Protein

UniProt accession
H6BI49_9CAUD [UniProt]
Protein name
Structural protein
RBP type
TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,9344

Protein sequence
MANRIQLRRGSATQWSNANPTLAQGELGIELDTGRIKIGDGVTAWNSLRYERPIESVSATANTLVQRDADGNFSAGTITASLIGNASTASRLSSTRQIQLSQDVTGSGVFDGSANLNINAVLGLVPSLPHYDGTDTSSGTYTKVVVDAKGRITNASNPTTIQDYGLDGTVVGQSAQPYDLDLISLTNLPDGAAGFGIVTRTSTGNITVRDIVTASTQRIIVDNGDGIGGNPAIDLANTTVVPDPTTYSDGNYNTESLTSVTSVGAKGEPVGTQTVNTVKFTVDKYGRLQSATNVPIATATEGSKYPTYSAGASYSRYDIIEEGGNVYQAIQDILAGSGAPAHTDSSDTGGWRFLASAATEQKGLASFAQEDFDVDNNGHVTIAAAGVDNTQLQNNRIIFTDQNTVQEFELDNELTTATAHTGFDYLNYIKVNDTSGNLLFGANNTGDGGAGEIDINVRSYFSDPDITLDGIVAQTLDKTGDGDLTLQLTQNTASNRNFNILTTNAGSGTSNIIVTAEDTVQISASQAAGKVWVEDARFQDNYIATTNATLNLDPGDDRAVTGTVRVWGDLQVDGTTTTVNSTTLQVDDPIVTLGGDTAPVANDNLDRGVEFRYYDSAAKLGFYGYDASYSDLAGHTGGYRFLYDATNTSEVFSGTDAGIIAGNLKLTTNTNSTSNTTGDLVLAGGAGIGQDVNIGGLLDVDSTLRVHSTSRFDDSMVIQGASKTLQLNNGTGTTRIELQSTTGNADFYGIVNITNDLNINTNKFNVASATGNTLIAGTLGVTGQTTLTGALDLNNTLNVSGFTYLESTDEPQIALNSGTGLYEIQNSDYGAFRFNGGGYIEGDFMFNSDVYVNGTVVQKEDETAVFNRQNYLNVRYILYAGSSSARTPSYATDTTTNLRVFGGAGIATDLHIGDDLYIGKLNSSDTIEFQVVGESGNTTIGRSGAGTNSVGTLTVHGDVTFNRDLFANGNITLGNATSDTLTVQANSEFNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLYVLGNTNIDGTLDVDSNFAVRSGTTDKFTVASASGNVATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSIRNGSAIEKFSVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTFGVSGIVTSTNNTQQSINGNSIALDGAARFSGGVGVAKNLAVGEDLMVYGDFNIVGNQVINGTTTYNARIDITNTAEADSLSDNNVAFQVDGGGIIRKKLWAGGDFTVYDTANARNAFFVDVSTGDATLHNTLTVGGDLIVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTAPTTNDGKDRGVEFRYYDGSAKVGFFGFDRSSSQFTFLTDSTNVSEVHTGTDAALRAGSLNLTGTGTILDVDANANIDGTLTVDGQIISQVTSGPALVIPNTTKINNLNADLLDGYTTATANTASTVVVRDASGDFAAGTITASLAGNATTASRLQTARTITIDGVVDGSVSFNGSSNVTISTTYNDADITALAAMAGTGLVTRTAANTYAQRSVTATAASGITITNADGVSGDITINVASASTNASNNLVLRDASGNFAAGTITASLVGNVTGNVTGNVTGDLTGQADGADRVVTQEVTTNFDYPIVFASARFTTPTNTQIYTEASGGAAATYNPSTKTLEVETIKCDTISPRDPGAIQFNINANSVTATIGFTGDLTGDVTGDVTGNADTATVADTATQVATQTVQTNFNQEHFLPFVVSNSASVINQSVLTDGGATYNPFQNRITAQTFAGDLTGDVTGNVDGNVAGEVTLEGTVPATATDPGTAGDVRYDADYVYVCVATNTWKRSALATW
Physico‐chemical
properties
protein length:1806 AA
molecular weight: 187465,41410 Da
isoelectric point:4,13853
aromaticity:0,06866
hydropathy:-0,16318

Domains

Domains [InterPro]
IPR041352
5–43
IPR041352
H6BI49_9CAUD
1 1806
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-RIM8 A.HR1
[NCBI] 		869724 Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > Neptunevirus srim18 >
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFB17583.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JF974288 [NCBI]
CDS location
range 83158 -> 88578
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAGTTAAGACGTGGCTCGGCTACGCAGTGGAGTAATGCAAACCCCACTCTAGCTCAAGGCGAGTTGGGAATCGAACTTGATACGGGTCGTATCAAAATCGGTGATGGTGTTACCGCATGGAACTCATTGAGGTATGAGAGACCGATTGAATCTGTGTCAGCAACTGCCAATACTTTGGTGCAACGTGATGCCGATGGAAATTTCTCGGCAGGAACAATCACAGCATCCTTAATTGGTAATGCTTCTACTGCATCTAGACTGTCATCTACACGCCAGATTCAGTTGTCTCAAGACGTTACTGGTTCTGGTGTTTTTGATGGTTCTGCTAACTTAAATATTAATGCTGTTCTTGGATTAGTGCCATCGTTACCACATTACGATGGTACAGATACTTCTAGTGGCACTTACACAAAAGTTGTAGTTGATGCCAAGGGTAGAATAACCAATGCTTCCAATCCAACCACTATTCAAGACTACGGACTAGATGGCACTGTTGTTGGTCAATCTGCTCAACCATATGACCTCGATTTAATATCGCTCACAAATCTTCCTGATGGTGCCGCAGGTTTTGGTATTGTTACCCGAACATCTACAGGTAACATTACCGTTAGAGATATTGTAACTGCTTCGACACAACGCATCATTGTTGATAATGGTGATGGTATTGGCGGCAATCCCGCAATCGATTTAGCAAACACTACTGTTGTTCCAGACCCAACAACATATAGTGATGGTAACTATAATACAGAATCGTTAACTTCAGTAACTAGTGTTGGTGCCAAAGGAGAACCAGTAGGAACTCAAACAGTAAATACTGTCAAATTTACTGTTGATAAGTACGGTCGTCTTCAATCTGCTACAAATGTACCAATTGCTACTGCTACCGAAGGTAGCAAGTATCCTACATATAGTGCTGGGGCATCTTATTCCCGATATGACATCATCGAAGAAGGTGGCAACGTTTATCAAGCCATTCAAGATATTCTTGCGGGTTCTGGTGCCCCAGCTCATACTGATAGCAGCGATACTGGAGGATGGAGGTTCCTCGCGTCTGCGGCAACAGAGCAGAAGGGACTGGCTAGCTTTGCACAGGAAGATTTCGACGTTGACAACAACGGGCATGTCACCATTGCCGCCGCTGGTGTAGATAACACCCAATTACAGAATAATAGAATTATCTTTACTGACCAGAACACTGTTCAAGAGTTTGAGTTAGATAACGAACTCACTACTGCTACAGCACATACTGGTTTTGATTATCTTAACTATATTAAAGTTAATGACACGAGTGGTAATTTACTGTTCGGCGCTAATAATACAGGTGACGGTGGTGCTGGTGAGATTGATATCAATGTACGCTCGTACTTCAGCGATCCTGATATCACTCTTGATGGTATTGTTGCTCAAACCCTGGACAAGACTGGAGATGGTGACCTCACTCTTCAATTAACACAGAATACTGCTTCTAACAGAAACTTCAACATCCTGACAACAAATGCTGGTTCTGGAACTAGCAACATTATTGTCACTGCTGAAGATACTGTTCAAATTAGTGCATCTCAAGCAGCAGGTAAAGTTTGGGTAGAAGATGCACGTTTCCAAGATAATTATATTGCTACAACAAATGCAACTCTCAACCTTGATCCTGGTGATGATAGGGCGGTTACTGGAACCGTCAGAGTTTGGGGTGATTTACAGGTTGACGGCACCACGACGACGGTCAATTCGACGACCCTTCAGGTTGATGACCCCATTGTTACTCTTGGTGGTGATACTGCTCCTGTTGCTAACGATAATCTCGATAGAGGCGTTGAGTTCAGATATTATGATAGTGCAGCAAAGCTTGGATTCTACGGTTACGATGCTTCGTATTCTGATCTCGCAGGTCATACAGGAGGATACCGATTCCTCTACGATGCTACAAACACTTCTGAAGTCTTCTCTGGAACAGATGCAGGCATCATCGCTGGTAACCTTAAACTAACTACCAACACTAACTCCACCTCCAATACAACTGGCGACCTTGTACTTGCTGGTGGTGCTGGTATCGGTCAGGATGTTAATATTGGTGGTCTTCTGGATGTTGACAGCACTCTGCGCGTCCACAGCACCTCTCGCTTTGATGACAGCATGGTCATCCAAGGTGCTTCTAAGACACTGCAACTGAATAATGGTACTGGTACAACTCGTATTGAGTTGCAATCTACAACTGGTAATGCTGATTTCTATGGTATCGTCAATATTACCAATGACCTTAACATCAACACTAATAAATTTAATGTTGCTTCTGCAACTGGTAACACTCTCATTGCTGGTACACTTGGAGTAACTGGTCAGACTACTTTAACTGGTGCTCTTGACCTTAACAACACTCTGAATGTTTCTGGATTTACATATCTGGAAAGTACAGACGAACCTCAGATTGCTCTGAATTCTGGCACTGGTCTGTATGAGATTCAGAACAGTGACTATGGTGCATTCCGATTTAATGGTGGTGGATACATTGAAGGCGACTTCATGTTTAACTCCGATGTTTATGTCAACGGTACTGTAGTTCAGAAAGAAGACGAAACCGCAGTATTCAACAGACAAAACTACCTGAACGTTCGTTATATTCTATATGCAGGTTCTTCTTCTGCACGCACACCTTCTTATGCAACAGACACTACAACTAACTTAAGAGTTTTTGGTGGTGCTGGTATTGCAACTGACCTTCACATCGGTGATGACCTGTATATCGGTAAACTCAACAGTAGCGATACTATTGAATTCCAAGTCGTCGGTGAAAGCGGCAACACTACAATCGGTCGCTCTGGTGCAGGCACTAACTCTGTAGGTACACTGACTGTCCATGGTGATGTAACATTCAACAGAGACCTGTTTGCTAATGGCAACATCACTCTTGGTAACGCAACTAGCGATACTCTGACTGTCCAAGCAAACTCCGAGTTTAATGGCACGGTTGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTTAGAAACGGCACAACCGACAAGTTCTTTGTTGACAACGTAACAGGTAACACTGATATTCAAGGAACTTTATACGTATTGGGTAATACCAATATCGATGGTACTTTAGATGTTGACTCCAACTTTGCTGTTAGAAGTGGCACTACAGACAAATTTACTGTTGCTTCTGCTTCTGGTAACGTTGCAACTGATGGTACTCTGGTCGTCCAAGGTCAAACAACTATTAACGATTCTTTGATTGTTGATGCTGCTAATGAAGTTTTCTCTATCAGAAATGGTTCTGCTATTGAAAAGTTTAGTGTTGATGCAGATAACGGTAATACCAACATCATTGGTACTCTGACCGTTGGTGATGCAACTCAGATTAATGATACCTTCGGCGTATCTGGTATTGTAACCTCAACCAATAATACTCAACAATCTATTAATGGCAATTCTATTGCTCTTGACGGTGCTGCAAGATTCTCGGGTGGTGTTGGTGTTGCTAAGAACTTAGCAGTTGGTGAAGACCTTATGGTCTACGGGGACTTCAACATTGTTGGTAATCAGGTCATCAATGGTACTACCACTTATAATGCACGAATTGATATTACAAATACTGCTGAAGCAGACTCTCTTAGTGATAATAACGTTGCATTCCAAGTTGATGGTGGCGGTATTATTAGAAAGAAACTTTGGGCGGGTGGAGACTTCACTGTATATGATACTGCAAACGCTAGAAATGCATTCTTTGTTGATGTAAGCACTGGCGATGCCACCCTACACAATACACTTACTGTTGGTGGAGACTTAATTGTAAATGGCACAACCACTACTGTTAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTTTGGGTGGTGACACAGCACCAACAACTAACGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAGTGGGTTTCTTCGGATTCGACAGGTCGTCCTCCCAATTCACATTCCTAACAGATTCTACCAATGTATCTGAAGTTCACACTGGCACAGATGCTGCTCTTCGTGCTGGTAGCCTGAATCTGACTGGCACTGGCACCATTCTTGACGTTGATGCTAATGCCAACATCGATGGCACTCTGACTGTTGATGGTCAGATTATCTCTCAGGTTACATCTGGTCCTGCTCTGGTTATTCCTAACACTACTAAGATTAATAACCTGAATGCTGACTTGCTGGATGGTTATACAACTGCAACTGCTAATACTGCAAGTACGGTTGTTGTCAGAGATGCTTCGGGAGATTTTGCTGCAGGAACTATCACTGCTTCCCTGGCGGGCAATGCTACTACTGCATCTAGATTGCAGACAGCACGCACAATCACAATCGACGGAGTTGTTGATGGCAGCGTTTCCTTTAATGGTTCTTCCAACGTAACAATCAGCACCACCTACAACGACGCAGACATCACTGCACTCGCCGCTATGGCAGGTACAGGTCTGGTTACCAGAACTGCTGCTAATACCTACGCACAACGCTCTGTGACCGCCACAGCAGCGTCTGGAATCACGATTACTAATGCAGACGGTGTATCAGGCGACATCACCATTAACGTCGCTTCTGCGAGCACCAACGCATCAAATAACCTCGTTCTTCGTGATGCCTCTGGTAACTTTGCTGCTGGCACAATTACGGCAAGTTTGGTTGGTAACGTAACTGGTAATGTCACTGGTAACGTAACTGGAGACTTGACTGGTCAGGCAGATGGTGCAGATAGAGTAGTTACTCAAGAGGTTACAACTAATTTTGATTACCCAATTGTTTTTGCATCGGCAAGATTTACAACTCCAACTAATACTCAGATTTATACAGAGGCTTCGGGTGGTGCAGCTGCAACATATAATCCATCTACTAAAACTTTAGAAGTAGAAACAATTAAGTGTGATACAATTTCACCTAGGGATCCTGGAGCCATCCAATTCAATATTAATGCAAATAGTGTTACTGCTACTATTGGATTTACTGG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Gene Ontology

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Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.