Protein
View in Explore- Genbank accession
- AIX32222.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MPLNKLENFIKNTDGRTLYVNPNDLNATDSITNQGTSLTEPFRTIQRALIESARFSYVRGDDNDLIERTTIMVYPGEHPIDNRPGFGIKTVGNSPVAVTPSGELIDPFQAFNLTDASNFDIESSNNVLYRFNSIYGGVVVPRGTSIVGMDLRKTKIRPIYVPNPTDDSVDYSAIFRITGTCYFWQFTIFDGNENGVVFTDPRDFSENNQSRPTFSHHKLTAFEYADGVNPAVESGFELTDLAMYYSKLSNAYNEASGRPIDEKYPSDPGGFSPQRPEFEIVGAFATDPINITRLISGDGFVPDAVITVDTQVPHELNTGTPIKIRGVAISDYNISTKVSAVLSPTRFTYNLSFVRPNLPAEPSVSSATVTVETDTVTGASPYIFNCSMRSVWGINGMHADGAKATGFRSMVVAQFTAISLQKDDRSFVTYNKQARRYDGINVNKTVRGAELSAQSSSTNSATVYHLDPDAIYRPDWGTTHIKMSNDAVIQIVSVFAIGFNQHFASIGGADASITNSNSNFGQFALKADGFKNDAFLKDDKGFLTSFVSPKSAYNPETDDVEIIDWINIDFDLTRSIAFANQLYLTGYTNAEDKPPVVNQGFRIGANYKESLIQRTTVGAGADVTSSVRMCDNILGPGNNQANGSSVARKVYQVLAGPINNTLSLGVHGLLNGESVRVFSSTGDLPENLERGALYYANVVDGENIRIATSESNALNNIFLNIYGGVELRVESRVNDKEAGERGHPVQYDYTNQNWFVHTDANSDIYQYIVANPTSTDGIDFVSIFKRFGDNRALEDKLYRLRYVIPKESRNAKPPTPGYVLQASATTGARNNDDFILQDIGINDYEYNRNPRYIVSCTVIANEVEVRSEIPHNLNVGDKIKIVNVASTNNTGASQIKGFNGEFLVTRVINSREFRYDITDVNGFSRNPGTFTNNINERNILLPRYERKDLQSNVFVYRIETITDFLEGERDGIYHLFLLNGSNPVTETFTDIQYNQPVEDLYPQMDPDNLIQNPPATTTFAKRAPLGDVTIDEQQNSITKESVDKIYKTLNVGIIETATDGTVGAGGTRTTTLTFQREHEFNSVYSYTTLVGGGGYTDGTFYDVKLLSEFGTVWGGASAVVTVTAGTVTAVTIMDPGSGYSAGQTLFIDGTTIGGGTNATISITQADLEDNKHSILQISGGALYNPDSYVVMTSVEDQSSVGVARTSGSPAIIPGMYAYPADSGTGISSTTYNSDTGLTTLVSTGSAGFGLQRGNTFVVFSSNYSYLGKFFVSNVPTPDTLEFYSYRDLGTVSIVGKTGLDVNDANTGSLGENVGVRATPLYDNGVFYLEQSSGTGTQLTVRAEDGGVAGNVDSKMYLGRYFQMGSEIIRVASKNFDGANNNIVTVIRGALGTVVSNLPINTKVKAIRPSALELRRPSILRASGHTFEYLGYGPGNYSTSLPQLQVKQLPDDEIYLVQAQELSCGQVVYTGMSDNGDFYIGNTKYSATSGTQSTFDVPIPTVAGQPGSSNNVVFDEVIINRRLFVSGGETNEVQSQFDGPVKFTQSVTIQNNLFVTGTTQLNRIEITSTENATSSANGGALTIRGGAAIGKDFYVGGEMYTNAYQIEDTSAVLEIGTNQSSKDISVGGSTDTDRVVFNTTKLATGEGAEEVVNADAGVVVEGGLVVRDVIIAKEFRGAGTGGGPGTILLWGGSTSALPDRYLLCNGATLNKNTYNKLFEAIGYIHGGSGNSFKLPDLRNRFIPGAGSSYAVAAKGGDDSVVLTETQMPRHTHSTSAVNAPHTHPVSFTSGAANAPHKHPAGTGGGGNHNHPSGGTGGGGNHNHPSGGSNNTGNHGHPYSAPGQSKTDVANSNEKNVTSNVNASGAGTGGGGAHSHSVSVNSTSSAHNHPVSVNSGSSAHNHPVSVNSANAPHSHPISGNAGSANAPHVHPIGNTGGTASFDNRPKYYALCYIIQSE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1955 AA molecular weight: 209740,91220 Da isoelectric point: 5,19249 aromaticity: 0,08900 hydropathy: -0,31959
Domains
Domains [InterPro]
DC_0066
STR
1–1955
STR
1–1955
IPR037053
ATT
1682–1737
ATT
1682–1737
SSF88874
STR
1683–1823
STR
1683–1823
IPR011083
ATT
1684–1741
ATT
1684–1741
1
1955
Architecture
STR 1-1681 | ATT 1682-1741 | STR 1742-1955
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage ACG-2014f [NCBI] |
1493511 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Atlauavirus > Atlauavirus tusconc8 |
| Host |
Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI] |
32051 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX32222.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019103.1
[NCBI]
CDS location
range 19734 -> 25601
strand +
strand +
CDS
TTGCCCCTTAATAAGTTAGAGAATTTCATTAAGAATACGGATGGACGTACTCTGTATGTTAATCCAAACGATCTTAATGCTACTGATAGTATTACAAACCAAGGCACTTCCCTTACAGAACCCTTCAGAACTATTCAGAGGGCGTTAATTGAGAGTGCGCGTTTCTCATATGTGCGTGGTGATGATAATGATCTCATCGAGAGAACCACCATCATGGTGTATCCCGGTGAGCATCCTATCGATAACCGTCCTGGTTTCGGTATTAAGACAGTAGGTAATAGTCCGGTAGCGGTAACTCCTTCAGGTGAGTTGATTGATCCGTTCCAAGCATTTAACCTGACTGATGCTAGTAACTTTGATATTGAGTCTAGTAATAACGTTCTCTATAGATTTAACAGTATCTACGGTGGTGTTGTTGTTCCCCGTGGTACTTCTATCGTGGGTATGGACCTACGTAAGACAAAGATTCGTCCGATATATGTTCCCAACCCCACTGATGATTCAGTAGATTACTCAGCGATCTTCCGTATCACAGGTACTTGCTACTTCTGGCAGTTCACCATCTTTGATGGTAATGAGAATGGTGTAGTATTCACTGACCCAAGAGATTTCTCTGAGAATAACCAGTCCAGACCCACTTTCTCACACCACAAACTAACAGCATTTGAATACGCTGATGGTGTCAACCCAGCGGTAGAATCAGGGTTTGAACTCACTGACCTTGCTATGTATTATAGTAAGTTGTCTAACGCATATAATGAAGCATCTGGTCGTCCTATTGATGAGAAGTATCCATCAGATCCTGGTGGTTTTTCACCACAACGTCCTGAGTTTGAGATTGTTGGTGCATTCGCAACTGACCCAATCAATATCACTCGTTTAATCTCTGGTGATGGTTTTGTCCCTGATGCTGTCATCACAGTAGATACACAGGTCCCACATGAACTAAACACTGGAACACCAATTAAGATTCGTGGTGTTGCCATCAGTGACTATAATATCTCTACAAAAGTATCTGCAGTTCTTAGTCCTACTAGGTTTACGTATAACCTATCATTCGTAAGACCTAACCTACCAGCAGAACCTTCAGTATCCTCTGCAACTGTAACCGTTGAGACTGATACTGTAACAGGTGCTTCACCATACATCTTTAACTGTTCGATGAGATCAGTTTGGGGTATCAATGGAATGCACGCCGATGGTGCCAAAGCAACTGGATTCCGTTCCATGGTTGTTGCTCAGTTCACCGCGATCTCCCTTCAAAAAGATGATAGATCCTTCGTTACTTATAATAAACAGGCACGTAGATACGATGGTATCAACGTCAATAAGACTGTAAGGGGTGCTGAACTATCTGCACAGTCATCTTCTACTAACTCAGCAACTGTATACCACCTAGATCCTGACGCTATCTATCGTCCTGACTGGGGTACAACTCACATCAAGATGAGTAATGATGCAGTCATTCAGATTGTGTCTGTATTCGCTATTGGTTTCAATCAACACTTTGCTTCTATTGGTGGAGCTGATGCATCAATCACAAACTCTAACTCCAACTTTGGTCAGTTTGCACTGAAAGCTGATGGATTCAAGAATGATGCTTTCCTCAAAGATGATAAAGGTTTCCTAACATCATTTGTTTCTCCTAAGAGTGCGTATAACCCAGAAACTGATGATGTTGAGATCATTGACTGGATTAACATTGACTTTGATCTAACTCGTAGTATTGCCTTTGCTAATCAACTCTATCTAACTGGTTATACTAACGCGGAAGATAAACCACCAGTAGTTAATCAGGGTTTCCGAATTGGTGCCAACTACAAAGAGAGTCTCATTCAGAGAACAACAGTTGGTGCTGGTGCAGATGTAACCTCATCAGTAAGAATGTGTGATAATATTCTCGGTCCTGGTAACAATCAAGCCAATGGTAGTAGTGTTGCTAGGAAAGTATATCAAGTTCTAGCAGGACCTATCAACAATACCCTCTCACTGGGTGTTCATGGACTACTTAATGGTGAGAGTGTAAGAGTATTCTCATCAACAGGTGACCTACCTGAGAACCTAGAAAGAGGTGCCCTATACTACGCAAATGTGGTTGATGGTGAGAATATTCGTATTGCTACTTCCGAGTCTAATGCACTCAACAACATCTTCCTCAACATCTATGGTGGTGTTGAACTTCGTGTTGAGTCTAGAGTTAATGATAAGGAAGCAGGTGAAAGAGGTCATCCCGTTCAGTATGACTACACTAACCAGAACTGGTTTGTTCATACTGATGCCAATAGTGATATCTATCAGTATATTGTAGCCAACCCAACCTCTACAGATGGTATTGACTTTGTATCCATATTCAAGAGATTTGGTGATAACAGGGCACTAGAAGACAAACTATATCGCCTCAGGTATGTTATTCCTAAGGAGTCAAGGAACGCAAAACCACCTACCCCTGGTTATGTTCTACAAGCATCAGCAACAACAGGTGCTAGGAATAACGATGACTTTATCCTACAGGATATTGGTATCAATGACTATGAATATAACAGAAACCCACGTTATATTGTAAGTTGTACTGTTATTGCTAATGAAGTTGAGGTTCGTAGTGAGATTCCACACAACTTGAATGTTGGTGATAAGATTAAAATAGTGAATGTTGCCAGTACAAATAACACTGGCGCATCACAAATCAAAGGTTTTAATGGTGAGTTCCTAGTTACTAGAGTTATCAACTCTCGTGAGTTTAGGTATGATATTACTGATGTAAATGGTTTTAGTAGAAATCCTGGTACCTTCACCAACAACATCAATGAAAGAAACATTCTTCTACCTCGTTATGAGAGAAAGGATCTACAGAGTAATGTATTCGTATATCGTATTGAAACTATCACTGATTTCCTAGAAGGTGAGAGGGATGGTATCTACCACTTATTCCTTCTTAATGGTTCTAACCCAGTAACAGAGACATTCACTGATATCCAATACAATCAACCTGTGGAAGATTTATATCCACAGATGGATCCTGATAACCTTATTCAGAACCCCCCTGCAACCACAACGTTTGCTAAGAGGGCACCCCTAGGTGATGTTACTATTGATGAACAACAGAACTCCATTACTAAAGAGTCTGTTGATAAAATATACAAGACACTTAATGTTGGTATCATTGAGACTGCTACTGATGGCACTGTTGGTGCTGGTGGAACACGTACAACCACACTAACATTCCAAAGAGAGCACGAGTTCAACTCTGTGTATAGTTACACCACACTAGTTGGTGGTGGTGGATATACTGATGGTACTTTCTATGATGTTAAACTACTCAGTGAGTTTGGCACAGTATGGGGAGGTGCTTCTGCTGTTGTTACTGTTACTGCTGGTACAGTTACCGCAGTTACTATCATGGATCCTGGTTCAGGTTATTCTGCAGGTCAGACACTATTCATCGATGGAACTACAATTGGTGGTGGTACTAACGCTACTATTAGTATTACTCAGGCAGACTTAGAGGATAACAAGCATAGTATCCTACAGATTTCTGGTGGTGCTTTGTATAACCCAGATTCATATGTAGTGATGACCAGTGTTGAGGATCAGTCTTCAGTTGGTGTTGCTAGAACTTCTGGAAGTCCTGCTATTATTCCTGGTATGTACGCATATCCAGCAGATAGTGGAACAGGTATTTCTTCAACTACATATAACTCCGATACAGGTTTAACAACACTAGTATCTACAGGTAGTGCTGGTTTTGGTCTTCAGAGGGGTAACACTTTCGTTGTATTCAGTAGTAACTATAGCTATCTCGGTAAGTTCTTTGTATCTAATGTTCCAACTCCAGATACATTGGAGTTCTACTCATACCGAGATCTAGGAACTGTATCTATTGTAGGTAAGACAGGTTTAGATGTAAATGATGCTAACACTGGTTCCTTAGGTGAGAACGTGGGTGTTAGAGCTACACCACTATATGATAACGGTGTATTCTATCTTGAACAGTCTTCAGGTACTGGAACACAACTAACAGTTAGGGCTGAAGATGGTGGTGTGGCTGGTAATGTAGACTCTAAGATGTACCTAGGAAGATACTTCCAAATGGGTTCTGAGATTATCAGAGTTGCTAGTAAGAACTTTGATGGAGCCAATAACAATATCGTAACTGTTATCCGTGGTGCTCTTGGTACCGTTGTTAGCAACCTTCCCATTAATACTAAGGTGAAGGCAATCAGACCTTCCGCACTAGAACTTAGAAGACCTTCTATTCTACGTGCCTCAGGTCACACCTTTGAATATCTTGGTTATGGTCCTGGTAACTATTCCACTTCATTACCACAACTACAGGTTAAGCAACTCCCAGATGATGAAATTTACCTAGTACAGGCTCAGGAACTATCCTGTGGTCAGGTTGTTTATACTGGTATGAGTGATAATGGTGACTTCTATATCGGTAATACCAAGTATTCCGCAACCTCAGGAACACAATCAACCTTTGATGTTCCCATCCCAACTGTTGCTGGTCAACCAGGTAGTTCTAATAATGTTGTGTTTGATGAAGTTATCATCAACCGTCGTCTATTCGTATCTGGTGGTGAAACTAATGAGGTTCAGTCACAGTTTGATGGTCCTGTTAAGTTTACCCAGTCTGTTACTATTCAGAACAATCTTTTCGTAACTGGTACAACTCAACTCAATAGAATTGAGATCACCAGTACAGAGAACGCAACCAGTTCTGCTAATGGTGGAGCACTAACTATCAGAGGTGGTGCTGCTATTGGTAAAGACTTCTATGTTGGTGGTGAAATGTACACCAACGCATATCAAATAGAAGATACAAGTGCAGTTCTTGAAATTGGTACTAACCAGTCATCTAAGGATATCTCTGTTGGTGGTTCAACTGATACAGATAGAGTTGTTTTTAATACAACTAAACTAGCAACAGGTGAAGGTGCTGAAGAGGTAGTTAACGCAGACGCTGGTGTTGTTGTTGAGGGTGGATTAGTTGTTCGTGA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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
23e03c92ffa343511957028c0313a1d43c67bd5c8faa7431299cd9cdf056dbc9
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community | Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. | 2015-03-20 | — | GenBank |