Protein
- UniProt accession
- A0A1D7SBW5_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- LamG-like jellyroll fold domain-containing protein
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,5475
- Protein sequence
-
MNINKVSQAVTNQLPDFISSEYELFSKFIEYYYKSQEKTGLGQNILNNFLNYLDIDQLDVDILDGQTVLVENIDKDSTRIAVESVDQFLAQNGTILIGDEIIFYEDVISAPNIAISPGISYQQVLLKSIELQSPLSQFDDVKRDFVLLSQDRPVSPPTAKHLLVRTYSRYLVPEVDFQVSGNSIVFTEAPRTALTSDGADETSIQFLSGFLENSIIDLDDISPSFGDGITKFRITSGGEKFVPEVDEYVIAYYDGRLLLPKIDYVFDKDLFIFRSLVPLKGRRLDLFYIDAPIPSFGTGSFANARVNDDGEIYSVVTKNAGSGYRFEYPPSINIESESGSGAAAVALINGVKNLQLISGGIGYSDTNPPVVQIESPTKDGSTVAIITATVENGSVSKLTLENSGSGYTSVPRISFKQPGGAVVSTPTIVNGSISGTIDIISTGSGYSTPPEIYIDEPTGPNGIKASLRTNLSSDGEVTSVTILNPGQGYETVPRIKIIEPVGAQVLETVVDADGRLINIELLDGGSGYSDVPSVYIIDDRVSNTGQYLGGSGAKAAASIFNGRITDINVTEFGTGYSQEFPPRVVIQAPPQASASVDIGINEITGFEVLESGSGYSKAQFLGCARAASAITGYTEDGNAIFKSNTSASAATIDTEVKCLDAVFVKRILDKYTEQLLPDVPKLDYNAIDVRTAIKNIKSFYSTKGTTFSIEYLFKLLYGESVSVSYPKDQIIKPSAATWSINTILRATLVSGDPRNIQDALIQQEADIADINVKDASALVENYIAIETANITIYELVLSEETIKGSFVVPYKTRLAEPLDENTSIITVDSTIGWPERNGEFVLGGTEVVQYKEKSLNQFIECTRGSAGSIGGVGNSRVWDSATEVTSNFRVYLNKGTSQEVVMNIVGIVDAQQTNLTDTGSYYLPGDKLTVAKLGGTGEQPLLTTWLYNVKKLIEIESITFGGINDRFATVTCSNNHGLLVGDEVTIYGANPILYNGTFIVTSRDTDTVFQYQLPQTALVEPQGNILVSVNLNKGKSIDTAINNNISVYTTNIQNSFFNDNYVYVASTGIPNYNVGPFPGSALFPGNQRKLNRFPQSPVTISTKDAITPGPIGAWVNGVSIWSYKSTSSKTFGPIVDVSITNSGQGYDAASPPNITISGGGGSGATAEVIVNGSVTNIEVEDGGSGYTSSPLVSIVGGGGSGASATAIITKGSVSNILITNGGTGYTSQPTITIVGGGGTGATASALVRGPIKSVNLLSQGTSYTSTPNVLISSGTGAVAQAIVNNGRIISIAIISAGSGYTTAPEVQIQGEGFGAKARAIIDTEGENAGRVTGVEILNRGIGYVQGTTVINLTSIGQDAQFNANVFQWTYNLQETATFDSSQGSVFEGFNNQYGGEYAHLSNPQRLRYILGDNLFENTSGQIKEQETQLEHSPIIGWAFDGTPIYGPYGYQDPTDQTSDLIRVSSSYRLKTNLVYDQITNPNPYRIEGSPLSVDPAGTFIEDYVYSFASGDLDQYNGRFCKTPEYPEGRYCYFVTIDNTEDGNPVFPYVLGPSFNSVVDSWNLVDSAIQQNIPRGVVRFRDPYQNVDIDVERIPNASTNALTLENGDLLLFEVEDENRDGIISQDETDDPDQILEEPPLQIFDYFPKVKVESKVDIEVETISRFENASITDFVIENAGENYQVNDKLIFNNDGTGGTGASARISRINGENIISYDYEYVNGRNYGVLRTEQPHNLVEGDTIFIDYEENIETTNKTFVVRQFRGIEQIVIDQTGSGYNDEIPPTIIIDGDGESAELEAVVDSVGSIKNVNILNSGNGYTENPRVILSHPQVFKKADYFVTKIDNQEYVKVNDCFVNESKESFICGKTLDDGGNTVAFVAKLSAGGVKEWQKTLELNSGLQYAEFQKVYVNGNNVWVVGVNKPNISILNAYNPDIIVAKYTQSNDGLSATLQFQKAYAGISGGTRSDNVTKIVPLGEDRVAIAGYTDTNSSSPYDGFIAILDAVGTFNVKRKISSTNLSEKVVDVAFDSSGTVYAILETATSKNAADINFAIARLTLSSTALTINWVKEIKNNAYSFLNTSLTIDEFDEMYVSSTLQLKSDDTTRDSFWVGKFNTDGVNLWNYRYLAPGRDINLVQKSKIDIFNELNVAFTRTNHLTDKKTVDTVKLNYKGEIVNHVTTDFIDNTVEGITAHAMDVDVSGDVYIFGQTSWNRNEAIFSFDTDLSDTTEHHTLTTIGLNNSVVNENSILKIYGFQTGQPTIWENSAAKVAGTSLGDALSDDFTIDFLLYKDNTNGNAETLVANQQTLLSIGDATDTTGGLWLYYNTDGSADNGRVELVVANSSNTIASSAAAVGTNSNLFANDTWQLISLKKEDNNFKVYINGVEQISGNVNNTSLGSKDIHIGNIPGFAGTGGFIEDNQGQFFIDALRIRNRGVAVTYPSDFTTLPSAGAIALNHTWVDTAWFDQQLSRYDYIDYLGFGYKVDKNADADRLGTFDNLINSDYGFVRTSVGAVTGSSLVITTTGYALGESGLQTLDYSDAATTMSEGTVTLTYSRDIWSSRTSTVPSPGSQKLKVTANVRDRYYFKTFDIVKIDNVQELTINQQFAFTVGAKLLLKNGETFVNSGYITKVDYENLKVFVAINNNDWDNDIDVYELSTEQFNEQDTFGITGPVPNDINEIRQTFPEVNNTTPGTFDIDLSNYDAPEEVGGTNNLDQYAKFKSFSEFDYSVRIDEVGGSSTYSVGSVVVLEPGQITWNASYSTAQITGLTGVLKITLIANLAKILQVTSVSNSDIVYVISNTLHYLTEGEQLYIDGNPSRTVNSVVYDEYDGSFPVDEIISPVEFTYKLLQTAVSLPSSNASSVSVFVKSPTLKMYYGHQYLFDLSHSSLLGGNLSFSKDPVYKLEYSFNSIERIGTPGVTGQGVPTPSVKLKVTRDVITNISYYFDPSRTGEDSPIIPESYLDVTFSPYVGTFTITSTSGGTITRGDDVFRFLLVNQPERAATTANASYSTSSVKAVGSIGQIRIVNPGGFYTKLPVVSRIQSTRNIERVEIEDPGTEYAVGVYTGVPIQGDGEGGIVAITVADGTDDEGGLIPGQIQRVVVTSPGKGYTTAFIDIESVNGILGPGLTGSGAIVNVIIPPFGTGASIFTLGEEIGKIKNLKNNNFGFDYPHDYTLRPEITFPINAQLTATSILDSITVTNPGSGYTQAPEVVIIGGGGSGAIAEATIKNGRLNTIEVKDPGAGYSSQPSVQLKSSFNYVINLDLGLLQFAFPHGIQNGAEVTLNVIDTGDGIEFPLAAGAIGRLNGTTTYYAIAGTENSLEDDQLKIALTAANAELGDSINFVNAGTGRQQVLTSSFGATAEANVVTSTFLEGELVYQGISLDFATATGYVSTNSGWQVGPRILKLVDYTGTFVEGERITGVISKSSGIISTLKIARGVLEVGSITKTTGQFIDDVGKPSEIVQKIQDSYYYQDFSYAVKSAVSINEWKDILIRNVHPASFKVFGELSISDYTTIPNKATDFELTKSVQLANEAIVPNIQNFTLVEPIYSEFNNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRIDDISNLFDGVRTAFPLTVNNGDPVIANANQLVVILNGVVQTPEVAFEIQSDSIVFSEPPQPPASVRYVNVEIQQIPTVDITFSSISGIFPNIGNTLTGTGSGAKLTVTKVVGNTVSGFFTVGTAFTSNELVLGSTTGFASLFASQTDVVNNGLFIFGESITNLEGNTAVIEDVNLESGSETPLAKLRYGVGISTTSLEVINYTSTVDEPQNVPAGTFVVNQDYQIGREIVRIISITQNADSSTLIVERARLGTSAGSIQQDTPFYGTSITITNKLTLSKTAGTYQSTPGLYDIVLNDVIVAAQSGVVARITSTSPYRDPATNAVVEQVEISEGSSFFALLFDRLSSVTYPNIVLDDISQSQISVVEFDDNVTDFNTKFPENELVTNYVLPYDNETGDFEDNEFIKNFKIEYGNKTGNFVSSENLTVRKLSLTNEVGDGFFSAGQVLRTQDTKAQIIGYNQARKTVFLGKIGRTQSNGADYHEVVFNNSAQLDTAQKKYGSASLLLANTTTDYVSVATSSEFGFGTGEFTLECWIRPTTVVGTQYILDLRASAADTAPKLYLEGDELRYGSAGTDHITGGTLIANTWHHVSVAKSGTTTKLFLDGIQVGSDFTDNNDYGSSQPIIIGADYANANSIDGHIDELRVSNSARYTAAFTPRNGMFQGDVNVVLLIHFDGADTQTYTEDWSGSQDFTFGELLNNDAILATTNANGGAVVAGFTGNSQRYLDAANLLEANKNFIAKEVVYLTKQQYPSLVIPGGDINCEDDIRDVVQQICEDLRNGSNSHMWDAAAIYVDRTVPAAVTLNHIETEVEETIWAYNKVGDMIPYIVNNVLWTVSGSHGVSQFTDTTITDSNNTVYTQFTPTAATYDPATGDMVLTIGAHSLTTSNQIKIDGGSIVFTCDSDDNATQHAYPRIDDPFYNKVIGIDAVDATTITVNVGESPEDAQFVHTFVSADTNAISVLNYTTGDCADVVSTADNLLNILVDTLDQANQVTPVDHLGGVTRVEPEYEYLGGTVDGFYEVPFAADYNDTGSNTLYSNIIGTLDMNRFYDAANLIRANRAAIVDKASYDLIQRYPDLALDMPRNEDGSGDGTDRCKVDLGLILDAIANDIEIGGNLKTVTASKFYIGANNRLLHIRLQIWQSVYAHTRLAYYAKQAITGDLDNTNTNALIIGDWGITNDPGNCANVQTAIDTLVSKLNDTIAPTGDDFNIAADRLYFNRDYIAEEAVGLLDQEFTYVLNNISYNAFSYPDGSAGRDTCIRDLKNYILPSIISDLQTGGNNSTIEAIEFYLTANLQLNHIEEQLSATIFAIEQLRNLGLKAIQNLLYDKGFGAIDPQYAAVSTTTSAYRDALSMTDVQSVMARYGELVDIAVSILSPAGKPGRFASQQLLFNKNYYRSEIANIVDGQFGAGSWQYNEFIDGLVENLS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- Physico‐chemical
properties -
protein length: 6395 AA molecular weight: 690970,38960 Da isoelectric point: 4,36890 aromaticity: 0,09617 hydropathy: -0,13263
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Synechococcus phage S-RIM8 [NCBI] |
756278 | Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > Neptunevirus srim18 > |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO11117.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349289
[NCBI]
CDS location
range 48784 -> 67971
strand +
strand +
CDS
ATGAATATCAATAAGGTCTCCCAAGCAGTTACGAATCAACTCCCAGACTTTATTTCGTCGGAGTATGAACTGTTTTCAAAGTTTATTGAATATTACTACAAGTCTCAGGAAAAGACTGGTCTAGGACAGAATATCCTCAATAACTTTCTTAATTATTTGGATATCGACCAATTGGATGTTGATATTCTAGATGGTCAGACGGTTCTTGTAGAAAATATTGATAAAGATTCCACAAGAATTGCCGTTGAAAGTGTCGATCAGTTTTTGGCGCAAAACGGCACTATTCTGATTGGAGACGAAATTATCTTCTATGAAGATGTAATTTCTGCTCCAAATATCGCTATTAGTCCTGGTATTTCGTATCAGCAGGTATTATTAAAGTCTATTGAACTTCAGAGTCCACTCTCGCAGTTTGATGATGTTAAGAGAGATTTTGTTTTACTGAGTCAAGATAGACCTGTTTCTCCACCAACAGCAAAGCATTTACTAGTAAGAACTTATAGTAGGTACTTAGTTCCTGAAGTAGATTTCCAAGTATCTGGGAATTCTATTGTTTTTACTGAAGCTCCAAGAACAGCATTAACTTCCGATGGTGCTGATGAAACTAGCATTCAGTTTCTTAGTGGATTTCTCGAAAACAGTATCATTGACCTTGATGATATTTCTCCTTCTTTTGGTGATGGTATCACTAAATTCAGGATTACCAGTGGTGGAGAAAAGTTTGTTCCAGAAGTTGATGAGTATGTCATTGCATATTATGATGGAAGACTTTTACTTCCAAAAATTGATTATGTTTTTGATAAGGACCTATTTATTTTTAGAAGTCTTGTTCCCTTAAAAGGAAGAAGACTCGACCTCTTTTACATCGATGCCCCCATTCCATCTTTCGGAACTGGTTCATTTGCAAATGCTAGAGTTAATGATGATGGGGAAATTTATTCTGTTGTAACTAAAAATGCTGGTTCTGGATATAGATTTGAATATCCACCTTCAATCAATATTGAATCCGAATCTGGAAGTGGAGCAGCTGCTGTTGCTCTTATCAATGGTGTTAAGAATTTACAATTAATTTCGGGTGGTATCGGTTATAGTGACACCAATCCACCAGTAGTTCAGATTGAGTCACCAACAAAAGACGGTTCAACAGTTGCTATTATTACAGCAACTGTTGAAAATGGAAGTGTTTCTAAATTAACGTTAGAAAATTCTGGAAGTGGGTATACGTCTGTACCAAGAATTAGTTTTAAACAACCTGGTGGGGCAGTAGTTTCTACCCCAACCATCGTCAATGGTTCTATTTCTGGAACTATTGACATTATTTCTACTGGTTCTGGGTATAGTACACCACCAGAAATCTATATCGATGAACCAACTGGTCCTAACGGAATCAAGGCATCTCTTAGAACTAATTTAAGTTCTGACGGAGAAGTTACATCTGTAACAATTTTAAATCCTGGTCAAGGATATGAGACTGTTCCCAGAATTAAAATTATCGAACCAGTTGGTGCTCAAGTTTTAGAAACCGTAGTTGATGCTGATGGTCGTTTAATTAATATCGAACTTCTTGATGGTGGAAGTGGATATAGTGATGTACCTTCGGTGTACATCATTGACGATAGAGTAAGTAATACTGGACAATATCTTGGTGGTTCTGGTGCTAAAGCCGCAGCATCCATTTTCAATGGAAGAATTACTGACATTAATGTTACGGAATTTGGTACTGGATATAGTCAGGAATTTCCACCAAGAGTTGTTATCCAGGCACCTCCACAGGCATCTGCTTCTGTAGATATTGGTATTAATGAAATTACTGGATTTGAAGTATTGGAGTCTGGTTCTGGATATTCCAAAGCGCAGTTTCTTGGATGTGCTAGAGCAGCTAGTGCAATTACTGGATATACCGAAGATGGAAATGCAATCTTCAAATCTAATACTAGTGCTTCTGCTGCAACTATTGATACTGAAGTAAAGTGCTTAGATGCGGTATTTGTCAAGAGAATTCTAGACAAGTATACCGAACAACTTTTGCCAGATGTTCCTAAACTCGATTATAATGCAATCGATGTAAGAACGGCAATTAAAAATATTAAGTCTTTCTATTCTACTAAGGGAACTACCTTTAGTATTGAATACCTATTCAAGTTGCTTTATGGTGAGTCTGTAAGTGTTTCTTATCCAAAAGACCAAATTATTAAACCATCTGCTGCTACTTGGTCGATTAACACCATTTTACGCGCAACTTTAGTTAGTGGTGACCCAAGAAATATTCAAGATGCTCTAATTCAACAAGAAGCAGATATTGCCGATATCAACGTTAAAGATGCTAGTGCTCTTGTTGAAAACTATATTGCAATTGAAACTGCTAACATAACTATCTACGAATTGGTTCTTTCTGAAGAAACCATTAAAGGTTCCTTTGTCGTACCCTATAAAACAAGACTTGCTGAACCACTGGATGAAAATACTAGTATCATCACAGTTGACTCGACGATTGGTTGGCCAGAAAGAAACGGTGAGTTCGTTCTTGGTGGAACGGAAGTTGTACAATATAAAGAAAAATCCTTAAACCAGTTTATTGAATGTACTAGAGGTTCTGCTGGTTCTATCGGTGGTGTTGGAAATTCTAGAGTTTGGGATTCTGCTACTGAAGTAACTTCTAATTTTAGAGTATATCTCAATAAGGGAACTTCTCAAGAAGTTGTTATGAATATTGTTGGTATCGTTGATGCACAACAAACTAATTTGACGGATACTGGTTCTTATTATCTTCCTGGTGATAAACTTACTGTTGCAAAACTCGGTGGCACTGGAGAACAACCATTATTGACAACCTGGTTGTACAACGTTAAAAAATTAATTGAGATTGAGTCTATTACTTTCGGCGGAATTAATGATAGATTCGCAACAGTTACTTGTAGTAATAATCATGGTTTGTTGGTTGGCGATGAGGTCACCATTTATGGCGCTAACCCTATCCTGTATAATGGAACCTTTATTGTAACATCTAGAGATACTGATACTGTTTTCCAGTATCAACTACCTCAAACTGCTTTGGTTGAACCTCAGGGCAACATTCTTGTGTCTGTCAACCTTAATAAGGGTAAGTCTATTGATACGGCAATTAATAACAATATTTCTGTATATACAACTAATATTCAGAACTCGTTCTTTAACGATAATTACGTCTATGTTGCTTCCACTGGTATTCCTAACTATAATGTTGGACCTTTTCCAGGGTCGGCACTTTTCCCTGGAAACCAAAGAAAGTTAAATAGATTTCCCCAGTCTCCAGTAACAATCTCCACTAAAGATGCTATTACACCAGGACCTATTGGTGCATGGGTAAATGGCGTATCAATTTGGTCTTATAAATCGACTTCAAGTAAAACTTTTGGACCAATTGTCGATGTCTCGATTACCAATTCTGGTCAGGGGTATGATGCTGCATCTCCACCAAATATTACAATTTCTGGTGGCGGCGGTTCGGGCGCTACCGCTGAAGTTATTGTTAACGGTTCTGTAACGAATATTGAGGTTGAGGATGGTGGTTCTGGGTATACTTCCTCTCCATTGGTCTCCATCGTCGGTGGAGGCGGTTCTGGAGCGTCTGCGACAGCAATTATTACCAAGGGTAGTGTATCTAATATTTTAATTACCAATGGAGGTACTGGATACACGTCTCAACCAACTATTACTATTGTTGGTGGGGGTGGAACTGGCGCTACTGCGTCGGCATTAGTTCGTGGTCCAATTAAATCTGTAAATCTTTTATCTCAAGGAACATCCTATACTTCTACTCCAAATGTCTTAATTAGTTCTGGTACTGGAGCAGTTGCTCAGGCAATTGTGAATAATGGTCGTATTATCTCTATTGCTATCATTTCTGCTGGTAGTGGTTACACTACTGCCCCAGAAGTTCAGATTCAAGGTGAAGGTTTTGGTGCTAAAGCAAGAGCGATTATCGATACTGAAGGGGAAAATGCTGGTAGAGTTACTGGTGTTGAAATTCTTAACAGGGGTATTGGATATGTTCAGGGCACGACTGTCATTAATCTGACTTCTATTGGACAAGATGCACAGTTTAATGCAAATGTATTCCAGTGGACTTATAACTTACAAGAAACAGCAACATTTGATTCTTCTCAAGGTTCTGTTTTTGAAGGATTTAACAATCAGTATGGTGGCGAATATGCACACCTGTCCAACCCACAAAGACTTCGTTATATTTTAGGTGATAATCTATTTGAAAATACTAGTGGTCAAATTAAAGAGCAGGAGACTCAATTAGAGCACTCTCCTATTATTGGATGGGCATTTGATGGAACTCCCATCTATGGTCCATATGGATATCAGGATCCAACTGACCAGACATCCGACCTTATCCGAGTTTCTAGTTCTTATAGATTGAAGACTAACTTAGTTTATGACCAAATTACAAATCCCAATCCATATAGAATTGAAGGTTCGCCCCTGTCTGTAGACCCAGCAGGAACATTTATTGAAGACTATGTTTACTCCTTTGCATCTGGAGACTTAGACCAATATAATGGTAGATTCTGTAAGACACCTGAATATCCAGAGGGTAGATATTGTTACTTCGTTACCATTGATAACACTGAAGATGGTAATCCTGTATTCCCCTATGTTTTAGGTCCAAGTTTTAACTCTGTTGTAGACTCTTGGAACCTTGTAGACTCTGCAATTCAGCAAAATATTCCTCGCGGGGTTGTTCGCTTTAGAGACCCATATCAAAATGTTGATATTGATGTAGAAAGAATTCCTAATGCATCTACAAATGCATTGACATTGGAAAATGGCGACCTACTGTTATTTGAAGTTGAGGATGAAAATAGAGACGGTATCATTAGTCAAGATGAGACGGATGACCCAGATCAAATTTTAGAAGAACCTCCTCTCCAAATCTTTGATTACTTCCCCAAGGTAAAAGTTGAATCTAAAGTTGACATTGAAGTCGAGACTATCAGTAGATTTGAAAATGC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