellulophaga phage phi39:1
[NCBI] 		1327993 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Cellulophaga baltica
[NCBI] 		76594 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > FCB group > Bacteroidota/Chlorobiota group > Bacteroidota

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_008242177.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_021804.1 [NCBI]
CDS location
range 16625 -> 18127
strand +
CDS
ATGAGAAAATTGATTTTATTTTTTGGATTAATTTTTTGCTTAGAAATGGCAGCCCAGGTAGAACAGGTAGAAGCCGTAGTATTAGCAAAAAAAAGTACAGCAGAATTAAACGCCTTGCCGTCTAGGTTAAAACAAATAGGTGGTATTTATTTTGATGTTACGTTAGATGATTTTGTAACCTGGAATGGATCTAATTTTGTAGATTTTTCTGGTGAAACTTATATTTTTACAGGTGGTATTTCTGAAAGTGGCGGTACTGTTACTTTGGAAAATGAATATACTGCTGCGGAAAAATCAAAGGTTTCTAATTTACCTAATGATCAATCCGCAGTTAACGAAACTACTGTAAAATTTGATAAAAATAATGCCAATACTTTTAAAATTAAAACGGCCGATGATGACGCTGCAGCAGATGTAATTTTAACTATTAATGATGATGATACGCCAGGCGGTGTAGAATATTTTGATGAATATGTAGAAGAAATTTCTGGTGCTGTTAGTGATGGTAATTTAACGATAACGTTAGGGCGTACTAATTTATCAGATTTAATTAGTGCTGCTATTCCTTTACCTAGCCCTACAGGTTCTGGTTCTTATTCCGCAGGAACAGGTTTATCTTTAGGTGGTTCTGTTTTTAGTTTAGCGCCTAGTGTGCAGTCAGATATAGATAGCAAATTAAATAAAGGTTTAACTAATTTAGGTGGTACATTATTAGATGTTAAAAGTGATGTAGGTTTTAGATTTCAACCTAATGAAGGTTTAAGCGGTTTTCTAGTTACACCTACTTTAACCAGTTTTTTAATGGGTACTGCGGATTTATCGAAAATGACTAGTTTTTCATTGACTGCAGATTATTTTAGAACAAATTTATCGGATGCTAAAATTTTAGCGCAGGGTGATGATTCGATGTTAACTTATGGATTTGTAAAAAATTATTTTTTAACTAAAGATGCTGCGGCTGCTTTGTATGCTCCTATCGGTTCTAGTACTGGTGGTGGTGATGTAGATGATGCAGATGCAGATCCTTTAAATGAAATACAAACATTATCAGTAAGTGGTAATACTGTTACACTTTCTAAAGATGGTGGTGCTTTTGTTATTCCTTCTGGGGGTATAAACCAAACTATAGGTAATTCTGTTTTAACATTAAAAGGTATTACCCAGGGAGATATAACAACAACTGCAAAATGGAGTTTAACAGGATCTGTTTTGACGCTTCATTATAGGTTTGTAATGTCAGGAAATAAAACCACAAATGGTTTAGTAACTATTGATGGGTTACCGTATAGGCCAGAAGGTTTAACACATCATGCAATGTTTATTACTGGATCTACTTCTAATAGTATGATAGGCGCCTTTACAGATGCTAATTATTCGAATGGCAATGTATTACGGCCTTTTGTTTATTTGTCTGGGGGAAATAATCCAATACAATTAAATACGGGGCAGTCTTTAAATAGTGGAACTCAAATTTTAGGTACTGTTACCTATATAATCAATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
ffd4908e8b52a86c81c89962fabe8d2a3908e34b39c4391c232690c9fa96d33e
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,3965
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50