Protein

UniProt accession
H6BI42_9CAUD [UniProt]
Protein name
Gp7
RBP type
TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,5475

Protein sequence
MNINKVSQAVTNQLPDFISSEYELFSKFIEYYYKSQEKTGLGQNILNNFLNYLDIDQLDVDILDGQTVLVENIDKDSTRIAVESVDQFLAQNGTILIGDEIIFYEDVISAPNIAISPGISYQQVLLKSIELQSPLSQFDDVKRDFVLLSQDRPVSPPTAKHLLVRTYSRYLVPEVDFQVSGNSIVFTEAPRTALTSDGADETSIQFLSGFLENSIIDLDDISPSFGDGITKFRITSGGEKFVPEVDEYVIAYYDGRLLLPKIDYVFDKDLFIFRSLVPLKGRRLDLFYIDAPIPSFGTGSFANARVNDDGEIYSVVTKNAGSGYRFEYPPSINIESESGSGAAAVALINGVKNLQLISGGIGYSDTNPPVVQIESPTKDGSTVAIITATVENGSVSKLTLENSGSGYTSVPRISFKQPGGAVVSTPTIVNGSISGTIDIISTGSGYSTPPEIYIDEPTGPNGIKASLRTNLSSDGEVTSVTILNPGQGYETVPRIKIIEPVGAQVLETVVDADGRLINIELLDGGSGYSDVPSVYIIDDRVSNTGQYLGGSGAKAAASIFNGRITDINVTEFGTGYSQEFPPRVVIQAPPQASASVDIGINEITGFEVLESGSGYSKAQFLGCARAASAITGYTEDGNAIFKSNTSASAATIDTEVKCLDAVFVKRILDKYTEQLLPDVPKLDYNAIDVRTAIKNIKSFYSTKGTTFSIEYLFKLLYGESVSVSYPKDQIIKPSAATWSINTILRATLVSGDPRNIQDALIQQEADIADINVKDASALVENYIAIETANITIYELVLSEETIKGSFVVPYKTRLAEPLDENTSIITVDSTIGWPERNGEFVLGGTEVVQYKEKSLNQFIECTRGSAGSIGGVGNSRVWDSATEVTSNFRVYLNKGTSQEVVMNIVGIVDAQQTNLTDTGSYYLPGDKLTVAKLGGTGEQPLLTTWLYNVKKLIEIESITFGGINDRFATVTCSNNHGLLVGDEVTIYGANPILYNGTFIVTSRDTDTVFQYQLPQTALVEPQGNILVSVNLNKGKSIDTAINNNISVYTTNIQNSFFNDNYVYVASTGIPNYNVGPFPGSALFPGNQRKLNRFPQSPVTISTKDAITPGPIGAWVNGVSIWSYKSTSSKTFGPIVDVSITNSGQGYDAASPPNITISGGGGSGATAEVIVNGSVTNIEVEDGGSGYTSSPLVSIVGGGGSGASATAIITKGSVSNILITNGGTGYTSQPTITIVGGGGTGATASALVRGPIKSVNLLSQGTSYTSTPNVLISSGTGAVAQAIVNNGRIISIAIISAGSGYTTAPEVQIQGEGFGAKARAIIDTEGENAGRVTGVEILNRGIGYVQGTTVINLTSIGQDAQFNANVFQWTYNLQETATFDSSQGSVFEGFNNQYGGEYAHLSNPQRLRYILGDNLFENTSGQIKEQETQLEHSPIIGWAFDGTPIYGPYGYQDPTDQTSDLIRVSSSYRLKTNLVYDQITNPNPYRIEGSPLSVDPAGTFIEDYVYSFASGDLDQYNGRFCKTPEYPEGRYCYFVTIDNTEDGNPVFPYVLGPSFNSVVDSWNLVDSAIQQNIPRGVVRFRDPYQNVDIDVERIPNASTNALTLENGDLLLFEVEDENRDGIISQDETDDPDQILEEPPLQIFDYFPKVKVESKVDIEVETISRFENASITDFVIENAGENYQVNDKLIFNNDGTGGTGASARISRINGENIISYDYEYVNGRNYGVLRTEQPHNLVEGDTIFIDYEENIETTNKTFVVRQFRGIEQIVIDQTGSGYNDEIPPTIIIDGDGESAELEAVVDSVGSIKNVNILNSGNGYTENPRVILSHPQVFKKADYFVTKIDNQEYVKVNDCFVNESKESFICGKTLDDGGNTVAFVAKLSAGGVKEWQKTLELNSGLQYAEFQKVYVNGNNVWVVGVNKPNISILNAYNPDIIVAKYTQSNDGLSATLQFQKAYAGISGGTRSDNVTKIVPLGEDRVAIAGYTDTNSSSPYDGFIAILDAVGTFNVKRKISSTNLSEKVVDVAFDSSGTVYAILETATSKNAADINFAIARLTLSSTALTINWVKEIKNNAYSFLNTSLTIDEFDEMYVSSTLQLKSDDTTRDSFWVGKFNTDGVNLWNYRYLAPGRDINLVQKSKIDIFNELNVAFTRTNHLTDKKTVDTVKLNYKGEIVNHVTTDFIDNTVEGITAHAMDVDVSGDVYIFGQTSWNRNEAIFSFDTDLSDTTEHHTLTTIGLNNSVVNENSILKIYGFQTGQPTIWENSAAKVAGTSLGDALSDDFTIDFLLYKDNTNGNAETLVANQQTLLSIGDATDTTGGLWLYYNTDGSADNGRVELVVANSSNTIASSAAAVGTNSNLFANDTWQLISLKKEDNNFKVYINGVEQISGNVNNTSLGSKDIHIGNIPGFAGTGGFIEDNQGQFFIDALRIRNRGVAVTYPSDFTTLPSAGAIALNHTWVDTAWFDQQLSRYDYIDYLGFGYKVDKNADADRLGTFDNLINSDYGFVRTSVGAVTGSSLVITTTGYALGESGLQTLDYSDAATTMSEGTVTLTYSRDIWSSRTSTVPSPGSQKLKVTANVRDRYYFKTFDIVKIDNVQELTINQQFAFTVGAKLLLKNGETFVNSGYITKVDYENLKVFVAINNNDWDNDIDVYELSTEQFNEQDTFGITGPVPNDINEIRQTFPEVNNTTPGTFDIDLSNYDAPEEVGGTNNLDQYAKFKSFSEFDYSVRIDEVGGSSTYSVGSVVVLEPGQITWNASYSTAQITGLTGVLKITLIANLAKILQVTSVSNSDIVYVISNTLHYLTEGEQLYIDGNPSRTVNSVVYDEYDGSFPVDEIISPVEFTYKLLQTAVSLPSSNASSVSVFVKSPTLKMYYGHQYLFDLSHSSLLGGNLSFSKDPVYKLEYSFNSIERIGTPGVTGQGVPTPSVKLKVTRDVITNISYYFDPSRTGEDSPIIPESYLDVTFSPYVGTFTITSTSGGTITRGDDVFRFLLVNQPERAATTANASYSTSSVKAVGSIGQIRIVNPGGFYTKLPVVSRIQSTRNIERVEIEDPGTEYAVGVYTGVPIQGDGEGGIVAITVADGTDDEGGLIPGQIQRVVVTSPGKGYTTAFIDIESVNGILGPGLTGSGAIVNVIIPPFGTGASIFTLGEEIGKIKNLKNNNFGFDYPHDYTLRPEITFPINAQLTATSILDSITVTNPGSGYTQAPEVVIIGGGGSGAIAEATIKNGRLNTIEVKDPGAGYSSQPSVQLKSSFNYVINLDLGLLQFAFPHGIQNGAEVTLNVIDTGDGIEFPLAAGAIGRLNGTTTYYAIAGTENSLEDDQLKIALTAANAELGDSINFVNAGTGRQQVLTSSFGATAEANVVTSTFLEGELVYQGISLDFATATGYVSTNSGWQVGPRILKLVDYTGTFVEGERITGVISKSSGIISTLKIARGVLEVGSITKTTGQFIDDVGKPSEIVQKIQDSYYYQDFSYAVKSAVSINEWKDILIRNVHPASFKVFGELSISDYTTIPNKATDFELTKSVQLANEAIVPNIQNFTLVEPIYSEFNNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRIDDISNLFDGVRTAFPLTVNNGDPVIANANQLVVILNGVVQTPEVAFEIQSDSIVFSEPPQPPASVRYVNVEIQQIPTVDITFSSISGIFPNIGNTLTGTGSGAKLTVTKVVGNTVSGFFTVGTAFTSNELVLGSTTGFASLFASQTDVVNNGLFIFGESITNLEGNTAVIEDVNLESGSETPLAKLRYGVGISTTSLEVINYTSTVDEPQNVPAGTFVVNQDYQIGREIVRIISITQNADSSTLIVERARLGTSAGSIQQDTPFYGTSITITNKLTLSKTAGTYQSTPGLYDIVLNDVIVAAQSGVVARITSTSPYRDPATNAVVEQVEISEGSSFFALLFDRLSSVTYPNIVLDDISQSQISVVEFDDNVTDFNTKFPENELVTNYVLPYDNETGDFEDNEFIKNFKIEYGNKTGNFVSSENLTVRKLSLTNEVGDGFFSAGQVLRTQDTKAQIIGYNQARKTVFLGKIGRTQSNGADYHEVVFNNSAQLDTAQKKYGSASLLLANTTTDYVSVATSSEFGFGTGEFTLECWIRPTTVVGTQYILDLRASAADTAPKLYLEGDELRYGSAGTDHITGGTLIANTWHHVSVAKSGTTTKLFLDGIQVGSDFTDNNDYGSSQPIIIGADYANANSIDGHIDELRVSNSARYTAAFTPRNGMFQGDVNVVLLIHFDGADTQTYTEDWSGSQDFTFGELLNNDAILATTNANGGAVVAGFTGNSQRYLDAANLLEANKNFIAKEVVYLTKQQYPSLVIPGGDINCEDDIRDVVQQICEDLRNGSNSHMWDAAAIYVDRTVPAAVTLNHIETEVEETIWAYNKVGDMIPYIVNNVLWTVSGSHGVSQFTDTTITDSNNTVYTQFTPTAATYDPATGDMVLTIGAHSLTTSNQIKIDGGSIVFTCDSDDNATQHAYPRIDDPFYNKVIGIDAVDATTITVNVGESPEDAQFVHTFVSADTNAISVLNYTTGDCADVVSTADNLLNILVDTLDQANQVTPVDHLGGVTRVEPEYEYLGGTVDGFYEVPFAADYNDTGSNTLYSNIIGTLDMNRFYDAANLIRANRAAIVDKASYDLIQRYPDLALDMPRNEDGSGDGTDRCKVDLGLILDAIANDIEIGGNLKTVTASKFYIGANNRLLHIRLQIWQSVYAHTRLAYYAKQAITGDLDNTNTNALIIGDWGITNDPGNCANVQTAIDTLVSKLNDTIAPTGDDFNIAADRLYFNRDYIAEEAVGLLDQEFTYVLNNISYNAFSYPDGSAGRDTCIRDLKNYILPSIISDLQTGGNNSTIEAIEFYLTANLQLNHIEEQLSATIFAIEQLRNLGLKAIQNLLYDKGFGAIDPQYAAVSTTTSAYRDALSMTDVQSVMARYGELVDIAVSILSPAGKPGRFASQQLLFNKNYYRSEIANIVDGQFGAGSWQYNEFIDGLVENLS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Physico‐chemical
properties
protein length:6395 AA
molecular weight: 690970,38960 Da
isoelectric point:4,36890
aromaticity:0,09617
hydropathy:-0,13263

Domains

Domains [InterPro]
IPR023366
957–1029
IPR023366 IPR025924 IPR013320 IPR049419
IPR006558
4100–4227
IPR006558
H6BI42_9CAUD
1 6395
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-RIM8 A.HR1
[NCBI] 		869724 Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > Neptunevirus srim18 >
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFB17576.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JF974288 [NCBI]
CDS location
range 48783 -> 67970
strand +
CDS
ATGAATATCAATAAGGTCTCCCAAGCAGTTACGAATCAACTCCCAGACTTTATTTCGTCGGAGTATGAACTGTTTTCAAAGTTTATTGAATATTACTACAAGTCTCAGGAAAAGACTGGTCTAGGACAGAATATCCTCAATAACTTTCTTAATTATTTGGATATCGACCAATTGGATGTTGATATTCTAGATGGTCAGACGGTTCTTGTAGAAAATATTGATAAAGATTCCACAAGAATTGCCGTTGAAAGTGTCGATCAGTTTTTGGCGCAAAACGGCACTATTCTGATTGGAGACGAAATTATCTTCTATGAAGATGTAATTTCTGCTCCAAATATCGCTATTAGTCCTGGTATTTCGTATCAGCAGGTATTATTAAAGTCTATTGAACTTCAGAGTCCACTCTCGCAGTTTGATGATGTTAAGAGAGATTTTGTTTTACTGAGTCAAGATAGACCTGTTTCTCCACCAACAGCAAAGCATTTACTAGTAAGAACTTATAGTAGGTACTTAGTTCCTGAAGTAGATTTCCAAGTATCTGGGAATTCTATTGTTTTTACTGAAGCTCCAAGAACAGCATTAACTTCCGATGGTGCTGATGAAACTAGCATTCAGTTTCTTAGTGGATTTCTCGAAAACAGTATCATTGACCTTGATGATATTTCTCCTTCTTTTGGTGATGGTATCACTAAATTCAGGATTACCAGTGGTGGAGAAAAGTTTGTTCCAGAAGTTGATGAGTATGTCATTGCATATTATGATGGAAGACTTTTACTTCCAAAAATTGATTATGTTTTTGATAAGGACCTATTTATTTTTAGAAGTCTTGTTCCCTTAAAAGGAAGAAGACTCGACCTCTTTTACATCGATGCCCCCATTCCATCTTTCGGAACTGGTTCATTTGCAAATGCTAGAGTTAATGATGATGGGGAAATTTATTCTGTTGTAACTAAAAATGCTGGTTCTGGATATAGATTTGAATATCCACCTTCAATCAATATTGAATCCGAATCTGGAAGTGGAGCAGCTGCTGTTGCTCTTATCAATGGTGTTAAGAATTTACAATTAATTTCGGGTGGTATCGGTTATAGTGACACCAATCCACCAGTAGTTCAGATTGAGTCACCAACAAAAGACGGTTCAACAGTTGCTATTATTACAGCAACTGTTGAAAATGGAAGTGTTTCTAAATTAACGTTAGAAAATTCTGGAAGTGGGTATACGTCTGTACCAAGAATTAGTTTTAAACAACCTGGTGGGGCAGTAGTTTCTACCCCAACCATCGTCAATGGTTCTATTTCTGGAACTATTGACATTATTTCTACTGGTTCTGGGTATAGTACACCACCAGAAATCTATATCGATGAACCAACTGGTCCTAACGGAATCAAGGCATCTCTTAGAACTAATTTAAGTTCTGACGGAGAAGTTACATCTGTAACAATTTTAAATCCTGGTCAAGGATATGAGACTGTTCCCAGAATTAAAATTATCGAACCAGTTGGTGCTCAAGTTTTAGAAACCGTAGTTGATGCTGATGGTCGTTTAATTAATATCGAACTTCTTGATGGTGGAAGTGGATATAGTGATGTACCTTCGGTGTACATCATTGACGATAGAGTAAGTAATACTGGACAATATCTTGGTGGTTCTGGTGCTAAAGCCGCAGCATCCATTTTCAATGGAAGAATTACTGACATTAATGTTACGGAATTTGGTACTGGATATAGTCAGGAATTTCCACCAAGAGTTGTTATCCAGGCACCTCCACAGGCATCTGCTTCTGTAGATATTGGTATTAATGAAATTACTGGATTTGAAGTATTGGAGTCTGGTTCTGGATATTCCAAAGCGCAGTTTCTTGGATGTGCTAGAGCAGCTAGTGCAATTACTGGATATACCGAAGATGGAAATGCAATCTTCAAATCTAATACTAGTGCTTCTGCTGCAACTATTGATACTGAAGTAAAGTGCTTAGATGCGGTATTTGTCAAGAGAATTCTAGACAAGTATACCGAACAACTTTTGCCAGATGTTCCTAAACTCGATTATAATGCAATCGATGTAAGAACGGCAATTAAAAATATTAAGTCTTTCTATTCTACTAAGGGAACTACCTTTAGTATTGAATACCTATTCAAGTTGCTTTATGGTGAGTCTGTAAGTGTTTCTTATCCAAAAGACCAAATTATTAAACCATCTGCTGCTACTTGGTCGATTAACACCATTTTACGCGCAACTTTAGTTAGTGGTGACCCAAGAAATATTCAAGATGCTCTAATTCAACAAGAAGCAGATATTGCCGATATCAACGTTAAAGATGCTAGTGCTCTTGTTGAAAACTATATTGCAATTGAAACTGCTAACATAACTATCTACGAATTGGTTCTTTCTGAAGAAACCATTAAAGGTTCCTTTGTCGTACCCTATAAAACAAGACTTGCTGAACCACTGGATGAAAATACTAGTATCATCACAGTTGACTCGACGATTGGTTGGCCAGAAAGAAACGGTGAGTTCGTTCTTGGTGGAACGGAAGTTGTACAATATAAAGAAAAATCCTTAAACCAGTTTATTGAATGTACTAGAGGTTCTGCTGGTTCTATCGGTGGTGTTGGAAATTCTAGAGTTTGGGATTCTGCTACTGAAGTAACTTCTAATTTTAGAGTATATCTCAATAAGGGAACTTCTCAAGAAGTTGTTATGAATATTGTTGGTATCGTTGATGCACAACAAACTAATTTGACGGATACTGGTTCTTATTATCTTCCTGGTGATAAACTTACTGTTGCAAAACTCGGTGGCACTGGAGAACAACCATTATTGACAACCTGGTTGTACAACGTTAAAAAATTAATTGAGATTGAGTCTATTACTTTCGGCGGAATTAATGATAGATTCGCAACAGTTACTTGTAGTAATAATCATGGTTTGTTGGTTGGCGATGAGGTCACCATTTATGGCGCTAACCCTATCCTGTATAATGGAACCTTTATTGTAACATCTAGAGATACTGATACTGTTTTCCAGTATCAACTACCTCAAACTGCTTTGGTTGAACCTCAGGGCAACATTCTTGTGTCTGTCAACCTTAATAAGGGTAAGTCTATTGATACGGCAATTAATAACAATATTTCTGTATATACAACTAATATTCAGAACTCGTTCTTTAACGATAATTACGTCTATGTTGCTTCCACTGGTATTCCTAACTATAATGTTGGACCTTTTCCAGGGTCGGCACTTTTCCCTGGAAACCAAAGAAAGTTAAATAGATTTCCCCAGTCTCCAGTAACAATCTCCACTAAAGATGCTATTACACCAGGACCTATTGGTGCATGGGTAAATGGCGTATCAATTTGGTCTTATAAATCGACTTCAAGTAAAACTTTTGGACCAATTGTCGATGTCTCGATTACCAATTCTGGTCAGGGGTATGATGCTGCATCTCCACCAAATATTACAATTTCTGGTGGCGGCGGTTCGGGCGCTACCGCTGAAGTTATTGTTAACGGTTCTGTAACGAATATTGAGGTTGAGGATGGTGGTTCTGGGTATACTTCCTCTCCATTGGTCTCCATCGTCGGTGGAGGCGGTTCTGGAGCGTCTGCGACAGCAATTATTACCAAGGGTAGTGTATCTAATATTTTAATTACCAATGGAGGTACTGGATACACGTCTCAACCAACTATTACTATTGTTGGTGGGGGTGGAACTGGCGCTACTGCGTCGGCATTAGTTCGTGGTCCAATTAAATCTGTAAATCTTTTATCTCAAGGAACATCCTATACTTCTACTCCAAATGTCTTAATTAGTTCTGGTACTGGAGCAGTTGCTCAGGCAATTGTGAATAATGGTCGTATTATCTCTATTGCTATCATTTCTGCTGGTAGTGGTTACACTACTGCCCCAGAAGTTCAGATTCAAGGTGAAGGTTTTGGTGCTAAAGCAAGAGCGATTATCGATACTGAAGGGGAAAATGCTGGTAGAGTTACTGGTGTTGAAATTCTTAACAGGGGTATTGGATATGTTCAGGGCACGACTGTCATTAATCTGACTTCTATTGGACAAGATGCACAGTTTAATGCAAATGTATTCCAGTGGACTTATAACTTACAAGAAACAGCAACATTTGATTCTTCTCAAGGTTCTGTTTTTGAAGGATTTAACAATCAGTATGGTGGCGAATATGCACACCTGTCCAACCCACAAAGACTTCGTTATATTTTAGGTGATAATCTATTTGAAAATACTAGTGGTCAAATTAAAGAGCAGGAGACTCAATTAGAGCACTCTCCTATTATTGGATGGGCATTTGATGGAACTCCCATCTATGGTCCATATGGATATCAGGATCCAACTGACCAGACATCCGACCTTATCCGAGTTTCTAGTTCTTATAGATTGAAGACTAACTTAGTTTATGACCAAATTACAAATCCCAATCCATATAGAATTGAAGGTTCGCCCCTGTCTGTAGACCCAGCAGGAACATTTATTGAAGACTATGTTTACTCCTTTGCATCTGGAGACTTAGACCAATATAATGGTAGATTCTGTAAGACACCTGAATATCCAGAGGGTAGATATTGTTACTTCGTTACCATTGATAACACTGAAGATGGTAATCCTGTATTCCCCTATGTTTTAGGTCCAAGTTTTAACTCTGTTGTAGACTCTTGGAACCTTGTAGACTCTGCAATTCAGCAAAATATTCCTCGCGGGGTTGTTCGCTTTAGAGACCCATATCAAAATGTTGATATTGATGTAGAAAGAATTCCTAATGCATCTACAAATGCATTGACATTGGAAAATGGCGACCTACTGTTATTTGAAGTTGAGGATGAAAATAGAGACGGTATCATTAGTCAAGATGAGACGGATGACCCAGATCAAATTTTAGAAGAACCTCCTCTCCAAATCTTTGATTACTTCCCCAAGGTAAAAGTTGAATCTAAAGTTGACATTGAAGTCGAGACTATCAGTAGATTTGAAAATGC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