Protein
- UniProt accession
- R9TQH3_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Structural protein
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,4622
- Protein sequence
-
MLQESFLGADIELYRSQLSGKIIEGLTTGVKAKVLYSISSTESDKGYITLYVKYIESGGEQNTQQTFQNNEQLVTDSEITFGTTLIEIGSPFAQLLPTSALQIGSVAYVQSGVYFIRGFFVDVDYQYILLDQYGSNPSYRVGLDIQESIITPEDDLSLNDNAAGTSNYAAPGAHRFRITTRLIKKLLTDDADKNFIELLRINNSKVEKIVDRSAYDELEKSIALRTFEESGNYVVKDFGIKVRQGLNNNFNNGVYNSGATTQSGNIASEDKYAVEFGPGIAYVKGYRVKKLAPAYIDLDKPRDTDSAQNVIIPFEMGNFSNVENLYGFLNTSGSTVGSAYQTLELRDTFTSSPGTSAGDIIGYARGATLEHIDDGADNEYGNADDKYRLNVFDVQMFTILELASNVDISAGSLVVGSSSGARGYLVDAVSSDDHINLYQVEGTFSVNEMLTIDGEQLDTISALHTYQYSDTRQIVAKDETTTAVEFTADVILEDIQIVQGTTFTYSTTSADILTVDTVSAADGSRTEGTYLIGATDYTTDANGSGATFSIAVDNTGDATVTIIKGGFSYVVDETITVTDAQLGGGGGANLTFDVATVGATIKGLQSNFALDLRSGDQIYFSDTQFVTVDKVDQDNLTGTASTNIFEFANQIVKVDPGSASPSDGVYNAILRYRSKLFDVANADLISPMPKKYVKSISDESMIVRRTFDAQTVASNSISITLPENEQFQSISEENYVITVLAGTNSTHPVGDQITIDTTNTGVIGYTFFTSTDRTTLQIDNLTNVTSVKVTATISKNVTVRKTKSGNQMFVLKVNKTTKNIDKQNYNLTYSNIYGTRIEDRDLSLGLKDCYRMHAVYESFDENDPVLPSVTLVEPVFFETGSIVTGRTSKARAKVVDFNSGSLKLSLVYLDGGMTSGETIDGVDSNGDPITAIVNDSEGSVVNGSKVVTDNYFLELNQTGFIYDISKIVRKKGTSIPIRKLLVVADYYSHSSTGDYFGGQSYLNTNYDEIPFFGAKYLTDYLDFRPGVKNLFSGSGTVGSPAFVNCSTFDFKSRIFNTSGTPSATIFDIPKLNSNFRCDFDWYLPRTDKCFVTPSGEFQVVKGNSSERPESPDNLKDAMLLATISHKPYGFDPESDVVISRSDNKRYTMRDIGTIERRLNQVEYQTSLNMLESDTFNTQILDADGKNRLKNGFMVDDFTDHSKSDTGHEDFAAALDFQKGECHPAHYTTNVSLEINDNLSQNYQQTGPIITLPYTELAIINQPYASRVENINPFNVFTYIGRIVLTPGSDDWIETERLPANVTQIEGDFEAVAAEMNVDQNGFLPIQWNSWTTTWKSEEFIGSSTVHNPGWLQEDIGRSPRPDVWGGRGMRRINVVETFEVSGEQVRTGIRTQVVPRIEMESLGDALISATVIPWIRSRNIELDVARLKPRTQVYSFFDGQNVSAYMTPKLIEIIKDPAVDTRTNSTPFVIGETVTGQTSGCVFKVAAPNDLFEFNPYTDEELPSSYASTTAYLSIDTEALAKQAVGDFYGNMQVGEVLIGTSGATAVVKDRRMITDRFGKMKTSFFIPTPKIDTNPRWSTGTRTLRLTTSDSDSRIAGAVASSAQVEYEARGTLNVVQENILAVRNAEIVQDTVNQEQTIQSTRTEVRQVGWYDPLAQSFIVDQDGGVFLTSVDVYFFTKDSAIPISMQIRTMENGYPTTTILPFSDITLEPSEVQLSETAAVATKFTFRAPVYIPQSQEHCFVLLSDSNEYQIWISRMGDIDVTGDRTISEQPYAGVLFKSQNASTWTADQYEDIKFIINRAEFNNQVNSTLVLNNAELGLGNRGKLRLRNDAIESFLPELILTMNNTTLPYTAGSRVYQKTTLAEATIKTVQTTTAGVLLTINDINGTWASGSESGGIVSNGIVSSKTLSTIVVTGRSGLFEVGETITGGTSGSTAEIVTFDAGTETLTLRYVSKTFSSGEQITGGTSNVTANLSTVTPPTYSGDAVESSVIANAFPVSTPTYSSAQRKVRVNHSNHNMHDLSNNVVIEGIKSEVTDTFLTAAISASDTTVTVNDASAFHKIINGVAISSSNVGYIMINSEIMSYSAISSDNKTITVNERGLDGTTAVSHIDESAVKCYNFDGIPLIEINKTHEGILNPTLDSYELSTSSIARLGIRSGGNAIVATQNIQYDILVPQVERMLLSKTTLSSRINTISGTSINDGSALSQASFSNDGVFSDIILSKDNYLYQPALICSAINESSELSGAKSFRMDLTLGSETTNVSPIIDTDRMSITLVSNRINSPSDPNSAKLSVGDEHEAVYITRVASLTNPSGAIKLYFTGYRPSNTEIKVLYRTRPVGSTTPISQYGFEFFPTEDANIPLTTERRVYREYSYEVSGLNFDQYQIKVVFVSPNQSLTPIIRDIRAIALAV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2413 AA molecular weight: 263938,54220 Da isoelectric point: 4,65900 aromaticity: 0,08952 hydropathy: -0,22561
Domains
Domains [InterPro]
IPR032096
1054–1296
1054–1296
1
2413
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Synechococcus phage S-CAM8 [NCBI] |
754038 | Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > Neritesvirus scam8 > |
Host |
Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI] |
32051 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGN33927.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ634178
[NCBI]
CDS location
range 80564 -> 87805
strand +
strand +
CDS
ATGCTTCAAGAATCATTCTTGGGTGCAGATATTGAACTGTATAGAAGTCAATTGTCAGGTAAGATCATCGAAGGTCTTACCACAGGTGTTAAGGCAAAGGTTCTCTATAGTATTTCTTCTACAGAATCCGATAAGGGTTATATTACACTATATGTTAAGTACATTGAATCTGGTGGTGAACAAAATACTCAGCAAACATTTCAAAATAATGAGCAGTTAGTTACCGATAGTGAGATTACTTTCGGTACAACTCTGATTGAGATTGGTTCTCCTTTTGCTCAGTTACTTCCTACTTCTGCTCTACAAATTGGTTCTGTTGCATATGTTCAGAGCGGTGTGTACTTCATCAGAGGTTTCTTTGTTGATGTAGATTATCAATATATTCTTCTTGATCAGTATGGAAGCAACCCCTCCTATCGTGTTGGTCTCGACATTCAAGAATCGATCATCACTCCAGAAGATGACCTTAGTCTCAACGATAACGCTGCTGGAACATCTAACTATGCTGCACCTGGTGCTCATAGATTTAGAATCACTACCAGACTTATCAAGAAACTTCTGACGGATGATGCAGATAAAAACTTTATTGAATTGTTGCGTATTAACAATTCTAAGGTAGAAAAGATTGTTGACCGAAGTGCATACGATGAACTGGAAAAGAGTATTGCTCTCAGGACATTTGAAGAATCTGGTAATTATGTTGTAAAAGATTTTGGAATTAAAGTTCGTCAAGGATTGAATAACAACTTTAATAACGGTGTATATAACTCTGGTGCAACAACTCAAAGCGGTAACATTGCTTCTGAGGATAAGTATGCTGTAGAGTTTGGTCCTGGTATTGCTTATGTCAAGGGATATAGAGTTAAGAAATTAGCACCAGCGTATATCGATTTAGATAAACCCAGAGATACTGATTCTGCACAGAACGTTATTATTCCATTTGAGATGGGTAACTTCTCAAATGTTGAAAATCTCTATGGTTTCCTTAATACATCTGGTTCTACTGTTGGAAGTGCATACCAAACTTTAGAACTTCGTGATACATTTACTTCTTCTCCTGGAACTTCTGCTGGAGATATTATCGGATATGCTCGTGGTGCTACCCTAGAGCACATAGATGATGGTGCTGACAATGAGTATGGTAATGCTGACGATAAGTATAGATTGAACGTCTTTGATGTTCAAATGTTTACTATTTTAGAACTTGCATCTAATGTTGATATTTCTGCAGGATCTTTAGTAGTTGGATCTTCTAGTGGTGCTAGAGGATATCTGGTTGATGCTGTATCCTCCGATGATCACATCAACTTATATCAAGTAGAAGGAACTTTCTCCGTCAACGAAATGCTCACAATTGACGGTGAACAACTTGATACTATTAGTGCGTTACACACATATCAATACTCAGATACTCGTCAAATTGTTGCTAAAGATGAAACTACAACTGCTGTAGAATTCACCGCAGACGTTATCCTTGAAGATATTCAAATTGTTCAAGGAACTACATTTACATATAGCACTACCTCTGCTGATATTCTGACTGTAGACACTGTTAGTGCTGCAGATGGATCTAGAACTGAGGGTACTTATTTAATTGGTGCAACTGATTATACTACAGATGCAAATGGTTCTGGTGCAACATTTAGTATTGCAGTTGATAATACTGGTGACGCCACTGTTACAATAATCAAAGGTGGTTTTAGTTACGTAGTAGATGAAACAATTACTGTAACTGATGCTCAACTTGGTGGTGGCGGCGGTGCTAATTTAACTTTTGATGTTGCAACAGTTGGAGCAACAATTAAAGGTCTTCAATCTAACTTTGCTCTAGACCTCAGATCTGGAGATCAGATTTATTTCAGCGACACCCAATTTGTTACTGTAGATAAGGTCGATCAAGATAATTTGACTGGTACAGCGTCTACAAACATTTTTGAATTTGCAAATCAAATTGTCAAAGTAGATCCTGGTTCTGCATCTCCTTCTGATGGAGTTTATAATGCTATCTTACGTTATAGATCTAAACTTTTTGATGTTGCTAATGCTGATCTTATCAGCCCCATGCCTAAGAAGTATGTAAAGAGCATTTCTGACGAATCCATGATTGTCAGAAGAACATTTGATGCTCAAACAGTTGCTTCTAACTCAATCTCTATCACACTTCCTGAGAACGAGCAGTTCCAATCTATTTCTGAAGAAAACTACGTCATTACTGTTCTTGCTGGCACTAATTCTACTCATCCTGTTGGGGATCAAATTACAATTGATACCACAAATACTGGAGTAATAGGATATACTTTCTTCACTTCAACTGATAGAACAACATTACAAATCGATAATCTGACAAATGTTACTTCGGTTAAAGTTACTGCAACTATTTCTAAGAACGTAACTGTCAGAAAGACAAAATCTGGAAATCAGATGTTTGTTCTGAAAGTCAATAAAACTACTAAAAATATTGATAAGCAGAATTATAATCTCACATATTCAAATATCTATGGAACTAGAATTGAAGATAGAGATCTCAGTCTTGGTTTAAAAGATTGCTACCGTATGCACGCTGTCTATGAATCTTTTGATGAGAATGATCCTGTACTTCCTTCAGTAACATTAGTTGAACCTGTATTCTTTGAGACTGGTTCTATCGTTACTGGCAGAACTTCAAAGGCTCGTGCTAAGGTTGTAGATTTTAATTCTGGTAGTCTAAAACTCAGTTTGGTTTACCTTGATGGTGGAATGACTTCTGGAGAGACTATTGATGGTGTTGATAGTAATGGAGATCCAATTACCGCTATTGTAAATGATAGTGAAGGATCTGTTGTTAATGGATCTAAAGTTGTAACAGACAATTATTTCTTAGAATTAAATCAAACTGGATTTATCTATGATATTTCTAAAATTGTACGTAAAAAAGGTACATCTATTCCAATTAGAAAACTTTTAGTTGTTGCTGATTATTACTCACATTCTTCTACAGGAGATTATTTTGGTGGTCAGTCCTATCTGAACACAAATTATGATGAGATTCCATTCTTTGGAGCTAAGTATCTTACCGACTATCTAGATTTCCGTCCTGGTGTCAAAAATCTTTTCAGTGGAAGTGGCACTGTAGGTTCTCCTGCTTTCGTAAATTGTTCTACTTTTGACTTTAAGTCGAGAATATTCAATACTTCTGGTACTCCTTCTGCAACTATTTTTGATATTCCTAAGTTGAATAGCAATTTTAGATGTGATTTTGATTGGTATCTTCCCAGAACGGATAAGTGTTTTGTTACTCCATCTGGTGAATTCCAAGTTGTTAAAGGAAATTCTTCAGAAAGACCTGAATCTCCAGACAATCTTAAAGATGCAATGCTGTTGGCAACAATCAGTCACAAACCATATGGTTTTGATCCTGAATCTGATGTTGTTATTAGTCGTTCTGATAATAAAAGATACACTATGCGTGATATCGGAACGATTGAGAGACGTTTGAACCAGGTAGAATACCAAACCTCTCTCAATATGCTTGAGTCGGATACTTTCAATACTCAAATTTTAGATGCTGATGGTAAAAATCGTCTTAAGAATGGTTTTATGGTAGATGATTTTACTGATCATAGTAAGTCAGATACTGGTCATGAAGATTTTGCTGCAGCATTAGATTTCCAAAAAGGTGAGTGTCACCCCGCTCACTATACGACTAATGTTTCTCTTGAAATTAACGATAACCTGTCTCAGAATTATCAGCAGACTGGTCCTATTATTACGTTACCATATACAGAGCTTGCAATTATCAATCAACCTTATGCTTCTCGTGTTGAGAACATTAACCCATTCAACGTCTTTACTTACATTGGTCGTATTGTATTGACACCTGGATCTGATGATTGGATTGAGACTGAAAGACTTCCTGCAAATGTTACTCAAATCGAAGGCGATTTTGAAGCAGTCGCCGCAGAGATGAATGTTGACCAAAATGGTTTTTTACCTATTCAGTGGAATTCATGGACAACTACATGGAAATCTGAAGAATTTATTGGATCTTCAACTGTACACAATCCTGGTTGGTTGCAGGAAGACATTGGTAGATCTCCTAGACCCGATGTATGGGGTGGTCGTGGTATGCGTCGTATCAACGTCGTTGAAACATTTGAAGTTAGTGGAGAACAAGTTAGAACAGGTATTAGAACTCAGGTTGTACCTAGGATTGAGATGGAATCTCTTGGCGATGCTCTCATCTCCGCTACAGTTATTCCCTGGATTCGTTCTAGGAATATTGAACTTGATGTTGCTCGTCTCAAGCCAAGAACACAAGTCTACTCATTCTTTGATGGTCAGAATGTCAGTGCATACATGACTCCAAAATTGATTGAGATCATTAAAGATCCTGCTGTTGATACAAGAACAAATTCTACTCCTTTTGTAATTGGTGAGACTGTAACTGGTCAAACAAGTGGTTGTGTATTCAAGGTTGCAGCACCTAATGATTTATTTGAATTCAATCCATATACTGATGAAGAACTACCTTCTTCATATGCTTCAACAACTGCATATTTGAGTATTGATACTGAAGCACTTGCAAAGCAAGCAGTTGGTGATTTCTATGGAAATATGCAAGTTGGAGAAGTTCTTATCGGAACTTCTGGTGCTACAGCGGTAGTCAAAGACCGCAGAATGATCACAGACAGATTTGGTAAGATGAAGACATCTTTCTTCATTCCAACACCTAAAATCGATACAAATCCTCGTTGGTCAACGGGTACTAGAACACTTAGATTGACTACATCAGATAGTGATTCTCGTATTGCAGGTGCTGTTGCATCTTCTGCTCAGGTAGAATATGAAGCAAGAGGTACGTTGAATGTCGTTCAAGAAAATATTCTTGCAGTTAGAAATGCTGAGATTGTTCAAGATACAGTAAATCAAGAACAAACAATTCAATCTACAAGAACTGAAGTTCGTCAGGTTGGTTGGTATGACCCTCTTGCACAATCATTTATCGTCGATCAAGATGGTGG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Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.