Protein

UniProt accession
R9TQ12_9CAUD [UniProt]
Protein name
Structural protein
RBP type
TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,9302

Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSAWNTLRYERPVESTSNTANTLVQRDTDGNFSAGTITATLIGNASTAARLASTRQIQLSQDITASGVFDGSANLNLNAELTLVSTLPHYDGTGTPTATYTSVTVDAKGRIINASNPSTLADYNLNGTVEGQSAQPYDLDLVAISGLTTTGIISRTSGGSMATRTITGTATRIAINDGAGLSGNPTIDLIVTAVTPGDYNTESLTSVSGVGGNSEPFGTETVNATKFTVDAYGRLTSATNVPIATATEGSKYPNYDAGTAYSRYAIIQNASKVYQAIADISAGAGAPTHSSGDSGSWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIAAAGVDNTQLQNNRIIFTDGNTVDEFELDNELTTSTAHTGFDYLNYIKINDTSGNLLFGANNTGDSGAGEIDVNVRSYFSDPDITLDGAVAQTLDKTGDGNLTFQLTQNSASARNLSILSTNAGSGTSTVTITAEDVVDIDASDANGKVHVENARFQANYIATTDATMNLDPGDDRAVTGLVRVWGDLQVDGVTTTVNSTTMTVDDVVLTLGGDTAPASDDNLDRGVEFRYYDTQARLGFYGWDTNYTDLGGHEGGYRFLHAATNTSETFAGTDSGIIAGNVKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGAGIGQDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDTMVLRGASKSLQFQNGAGTVKSEIHTTSGNAEFGGIVTVTGATDLNSTLNVASTVNFEDTDEPTVLLSGSTGLYEIQSSDYGSFKFDGGGYVEGDTVFNSDIYLNGQFNQKEDATANYGLRNYLAVRYKMRTGTTAAYTPSYSNHDTSNLRVFGGAGINTTLHVGGTGSGEGLFVGKENSGDTVKFSVLGASGNTDIEGTLNVEGQVTIQDSVIINAANEEFAIQNGSAVDKFTVDTDNGNTLIEGTLNVNGVTDIDADFAVRNGTTDKFTVASATGNTVIEGTLNGKGAADFDSTLNVDGNTTLGGTLTVTGASEFNNTVDVDNNFAVRTSGGVDKFTVASASGNTVTQGTLTVEGETNINETLNVSANGEFFRVRNGNNALQFTVDTDNGNTNVYGTLTVSDATQINDTLGVTGVTSITNSTGQTLTGSYGADGAVRITGGVGVGENLAVGGNMRVYGDFEITGSTTQSGNTGFSGRVSITNTQDVTSFGDNNVSLTTDGGLRVSKNAYVGGDFVVYDDANSRNAFIVDVSTGDATLHNTLTVGGNLVVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDGSAKVGFFGYDRSSDQYTFLVDATNTAEVHSGTDAAVRAGSLRLTSAGTALDVDNNANIDGTLTVDGQIISNVATGSAPFTVASTTKVLNLNADLLDGMTTASAATGSTVVNRDSSGDFAANVITMATSTITGAATVGTTLGVTGAATLSSTLGVTGATTLSSTLGVTGVTTLTGLLNANGGIAVDTNNFTVDGTTGAVVTASTLSVGSTSSFTGAITATGGVVGNVTGNLVAAISTGKTFNPETDSTYNLGASTLRWATAYLDSLNAGTSITTAGTLSVTGTSTFTGEISANGGIALQDTDKATFGDDDDMEIYWSGTQNRIDTEGPFQIRNSNTSSGISFYDGDNTNFMFKALPLGAIELYHSGVKTFETTATGATLTGVLVATSLTGNVTGNVTGTVSSIANHDTDALSEGSSNLYYTDERVDDRVNALIVAGTGITKAYNDVAGTYTLTVTQADIDTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIEHDGSGTLSVTQADIDTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIELSGAGELSVTQADINTDNITEGGTNIFFTNARADARFDTKIAAADTDDLSEGSTNLYFTEARADARVDAGFTAKSTSDLSEGTNQYYTEARVQTKLDNAFAQLQAMLNNLATTTTLTLNLSGDPTPGAVVAVGVSDGGGGGFTAGTAVATSGGTGSSLTVDTTVVGGVITAASVNAGGSDYLISDTVTVTNPNAGKVLSLNLASLAGGSNYVTGTALATTGGSGSASLTVDITAVAGAITNVTINDGGTGYVAGETITIVQPTGADGSNPATGGTVDIATVATNATLTLTDITTMEVGATVTGATSGTTGVITALGTNQITVDTVSGFFKVGEVVSANDVTTLTISSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:2177 AA
molecular weight: 222608,48090 Da
isoelectric point:4,14029
aromaticity:0,06431
hydropathy:-0,13018

Domains

Domains [InterPro]
IPR041352
5–43
IPR041352
R9TQ12_9CAUD
1 2177
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-IOM18
[NCBI] 		754039 Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > Tefnutvirus siom18 >
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGN33584.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ317383 [NCBI]
CDS location
range 75174 -> 81707
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGAAGAGGTGGCGCTCAGGAATGGGCAAACGCTAACCCAACCTTGGCACAAGGTGAACTCGGAATCGAACTTGATACTGGTCGTTTCAAAATCGGTGACGGTGTTTCTGCTTGGAACACGCTGAGATATGAACGCCCTGTTGAGTCTACCTCTAATACGGCAAATACTCTTGTACAGAGAGATACTGATGGCAACTTTTCTGCAGGTACTATTACTGCAACTCTGATTGGTAATGCTTCTACCGCTGCACGTCTGGCATCTACCAGACAAATTCAGTTATCTCAAGACATCACTGCTTCTGGTGTTTTCGATGGTTCTGCAAACCTGAACCTCAATGCTGAACTCACCCTGGTTTCAACTCTTCCCCATTACGATGGTACAGGAACACCTACAGCAACATACACCTCTGTTACTGTAGATGCAAAAGGTAGAATTATCAATGCTTCAAATCCATCTACCCTTGCAGATTATAATCTTAATGGAACTGTAGAAGGTCAATCTGCACAACCATATGACCTTGATCTGGTTGCTATTTCTGGTCTGACAACTACTGGTATTATCTCCAGAACTTCTGGTGGTAGTATGGCAACCAGAACTATCACTGGTACTGCCACAAGAATTGCAATTAATGATGGTGCAGGTCTTTCTGGTAATCCAACAATCGATCTTATTGTTACTGCTGTAACTCCTGGTGATTATAATACAGAATCTCTGACATCTGTAAGTGGTGTTGGTGGTAACAGCGAACCATTTGGCACAGAAACTGTAAACGCTACGAAATTTACAGTTGATGCCTATGGTCGTTTAACAAGTGCAACAAATGTGCCCATTGCTACTGCCACTGAGGGTAGTAAGTATCCTAACTATGATGCAGGGACTGCTTATTCTAGATATGCAATCATTCAGAATGCATCCAAGGTTTACCAAGCGATTGCGGACATTAGTGCTGGTGCTGGTGCTCCTACTCATTCCAGTGGTGATTCTGGATCATGGCGTTACCTCGCGGCTGAAGCAACGGAACAGAAGGGACTGGCTAGTTTTGCACAGGAAGATTTTGACGTTGACGCAAACGGGCACGTTACCATCGCCGCCGCAGGCGTAGATAATACACAACTTCAAAATAATAGAATTATTTTCACCGATGGCAATACCGTCGATGAGTTTGAATTAGATAATGAACTTACAACATCTACAGCGCACACTGGTTTTGATTATCTCAACTATATCAAAATCAATGATACAAGTGGCAATCTTCTGTTTGGCGCTAATAATACAGGGGACAGTGGCGCTGGTGAGATTGATGTTAACGTCCGTTCCTATTTTTCTGATCCTGATATTACTCTTGATGGAGCAGTTGCTCAGACATTGGATAAAACTGGGGATGGCAACCTTACCTTCCAGTTAACACAAAACTCTGCATCTGCTAGAAACCTTAGCATCCTCTCTACAAATGCTGGGTCTGGTACAAGCACAGTTACAATCACTGCAGAAGATGTTGTTGACATTGATGCATCTGATGCAAATGGTAAAGTTCATGTAGAAAACGCAAGATTCCAAGCAAACTACATCGCCACAACCGATGCGACGATGAATCTTGACCCTGGCGATGACCGTGCTGTAACTGGTCTGGTTCGTGTTTGGGGTGACCTCCAAGTTGATGGTGTGACAACAACTGTCAACTCTACAACCATGACAGTTGATGATGTTGTACTCACTCTGGGTGGTGATACTGCTCCTGCTTCTGACGATAACCTCGATCGCGGTGTTGAGTTCCGTTATTATGATACTCAAGCACGTCTTGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTATACTGATTTGGGTGGTCATGAAGGCGGTTATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATACTTCCGAAACTTTTGCTGGTACTGATTCTGGTATTATTGCTGGTAATGTAAAACTCACCACTAATACTAACTCTACTTCCAACACAACTGGTGACCTTGTAGTTGCTGGTGGTGCTGGTATCGGTCAAGATGTAAACATCGGTGGTCTGCTGGATGTTGATGGCACCTTCCGTGCTAACAGCACCTCCCGCTTTGATGACACCATGGTTCTTCGCGGTGCATCTAAGTCACTTCAGTTCCAGAATGGTGCTGGCACTGTTAAGTCTGAAATTCATACAACTTCTGGTAATGCTGAGTTTGGTGGTATCGTTACTGTAACTGGTGCTACCGATCTTAATAGCACCCTTAATGTTGCATCTACAGTTAACTTTGAAGATACTGATGAACCCACTGTTTTACTCAGTGGCAGTACTGGTCTTTATGAAATTCAGTCGAGTGATTATGGTTCGTTTAAATTTGATGGTGGTGGATATGTTGAAGGAGATACAGTCTTTAATAGTGATATCTACCTTAATGGTCAATTTAACCAGAAAGAAGACGCAACAGCGAACTATGGTTTAAGAAACTACCTGGCAGTTCGTTATAAAATGAGGACAGGTACTACTGCTGCCTATACTCCCTCATATTCTAATCACGACACCTCTAACCTAAGAGTCTTTGGTGGTGCTGGTATTAACACAACTCTGCACGTTGGTGGTACAGGTTCTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAAGAGAATAGTGGTGATACCGTTAAGTTCTCCGTTCTTGGTGCATCTGGTAACACTGATATTGAAGGCACACTGAACGTTGAAGGTCAAGTAACTATTCAAGATAGTGTAATCATCAACGCTGCGAATGAAGAGTTTGCAATTCAAAACGGTTCTGCAGTAGATAAGTTTACTGTCGATACTGACAACGGTAACACTTTAATTGAGGGCACACTGAATGTTAACGGCGTAACTGATATTGACGCCGACTTTGCTGTTAGAAATGGCACAACTGATAAGTTTACAGTTGCATCTGCCACAGGTAACACTGTAATTGAAGGCACTCTGAATGGTAAGGGTGCAGCAGACTTTGATAGCACTCTGAATGTTGATGGCAATACTACTCTGGGTGGAACTTTAACAGTTACTGGTGCTTCTGAGTTCAACAACACTGTTGATGTTGATAATAACTTTGCAGTTAGAACTTCTGGTGGTGTAGATAAGTTTACTGTTGCTTCTGCTTCAGGTAACACCGTTACTCAGGGTACACTCACGGTTGAAGGCGAAACTAATATCAACGAAACTCTGAATGTTTCTGCAAATGGTGAGTTCTTCAGAGTTAGAAACGGCAATAATGCTCTGCAGTTTACTGTCGATACTGACAATGGTAATACCAATGTATACGGTACATTAACGGTTAGTGATGCGACTCAAATCAATGACACTTTGGGTGTTACTGGTGTTACTTCTATTACTAATTCCACTGGTCAGACTTTAACTGGAAGTTATGGTGCTGACGGCGCAGTTCGCATTACTGGTGGTGTCGGAGTTGGAGAGAATCTCGCTGTTGGTGGCAACATGCGTGTCTACGGTGACTTTGAAATCACTGGTAGCACAACTCAGTCTGGTAACACTGGATTCAGCGGTCGTGTTTCGATCACCAATACACAAGACGTTACATCTTTTGGTGATAACAATGTTTCTCTCACAACCGATGGCGGTCTTAGAGTAAGTAAGAATGCATATGTTGGCGGTGATTTCGTTGTATATGATGATGCAAACTCCAGAAATGCATTTATTGTTGATGTAAGCACTGGTGATGCAACTCTACACAATACACTGACAGTTGGAGGAAACTTAGTTGTAAATGGAACGACCACTACTGTTAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTTTGGGTGGTGACACAGCACCAGCGTCTAACGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTATGACGGCTCTGCGAAAGTGGGCTTCTTCGGATATGACAGATCCTCCGACCAATACACATTCTTAGTTGATGCAACTAACACTGCCGAAGTTCATTCTGGTACAGACGCTGCAGTTCGTGCTGGTTCTCTGAGGCTCACTAGTGCTGGCACTGCACTTGACGTTGATAACAATGCTAACATCGATGGTACTTTGACTGTTGATGGTCAAATCATTTCTAATGTTGCTACGGGAAGTGCTCCTTTTACAGTTGCTTCTACAACTAAAGTTCTTAATCTGAATGCTGACCTTTTGGATGGCATGACCACAGCATCTGCAGCAACAGGATCTACAGTTGTTAATCGTGATTCTTCTGGTGATTTTGCTGCTAACGTCATCACGATGGCAACAAGCACAATCACTGGTGCAGCGACGGTTGGTACAACTCTCGGCGTCACTGGTGCAGCAACATTAAGTTCCACACTTGGTGTTACAGGTGCAACGACACTTAGCAGTACCTTAGGAGTTACTGGTGTTACCACACTTACTGGTCTTCTTAATGCCAATGGTGGCATTGCAGTTGATACAAATAACTTTACTGTCGATGGAACAACAGGTGCAGTTGTAACAGCAAGTACATTGAGTGTTGGTAGCACGTCTTCCTTTACAGGTGCTATTACAGCAACTGGTGGAGTTGTTGGTAATGTTACTGGTAATTTGGTTGCTGCCATTTCTACTGGTAAGACTTTTAACCCAGAAACTGATAGTACATATAACTTGGGTGCTAGCACACTGAGATGGGCAACTGCATATCTTGATTCTCTTAACGCTGGTACATCCATTACAACTGCTGGCACTCTGTCTGTAACAGGTACTTCTACCTTTACTGGTGAGATTAGTGCCAATGGTGGCATCGCTCTCCAAGATACCGATAAAGCGACATTCGGTGATGACGATGATATGGAGATTTACTGGAGTGGCACTCAGAATAGAATTGATACTGAAGGTCCTTTCCAGATTAGAAATAGCAATACCTCATCTGGTATCTCCTTCTATGATGGCGACAATACTAACTTTATGTTCAAAGCGTTACCTCTGGGTGCGATTGAACTCTATCATAGTGGTGTAAAAACCTTTGAAAC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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.